Sumário ANEXO I COMUNICADO HERMES PARDINI

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1 Sumário ANEXO I COMUNICADO HERMES PARDINI Conteúdo ESTUDO MOLECULAR DO GENE MSH2 HNPCC ALTERAÇÃO DE... 2 SÍNDROME DE DELEÇÕES SUBMICROSCOPICAS ALTERAÇÃO DE... 5 BRCA1 E BRCA2 INDICAÇÃO PARA JUDEUS ASHKENAZI ALTERAÇÃO DE

2 ASSUNTO: ESTUDO MOLECULAR DO GENE MSH2 HNPCC ALTERAÇÃO DE Prezados clientes, Comunicamos a alteração de layout do exame: ESTUDO MOLECULAR DO GENE MSH2 HNPCC [S MSH2], desde 18/10/2016. ANTERIOR METODO: PCR (REACAO EM CADEIA DA POLIMERASE) SEGUIDO POR SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERACAO VALOR DE REFERENCIA: MUTACAO NAO DETECTADA NOTAS: - Variacoes geneticas observadas que estejam catalogadas nos bancos de dados como sendo sem significado clinico e polimorfismos comuns, nao serao relatadas no resultado final, mas podem ser disponibilizadas se solicitadas. - Este resultado nao descarta a possibilidade de existirem outras variacoes geneticas localizadas fora da regiao de cobertura deste exame, em outros genes ou nao detectaveis pela tecnica utilizada. - Polimorfismos raros na regiao dos iniciadores podem ocasionar a falha da amplificacao de um alelo. - A tecnica utilizada nao e capaz de detectar grandes delecoes e duplicacoes no gene avaliado. Em casos negativos, sugerem-se a criterio medico o estudo por MLPA. - O resultado negativo para estas mutacoes nao devera ser utilizado para modificar o risco empirico relativo de desenvolvimento de tumor colorretal ou outros tumores obtido a partir da historia familiar. - As alteracoes detectadas serao confirmadas por sequenciamento de Sanger. - Os resultados do sequencimento foram comparados com a sequencia 2

3 referencia NM_ Exame realizado em parceria com o Laboratorio Progenetica ATUAL METODO: PCR transcriptase reversa em tempo real (RT-qPCR) multiplex para os transcritos BCR-ABL b2a2, b3a2 e e1a2 (Kit Asuragen BCR/ABL1 Quant Assay) DATA DO NUM.de NUM.COPIAS RELACAO %BCR-ABL REDUCAO EXAME COPIAS DO GENE ABL1 BCR-ABL/ EI LOG BCR-ABL (CONTROLE) ABL (isoforma) (%) EI : Escala Internacional IND: Transcritos BCR-ABL indetectaveis NA: Nao aplicavel INTERPRETACAO: O valor da % BCR-ABL EI deve ser interpretado de acordo com a fase de tratamento do paciente. A tendencia dos resultados deste exame ao longo do tempo e mais informativa do status da doença do que a avaliacao de um resultado individual. Variacoes de 0,5 log entre exames sao consideradas normais. Mudancas de log significativas entre um exame e o anterior (>0,5 log) que possam influenciar tomadas de decisoes clinicas devem ser confirmadas com uma amostra subsequente. VALORES DE REFERENCIA: TRANSCRITOS BCR-ABL SEGUNDO A ESCALA INTERNACIONAL (EI) %BCR-ABL EI(LOG): 100% (LINHA DE BASE AO DIAGNOSTICO) QUEDA DE 1 LOG: %BCR-ABL EI 10% QUEDA DE 2 LOG: %BCR-ABL EI 1% QUEDA DE 3 LOG: %BCR-ABL EI 0,1% - RESPOSTA MOLECULAR MAIOR (RMM) QUEDA DE 4 LOG: %BCR-ABL EI 0,01% - RM4 QUEDA DE 4,5 LOG: %BCR-ABL EI 0,0032% - RM4,5 IND: Transcritos BCR-ABL indetectaveis 3

