Análise genética de escores de avaliação visual de bovinos com modelos bayesianos de limiar e linear
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- Heitor Garrau Chaves
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1 Análse genéca de escores de avalação vsual 835 Análse genéca de escores de avalação vsual de bovnos com modelos bayesanos de lmar e lnear Carna Ubrajara de Fara (1), Cláudo Ulhôa Magnabosco (2), Lúca Galvão de Albuquerque (3), Arcado de los Reyes (4), Luz Anôno Framarno Bezerra (5) e Raysldo Barbosa Lobo (6) (1) Unversdade Federal de Goás (UFG), Campus de Jaaí, Caxa Posal 03, CEP Jaaí, GO. E-mal: carnauf@yahoo.com.br (2) Embrapa Cerrados, Caxa Posal 08223, CEP Planalna, DF. E-mal: mclaudo@cpac.embrapa.br (3) Unversdade Esadual Paulsa, Faculdade de Cêncas Agráras e Veernáras, Deparameno de Melhorameno Anmal, Va de acesso Prof. Paulo Donao Casellane, s/n o, CEP Jabocabal, SP. E-mal: lgalb@fcav.unesp.br (4) UFG, Escola de Veernára, Deparameno de Produção Anmal, Campus Samambaa, Caxa Posal 131, CEP Goâna, GO. E-mal: adlreyes@ve.ufg.br (5) Unversdade de São Paulo, Faculdade de Medcna de Rberão Preo, Deparameno de Genéca, Avenda Banderanes, n o 3.900, Mone Alegre, CEP Rberão Preo, SP. E-mal: lfbezer@fmrp.usp.br (6) Assocação Naconal de Cradores e Pesqusadores, Rua João Godoy, n o 463, CEP Rberão Preo, SP. E-mal: raysldo@ancp.org.br Resumo O objevo dese rabalho fo comparar as esmavas de parâmeros genécos obdas em análses bayesanas un-caracerísca e b-caracerísca, em modelo anmal lnear e de lmar, consderando-se as caraceríscas caegórcas morfológcas de bovnos da raça Nelore. Os dados de musculosdade, esruura físca e conformação foram obdos enre 2000 e 2005, em anmas de 13 fazendas parcpanes do Programa Nelore Brasl. Foram realzadas análses bayesanas un e b-caraceríscas, em modelos de lmar e lnear. De modo geral, os modelos de lmar e lnear foram efcenes na esmação dos parâmeros genécos para escores vsuas em análses bayesanas un-caraceríscas. Nas análses b-caraceríscas, observou-se que: com ulzação de dados conínuos e caegórcos, o modelo de lmar proporconou esmavas de correlação genéca de maor magnude do que aquelas do modelo lnear; e com o uso de dados caegórcos, as esmavas de herdabldade foram semelhanes. A vanagem do modelo lnear fo o menor empo gaso no processameno das análses. Na avalação genéca de anmas para escores vsuas, o uso do modelo de lmar ou lnear não nfluencou a classfcação dos anmas, quano aos valores genécos predos, o que ndca que ambos os modelos podem ser ulzados em programas de melhorameno genéco. Termos para ndexação: amosragem de Gbbs, caraceríscas morfológcas, gado de core, valores genécos. Genec analyss for vsual scores of bovnes wh he lnear and hreshold bayesan models Absrac The objecve of hs work was o compare he esmaes of genec parameers obaned n snglera and wo-ra bayesan analyses, under lnear and hreshold anmal models, consderng caegorcal morphologcal ras of bovnes of he Nelore breed. Daa of musculaure, physcal srucure and conformaon were obaned beween years 2000 and 2005, from 3,864 bovnes of he Nelore breed from 13 parcpan farms of he Nelore Brazl Program. Sngle-ra and wo-ra bayesan analyses were performed under lnear and hreshold anmal models. In general, he lnear and hreshold models were effcen n esmang genec parameers for vsual scores under sngle-ra bayesan analyses. In he wo-ra analyses, was observed ha: usng connuous and caegorcal daa, he hreshold model provded greaer esmaes of genec correlaon han hose of he lnear model; wh caegorcal daa, he herably esmaes were smlar. One major advanage of he lnear models was s smaller requremens n he analyses processng me. In he genec evaluaon of anmals for vsual