Bioinformática. Licenciaturas em Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Ciências Biomédicas, Engenharia Biológica. João Varela
|
|
- Thiago Varejão Marques
- 8 Há anos
- Visualizações:
Transcrição
1 Bioinformática Licenciaturas em Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Ciências Biomédicas, Engenharia Biológica João Varela
2 Docentes Paulo Martel (alinhamentos, pesquisas de sequências em bases de dados, bioinformática estrutural) João Varela (bioinformática: conceitos, bases de dados, aplicações, pesquisa de ORFs e suas funções, anotação de sequências, uso da ferramenta Annothaton, intrões e exões, localização intracelular, optimização de PCR). Rita Castilho (Filogenética)
3 Competências Conceito de ORF, pesquisa de ORFs em sequências nucleotídicas (JV) Previsão da localização de genes em genomas e metagenomas (JV) Bioinformática aplicada à taxonomia molecular (JV e RC) Estimação de massa molecular de proteínas e ácidos nucleicos (JV) Alinhamentos de sequências: ferramentas e aplicações (PM e JV) Construção de árvores filogenéticas: modelos, ferramentas e aplicações (RC) Previsão da função de genes e/ou proteínas por pesquisa de domínios funcionais (JV) Previsão da estrutura de proteínas; previsão da função e compreensão dos mecanismos de acção de proteínas através da bioinformática estrutural (PM) Anotação de sequências de bases de dados via Annothaton (PM, JV, RC)
4 Avaliação - Bioinformática Exame teórico PM 40%, JV 47% e RC 13% Componente Prática - Anotação de 1 sequência metagenómica (Annotathon) não há grupos NOTA FINAL = 70% Teórica + 30% Prática Todas as aulas são obrigatórias, incluindo as teóricas, para alunos que têm a 1ª frequência à disciplina; segundo o regulamento de avaliação os alunos terão de ter 75% de assiduidade a todas as componentes.
5 Avaliação Fundamentos de Bioinformática Exame teórico PM 45%, JV 33% e RC 22% Componente Prática Exame escrito da componente prática PM 50%, JV25% e RC 25% NOTA FINAL = 70% Teórica + 30% Prática Todas as aulas são obrigatórias, incluindo as teóricas, para alunos que têm a 1ª frequência à disciplina; segundo o regulamento de avaliação os alunos terão de ter 75% de assiduidade a todas as componentes.
6 Bioinformática: Conceito Bioinformática - campo interdisciplinar da Biologia, Ciências Informáticas, Matemática e Estatística para analisar dados de sequências biológicas e genomas (genes e disposição de genes em cromossomas) e prever a estrutura e função de macromoléculas
7 Bioinformática vs. Biologia Computacional Bioinformática desenvolvimento empírico de ferramentas práticas para gestão de dados (sequências, genomas) Biologia Computacional desenvolvimento de algoritmos eficazes para resolver problemas específicos (alinhamentos de sequências) com maior ênfase na correcção e eficiência
8 Algoritmo Conjunto de instruções bem definidas para resolver um problema; quando aplicado em informática, um algoritmo pode ser transformado em um programa e este numa aplicação informática
9 Algoritmo representado por um diagrama de fluxo Início Há luz? Sim Fazer algo Não Lâmpada fundida? Sim Substituir lâmpada
10 Bioinformática: para que serve? Limitação da mente humana em armazenar e processar informação devido a: Complexidade dos genomas Nº crescente de genomas sequenciados Nº crescente de anotações estruturais, funcionais e bibliográficas
11 Como resolver esta limitação humana? Aplicações computorizadas de armazenamento de dados: bases de dados Aplicações computorizadas de processamento de dados
