Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO
|
|
- Davi Caires Madeira
- 8 Há anos
- Visualizações:
Transcrição
1 Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática Professores: Luciano Maia Antonio Costa de Oliveira
2 Introdução Parte 2
3 Introdução
4 Competências gerais da Bioinformática Há dois tipos básicos de problemas onde atuam usuários da bioinformática. 1) TÉCNOLOGIA - problema biotecnológico -computação/estatística -montagem de trechos de DNA...seqüenciamento 2) NÃO TECNOLOGICO - natureza da biologia molecular -que informação está contida nos genomas.primeiro muitos genes cada gene tem várias formas.segundo interações entre os genes muitas interações entre muitas formas de muitos genes cross-talk A interpretação destas interações requer métodos e técnicas (algoritmos - ciência da computação) orientados por conceitos da estatística, genética, bioquímica e fisiologia
5 1) TÉCNOLOGIA - problema biotecnológico Bioinformática: Seqüenciamento... Manutenção e gerenciamento das informações geradas durante o seqüenciamento Qualidade das seqüências Armazenamento das seqüências Alinhamento/Montagem Etc...
6 2) NÃO TECNOLOGICO - natureza da biologia molecular Bioinformática: Pós seqüenciamento... Programas de seqüenciamento geram um grande volume de dados Esses dados precisam agora ser analisados Análise laboratorial é difícil e cara estudos in silico são necessários para a análise dos dados obtidos BANCOS DE DADOS GENOMA/TRANSCRIPTOMA PROTEOMA PROBLEMA PERGUNTA BIOLOGICA bioinformática EXPERIMENTO Testes BIOLOGIA MOLECULAR RESPOSTA Modelos BIOLÓGICOS (BIOQUIMICA/GENÉTICA)
7 Introdução BIOINFORMÁTICA Diferentes omicas X diferentes ferramentas
8 Diferentes pesquisas vs Diferentes abordagens Montagem de fragmentos Predição de genes Anotação de genomas Reconstrução de árvores filogenéticas Análise de dados de expressão gênica Previsão de estruturas de proteínas Análise de interação entre genes Estudo do sistema de transdução de sinais Kinases - Fatores de Transcrição (trans-) - promotores (cis-)
9 1) Aplicação: GENOMA Tratamento inicial de seqüências base-calling / trimming / assembly
10 Grande Escala: :: Base-caller PHRED :: Vector sequence masking Cross-Match :: Assembler PHRAP, CAP3, TIGR Assembler :: Visualizadores CONSED, AutoFinish :: Depósitos DataBase Tratamento refinado: :: VectorNTI
11
12
13 ASSEMBLY
14 2) Aplicação: GENOMA Predição de genes / anotação
15 PREDIÇÃO DE GENES - VISÃO GERAL ACGGTTAA...GCCTTAA QUAIS GENES ESTÃO AQUI?? NÚMERO DE INTRONs NÚMERTO DE EXOs NÚMERO DE UTRs NÚMERO DE CDSs
16 PREDIÇÃO DE GENES - VISÃO GERAL gene
17 PREDIÇÃO DE GENES - VISÃO GERAL
18 ANOTAÇÃO DE GENOMAS - VISÃO GERAL
19 2) Aplicação: TRANSCRIPTOMA base-calling / trimming / assembly Predição de genes / anotação
20 Biblioteca EST Redundant sequence Assembly CAP3/phrap
21 Assembly CAP3/phrap >contig1 >contig2 >contig3 >contig4 >singlet1 >singlet2 >singlet3 >contig5 >contig6 >contig7 Uniques non-redundant sequence
22 CONTIG/CLUSTER de EST >contig1
23 non-redundant EST >singlet1 >singlet2 >singlet3 >contig1 >contig2 >contig3 >contig4 ANOTAÇÃO Annotation >contig5 >contig6 >contig7 Process Function Component GO: protein import GO: ATP binding GO: membrane Pathway estrutura Domínio/função
24 3) Aplicação: Genomica estrutural e comparativa
25
26 Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome MIT, Harvard, Cambridge- Nature 437, 69-87,Sep 2005.