scores, he use of he lnear or hreshold model dd no nfluence he classfcaon of he anmals, based on her predced breedng values, whch suggess ha boh models can be used n genec mprovemen programs. Index erms: Gbbs samplng, morphologcal ras, beef cale, breedng values. Inrodução No Brasl, as caraceríscas morfológcas de conformação de bovnos de core êm desperado grande neresse em cradores e pesqusadores, e esudos êm sdo realzados para se verfcar quas são os faores genécos e ambenas que afeam essas caraceríscas. As pesqusas realzadas ndcam que a seleção baseada nos escores de conformação, precocdade e musculaura pode ser efeva, vso que as esmavas de herdabldade obdas são de moderada a méda magnude (Dal Farra e al., 2002; Koury Flho, 2005; Kpper e al., 2006). No enano, para se ober sucesso com a ulzação dos
2 836 C.U. de Fara e al. escores vsuas como créros de seleção, é necessáro conhecer os faores ambenas e genécos. Os parâmeros genécos êm sdo esmados por dferenes méodos, que evoluem à medda que novas eoras e écncas compuaconas são desenvolvdas. O méodo de esmação é um faor mporane na obenção dos parâmeros genécos, com o esabelecmeno de um modelo que descreva correamene os dados. Ganola & Foulley (1983) desenvolveram o modelo de lmar para avalação genéca de dados caegórcos. Poserormene, Van Tassel e al. (1998) ornaram possíves as análses mul-caraceríscas que relaconam dados conínuos e caegórcos. Os modelos de lmar admem que exse uma varável subjacene de dsrbução conínua, em relação à varável dscrea (Sorensen e al., 1995), e as esmavas referenes a uma deermnada caegora são observadas se os valores da escala subjacene esverem localzados enre os lmares que defnem essa caegora. Assm, a dsrbução de probabldade das esmavas, para dados caegórcos, depende da posção da méda da dsrbução subjacene conínua, em relação aos lmares fxos. O programa MTGSAM Threshold ( mulple ra Gbbs sampler for anmal models ), desenvolvdo por Van Tassel e al. (1998), que ulza a nferênca bayesana sob o enfoque da amosragem de Gbbs, em sdo ulzado na esmação de parâmeros genécos para dados caegórcos em modelo de ouro e em modelo ouro avô maerno. Em modelo anmal, alguns auores (Moreno e al., 1997; Luo e al., 2001; Phocas & Laloë, 2003) enconraram dfculdades para angr a convergênca da cadea de Gbbs, uma vez que o algormo ulzado caracerza-se como um processo eravo. Os modelos lneares êm sdo preferdos em relação aos de lmar, na avalação genéca de caraceríscas caegórcas, pela facldade de aplcação ano em modelo anmal quano no modelo de ouro, e pelo menor empo gaso de processameno. Esses modelos foram ulzados em dversos esudos com dados caegórcos, enre os quas se desacam os de Wegel e al. (1999), Carner e al. (2000), Benne e al. (2001), Cardoso e al. (2001) e Kpper e al. (2006). No enano, os procedmenos lneares são descros como não aproprados para se quanfcar a naureza dscrea dos dados caegórcos (Marcondes e al., 2005). Esse fao mplca no problema de se gerarem valores baxos das esmavas dos parâmeros genécos e em conclusões equvocadas referenes ao ganho genéco dessas caraceríscas, quando submedas à seleção. O objevo dese rabalho fo comparar as esmavas de parâmeros genécos, obdas em análses bayesanas un-caracerísca e b-caracerísca, em modelo anmal lnear e de lmar, quano às caraceríscas caegórcas morfológcas de bovnos da raça Nelore. Maeral e Méodos Foram esudadas as caraceríscas caegórcas morfológcas musculosdade, esruura físca e conformação; e a caracerísca conínua peso, aos 210 das de dade (P210), em bovnos da raça Nelore. As nformações das caraceríscas morfológcas foram obdas enre 2000 e 2005, relavas a anmas de 13 fazendas parcpanes do Programa Nelore Brasl, localzadas em Goás, Mao Grosso, Paraná e Dsro