12 Exemplo de Bases de Dados (sequências primárias de ácidos nucleicos e proteína com anotação básica) GenBank (NCBI, EUA) EMBL Nucleotide Sequence Database (Europa) DNA Data Bank of Japan (DDBJ, Japão)
13 Tipo de dados armazenados Sequências de DNA (desoxinucleótidos) Sequências de RNA (nucleótidos) Sequências de Proteína (aminoácidos) Anotações estruturais Anotações funcionais Anotações de localização intracelular Anotações de localização genómica Anotações bibliográficas
14 Exemplo de Bases de Dados (sequências primárias de ácidos nucleicos e proteína com anotação mais complexa) Ensembl (+ BioMart) (Genomas) UniProtKB/Swiss-Prot (Proteínas)
15 Exemplo de Bases de Dados (estruturas secundárias de proteínas - domínios funcionais) InterProScan ScanProsite
16 Estrutura Secundária e Domínios Funcionais Folhas β pregueadas héliceα
17 Domínios Funcionais Anotados (Ex: InterProScan Anotações estruturais e funcionais)
18 Como funciona a bioinformática em termos práticos? 1. Recolha de amostras (laboratoriais, ambientais) 2. Isolamento de DNA (ou RNA) [por vezes opcional] 3. Amplificação de sequências de DNA (ou cdna) por PCR [opcional] 4. Sequenciação de DNA 5. Armazenamento da sequência em ficheiros informáticos 6. Tratamento bioinformático das sequências
19 Recolha de Amostras Ambientais Annothaton: Amostras de água do mar
20 Recolha de Amostras Ambientais Annothaton: Amostras de água do mar (
21 Como funciona a bioinformática em termos práticos? 1. Recolha de amostras (laboratoriais, ambientais) 2. Isolamento de DNA (ou RNA) [por vezes opcional] 3. Amplificação de sequências de DNA (ou cdna) por PCR [opcional] 4. Sequenciação 5. Armazenamento da sequência em ficheiros informáticos 6. Tratamento bioinformático das sequências
22 Como funciona a bioinformática em termos práticos? 1. Recolha de amostras (laboratoriais, ambientais) 2. Isolamento de DNA (ou RNA) [por vezes opcional] 3. Amplificação de sequências de DNA (ou cdna) por PCR [opcional] 4. Sequenciação de DNA 5. Armazenamento da sequência em ficheiros informáticos 6. Tratamento bioinformático das sequências
23 Sequenciação de DNA O Método de Sanger baseia-se no uso de desoxinucleótidos artificiais em reacções de síntese de DNA (polimerização). dntp ddntp Desoxinucleótidos vs. Didesoxinucleótidos
24 Sequenciação de DNA Os didesoxinucleótidos bloqueiam a polimerização Ex: Uso de ddttp para gerar fragmentos de diferente tamanho terminando na posição das T
25 Sequenciação de DNA
26 Como funciona a bioinformática em termos práticos? 1. Recolha de amostras (laboratoriais, ambientais) 2. Isolamento de DNA (ou RNA) [por vezes opcional] 3. Amplificação de sequências de DNA (ou cdna) por PCR [opcional] 4. Sequenciação de DNA 5. Armazenamento da sequência em ficheiros informáticos 6. Tratamento bioinformático das sequências
27 Ficheiros Bioinformáticos Ficheiros de texto Ficheiros de DNA contêm letras que representam desoxinucleótidos Ficheiros de Proteína contêm letras que correspondem a aminoácidos Podem conter também notas explicativas sobre a sequência que se denominam: ANOTAÇÕES
28 Códigos de representação de sequências nucleotídicas em ficheiros bioinformáticos
29 Códigos de representação de sequências proteicas em ficheiros bioinformáticos
30 Formato de ficheiros de sequências nucleotídicas e a.a. FASTA FASTA-PEARSON NBRF GCG PIR GenBank PHYLIP ASN.1 PAUP
31 Formato FASTA Ficheiro de texto (ASCII) com: Linha de comentário iniciada por > Sequência (nucleotídica ou proteica) Terminação da sequência por * (opcional) Exemplo: > YCZ2_Yeast protein in HMR 3 region! MKAVVIEDGKAVVKEVGP*!