27 Schwartz et ali, Human Mouse Alignments with BLASTZ Genome Research, Vol 13, Issue 1, , January 2003
28 ORTÓLOGOS / PARÁLOGOS
29 Do Plants Have a One-Way Ticket to Genomic Obesity? L S Waxy Ligule-less Rice Foxtail millet Sorghum Pearl millet Maize Triticeae L Shattering L S 5pt 2pt S S S L 2p t Photoperiod sensitivity L 2pt 3 L 3 10pt B B 10pt L T T S S B 1pt 3pt B 2pt L S 8pt 4pt B T S 5pt 7pt S B T I B B S B 6 T 7pt T T G B T B B 5pt 1pt T T IIIpt VII Fpt T S L 6p t V L S L T T 8pt 12 4 IIpt 7pt 2pt 1pt B S S 1 7 S L 7pt E Fpt IIIpt L B T T L S 9pt IIpt SL B T T S 2pt 11 IV VIII J H S L L 8 2 L S 1pt 6p t 9pt 5pt B T pt 7pt VI I T B B S S L S B B 4pt 5p t A IXp t L S IXpt T D B T T T B 4pt T 3p t B Cp t B Cp t B 2pt 5pt L 1p t 5pt 4 T B 9p t B 2pt 2pt L T 5p t 6 7pt L 5p t 1p t S S 1p t L L 4 5pt L 1pt S S L 1. 2 GA-ins dwarfing
30 4) aplicação: Ontologia Promotores/Cis-elementos Metabolismo
31
32
33
34 5) aplicação: Cristalográfia / Proteômica Bioinformática estrutural (# de genômica estrutural)
35 CRISTALOGRAFIA desvendar as estruturas 3D
36 6) aplicação: MINERAÇÃO DE DADOS utilização de informações disponíveis data mining
37 USO DA BIOINFORMATICA PARA PROSPECÇÃO DE MARCADORES marcadores moleculares anônimos/randomicos -RFLP, AFLP, RAPD, SSRS -idéia é associar variações em regioes anonimas do genoma (genótipo) com as variações do fenótipo genes candidatos -idéia é associar variações alélicas em genes candidatos com variações do fenótipo -idéia tornou-se palpável a partir do desenvolvimento da Genômica
38 Genes candidatos! O que são? Encontrar uma rota e buscar todos os diferentes transcritos da rota num banco de dados Dormência, Viviparidade, Estresse biótico e abiótico
39 Genes candidatos! O que são?? PLANTA MODELO / MODELO GENÉTICO
40 Anotação estrutural on-line de genes
41 Anotação estrutural on-line de genes
42 >meu_gene GAATTCCGGTCGGGGTTCGCCCGGCGCAGTTGTTGAGAGGCAAGGCAAACTCAGGCGACTGAGCTAAAGA AGCCGCACTAGTATGGGGGTGACGAAGGCGGAGGCGGTTGCCGCGACGGGGAAGGTGGTGGACGACATCG AGGCGCTCGCCGATCTCAGAAAGGAGCCAGCATGGAAAAAGTTTTTGTCCCACATTGGACCAGGCTTTAT GGTCTGTTTGGCTTACCTCGATCCTGGAAATATGGAGACTGATCTACAAGCTGGTGCCAATCACAAATAT GAGCTTCTTTGGGTGATTTTGATTGGCCTGATCTTTGCACTGATTATACAATCATTATCGGCTAATCTTG GAGTGGTGACAGGGCGCCATCTTGCTGAGCTGTGCAAGACTGAATATCCAGTATGGGTGAAAACCTGCTT ATGGCTGCTAGCAGAACTAGCTGTGATTGCTTCCGATATTCCAGAAGTTATAGGTACAGGATTTGCTTTC AACCTTTTGTTCCACATACCAGTGTGGACCGGGGTTCTCATTGCTGGCTCTAGCACGCTTCTTCTTCTTG GACTGCAAAGATATGGGGTAAGGAAACTGGAGGTTGTGGTCGCGCTATTGGTGTTTGTCATGGCAGGGTG CTTCTTCGTGGAGATGAGCATAGTCAAGCCTCCGGTTAATGAGGTCCTTCAAGGATTATTCATCCCCAGG CTCAGTGGGCCCGGTGCCACAGGAGACTCCATTGCCCTTCTTGGGGCTCTTGTAATGCCGCACAATCTAT TCTTGCACTCTGCCCTGGTGCTGTCGAGGAATACACCCGCATCAGCAAAAGGAATGAAGGATGCCTGTAG GTTCTTCCTCTTTGAGAGTGGGATAGCTCTTTTCGTGGCTCTGCTTGTCAACATTGCAATCATCTCTGTC TCCGGCACTGTATGTAATGCAACCAACCTTTCACCAGAAGATGCTGTAAAATGCAGCGACCTTACATTGG Primers Marcador molecular Validação Transformação MAPEAMENTO SELEÇÃO ASSISTIDA GANHO GENÉTICO TRANSGENIA
43 TUDO ESTA PRONTO?! 7) Demandas especificas de cada grupo
44 EXEMPLO 1: Problema de saúde a resolver: Predição de classes de doenças Muitas doenças podem ser distinguidas de forma confiável por meio de técnicas tradicionais Muitas doenças não podem ser distinguidas de forma confiável por meio de técnicas tradicionais Diagnóstico de tecidos cancerosos e normais Classificação de tipos conhecidos e diferentes de cânceres Vários tumores diferentes têm a mesma aparência em exames histológicos (mas são diferentes genes!!) Diagnóstico é fundamental para o sucesso do tratamento PROBLEMA: Predição da função biológica de genes associados ao cancer
45 EXEMPLO 1: Problema de saúde a resolver: Microarray de cdna com 6567 genes 63 exemplos como treinamento Material da biopsia de tumores Fold cross-validation 3750 redes neurais já construídas Predição de classes de doenças Dado: um conjunto de experimentos de microarray Faça: um modelo que possa classificar de maneira precisa a existência de uma nova categoria da doença. SOLUÇÃO:????????????!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
46 Onde buscar
47
48 Em resumo... genética bioquímica ESTATISTICA BIOLOGIA fisiologia Etc... BIOINFORMÁTICA Etc... COMPUTAÇÃO BIOTECNOLOGIA
49 ???!!!