Federal. As nformações de P210 foram obdas de anmas, perencenes aos rebanhos avalados, nascdos enre 1990 e Os anmas foram avalados vsualmene, pelo méodo MERCOS, adapado por Lôbo (1996), em que: na musculosdade, avalou-se a dsrbução muscular no corpo do anmal, bem como o seu desenvolvmeno, volume e comprmeno dos músculos, quano à precocdade de acabameno e maor rendmeno de carcaça; na esruura físca, avalou-se a susenação do anmal, ou seja, cascos quano à negrdade e amanho, lgamenos ou arculações, quano à frmeza, e a largura dos ossos; na conformação, avalou-se o esqueleo do anmal, comprmeno do corpo, amplude orácca, arqueameno e comprmeno das coselas, largura de garupa e comprmeno, relação amanho dos membros e comprmeno das coselas, em que as lnhas dorsal e venral devem ser paralelas ou abrr levemene no sendo da garupa. De acordo com Lôbo (1996), em cada varável morfológca, os anmas avalados podem ober escores de 1 a 5 ponos, e a maor ponuação represena o grau mas favorável. Na Tabela 1, esá apresenada a dsrbução dos escores em percenagem para cada caracerísca morfológca. Tabela 1. Dsrbução (%) por escore das caraceríscas musculosdade (M), esruura físca (E) e conformação (C), em bovnos da raça Nelore. Caracerísca Escores M 0,6 12,4 43,2 33,4 10,4 E 0,4 6,5 37,6 44,0 11,5 C 0,4 11,3 39,0 35,8 13,5
3 Análse genéca de escores de avalação vsual 837 A esruuração dos arquvos de dados fo realzada com a ulzação do SAS (SAS Insue, 2004). Os dados analsados connham anmas cuja dade varou enre 570 e 750 das, nervalo deermnado de acordo com a dade-padrão de anmas jovens, 660 das (22 meses de dade). Na verfcação dos faores de ambene, que nfluencam as caraceríscas morfológcas, foram realzadas análses prévas pelos procedmenos GLM e REG do SAS (SAS Insue, 2004). A defnção dos grupos de conemporâneos quano às caraceríscas caegórcas morfológcas fo esabelecda por fazenda, ano e esação de nascmeno e loe de avalação. Na caracerísca conínua P210, os grupos conemporâneos consuíram-se de fazenda, ano e esação de nascmeno, sexo e loe de manejo aos 210 das. O efeo de esação de nascmeno fo dvddo em quaro classes para os anmas nascdos nos períodos de: janero a março, abrl a junho, julho a seembro e ouubro a dezembro. Foram elmnados os grupos conemporâneos que connham menos de quaro anmas para odas as caraceríscas avaladas. No peso aos 210 das de dade, além desa resrção, foram rerados os anmas com meddas de 3,5 desvos-padrão, acma ou abaxo da méda do seu grupo de conemporâneos, para elmnar possíves dados dscrepanes. Na esmação dos parâmeros genécos, foram consderadas as análses bayesanas un e bcaraceríscas, em modelos de lmar e lnear. Os parâmeros genécos das caraceríscas caegórcas morfológcas e o P210 foram esmados por meo do aplcavo MTGSAM Threshold. Quano às caraceríscas morfológcas, fo consderado o sexo como efeo fxo, os grupos de conemporâneos como efeos aleaóros e a dade na daa da colea como covarável (efeo lnear). Em relação ao peso aos 210 das de dade, foram ncluídos os efeos fxos de grupo de conemporâneos e a classe de dade da vaca ao paro. O modelo compleo pode ser represenado em noação marcal como: y = Xβ + Z 1 a + Z 2 c + e, em que: y é o veor das observações (caracerísca caegórca ou conínua); β é o veor dos efeos fxos (sexo para as caraceríscas morfológcas, grupo de conemporâneos e classe de dade da vaca ao paro para P210); a é o veor dos efeos aleaóros que represenam os valores genécos advos dreos de cada anmal; c é o veor de efeos aleaóros não correlaconados (efeo de grupos conemporâneos para as caraceríscas morfológcas ou efeo de ambene permanene maerno para P210); e é o veor de efeos aleaóros resduas; e X, Z 1 e Z 2 são as marzes de ncdênca, que relaconam as observações