32 Formato de ficheiros de sequências FASTA FASTA-PEARSON NBRF GCG PIR GenBank PHYLIP ASN.1 PAUP
33 Formato GenBank Ficheiro de texto com: Cabeçalho (header) Anotações (features) Sequência
34 Formato GenBank: Cabeçalho
35 Formato GenBank: Anotações
36 Formato GenBank: Sequência
37 Como funciona a bioinformática em termos práticos? 1. Recolha de amostras (laboratoriais, ambientais) 2. Isolamento de DNA (ou RNA) [por vezes opcional] 3. Amplificação de sequências de DNA (ou cdna) por PCR [opcional] 4. Sequenciação de DNA 5. Armazenamento da sequência em ficheiros informáticos 6. Tratamento bioinformático das sequências (anotações)
38 Tradução virtual de sequências nucleotídicas em proteicas quadro de leitura aberto (open reading frame [ORF]) Quadros de leitura (reading frames)
39 Genómica vs. Metagenómica Organismo DNA Vários organismos (comunidade) DNA Sequenciação de DNA Sequenciação aleatória de DNA Sequência do genoma de um organismo Sequência de genomas de uma comunidade de organismos
40 Preparação para a aula teórico-prática Ir ao site ANNOTHATON Leiam a página Rule Book para ver o que tem que fazer nas aulas teórico-práticas
Bioinformática. Licenciaturas em Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Engenharia Biológica. João Varela
Bioinformática Licenciaturas em Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Engenharia Biológica João Varela jvarela@ualg.pt Docentes João Varela (bioinformática: conceitos, bases de dados, aplicações, pesquisa
Leia maisAnotação de Genomas. Fabiana G. S. Pinto
Anotação de Genomas Fabiana G. S. Pinto Obtenção de Seqüências geradas pelo MegaBace 1000 Dados brutos (medidas analógicas) de saída do seqüênciamento Base calling BIOINFORMÁTICA * PHRED: - Transforma
Leia maisBioinformática Aula 01
Bioinformática Aula 01 Prof. Ricardo Martins Ramos * * Doutorando em Genética e Toxicologia Aplicada CEFET-PI/ULBRA-RS Linha de Pesquisa Bioinformática Estrutural E-mail: ricardo@cefetpi.br Visão Holística
Leia maisBioinformática. João Varela jvarela@ualg.pt. Aula T4 CURSOS EM BIOLOGIA, BIOQUÍMICA, BIOTECNOLOGIA, CIÊNCIAS BIOMÉDICAS E ENGENHARIA BIOLÓGICA
Bioinformática CURSOS EM BIOLOGIA, BIOQUÍMICA, BIOTECNOLOGIA, CIÊNCIAS BIOMÉDICAS E ENGENHARIA BIOLÓGICA João Varela jvarela@ualg.pt Aula T4 Esquema de anotação Annothaton 1. Determinar a localização das
Leia maisBioinformática. Trabalho prático enunciado complementar. Notas complementares ao 1º enunciado
Bioinformática Trabalho prático enunciado complementar Neste texto, enunciam- se algumas considerações adicionais ao 1º enunciado e uma lista de possíveis tarefas que complementam o enunciado original
Leia maisExplorando bancos de dados genômicos e introdução à bioinformática. Guilherme Targino Valente Marcos Tadeu Geraldo. Bioinformática
Explorando bancos de dados genômicos e introdução à bioinformática Guilherme Targino Valente Marcos Tadeu Geraldo 22/07/2011 Bioinformática É a aplicação de estatística e ciência da computação no campo
Leia maisReplicação Quais as funções do DNA?
Replicação Quais as funções do DNA? Aula nº 4 22/Set/08 Prof. Ana Reis Replicação O DNA é a molécula que contém a informação para todas as actividades da célula. Uma vez que as células se dividem, é necessário
Leia maisPrincípios moleculares dos processos fisiológicos
2012-04-30 UNIVERSIDADE AGOSTINHO NETO FACULDADE DE CIÊNCIAS DEI-BIOLOGIA ---------------------------------------------- Aula 5: Princípios moleculares dos processos fisiológicos (Fisiologia Vegetal, Ano
Leia maisAnálise de Dados de Expressão Gênica
Análise de Dados de Expressão Gênica Ivan G. Costa Filho igcf@cin.ufpe.br Centro de Informática Universidade Federal de Pernambuco Tópicos O que e expressão gênica? Como medir expressão gênica? Aspectos
Leia maisO surgimento da Bioinformática Banco de Dados Biológicos
Rede de Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal Programa de Pós-Graduação da Bionorte FUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DE RONDÔNIA NÚCLEO DE SAÚDE DEPARTAMENTO DE MEDICINA PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO
Leia maisEquipe de Biologia. Biologia
Aluno (a): Série: 3ª Turma: TUTORIAL 5B Ensino Médio Equipe de Biologia Data: Biologia Ácidos nucléicos Os ácidos nucléicos são moléculas gigantes (macromoléculas), formadas por unidades monoméricas menores
Leia maisDETERMINAÇÃO DA ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DE PROTEÍNAS POR DIFRAÇÃO DE RAIOS-X
DETERMINAÇÃO DA ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DE PROTEÍNAS POR DIFRAÇÃO DE RAIOS-X Disciplina: Engenharia de Proteínas Ma. Flávia Campos Freitas Vieira NÍVEIS ESTRUTURAIS DAS PROTEÍNAS Fonte: Lehninger, 2010.