50
Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO
Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática Professores: Luciano Maia Antonio
Leia maisUso do calcário no solo Desenvolvimento de pesticidas e fertilizantes. Máquinas a vapor substituindo a força animal
Fepagro em foco Samuel Mazzinghy Alvarenga Histórico recente da Agropecuária Era científica: a partir de ~ 1.700 Rotação de culturas e métodos de cultivo intensivo Drenagem Utilização de arado, máquinas
Leia maisDNA barcoding é um método que utiliza um trecho do DNA de cerca de 650 nucleotídeos como marcador para caracterizar espécies. Trata-se de uma sequência extremamente curta em relação à totalidade do genoma,
Leia maisAnotação de Genomas. Fabiana G. S. Pinto
Anotação de Genomas Fabiana G. S. Pinto Obtenção de Seqüências geradas pelo MegaBace 1000 Dados brutos (medidas analógicas) de saída do seqüênciamento Base calling BIOINFORMÁTICA * PHRED: - Transforma
Leia maisANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs
ANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs João Meidanis Scylla Bioinformática e UNICAMP III Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas Gramado, RS Maio 2005 MINI-CURSO - AGENDA 1. Primeiro Dia
Leia maisIntrodução ao SRS Sequence Retrieval System. Marcelo Falsarella Carazzolle
Introdução ao SRS Sequence Retrieval System Marcelo Falsarella Carazzolle Resumo Motivação Introdução Bancos de Dados Ferramentas de bioinformática SRS Exemplos Motivação Existem muitos bancos de dados
Leia maisBIOLOGIA MOLECULAR APLICADA AO ESTUDO DE DOENÇAS
! Universidade Federal de Pernambuco Centro de Ciências da Saúde Departamento de Patologia Laboratório de Imunopatologia Keizo Asami Prof. Dr. Lucas Brandão BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA AO ESTUDO DE DOENÇAS
Leia maisBioinformática. Licenciaturas em Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Ciências Biomédicas, Engenharia Biológica. João Varela jvarela@ualg.
Bioinformática Licenciaturas em Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Ciências Biomédicas, Engenharia Biológica João Varela jvarela@ualg.pt Docentes Paulo Martel (alinhamentos, pesquisas de sequências em
Leia maisANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs
ANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs João Meidanis Scylla Bioinformática e UNICAMP III Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas Gramado, RS Maio 2005 MINI-CURSO - AGENDA 1. Primeiro Dia
Leia maisAnálise de Dados de Expressão Gênica
Análise de Dados de Expressão Gênica Ivan G. Costa Filho igcf@cin.ufpe.br Centro de Informática Universidade Federal de Pernambuco Tópicos O que e expressão gênica? Como medir expressão gênica? Aspectos
Leia maisIntrodução à Bioinformática. Prof. IVAné@
Introdução à Bioinformática Prof. IVAné@ Bioinformática União da ciência da computação com a biologia molecular É uma área nova Há 10 anos atrás o termo nem existia Depois da descoberta de Watson e Crick
Leia maisBiologia Avançada Jatropha curcas L.
1 Pesquisadores: Hugo Bruno C. Molinari Betania F. Quirino Biologia Avançada Jatropha curcas L. Maior banco de informações moleculares em todo o mundo Gerar ferramentas para subsidiar programa de Melhoramento
Leia maisResumos do 56º Congresso Nacional de Botânica.
Genômica Florestal: Oportunidades e Desafios DARIO GRATTAPAGLIA - EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA/UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA dario@cenargen.embrapa.br Introdução Plantações florestais
Leia maisDesenvolvimento de uma Ferramenta. Cromatogramas
Desenvolvimento de uma Ferramenta Web para análise automática tica de Cromatogramas Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto USP Lariza Laura
Leia maisCURSO DE TECNOLOGIA EM BIOTECNOLOGIA
CURSO DE TECNOLOGIA EM BIOTECNOLOGIA Departamento de Biotecnologia, Genética e Biologia Celular Centro de Ciências Biológicas Universidade Estadual de Maringá Coordenador: Prof. Dr. João Alencar Pamphile
Leia maisSequenciamento de genomas
Sequenciamento de genomas 1 o genoma completo vírus OX174 5.000 nt (Sanger et al. 1977) em 1977 1000 pb sequenciados por ano neste ritmo genoma E. coli K-12 4.6-Mbp levaria mais de 1000 anos para ser completo
Leia maisACESSO VESTIBULAR QUESTÕES DE PROCESSAMENTO DE RNA OU SPLICING 01. (MAMA 2007.1) PÁGINAS OCULTAS NO LIVRO DA VIDA
ACESSO VESTIBULAR QUESTÕES DE PROCESSAMENTO DE RNA OU SPLICING 01. (MAMA 2007.1) PÁGINAS OCULTAS NO LIVRO DA VIDA Os biólogos supunham que apenas as proteínas regulassem os genes dos seres humanos e dos
Leia maisBioinformática. Trabalho prático enunciado complementar. Notas complementares ao 1º enunciado
Bioinformática Trabalho prático enunciado complementar Neste texto, enunciam- se algumas considerações adicionais ao 1º enunciado e uma lista de possíveis tarefas que complementam o enunciado original
Leia maisAnálise de expressão gênica
Universidade Federal do Espírito Santo Laboratório de Biotecnologia Aplicado ao Agronegócio Análise de expressão gênica Fernanda Bravim EXPRESSÃO GÊNICA Processo pelo qual a informação contida em um gene
Leia maisProjeto Genoma e Proteoma
Projeto Genoma e Proteoma Grupo 3: *Artur S. Nascimento *Bárbara S. Costa *Beatrice Barbosa *Tamyres S. E. Guimarães *Yara Cavalcante O que é genoma? O genoma é o conjunto de todo o material genético que
Leia maisSTATGEN Plataforma web para análise de dados genéticos.