aos efeos fxos e aos efeos aleaóros genécos advos dreos e não correlaconados, respecvamene. O arquvo de genealoga ncluu anmas da raça Nelore. Os modelos de lmar, geralmene, apresenam problemas na esmação de componenes de varânca e predção dos valores genécos, quando se em um grande número de níves de efeos fxos (Moreno e al., 1997; Varona e al., 1999; Luo e al., 2002). Nesa condção, os auores recomendam assumr esses efeos como aleaóros. No enano, para que a convergênca seja angda, ambém é necessáro que haja maor número de dados denro de cada nível (Varona e al., 1999). Assm, os efeos de grupos de conemporâneos foram assumdos como aleaóros, e o sexo como efeo fxo, para as análses genécas de caraceríscas caegórcas. No modelo de lmar, assumu-se que a escala subjacene apresena dsrbução normal conínua, represenada como: U θ ~ N(W θ, Iσ 2 e), em que: U é o veor da escala base de ordem r; θ = (β, a, c ) é o veor dos parâmeros de locação de ordem s, com β defndo sob o pono de vsa freqüensa como efeos fxos, e ordem s, com a e c como efeos aleaóros genéco advo dreo e de grupo de conemporâneos; W é a marz de ncdênca conhecda, de ordem r por s; I é a marz de dendade de ordem r por r; e σ 2 e é a varânca resdual. Consderando-se que a varável na dsrbução subjacene não é observável, a paramerzação σ 2 e = 1 é geralmene adoada para se ober denfcabldade na função de verossmlhança (Ganola & Sorensen, 2002). Tal pressuposção é padrão em análses para dados caegórcos em modelo de lmar (Van Tassel e al., 1998). As caraceríscas caegórcas são deermnadas por varáves conínuas não observáves, em escala subjacene, em que são fxados valores ncas de lmares, as que: 1 < 2 K < j - 1, com 0 = - e j =, em que j é o número de caegoras. Os dados observáves são dependenes da varável subjacene, que é lmada enre dos lmares não observáves (Ganola & Foulley, 1983). Assm, as caegoras ou escores de y (caraceríscas morfológcas), para cada anmal, são defndos por U, na escala subjacene:
4 838 C.U. de Fara e al. 1 0 U 2 1 U y 3 2 U 4 3 U 5 4 U em que: n é o número de observações. Após as especfcações dos lmares 0 a 5, é necessáro que um deles (de 1 a 4 ) seja ajusado a uma consane arbrára. Nese rabalho, adoou-se a resrção 1 = 0, al que o veor de lmares esmáves fo defndo como: Nas análses b-caraceríscas envolvendo caegórcas e conínuas, de acordo com o enfoque bayesano, admu-se que as dsrbuções ncas dos efeos aleaóros genécos, não correlaconados e resduas, seguem dsrbução normal mulvarada, conforme represenado a segur: a1 0 G ~ N,G G a 2 0 e1 0 R ~ N,R R e 2 0 p 0 p ,, n c1 0 A, p C ~ N,C C0 I, c2 0 I em que: G 0 é a marz de varâncas e covarâncas genécas; C 0 é a marz das varâncas de efeos não correlaconados; R 0 é a marz de varâncas resduas; é o operador do produo dreo; A é a marz de parenesco; e I é a marz dendade. Assumram-se dsrbuções ncas das (co)varâncas como uma Wshar nverda para os efeos aleaóros genécos, não correlaconados e resduas das caraceríscas esudadas, nclusve a covarânca enre elas. Foram defndas dsrbuções ncas unformes ano para os efeos fxos quano para os lmares. O parâmero v é o grau de lberdade correspondene à dsrbução Wshar nverda que ndca o grau de confabldade da dsrbução ncal. Nese rabalho, o parâmero v ulzado fo de valor zero, ou seja, não refleu grau de conhecmeno sobre os parâmeros (Van Tassel e al., 1998). Na mplemenação da amosragem de Gbbs, nas análses em modelo anmal de lmar (un-caracerísca), modelo anmal lnear-lmar (b-caracerísca conínua-caegórca) e modelo anmal lmar-lmar (b-caracerísca caegórca-caegórca), fo ulzado um amanho de cadea ncal de cclos, em que os prmeros foram descarados, e as amosras foram reradas a cada ml cclos, no oal de 400 amosras ncas. Em seguda, foram