Leia maisPrograma Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática - Universidade de São Paulo
*Tópicos e Bibliografia da Prova de Seleção em Bioinformática Área: Biológicas 1 Estrutura e Função de ácidos nucleicos 1.1 Fluxo da Informação genética 1.2 Blocos estruturais do DNA e RNA 1.3 Níveis de
Leia maisInformática Aplicada às Ciências Biológicas. Apresentação da Unidade Curricular 2012/13
Informática Aplicada às Ciências Biológicas Apresentação da Unidade Curricular 2012/13 Objectivos, Programa,, Bibliografia,... Paulo Fazendeiro Universidade da Beira Interior 1 Conteúdo Objectivos Programa
Leia maisHoje estudaremos a bioquímica dos ácidos nucléicos. Acompanhe!
Aula: 2 Temática: Ácidos Nucléicos Hoje estudaremos a bioquímica dos ácidos nucléicos. Acompanhe! Introdução: Os ácidos nucléicos são as moléculas com a função de armazenamento e expressão da informação
Leia maisBanco de Dados aplicado a Sistemas Biológicos
Dados Biológicos Banco de Dados aplicado a Sistemas Biológicos A internet mudou a maneira como os cientistas compartilham os dados e possibilitou que um depósito central de informações atendesse totalmente
Leia maisCONHECIMENTOS ESPECÍFICOS
Acerca da bioinformática em geral, julgue os itens subsequentes. 41 A bioinformática pode ser definida como uma área multidisciplinar que envolve principalmente a Biologia, a Ciência da Computação, a Matemática
Leia maisMiguel Rocha Dep. Informática - Universidade do Minho. BIOINFORMÁTICA: passado, presente e futuro!!
Miguel Rocha Dep. Informática - Universidade do Minho BIOINFORMÁTICA: passado, presente e futuro!! Bragança, 11 de Maio de 2006 Porquê a Bioinformática?! Novas tecnologias experimentais da Biologia Molecular
Leia maisPROGRAMA TEÓRICO. 2. O Dogma Central da Biologia Molecular
PROGRAMA TEÓRICO 1. As moléculas da Biologia Molecular: DNA, RNA e proteínas Aspectos particulares da composição e estrutura do DNA, RNA e proteínas. EG- Características bioquímicas dos ácidos nucleicos,
Leia maisCONTROLE DO METABOLISMO GENES
CONTROLE DO METABOLISMO GENES 10/06/15 1º ANO - BIOLOGIA 1 ESTRUTURA DO GENE Segmentos (pedaços) da molécula de DNA, o constituinte dos nossos cromossomos, onde estão inscritas receitas (códigos genéticos)
Leia maisCOMUNICAÇÃO DA INFORMAÇÃO NAS MOLÉCULAS DE DNA E RNA
COMUNICAÇÃO DA INFORMAÇÃO NAS MOLÉCULAS DE DNA E RNA Andréia Cristina Hypólito José 11075810 Fernando Caldas Oliveira 11085410 Giovana Zaninelli 11017210 Renato Fernandes Sartori 11061110 Rodrigo de Mello
Leia maisDOCUMENTO DE APOIO AO ESTUDO BIOLOGIA E GEOLOGIA 11.º
DOCUMENTO DE APOIO AO ESTUDO BIOLOGIA E GEOLOGIA 11.º Avisos 1.EstedocumentoapenasservecomoapoioparcialàsaulasdeBiologiaeGeologia11.ºano Unidade5 lecionadas na Escola Secundária Morgado Mateus(Vila Real)
Leia maisCURSO SUPERIOR DE TECNOLOGIA EM ESTÉTICA E COSMÉTICA Autorizado pela Portaria MEC nº 433 de 21/10/11 - DOU de 24/10/11 PLANO DE CURSO
CURSO SUPERIOR DE TECNOLOGIA EM ESTÉTICA E COSMÉTICA Autorizado pela Portaria MEC nº 433 de 21/10/11 - DOU de 24/10/11 Componente Curricular: Citologia e Histologia Código: Pré-requisito: ---- Período