4 NOTA: - Este exame e utilizado para a quantificacao dos transcritos da fusao BCR-ABL para acompanhamento de resposta a terapia em pacientes previamente detectados como portadores da fusao BCR-ABL, e nao deve ser utilizado para realizar o diagnostico da presença da fusao BCR-ABL em pacientes com LMC ou LLA. Para o diagnostico inicial da presenca da fusao BCR-ABL,favor solicitar o exame translocacao BCR-ABL qualitativo. - O gene constitutivo ABL1 e utilizado como controle para quantificacao relativa. - A escala internacional (EI) permite que diferentes laboratorios relacionem a carga leucemica (% BCR-ABL EI) obtida pelo uso de um fator de conversao. O valor do fator de conversao deste laboratorio e calculado utilizando o kit comercial ARQ IS Calibrator Panel (Asuragen). - O valor da reducao de log e avaliavel nos casos em que a %BCR-ABL EI esta proxima ou abaixo de 10% e se refere a resposta do paciente ao tratamento com inibidor tirosina quinase. Pacientes que atingem uma queda de pelo menos 2 log no momento da resposta celular completa ou de 3 log em ate 15 meses apos o inicio do tratamento apresentam melhor sobrevida livre de doenca. - A sensibilidade do teste e de Exame realizado em parceria com o Laboratorio Progenetica. MOTIVO: Revisão e adequação do layout. 4

5 ASSUNTO: SÍNDROME DE DELEÇÕES SUBMICROSCOPICAS ALTERAÇÃO DE Prezados clientes, Comunicamos a alteração de layout do exame: SÍNDROME DE DELEÇÕES SUBMICROSCOPICAS [S SDS-RM], desde 18/10/2016. ANTERIOR MÉTODO: MLPA - AMPLIFICACAO DE MULTIPLAS SONDAS DEPENDENTES DE LIGACAO RESULTADO: VALORES DE REFERÊNCIA: AUSENCIA DE DELEÇÕES NAS REGIOES ESTUDADAS. NOTA: - A técnica de MLPA (Amplificação de múltiplas sondas dependentes de ligação) e semiquantitativa, o que permite a identificação de deleções/duplicações nas regiões estudadas. - Deleções e duplicações detectadas por MLPA sempre devem ser verificadas com estudos publicados, uma vez que duplicações e deleções podem não ser consideradas patogênicas. 5

6 - A técnica utilizada não permite detectar mutações pontuais nos genes estudados. - O resultado negativo não exclui a presença de mutações ou deleções em outras regiões não estudadas do gene. - Deleções e duplicações detectadas por MLPA devem sempre ser confirmadas por outros métodos. - A interpretação dos resultados obtidos e de responsabilidade medica e deve ser avaliada em conjunto com os dados clínicos epidemiológicos e laboratoriais do paciente. ATUAL MÉTODO: MLPA - AMPLIFICAÇÃO DE MULTIPLAS SONDAS DEPENDENTES DE LIGAÇÃO RESULTADO: VALORES DE REFERÊNCIA: AUSENCIA DE DELEÇÕES NAS REGIÕES ESTUDADAS. NOTA: - Investigação da presença de deleções e duplicações nas regiões do genoma associada a síndromes de microdeleção: síndrome de deleção 1p36, Prader-Willi /Angelman (15q11), Wolf-Hirschhorn (4p16), Rubinstein-Taybi (16p13), Cri du Chat (5p15), Miller-Dieker (17p13), Sotos (5q35), Smith Magenis(17p11), Saethre /Chotzen(7p21), Alagille(20p12), Williams-Beuren (7q11), DiGeorge (22q11)Phelan- McDermid (22q13), Langer-Giedion (8q24) e WAGR (11p13). - A tecnica de MLPA (Amplificação de múltiplas sondas dependentes de ligação) e semiquantitativa, o que permite a identificação de deleções/duplicações nas regiões estudadas. 6

7 - Deleções e duplicações detectadas por MLPA sempre devem ser verificadas com estudos publicados, uma vez que duplicações e deleções podem não ser consideradas patogênicas. - A técnica utilizada não permite detectar mutações pontuais nos genes estudados. - O resultado negativo não exclui a presença de mutações ou deleções em outras regiões não estudadas do gene. - Deleções e duplicações detectadas por MLPA devem sempre ser confirmadas por outros métodos. - A interpretação dos resultados obtidos e de responsabilidade medica e deve ser avaliada em conjunto com os dados clínicos epidemiológicos e laboratoriais do paciente. MOTIVO: Adequação após revisão interna. 7