adconados cclos a cada rodada, aé que as esmavas obdas na úlma análse fossem guas às obdas na análse aneror. Esse créro fo ulzado com o nuo de se verfcar se realmene a convergênca fo alcançada. As análses das amosras da correlação seral e da convergênca da cadea de Gbbs foram realzadas com o auxílo do programa Gbanal (Van Kaam, 1998). Nas análses b-caraceríscas em modelo anmal de lmar-lmar, so é, na análse smulânea de duas varáves caegórcas, dferenemene da resrção para o processo aneror, adoaram-se as segunes resrções, 1 = 0 e 2 = 1 (Van Tassel e al., 1998). Nas análses em modelo anmal lnear (un-caracerísca) e modelo anmal lnear-lnear, fo ulzado o mesmo programa, endo-se alerado somene a opção para consderar o modelo como lnear (opção zero no módulo mgsprep.exe). As soluções dos valores genécos, obdas para cada anmal, foram ransformadas em escala de probabldade pela função PROBNORM do SAS (SAS Insue, 2004), que resulou em dferenças esperadas na progêne (DEPs), desvadas do valor 0,50 ou 50%. Essa ransformação em escala de probabldade é realzada, para que a undade da DEP para os escores vsuas fosse dada em percenagem. Nese caso, as DEPs predzem a probabldade de um reproduor de dexar descendenes que anjam o escore máxmo para a caracerísca avalada. Na verfcação das correlações de poso ou correlações de Spearman, enre os dferenes modelos de análse genéca das caraceríscas morfológcas avaladas por escores vsuas, fo aplcado o procedmeno PROC CORR do SAS (SAS Insue, 2004). Resulados e Dscussão Foram ulzados amanhos de cadea de Gbbs de aé cclos, na obenção das esmavas de parâmeros genécos das caraceríscas morfológcas musculosdade, esruura físca e conformação, consderando-se análses bayesanas em modelo anmal de lmar (un-caracerísca), modelo anmal lnear-lmar (b-caracerísca com dados conínuos e caegórcos) e modelo anmal lmar-lmar (b-caracerísca com dados caegórcos). Nas análses
5 Análse genéca de escores de avalação vsual 839 bayesanas em modelo anmal lnear, o amanho da cadea de Gbbs fo de cclos, e não foram necessáros cclos adconas para angr a convergênca da cadea amosral. Observou-se que, para musculosdade, as esmavas de méda, moda e medana da herdabldade foram maores, quando se ulzou o modelo de lmar (Tabela 2). Para esruura físca e conformação, as esmavas obdas pelos dos modelos foram pracamene dêncas. De modo geral, observou-se que os dos modelos apresenaram resulados smlares quano à esmação dos parâmeros genécos das caraceríscas morfológcas em análses bayesanas un-caraceríscas, pos as regões de credbldade se sobrepõem, o que caracerza não rejeção da hpóese esaísca de gualdade, enre as esmavas geradas pelos dos modelos. Esses resulados esão de acordo com os relaos de Maos e al. (1997), que concluíram que os modelos de lmar não foram mas adequados que os modelos lneares, na obenção de esmavas de parâmeros genécos, para dados caegórcos de caraceríscas reproduvas de ovelhas das raças Ramboulle e Fnnsheep. Porém, em rabalhos realzados por Ramrez-Valverde e al. (2001), Mwansa e al. (2002) e Marcondes e al. (2005), as esmavas obdas pelo modelo lnear foram de menor magnude que o modelo de lmar. É mporane ressalar que, no presene rabalho, as caraceríscas morfológcas possuíam cnco classes ou escores, o que pode er conrbuído para que as esmavas obdas pelo modelo lnear não fossem subesmadas. Tabela 2. Esaísca descrva das esmavas de herdabldade para musculosdade, esruura físca e conformação de bovnos da raça Nelore, obdas a parr de análses bayesanas un-caraceríscas, em modelo anmal de lmar e lnear. Esaísca descrva Lmar Lnear Musculosdade Méda 0,14 0,12 Moda 0,14 0,11 Medana 0,14 0,11 Regão de credbldade (95%) 0,09 a 0,20 0,06 a 0,18 Esruura físca Méda 0,15 0,14 Moda 0,14 