Leia maisMEDICINA VETERINÁRIA. Disciplina: Genética Animal. Prof a.: Drd. Mariana de F. G. Diniz
MEDICINA VETERINÁRIA Disciplina: Genética Animal Prof a.: Drd. Mariana de F. G. Diniz Gene, é a unidade fundamental da hereditariedade. Cada gene é formado por uma sequência específica de ácidos nucléicos
Leia maisAs bactérias operárias
A U A UL LA As bactérias operárias Na Aula 47 você viu a importância da insulina no nosso corpo e, na Aula 48, aprendeu como as células de nosso organismo produzem insulina e outras proteínas. As pessoas
Leia maisMINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO FUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DO PAMPA PRO-REITORIA ACADÊMICA
DADOS DE IDENTIFICAÇÃO Campus: Uruguaiana Curso: Enfermagem Componente Curricular: Genética Humana Código: UR 1303 Pré requisito: UR 1103 Co- requisito: ---------- Professor: Michel Mansur Machado Carga
Leia maisBASES DE DADOS COM INTERESSE BIOLÓGIO
Disciplina de BIOLOGIA COMPUTACIONAL Mestrado em ENGENHARIA BIOMÉDICA 4º Ano, 1º Semestre 2007/08 BASES DE DADOS COM INTERESSE BIOLÓGIO Relatório 1 Ana Calhau Ângela Pisco Nuno Santos 54605 55748 55746
Leia maisTutorial Introdução a anotação e comparação de genomas Tiago Mendes Doutorando em Bionformática
Tutorial Introdução a anotação e comparação de genomas Tiago Mendes Doutorando em Bionformática Hoje iremos trabalhar com dois programas free desenvolvidos pelo Sanger institute: Artemis e ACT. Artemis
Leia maisPrograma de Pós-Graduação Stricto Sensu em Biologia Computacional e Sistemas. Seleção de Mestrado 2012-B
Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Biologia Computacional e Sistemas Seleção de Mestrado 2012-B INSTRUÇÕES (LEIA ATENTAMENTE ANTES DE PREENCHER A PROVA): a. Identifique sua prova unicamente com
Leia maisTécnicas de biologia molecular. da análise de genes e produtos gênicos únicos a abordagens em larga escala
Técnicas de biologia molecular da análise de genes e produtos gênicos únicos a abordagens em larga escala os mesmos genes, qual a diferença? Dogma central Localizando alvos Técnicas iniciais para evidenciar
Leia maisUso do calcário no solo Desenvolvimento de pesticidas e fertilizantes. Máquinas a vapor substituindo a força animal
Fepagro em foco Samuel Mazzinghy Alvarenga Histórico recente da Agropecuária Era científica: a partir de ~ 1.700 Rotação de culturas e métodos de cultivo intensivo Drenagem Utilização de arado, máquinas
Leia maisUNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA BIOINFORMÁTICA ESTRUTURAL: PREDIÇÃO DE ESTRUTURA 3D DE PROTEÍNAS
UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA BIOINFORMÁTICA ESTRUTURAL: PREDIÇÃO DE ESTRUTURA 3D DE PROTEÍNAS 2 BIOINFORMÁTICA ESTRUTURAL Área da bioinformática que se aplica ao estudo da estrutura das moléculas Desafio
Leia maisUniversidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO
Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática Professores: Luciano Maia Antonio
Leia maisEDITAL DO MESTRADO EM TECNOLOGIA DA INFORMAÇÃO APLICADA A BIOLOGIA COMPUTACIONAL, 1º SEMESTRE 2015.