STATGEN Plataforma web para análise de dados genéticos. Diogo Gonçalves Neder 1 1 Introdução O melhoramento de plantas visa principalmente identificar combinações genotípicas com performance superior quando
Leia maisIntrodução à Bioinformática
Introdução à Bioinformática Sónia Andrade setembro/2012 ESALq - USP 1 O que é bioinformática... é a pesquisa, desenvolvimento e aplicação de ferramentas e abordagens computacionais que permitem o uso de
Leia maisDezembro - 2006. Bioinformática. e Anotação. Eduardo Fernandes Formighieri Laboratório de Genômica e Expressão / UNICAMP
Dezembro - 2006 Bioinformática e Anotação Eduardo Fernandes Formighieri Laboratório de Genômica e Expressão / UNICAMP Hoje 1. Introdução à Genômica 2. Introdução à Bioinformática 3. Introdução à Anotação
Leia maisUniversidade Estadual de Londrina (Reconhecida pelo Decreto Federal n. 69.324 de 07/10/71)
DELIBERAÇÃO Câmara de Pós-Graduação Nº 32/2012 Reestrutura o Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, em nível de Mestrado e Doutorado. CONSIDERANDO a solicitação da Comissão Coordenadora
Leia maisRachel Siqueira de Queiroz Simões, Ph.D rachelsqsimoes@gmail.com rachel.simoes@ioc.fiocruz.br
Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro Centro de Ciências Biológicas e da Saúde Casa da Medicina Unidade Gávea Coordenação Central de Extensão EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR Rachel Siqueira de Queiroz
Leia maisRNA: transcrição e processamento
Universidade Federal do Piauí Centro de Ciências Agrárias Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento Núcleo de Estudos em Genética e Melhoramento Bases Moleculares da Hereditariedade RNA: transcrição
Leia maisA função básica do ciclo celular das células somáticas é duplicar todo o conteúdo de DNA...
Atividade extra Fascículo 4 Biologia Unidade 9 Questão 1 A função básica do ciclo celular das células somáticas é duplicar todo o conteúdo de DNA. O processo de divisão celular é composto por cinco etapas:
Leia mais4. Que tipos de padrões podem ser minerados. 5. Critérios de classificação de sistemas de Data Mining. 6. Tópicos importantes de estudo em Data Mining
Curso de Data Mining - Aula 1 1. Como surgiu 2. O que é 3. Em que tipo de dados pode ser aplicado 4. Que tipos de padrões podem ser minerados 5. Critérios de classificação de sistemas de Data Mining 6.
Leia maisUnidade IV Tecnologia Aula 21.2 Conteúdo: Genética e sociedade
A A Unidade IV Tecnologia Aula 21.2 Conteúdo: Genética e sociedade 2 A A Habilidade: Conhecer sobre células- troncos, projeto genoma e engenharia genética. 3 A A Células-tronco Autorrenovação e diferenciação
Leia maisBioinformática Histórico e conceitos básicos
Bioinformática Histórico e conceitos básicos Raimundo Lima da S. Júnior M.Sc. Departamento de Biologia Núcleo de Pesquisas Replicon PUC-GO Silva Jr., RL Casamento entre a ciência da computação e a biologia
Leia maisExemplo de Aplicação do DataMinig
Exemplo de Aplicação do DataMinig Felipe E. Barletta Mendes 19 de fevereiro de 2008 INTRODUÇÃO AO DATA MINING A mineração de dados (Data Mining) está inserida em um processo maior denominado Descoberta
Leia maisBioinformática Aula 01
Bioinformática Aula 01 Prof. Ricardo Martins Ramos * * Doutorando em Genética e Toxicologia Aplicada CEFET-PI/ULBRA-RS Linha de Pesquisa Bioinformática Estrutural E-mail: ricardo@cefetpi.br Visão Holística
Leia maisDesenvolvimento de uma Ferramenta Web para análise automática de Cromatogramas
Desenvolvimento de uma Ferramenta Web para análise automática de Cromatogramas Lariza Laura de Oliveira, Gisele Helena Barboni Miranda, Kelly Christiane Ynoue, Vitor Soares Pereira, Fernando Sequeira Sousa,
Leia maisFUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DE RONDÔNIA - UNIR NÚCLEO DE CIÊNCIAS E TECNOLOGIA - NCT DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA. Carga Horária: 100 horas/aula
FUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DE RONDÔNIA - UNIR NÚCLEO DE CIÊNCIAS E TECNOLOGIA - NCT DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA Código: CBIGEBA Créditos: 05 Período: 3 o (terceiro período) Disciplina: Genética Básica
Leia maisPesquisador em Saúde Pública Prova Discursiva INSTRUÇÕES
Bioinformática Pesquisador em Saúde Pública Prova Discursiva 1. Você recebeu do fiscal o seguinte material: INSTRUÇÕES a) Este Caderno de Questões contendo o enunciado das 2 (duas) questões da prova discursiva.