0,14 Medana 0,15 0,14 Regão de credbldade (95%) 0,07 a 0,24 0,06 a 0,22 Conformação Méda 0,10 0,11 Moda 0,09 0,11 Medana 0,10 0,11 Regão de credbldade (95%) 0,04 a 0,15 0,05 a 0,18 Na Tabela 3, são apresenadas as esaíscas descrvas das esmavas de parâmeros genécos para as caraceríscas morfológcas musculosdade, esruura físca e conformação, obdas a parr de análses bayesanas b-caraceríscas em modelo anmal lnearlmar e lnear-lnear. Observou-se que, nese caso, a análse ncluu a caracerísca conínua peso aos 210 das de dade. De modo geral, as esmavas de herdabldade para as caraceríscas morfológcas foram semelhanes. Em relação à caracerísca conínua de peso aos 210 das de dade, observou-se que a méda das esmavas de herdabldade fo dênca nas duas análses. No enano, nas correlações genécas, observou-se que o modelo lnear-lmar proporconou esmavas de maor magnude do que o modelo lnear. De acordo com Slva e al. (2005), o uso de modelos de lmar pode proporconar esmavas mas adequadas, pos eses modelos relaconam a resposa observada na escala caegórca a uma escala subjacene normal conínua. Resulados de rabalhos de smulação Tabela 3. Esaísca descrva das esmavas de parâmeros genécos, para as caraceríscas caegórcas musculosdade (M), esruura físca (E), conformação (C) e caracerísca conínua peso aos 210 das de dade (P210), de bovnos da raça Nelore, obdas a parr de análses bayesanas b-caraceríscas, em modelo anmal lnear-lmar e lnear-lnear (1). Análse Méda Moda Medana RC (95%) Modelo lnear-lmar P M 2 0,19 0,19 0,19 0,14 a 0,23 0,21 0,22 0,21 0,13 a 0,30 r g 0,62 0,61 0,62 0,45 a 0,75 P E 2 0,21 0,21 0,21 0,17 a 0,25 0,27 0,28 0,28 0,20 a 0,35 r g 0,94 0,99 0,96 0,80 a 0,99 P C 2 0,25 0,25 0,25 0,20 a 0,30 0,29 0,31 0,31 0,07 a 0,40 r g 0,89 0,87 0,89 0,80 a 0,99 Modelo lnear-lnear P M 2 0,19 0,18 0,19 0,14 a 0,23 h 2 2 0,20 0,19 0,19 0,13 a 0,27 r g 0,61 0,62 0,61 0,46 a 0,74 P E 2 0,21 0,21 0,21 0,17 a 0,26 0,29 0,28 0,29 0,20 a 0,37 r g 0,86 0,90 0,87 0,76 a 0,95 P C 2 0,25 0,25 0,25 0,20 a 0,29 0,33 0,33 0,33 0,25 a 0,42 r g 0,85 0,85 0,85 0,78 a 0,92 (1) RC: regão de credbldade a 95%; h 2 : herdabldade; r g : correlação genéca; os valores subscros 1 e 2 ndcam, respecvamene, caraceríscas 1 e 2 da análse b-caracerísca.
6 840 C.U. de Fara e al. (Mejerng & Ganola, 1985; Hoeschele & Ganola, 1988) mosraram vanagens dos modelos de lmar, em relação aos modelos lneares. No enano, as análses com dados de campo não permram afrmar que os méodos de lmar são mas adequados que os méodos lneares, a não ser, eorcamene. Porém, Varona e al. (1999) ulzaram dados de grandes rebanhos em modelo anmal e observaram melhores resulados do modelo de lmar sobre o lnear, em análses b-caraceríscas, o que não ocorreu para análses un-caraceríscas. Observou-se que as esmavas de parâmeros genécos, para as caraceríscas caegórcas de musculosdade, esruura físca e conformação, obdas a parr de análses bayesanas b-caraceríscas em modelo anmal lmar-lmar e modelo anmal lnear-lnear, foram semelhanes para ambos os modelos (Tabela 4). Em relação à regão de credbldade, observou-se que as ampludes foram muo próxmas. A vanagem do modelo lnear fo a maor velocdade de processameno das análses. De acordo com Marcondes e al. (2005), as análses nese modelo podem ser preferdas, quando houver um grande arquvo de Tabela 4. Esaísca descrva das esmavas de parâmeros genécos, para musculosdade (M), esruura físca (E) e conformação (C) de bovnos da raça Nelore, obdas a parr de análses bayesanas b-caraceríscas, em modelo anmal de lmar-lmar e lnear-lnear (1). Análse Méda Moda Medana RC (95%) Modelo de lmar-lmar M 1 + E 2 0,15 0,15 0,15 0,08 a 0,22 0,18 0,16 0,17 0,09 a 0,28 r g 0,18 0,23 0,20-0,23 a 0,50 M 1 + C 2 0,17 0,18 0,17 0,11 a 0,26 0,18 