EDITAL DO MESTRADO EM TECNOLOGIA DA INFORMAÇÃO APLICADA A BIOLOGIA COMPUTACIONAL, 1º SEMESTRE 2015. CHAMADA DE SELEÇÃO PÚBLICA de Candidatos ao Programa de Pós-Graduação Stricto sensu em Tecnologia da
Leia maisBioinformática. Conceitos Fundamentais de Biologia Molecular. Paulo Henrique Ribeiro Gabriel phrg@ufu.br
Bioinformática Conceitos Fundamentais de Biologia Molecular Paulo Henrique Ribeiro Gabriel phrg@ufu.br Faculdade de Computação Universidade Federal de Uberlândia 24 de agosto de 2015 Paulo H. R. Gabriel
Leia maisDNA barcoding é um método que utiliza um trecho do DNA de cerca de 650 nucleotídeos como marcador para caracterizar espécies. Trata-se de uma sequência extremamente curta em relação à totalidade do genoma,
Leia maisDNA A molécula da vida. Prof. Biel Série: 9º ano
DNA A molécula da vida Prof. Biel Série: 9º ano DNA FINGER-PRINTING A expressão DNA "Finger-Print" (ou Impressões Genéticas) designa uma técnica de separação de segmentos de DNA que permite a identificação
Leia maisProjeto Genoma e Proteoma
Projeto Genoma e Proteoma Grupo 3: *Artur S. Nascimento *Bárbara S. Costa *Beatrice Barbosa *Tamyres S. E. Guimarães *Yara Cavalcante O que é genoma? O genoma é o conjunto de todo o material genético que
Leia maisBANCO DE DADOS BIOLÓGICOS Aula 11
BANCO DE DADOS BIOLÓGICOS Aula 11 Estudo dirigido 1. O que fazer com uma sequência de DNA? 2. Bancos de dados públicos e internacionais: GenBank, ENA, DDBJ; 3. NCBI; EMBL; DDBJ; 4. Sequências completas
Leia maisÁcidos nucléicos. São polímeros compostos por nucleotídeos. Açúcar - pentose. Grupo fosfato. Nucleotídeo. Base nitrogenada
ÁCIDOS NUCLÉICOS Ácidos nucléicos São polímeros compostos por nucleotídeos Açúcar - pentose Nucleotídeo Grupo fosfato Base nitrogenada Composição dos Ácidos nucléicos pentoses: numeração da pentose: pentose
Leia maisÁCIDOS NUCLEÍCOS RIBOSSOMO E SÍNTESE PROTEÍCA
ÁCIDOS NUCLEÍCOS RIBOSSOMO E SÍNTESE PROTEÍCA ÁCIDOS NUCLÉICOS: Moléculas orgânicas complexas, formadas polimerização de nucleotídeos (DNA e RNA) pela Contêm a informação que determina a seqüência de aminoácidos
Leia maisNúcleo Celular. Biomedicina primeiro semestre de 2012 Profa. Luciana Fontanari Krause
Núcleo Celular Biomedicina primeiro semestre de 2012 Profa. Luciana Fontanari Krause Núcleo Celular Eucarioto: núcleo delimitado por membrana nuclear (carioteca) Portador dos fatores hereditários e controlador
Leia maisConexões entre matemática e biologia
EB-207 Matemática Biológica 1 Conexões entre matemática e biologia Prof. Rodrigo Sávio Pessoa Sumário 2 1. Introdução 2. A nanotecnologia aplicada as ciências biológicas 3. Algumas questões biológicas
Leia maisBioinformática. Tipos de Bases de Dados (BD) Principais BD Primárias. Bases de dados Não-Redundantes. 3 - Bases de dados
Tipos de Bases de Dados (BD) Bioinformática 3 - Bases de dados Primárias: sequência de ácidos nucleicos e proteínas com vários níveis de anotação Primárias compostas: combinações de várias bases de dados
Leia maisSequenciamento de DNA
Sequenciamento de DNA Figure 8-50a Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Método de Sanger Reação de síntese de DNA por uma DNA polimerase A incorporação de um dideoxinucleotídeo interrompe
Leia maisIntrodução à Bioinformática. Prof. IVAné@
Introdução à Bioinformática Prof. IVAné@ Bioinformática União da ciência da computação com a biologia molecular É uma área nova Há 10 anos atrás o termo nem existia Depois da descoberta de Watson e Crick
Leia maisO processo da Expressão Gênica