Leia maisCONHECIMENTOS ESPECÍFICOS
Acerca da bioinformática em geral, julgue os itens subsequentes. 41 A bioinformática pode ser definida como uma área multidisciplinar que envolve principalmente a Biologia, a Ciência da Computação, a Matemática
Leia maisALP Algoritmos e Programação. . Linguagens para Computadores
ALP Algoritmos e Programação Iniciação aos computadores. Linguagens para Computadores. Compiladores, Interpretadores. Ambientes de Programação 1 Linguagens para Computadores. Linguagem binária: Dispositivos
Leia maisPrograma Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática - Universidade de São Paulo
*Tópicos e Bibliografia da Prova de Seleção em Bioinformática Área: Biológicas 1 Estrutura e Função de ácidos nucleicos 1.1 Fluxo da Informação genética 1.2 Blocos estruturais do DNA e RNA 1.3 Níveis de
Leia mais1156 Pesquisa e Desenvolvimento para a Competitividade e Sustentabilidade do Agronegócio
Programa úmero de Ações 8 1156 Pesquisa e Desenvolvimento para a Competitividade e Sustentabilidade do Agronegócio Objetivo Indicador(es) Incrementar a base de conhecimentos científicos e tecnológicos
Leia maisPROSPECÇÃO DE GENES REGULATÓRIOS E ESTRUTURAIS DE BOTÃO FLORAL DE ALGODOEIRO MORGANNA POLLYNNE N. PINHEIRO
UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco Programa de Pós Graduação em Melhoramento Genético de Plantas PROSPECÇÃO DE GENES REGULATÓRIOS E ESTRUTURAIS DE BOTÃO FLORAL DE ALGODOEIRO MORGANNA POLLYNNE
Leia maisCOMPUTAÇÃO GRÁFICA REPRESENTAÇÃO DE IMAGENS
COMPUTAÇÃO GRÁFICA REPRESENTAÇÃO DE IMAGENS Curso: Tecnológico em Análise e Desenvolvimento de Sistemas Disciplina: COMPUTAÇÃO GRÁFICA 4º Semestre Prof. AFONSO MADEIRA ARQUITETURA GRÁFICA Frame-buffer
Leia maisPUCRS CURSO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Genética I AULA PRÁTICA APLICAÇÕES DAS TÉCNICAS DE PCR E ELETROFORESE DE DNA
Analise a seguinte situação hipotética (1): Uma equipe de pesquisadores está realizando um inventário da biodiversidade de uma área tropical ainda inexplorada, porém já sofrendo grande impacto de fragmentação
Leia maisAvaliação molecular da macho-esterilidade citoplasmática em milho
Jornal Eletrônico da Embrapa Milho e Sorgo (Sete Lagoas-MG) Ano 04 - Edição 26 - Agosto / Setembro de 2010 Artigo Avaliação molecular da macho-esterilidade citoplasmática em milho por Sílvia Neto Jardim
Leia maisCOLIVRE Cooperativa de Tecnologias Livres www.colivre.coop.br contato@colivre.coop.br Telefone: (71) 3011-2199 CNPJ: 07.970.
Razões para usar Noosfero como plataforma de rede social da USP COLIVRE Cooperativa de Tecnologias Livres www.colivre.coop.br contato@colivre.coop.br Telefone: (71) 3011-2199 CNPJ: 07.970.746/0001-77 Contato:
Leia mais1. Conhecimento e compreensão de dados, conceitos, modelos e teorias; 3. Mobilização e utilização de dados, conceitos, modelos e teorias;
INFORMAÇÃO PROVA DE EQUIVALÊNCIA À FREQUÊNCIA BIOLOGIA Março de 2015 Prova 302 2015 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Leia maisUniversidade Federal de São Paulo Campus São José dos Campos LISTA DE DISCIPLINAS DA GRADUAÇÃO
A B C Álgebra Linear Álgebra Linear Computacional Álgebra Linear II Algoritmos e Estrutura de Dados I Algoritmos e Estrutura de Dados II Algoritmos em Bioinformática Alteridade e Diversidade no Brasil
Leia maisPlanejamento Estratégico de TI. Prof.: Fernando Ascani
Planejamento Estratégico de TI Prof.: Fernando Ascani Data Warehouse - Conceitos Hoje em dia uma organização precisa utilizar toda informação disponível para criar e manter vantagem competitiva. Sai na
Leia maisINFORMAÇÃO - PROVA DE EQUIVALÊNCIA À FREQUÊNCIA DO ENSINO SECUNDÁRIO - 2015
Prova de Biologia Prova 302 1. INTRODUÇÃO O presente documento visa divulgar as características da prova de equivalência à frequência do ensino secundário, a realizar em 2015 pelos alunos que se encontram
Leia maisOrganização do Material Genético nos Procariontes e Eucariontes
Organização do Material Genético nos Procariontes e Eucariontes Organização do Material Genético nos Procariontes e Eucariontes Procariontes Eucariontes Localização Organização Forma Disperso no citoplasma
Leia maisDadas a base e a altura de um triangulo, determinar sua área.