0,18 0,18 0,09 a 0,27 r g 0,75 0,74 0,76 0,57 a 0,88 E 1 + C 2 0,18 0,15 0,17 0,10 a 0,28 0,14 0,15 0,15 0,05 a 0,22 r g 0,56 0,53 0,57 0,26 a 0,86 Modelo lnear-lnear M 1 + E 2 0,13 0,13 0,13 0,07 a 0,19 0,15 0,12 0,15 0,09 a 0,25 r g 0,19 0,23 0,21-0,21 a 0,50 M 1 + C 2 0,15 0,16 0,15 0,09 a 0,22 0,16 0,16 0,16 0,09 a 0,24 r g 0,76 0,81 0,77 0,58 a 0,89 E 1 + C 2 0,13 0,14 0,13 0,07 a 0,20 0,15 0,12 0,14 0,09 a 0,24 r g 0,59 0,60 0,60 0,24 a 0,85 (1) RC: regão de credbldade a 95%; h 2 : herdabldade; r g : correlação genéca; os valores subscros 1 e 2 ndcam, respecvamene caraceríscas 1 e 2 da análse b-caracerísca. dados e muos regsros de produção. Nese rabalho, o uso de modelos de lmar apresenou maor demanda compuaconal como o maor empo gaso na obenção das esmavas de parâmeros genécos, e ese fao fo proporconado, provavelmene, pela maor demanda de cclos da cadea de Gbbs, para se alcançar a convergênca. As correlações de poso ou correlações de Spearman, para as esmavas de DEPs para musculosdade, esruura físca e conformação, consderando-se as análses un-caraceríscas em modelo anmal lnear e de lmar, foram acma de 99%, o que ndca que, pracamene, não houve mudança na classfcação dos anmas, conforme o modelo adoado. O mesmo ocorreu nas análses b-caraceríscas (dados conínuos e caegórcos), em modelo anmal lnear-lmar e lnearlnear e nas análses b-caraceríscas (dados caegórcos) em modelo anmal lnear-lnear e lmarlmar, em que as correlações de poso ambém foram maores que 99%. Assm, verfcou-se que o uso dos dferenes modelos de avalação genéca, proposos nese rabalho, não modfcou a classfcação dos anmas. Eses resulados corroboram os de Marcondes e al. (2005), que concluíram que não houve dferença na classfcação dos anmas, quando os valores genécos foram predos pelos modelos bayesanos de lmar ou lnear. Devdo ao menor empo compuaconal, os auores recomendaram o uso dos modelos lneares para dados caegórcos. Jamrozk e al. (1991) esudaram cnco caraceríscas de conformação, em bovnos da raça Holandesa, e observaram que a classfcação dos ouros fo a mesma para ambos os modelos. Conclusão 1. Não há dferença enre o modelo lnear e o de lmar, na obenção de esmavas de herdabldades e correlações genécas, de caraceríscas caegórcas morfológcas mulnomas. 2. Na avalação genéca, o uso do modelo de lmar ou lnear, não nfluenca a classfcação dos anmas, quano aos valores genécos predos, o que favorece a ulzação de ambos os modelos em programas de melhorameno genéco. Agradecmenos Ao Conselho Naconal de Desenvolvmeno Cenífco e Tecnológco, pelo apoo fnancero; à Embrapa Arroz e Fejão, ao Deparameno de Genéca e Melhorameno
7 Análse genéca de escores de avalação vsual 841 da Unversdade Esadual Paulsa e à Escola de Veernára da Unversdade Federal de Goás, pelo apoo écnco-cenífco; ao Dr. José Benedo de Freas Trovo, pela revsão dese rabalho. Referêncas BENNETT, G.L.; GREGORY, K.E. Genec (co)varances for calvng dffculy score n compose and parenal populaons of beef cale: I. Calvng dffculy score, brh wegh, weanng wegh, and posweanng gan. Journal of Anmal Scence, v.79, p.45-51, CARDOSO, F.F.; CARDELLINO, R.A.; CAMPOS, L.T. Faores ambenas sobre escores de avalação vsual à desmama em bezerros Angus crados no Ro Grande do Sul. Revsa Braslera de Zooecna, v.30, p , CARNIER, P.; ALBERA, A.; DAL ZOTTO, R.; GROEN, A.F.; BONA, M.; BITTANTE, G. Genec parameers for drec and maernal calvng ably over pares n Pedmonese cale. Journal of Anmal Scence, v.78, p , DAL FARRA, R.A.; ROSO, V.M.; SCHENKEL, F.S. Efeos de ambene e de heerose sobre o ganho de peso do nascmeno ao desmame e sobre os escores vsuas ao desmame de bovnos de core. Revsa Braslera de Zooecna, v.31, p , (Suplemeno). GIANOLA, D.; FOULLEY, J.L. Sre evaluaon for