Coordenadoria de Educação e Difusão de Ciências Rua 9 de Julho, 1205 - São Carlos - São Paulo e-mail: cbme@if.sc.usp.br- Telefone: (16) 3373-9159 http://cbme.ifsc.usp.br http://cbme.usp.br O processo da
Leia maisFUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DE RONDÔNIA - UNIR NÚCLEO DE CIÊNCIAS E TECNOLOGIA - NCT DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA. Carga Horária: 100 horas/aula
FUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DE RONDÔNIA - UNIR NÚCLEO DE CIÊNCIAS E TECNOLOGIA - NCT DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA Código: CBIGEBA Créditos: 05 Período: 3 o (terceiro período) Disciplina: Genética Básica
Leia maisDezembro - 2006. Bioinformática. e Anotação. Eduardo Fernandes Formighieri Laboratório de Genômica e Expressão / UNICAMP
Dezembro - 2006 Bioinformática e Anotação Eduardo Fernandes Formighieri Laboratório de Genômica e Expressão / UNICAMP Hoje 1. Introdução à Genômica 2. Introdução à Bioinformática 3. Introdução à Anotação
Leia maisTurma de terça-feira 14 hs. Total: 31 alunos
n. alunos Turma de terça-feira 14 hs 14 Distribuição de notas 12 10 8 6 4 2 Média = 6,7 0 0 -- 2 2 -- 4 4 -- 6 6 -- 8 8 -- 10 notas 18 alunos Total: 31 alunos BANCO DE DADOS BIOLÓGICOS Aula 12 Estudo dirigido
Leia maisPCR Real-time thermal cycler Standard thermal cycler
PCR Real-time thermal cycler Standard thermal cycler Tópicos (1) Estratégias gerais de estudo de sequências de DNA específicas em populações de DNA complexas Requisitos da reacção de polimerização em cadeia
Leia maisProjeto Pedagógico do Bacharelado em Ciência da Computação. Comissão de Curso e NDE do BCC
Projeto Pedagógico do Bacharelado em Ciência da Computação Comissão de Curso e NDE do BCC Fevereiro de 2015 Situação Legal do Curso Criação: Resolução CONSU no. 43, de 04/07/2007. Autorização: Portaria
Leia maisESCOLA SECUNDÁRIA DR. SOLANO DE ABREU ABRANTES. DISCIPLINA: Biologia TURMAS : A/B/C ANO: 12º ANO LECTIVO 2010/2011 ACTIVIDADES ESTRATÉGIAS
ESCOLA SECUNDÁRIA DR. SOLANO DE ABREU ABRANTES SECUNDÁRIO DISCIPLINA: Biologia TURMAS : A/B/C ANO: 12º ANO LECTIVO 2010/2011 COMPETÊNCIAS CONTEÚDOS PROGRAMÁTICOS ACTIVIDADES ESTRATÉGIAS AULAS PREVISTAS
Leia maisMANIPULAÇÃO MOLECULAR E BIOTECNOLOGIA. Susana Pereira, Prof. Auxiliar
MANIPULAÇÃO MOLECULAR E BIOTECNOLOGIA Susana Pereira, Prof. Auxiliar - MANIPULAÇÃO MOLECULAR E BIOTECNOLOGIA -BIOLOGIA - TRONCO COMUM / SEM RAMO - PLANO DE ESTUDO: 2º Ano 1º Semestre Área 12 2.50 UC 2.00H
Leia maisO fluxo da informação é unidirecional
Curso - Psicologia Disciplina: Genética Humana e Evolução Resumo Aula 3- Transcrição e Tradução Dogma central TRANSCRIÇÃO DO DNA O fluxo da informação é unidirecional Processo pelo qual uma molécula de
Leia maisCurso de Verão 2012 - Bioinformática
Curso de Verão 2012 - Bioinformática Bancos de Dados Biológicos Márcio K. Oikawa - UFABC marcio.oikawa@ufabc.edu.br Agenda Introdução: O que são bancos de dados? Por que são importantes? Bancos de dados
Leia maisUNIVERSIDADE LUSÍADA DE LISBOA. Programa da Unidade Curricular COMPLEMENTOS DE ANÁLISE MATEMÁTICA Ano Lectivo 2010/2011
Programa da Unidade Curricular COMPLEMENTOS DE ANÁLISE MATEMÁTICA Ano Lectivo 2010/2011 1. Unidade Orgânica Ciências da Economia e da Empresa (1º Ciclo) 2. Curso Engenharia Informática 3. Ciclo de Estudos
Leia maisIntrodução ao SRS Sequence Retrieval System. Marcelo Falsarella Carazzolle
Introdução ao SRS Sequence Retrieval System Marcelo Falsarella Carazzolle Resumo Motivação Introdução Bancos de Dados Ferramentas de bioinformática SRS Exemplos Motivação Existem muitos bancos de dados
Leia maisÁcidos Nucleicos 22/12/2011. Funções do Material Genético. informação genética.