Disciplina Lógica de Programação Visual Ana Rita Dutra dos Santos Especialista em Novas Tecnologias aplicadas a Educação Mestranda em Informática aplicada a Educação ana.santos@qi.edu.br Conceitos Preliminares
Leia maisIdentificar as mudanças que acontecem na forma e no uso de apoio à decisão em empreendimentos de e-business. Identificar o papel e alternativas de
1 Identificar as mudanças que acontecem na forma e no uso de apoio à decisão em empreendimentos de e-business. Identificar o papel e alternativas de relatórios dos sistemas de informação gerencial. Descrever
Leia maisPrograma de Pós-Graduação em Sistemas de Informação (PPgSI)
Programa de Pós-Graduação em Sistemas de Informação () Escola de Artes, Ciências e Humanidades Universidade de São Paulo Universidade de São Paulo -Brasil Universidade de São Paulo -Brasil UniversityofSão
Leia maisUNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA BIOINFORMÁTICA ESTRUTURAL: PREDIÇÃO DE ESTRUTURA 3D DE PROTEÍNAS
UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA BIOINFORMÁTICA ESTRUTURAL: PREDIÇÃO DE ESTRUTURA 3D DE PROTEÍNAS 2 BIOINFORMÁTICA ESTRUTURAL Área da bioinformática que se aplica ao estudo da estrutura das moléculas Desafio
Leia maisExplorando bancos de dados genômicos e introdução à bioinformática. Guilherme Targino Valente Marcos Tadeu Geraldo. Bioinformática
Explorando bancos de dados genômicos e introdução à bioinformática Guilherme Targino Valente Marcos Tadeu Geraldo 22/07/2011 Bioinformática É a aplicação de estatística e ciência da computação no campo
Leia maisConstrução de Bibliotecas de cdna
Construção de Bibliotecas de cdna Claudia Teixeira Guimarães Antônio A.C. Purcino Eliane A. Gomes Jurandir V. Magalhães Newton P. Carneiro Elto E.G. Gama Robert E. Schaffert Sidney N. Parentoni Vera M.C.
Leia maisAnálise de técnicas de selecção de atributos em Bioinformática
Análise de técnicas de selecção de atributos em Bioinformática Rui Mendes 100378011 Bioinformática 10/11 DCC Artigo Base Yvan Saeys, Inaki Inza and Pedro Larranaga. A review of feature selection techniques
Leia maisPCR technology for screening and quantification of genetically modified organisms (GMOs)
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências do Mar e do Ambiente Curso de Licenciatura em Biologia Marinha e Pescas PCR technology for screening and quantification of genetically modified organisms (GMOs)
Leia maisEscola Secundária de Camões
Escola Secundária de Camões INFORMAÇÃO - PROVA DE EQUIVALÊNCIA À FREQUÊNCIA BIOLOGIA Código 302 Curso Científico-Humanístico de Ciências e Tecnologias- 12ºano Duração da prova escrita: 90 min Duração da
Leia maisPLANEJAMENTO ANUAL / TRIMESTRAL 2014 Conteúdos Habilidades Avaliação
COLÉGIO LA SALLE BRASÍLIA SGAS Q. 906 Conj. E C.P. 320 Fone: (061) 3443-7878 CEP: 70390-060 - BRASÍLIA - DISTRITO FEDERAL Disciplina: Biologia Trimestre: 1º Professor(a): Camilla Silva (B1) e Elisangela
Leia mais5 Resultados. 5.1. Avaliação Baseada na Taxa de Igual Erro
5 Resultados Neste capitulo discutem-se os resultados obtidos no desenvolvimento desta pesquisa segundo a metodologia descrita no capitulo anterior. A avaliação de acurácia para tarefas de verificação
Leia maisGenética I: Mendel, Mitose e Meiose
Página 1 de 6 Genética I: Mendel, Mitose e Meiose Uma forma de estudar a função biológica é pegar um organismo/célula e dividi-lo em componentes, como as proteínas, e então estudar os componentes individuais.
Leia maisHerança Quantitativa
UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ - UFPI CENTRO DE CIÊNCIAS AGRARIAS - CCA PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO NÚCLEO DE ESTUDOS EM GENÉTICA E MELHORAMENTO Herança Quantitativa MÁRIO HENRIQUE INTRODUÇÃO
Leia maisUNIFESP Virtual - DIS
UNIFESP Virtual - DIS UNIFESP Virtual Avaliação 2003 http://www.virtual.unifesp.br Com o crescimento explosivo da Internet, da comunicação e do reconhecimento do potencial da rede em atuar na globalização
Leia maisEDITAL 002/2012: SELEÇÃO DE CANDIDATOS AO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOQUÍMICA MESTRADO
Universidade Federal do Ceará Centro de Ciências Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular Programa de Pós-Graduação em Bioquímica Campus do Pici Bloco 907 Telefone +5585 3366 9783 FAX +5585 3366
Leia maisEntendendo a herança genética (capítulo 5) Ana Paula Souto 2012
Entendendo a herança genética (capítulo 5) Ana Paula Souto 2012 CÂNCER 1) O que é? 2) Como surge? CÂNCER 1) O que é? É o nome dado a um conjunto de mais de 100 doenças que têm em comum o crescimento desordenado
Leia maisANEXO III. Domínios e áreas científicas
ANEXO III Domínios e áreas científicas Ciências da Vida e da Saúde Neurociências - Molecular e Celular Neurociências, Envelhecimento e Doenças Degenerativas Imunologia e Infeção Diagnóstico, Terapêutica
Leia maisUniversidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO
Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática Professores: Luciano Maia Antonio
Leia maisPROGRAMA TEÓRICO. 2. O Dogma Central da Biologia Molecular
PROGRAMA TEÓRICO 1. As moléculas da Biologia Molecular: DNA, RNA e proteínas Aspectos particulares da composição e estrutura do DNA, RNA e proteínas. EG- Características bioquímicas dos ácidos nucleicos,
Leia maisPesquisador em Saúde Pública Prova Discursiva INSTRUÇÕES
Biologia computacional Pesquisador em Saúde Pública Prova Discursiva 1. Você recebeu do fiscal o seguinte material: INSTRUÇÕES a) Este Caderno de Questões contendo o enunciado das 2 (duas) questões da
Leia maisAncestralidade Materna polimorfismos matrilínea DNA Mitocondrial (mtdna).