8 ASSUNTO: BRCA1 E BRCA2 INDICAÇÃO PARA JUDEUS ASHKENAZI ALTERAÇÃO DE Prezados clientes, Comunicamos a alteração de layout ocorrida no exame: BRCA1 E BRCA2 Indicação para JUDEUS ASHKENAZI [S BRCAJU]. ANTERIOR METODO: Os genes BRCA1 e BRCA2 foram analisados por PCR seguido de sequenciamento bidirecional dos exons 2 e 20 (BRCA1) e de regiao parcial do exon 11 (BRCA2). Os resultados do sequen- ciamento sao comparados com as sequencias referencia: BRCA1: NC_ (NCBI- Homo sapiens chromosome 13, GRCh37.p10 Primary Assembly)BRCA2: NC_ (NCBI -Homo sapiens chromosome 13, GRCh37.p10 Primary Assembly) R E S U L T A D O Gene Designacao (BIRC*) dssnp (NCBI*) MUTACAO BRCA1 185delAG rs (EXON 2) BRCA1 5382insC rs (EXON 20) BRCA2 6174delT rs (EXON 11) * BIRC - Breast Information Core - National Institute of Heath. * NCBI - National Center for Biotechnology Information COMENTARIOS: 8

9 VALORES DE REFERENCIA: Mutacao DETECTADA / NAO DETECTADA. NOTA: 1. O teste visa analisar se um individuo e portador das mutacoes 185delAG, 5382insC no gene BRCA1 e 6174delT no gene BRCA2, para avaliacao de risco para cancer de mama e ovario em pessoas de ascendencia judaica. BRCA1-185delAG: Mutacao com efeito dominante que consiste numa delecao dos nucleotideos AG no exon 2, posicao 185 do gene BRCA1. BRCA1-5382insC: Mutacao com efeito dominante que consiste numa insercao do nucleotideo C no exon 20, posicao 5382 do gene BRCA1. BRCA2-6174delT: Mutacao com efeito dominante que consiste numa delecao do nucleotideo T no exon 11, posicao 6174 do gene BRCA2. 2. Individuos com genotipo (wt/mut) ou (mut/mut) para uma ou mais destas mutacoes possuem um risco elevado de desenvolver cancer de mama. 3. As mutacoes analisadas neste exame sao as mais frequentemente encontradas em pessoas judias de ascendencia Ashkenazi. OBS: O resultado negativo nao exclui a susceptibilidade hereditaria ao desenvolvimento de cancer neste paciente. E recomendado o teste de outros genes relacionados com a susceptibilidade hereditaria com o objetivo de estabelecer a causa da doenca. Sugerimos o aconselhamento genetico pos-teste para a melhor compreensao dos resultados. ATUAL METODO: PCR (REACAO EM CADEIA DA POLIMERASE) SEGUIDO POR SEQUENCIAMENTO R E S U L T A D O Gene Nomenclatura(BIC*) dbsnp MUTACAO BRCA1 (EXON 2) 185delAG rs BRCA1 (EXON 20) 5382insC rs

10 BRCA2 (EXON 11) 6174delT rs * BIC (Breast Information Core): National Institute of Health COMENTARIOS: VALOR DE REFERENCIA: MUTACAO NAO DETECTADA NOTA: - Os genes BRCA1 e BRCA2 foram analisados por PCR seguido de sequenciamento bidirecional dos exons 2 e 20(BRCA1)e de regiao parcial do exon 11(BRCA2). Os resultados do sequenciamento sao comparados com as sequencias referencia BRCA1:NM_ e BRCA2:NM_ Este resultado nao descarta a possibilidade de existirem outras variações geneticas localizadas fora da regiao de cobertura deste exame, em outros genes ou nao detectaveis pela tecnica utilizada. Polimorfismos raros na regiao dos primers podem ocasionar falha da amplificacao de um alelo. - O resultado negativo para estas mutacoes nao devera ser utilizado para modificar o risco empirico relativo de desenvolvimento de tumor de ovário e/ou mama obtido a partir de historia familiar. MOTIVO: Adequação do prestador de serviço que executa o exame. 10