ordered caegorcal daa wh a hreshold model. Genecs Selecon Evoluon, v.15, p , GIANOLA, D.; SORENSEN, D. Lkelhood, Bayesan, and MCMC mehods n quanave genecs. New York: Sprnger- Verlag, p. HOESCHELE, I.; GIANOLA, D. Bayesan versus maxmum quaslkelhood mehods for sre evaluaon wh caegorcal daa. Journal of Dary Scence, v.72, p , JAMROZIK, J.; SCHAEFFER, L.R.; BURNSIDE, E.B.; SULLIVAN, B.P. Threshold models appled o Holsen conformaon ras. Journal of Dary Scence, v.74, p , KIPPERT, C.J.; RORATO, P.R.N.; CAMPOS, L.T.; BOLIGON, A.A.; WEBER, T.; GHELLER, D.G.; LOPES, J.S. Efeo de faores ambenas sobre escores de avalação vsual à desmama e esmava de parâmeros genécos, para bezerros da raça Charolês. Cênca Rural, v.36, p , KOURY FILHO, W. Escores vsuas e suas relações com caraceríscas de crescmeno em bovnos de core p. Tese (Douorado) - Unversdade Esadual Paulsa, Jabocabal. LÔBO, R.B. Programa de melhorameno genéco da raça Nelore. Rberão Preo: Fnep, p. LUO, M.F.; BOETTCHER, P.J.; SCHAEFFER, L.R.; DECKKERS, J.C.M. Bayesan nference for caegorcal ras wh an applcaon o varance componen esmaon. Journal of Dary Scence, v.84, p , LUO, M.F.; BOETTCHER, P.J.; SCHAEFFER, L.R.; DEKKERS, J.C.M. Esmaon of genec parameers of calvng ease n frs and second pares of Canadan Holsens usng Bayesan mehods. Lvesock Producon Scence, v.74, p , MARCONDES, C.R.; PANETO, J.C.C.; SILVA, J.A.V.; OLIVEIRA, H.N.; LÔBO, R.B. Comparação enre análses para permanênca no rebanho de vacas Nelore ulzando modelo lnear e modelo de lmar. Arquvo Braslero de Medcna Veernára e Zooecna, v.57, p , MATOS, C.A.P.; THOMAS, D.L.; GIANOLA, D.; TEMPELMAN, R.J.; YOUNG, L.D. Genec analyss of dscree reproducve ras n sheep usng lnear and nonlnear models: I. Esmaon of genec parameers. Journal of Anmal Scence, v.75, p.76-87, MEIJERING, A.; GIANOLA, D. Lnear versus nonlnear mehods of sre evaluaon for caegorcal ras: a smulaon sudy. Genecs Selecon Evoluon, v.17, p , MORENO, C.; SORENSEN, D.; GARCÍA-CORTÉS, L.A.; VARONA, L.; ALTARRIBA, J. On based nferences abou varance componens n he bnary hreshold model. Genecs Selecon Evoluon, v.29, p , MWANSA, P.B.; CREWS, D.H.J.; WILTON, J.W.; KEMP, R.A. Mulple ra selecon for maernal producvy n beef cale. Journal of Anmal Breedng Genecs, v.119, p , PHOCAS, F.; LALOË, D. Evaluaon models and genec parameers for calvng dffculy n beef cale. Journal of Anmal Scence, v.81, p , RAMIREZ-VALVERDE, R.; MISZTAL, I.; BERTRAND, J.K. Comparson of hreshold vs lnear and anmal vs sre models for predcng drec and maernal genec effecs on calvng dffculy n beef cale. Journal of Anmal Scence, v.79, p , SAS INSTITUTE. SAS OnlneDoc Cary: SAS Insue, SILVA, J.A.V.; DIAS, L.T.; ALBUQUERQUE, L.G. Esudo genéco da precocdade sexual de novlhas em um rebanho Nelore. Revsa Braslera de Zooecna, v.34, p , SORENSEN, D.A.; ANDERSEN, S.; GIANOLA, D.; KORSGAARD, I. Bayesan nference n hreshold models usng Gbbs samplng. Genecs Selecon Evoluon, v.27, p , VAN KAAM, J.B.C.H.M. Gbanal 2.9: analyzng program for Markov chan Mone Carlo sequences. Wagenngen: Wagenngen Agrculural Unversy, VAN TASSELL, C.P.; VAN VLECK, L.D.; GREGORY, K.E. Bayesan analyss of wnnng and ovulaon raes usng a mulplera hreshold model and Gbbs samplng. Journal of Anmal Scence, v.76, p , VARONA, L.; MISZTAL, I.; BERTRAND, J.K. Threshold-lnear versus lnear-lnear analyss of brh wegh and calvng ease usng an anmal model: I. Varance componen esmaon. Journal of Anmal Scence, v.77, p , WEIGEL, K.A.; REKAYA, R. Genec parameers for reproducve ras of Holsen cale n Calforna and Mnnesoa. Journal of Dary Scence, v.83, p , Recebdo em 20 de janero de 2008 e aprovado em 30 de junho de 2008
2 Programação Matemática Princípios Básicos
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