Ancestralidade Materna A atual população dos países latino-americanos foi gerada por um complexo processo de mistura genética entre ameríndios, europeus e africanos. As porcentagens relativas destas três
Leia maisGerenciamento de Workflows Científicos em Bioinformática
Gerenciamento de Workflows Científicos em Bioinformática Agosto de 2007 Estudante: Orientador: Co-orientadora: Luciano Antonio Digiampietri João Carlos Setubal Claudia Bauzer Medeiros Roteiro Introdução
Leia mais17/10/2012. dados? Processo. Doutorado em Engenharia de Produção Michel J. Anzanello. Doutorado EP - 2. Doutorado EP - 3.
Definição de Data Mining (DM) Mineração de Dados (Data Mining) Doutorado em Engenharia de Produção Michel J. Anzanello Processo de explorar grandes quantidades de dados à procura de padrões consistentes
Leia maisGenômica. O que chamou mais atenção no filme?
Genômica O que chamou mais atenção no filme? Tempo para sequenciamento do genoma Predição do fenótipo com base no genótipo Como este conhecimento pode ser usado para gerar novas tecnologias? Sequenciamento
Leia maisUNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO DEPARTAMENTO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA - DCT. CURSO: BCT (Disciplinas Obrigatórias)
UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO DEPARTAMENTO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA - DCT CURSO: BCT (Disciplinas Obrigatórias) Cálculo em Várias Variáveis FUV ou Calculo I Algoritmos e Estrutura de Dados Lógica de
Leia maisPALAVRAS-CHAVE: Massas Nodulares, Classificação de Padrões, Redes Multi- Layer Perceptron.
1024 UMA ABORDAGEM BASEADA EM REDES PERCEPTRON MULTICAMADAS PARA A CLASSIFICAÇÃO DE MASSAS NODULARES EM IMAGENS MAMOGRÁFICAS Luan de Oliveira Moreira¹; Matheus Giovanni Pires² 1. Bolsista PROBIC, Graduando
Leia maisO que são domínios protéicos
Domínios protéicos O que são domínios protéicos Domínios protéicos é uma parte da cadeia polipeptídica que pode de enovelar independentemente para formar uma estrutura compacta e estável A existência de
Leia maisIntrodução à genética quantitativa usando os recursos do R
Introdução à genética quantitativa usando os recursos do R Marisa R. Cantarino 1 Julia M. P. Soler (orientadora) 2 1 Introdução Um dos principais desafios da pesquisa genética atualmente é estabelecer
Leia maisTranscritômica. João Carlos Setubal IQ/USP outubro de 2013
Transcritômica João Carlos Setubal IQ/USP outubro de 2013 Objetivo Obter, analisar, e interpretar dados de expressão gênica mrnas (que vão virar proteína) RNAs (que não vão virar proteína; ncrnas) O gene
Leia maisSimulação Computacional de Sistemas, ou simplesmente Simulação
Simulação Computacional de Sistemas, ou simplesmente Simulação Utilização de métodos matemáticos & estatísticos em programas computacionais visando imitar o comportamento de algum processo do mundo real.
Leia maisSistema Web para Projeto de PCR
Sistema Web para Projeto de PCR Abstract. This paper describes a web system that help the work of molecular biologists, automatizating the steps necessary for preparing a PCR experiment. This system will
Leia maisSequenciamento de DNA
Sequenciamento de DNA Figure 8-50a Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Método de Sanger Reação de síntese de DNA por uma DNA polimerase A incorporação de um dideoxinucleotídeo interrompe
Leia maisINTELIGÊNCIA COMPUTACIONAL
INTELIGÊNCIA COMPUTACIONAL Engenharia de Computação Professor: Rosalvo Ferreira de Oliveira Neto Dados pessoais Rosalvo Ferreira de Oliveira Neto MSc. em ciência da computação (UFPE) rosalvo.oliveira@univasf.edu.br
Leia maisNúcleo Celular. Biomedicina primeiro semestre de 2012 Profa. Luciana Fontanari Krause
Núcleo Celular Biomedicina primeiro semestre de 2012 Profa. Luciana Fontanari Krause Núcleo Celular Eucarioto: núcleo delimitado por membrana nuclear (carioteca) Portador dos fatores hereditários e controlador
Leia maisPós-Graduação em Engenharia Elétrica Inteligência Artificial
Pós-Graduação em Engenharia Elétrica Inteligência Artificial João Marques Salomão Rodrigo Varejão Andreão Inteligência Artificial Definição (Fonte: AAAI ): "the scientific understanding of the mechanisms
Leia maisNo mundo atual, globalizado e competitivo, as organizações têm buscado cada vez mais, meios de se destacar no mercado. Uma estratégia para o
DATABASE MARKETING No mundo atual, globalizado e competitivo, as organizações têm buscado cada vez mais, meios de se destacar no mercado. Uma estratégia para o empresário obter sucesso em seu negócio é
Leia maisA GENÉTICA SE FAZ PRESENTE NO VESTIBULAR
A GENÉTICA SE FAZ PRESENTE NO VESTIBULAR Jonice Ferreira de Macedo Nascimento - UFSC 1 RESUMO - O presente trabalho tem como intuito analisar as questões dos vestibulares realizados pela Universidade Federal
Leia maisMestrado: Uso Sustentável de Recursos Naturais em Regiões Tropicais
Mestrado: Uso Sustentável de Recursos Naturais em Regiões Tropicais Informações Gerais Nível do Curso: Mestrado Profissional (Pós-graduação stricto sensu) Área Básica: Meio Ambiente e Agrárias Área de
Leia maisAnálise genômica 2013
Curso de Férias Análise genômica 2013 08 a 11 de julho de 2013 Dr. Marcos Correa Dias (dias@ibb.unesp.br) Instituto de Biociências, UNESP, Botucatu, SP Qual a diferença? homem bactéria 1 COMPLEXIDADE MECÂNICA
Leia maisDisciplinas. Dinâmica de Potássio no solo e sua utilização nas culturas
Disciplinas Solos nos domínios morfoclimáticos do cerrado Ementa: Solos em ambientes de Cerrado. Sistema Brasileiro de Classificação do Solo. Caracterização morfológica das principais classes de solo inseridas
Leia maisGenética e Melhoramento de Plantas
Genética e Melhoramento de Plantas Marcadores moleculares e sua utilização no melhoramento Por: Augusto Peixe Introdução ao uso de Marcadores moleculares Definição Marcador molecular é todo e qualquer
Leia maisTRIAGEM METABÓLICA POR PKS E NRPS EM ACTINOBACTÉRIAS ENDOFÍTICAS DE Citrus reticulata
Quim. Nova, Vol. XY, No. 00, S1-S5, 200_ TRIAGEM METABÓLICA POR PKS E NRPS EM ACTINOBACTÉRIAS ENDOFÍTICAS DE Citrus reticulata Pedro L. R. da Cruz a, Leila R. Giarola b, Suellen da Silva Moraes a, Déborah
Leia maisMarilia de Freitas Calmon
Marilia de Freitas Calmon U N E S P UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA Campus de São José do Rio Preto INSTITUTO DE BIOCIÊNCIAS, LETRAS E CIÊNCIAS EXATAS Programa de Pós Graduação em Genética Marilia de Freitas
Leia maisO que é Bioinformática?
Bioinformática O que é Bioinformática? O que é Bioinformática? The mathematical, statistical and computing methods that aim to solve biological problems using DNA and amino acid sequences and related Information.
Leia maisPLANOS DE AULA. TEMA: Proteínas: macromoléculas com estruturas complexas e funções quase infinitas.
PLANOS DE AULA UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ UFC Professor: Isabel Cristina da Costa Souza Data: 23 /11/2015 TEMA: Proteínas: macromoléculas com estruturas complexas e funções quase infinitas. OBJETIVO
Leia maisESCOLA SECUNDÁRIA DR. SOLANO DE ABREU ABRANTES. DISCIPLINA: Biologia TURMAS : A/B/C ANO: 12º ANO LECTIVO 2010/2011 ACTIVIDADES ESTRATÉGIAS
ESCOLA SECUNDÁRIA DR. SOLANO DE ABREU ABRANTES SECUNDÁRIO DISCIPLINA: Biologia TURMAS : A/B/C ANO: 12º ANO LECTIVO 2010/2011 COMPETÊNCIAS CONTEÚDOS PROGRAMÁTICOS ACTIVIDADES ESTRATÉGIAS AULAS PREVISTAS
Leia maisPor outro lado, na avaliação citológica e tecidual, o câncer tem seis fases, conhecidas por fases biológicas do câncer, conforme se segue:
8 - O câncer também tem fases de desenvolvimento? Sim, o câncer tem fases de desenvolvimento que podem ser avaliadas de diferentes formas. Na avaliação clínica feita por médicos é possível identificar
Leia maisUniversidade Tecnológica Federal do Paraná UTFPR Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicada Disciplina de Mineração de Dados
Universidade Tecnológica Federal do Paraná UTFPR Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicada Disciplina de Mineração de Dados Prof. Celso Kaestner Poker Hand Data Set Aluno: Joyce Schaidt Versão:
Leia maisDOCUMENTO DE APOIO AO ESTUDO BIOLOGIA E GEOLOGIA 11.º
DOCUMENTO DE APOIO AO ESTUDO BIOLOGIA E GEOLOGIA 11.º Avisos 1.EstedocumentoapenasservecomoapoioparcialàsaulasdeBiologiaeGeologia11.ºano Unidade5 lecionadas na Escola Secundária Morgado Mateus(Vila Real)
Leia mais