Ácidos Nucleicos Profa. Dra. Juliana Garcia de Oliveira Disciplina: Biologia Celular e Molecular Turmas: Ciências Biológicas, enfermagem, nutrição e TO. Funções do Material Genético Mendel, 1865: genes
Leia maisOrganização do Material Genético nos Procariontes e Eucariontes
Organização do Material Genético nos Procariontes e Eucariontes Organização do Material Genético nos Procariontes e Eucariontes Procariontes Eucariontes Localização Organização Forma Disperso no citoplasma
Leia maisSupercomputação em Portugal: realidade e perspectivas Pedro Alberto Centro de Física Computacional Laboratório de Computação Avançada Universidade de Coimbra Ciência 2008 3 Julho 2008 1 O que é supercomputação?
Leia maisVI Congresso Brasileiro de Biossegurança Simpósio Latino-Americano de Produtos Biotecnológicos
VI Congresso Brasileiro de Biossegurança Simpósio Latino-Americano de Produtos Biotecnológicos Rio de Janeiro, 21-25 setembro de 2009 Universidade do Estado do Rio de Janeiro - UERJ Construções Mais Comuns
Leia maisPROGRAMA DE DISCIPLINA: BIOQUÍMICA
PROGRAMA DE DISCIPLINA: BIOQUÍMICA Departamento de Ciências Fisiológicas Carga horária total: 188h Ano letivo: 2012 - Série: 1º ano - Curso de Medicina Coordenador: Professor Doutor Wagner Ricardo Montor
Leia maisUNIVERSIDADE LUSÍADA DE LISBOA. Programa da Unidade Curricular PROGRAMAÇÃO Ano Lectivo 2013/2014
Programa da Unidade Curricular PROGRAMAÇÃO Ano Lectivo 2013/2014 1. Unidade Orgânica Ciências da Economia e da Empresa (1º Ciclo) 2. Curso Engenharia Electrotécnica e de Computadores 3. Ciclo de Estudos
Leia maisMEDICINA VETERINÁRIA. Disciplina: Genética Animal. Prof a.: D rd. Mariana de F. Gardingo Diniz
MEDICINA VETERINÁRIA Disciplina: Genética Animal Prof a.: D rd. Mariana de F. Gardingo Diniz TRANSCRIÇÃO DNA A transcrição é o processo de formação de uma molécula de RNA a partir de uma molécula molde
Leia maisBases Moleculares da Hereditariedade
UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ CENTRO DE CIÊNCIAS AGRÁRIAS PROG. DE PÓS GRAD. EM GENET. E MELHORAMENTO NÚCLEO DE ESTUDOS EM GENET. E MELHORAMENTO Bases Moleculares da Hereditariedade Ministrante: João Paulo
Leia maisUNIVERSIDADE FEDERAL DE ALAGOAS INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS E DA SAÚDE SETOR DE BIOLOGIA CELULAR E MOLECULAR
UNIVERSIDADE FEDERAL DE ALAGOAS INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS E DA SAÚDE SETOR DE BIOLOGIA CELULAR E MOLECULAR DISCIPLINA: BIOLOGIA CELULAR E MOLECULAR ESTUDO DIRIGIDO FLUXO DA INFORMAÇÃO GÊNICA págs:
Leia maisSistema Web para Projeto de PCR
Sistema Web para Projeto de PCR Abstract. This paper describes a web system that help the work of molecular biologists, automatizating the steps necessary for preparing a PCR experiment. This system will
Leia maisApostila de aula prática REAÇÃO EM CADEIA PELA POLIMERASE (PCR)
1 Universidade Federal Fluminense Instituto Biomédico Departamento de Microbiologia e Parasitologia Disciplina: Virologia Apostila de aula prática REAÇÃO EM CADEIA PELA POLIMERASE (PCR) A técnica de reação
Leia maisANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs
ANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs João Meidanis Scylla Bioinformática e UNICAMP III Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas Gramado, RS Maio 2005 MINI-CURSO - AGENDA 1. Primeiro Dia
Leia maisUNIVERSIDADE LUSÍADA DE LISBOA. Programa da Unidade Curricular ECONOMETRIA Ano Lectivo 2015/2016
Programa da Unidade Curricular ECONOMETRIA Ano Lectivo 2015/2016 1. Unidade Orgânica Ciências da Economia e da Empresa (1º Ciclo) 2. Curso Economia 3. Ciclo de Estudos 1º 4. Unidade Curricular ECONOMETRIA
Leia maisDO GENE À PROTEÍNA ALGUNS CONCEITOS BASICOS COMO SE ORGANIZAM OS NUCLEÓTIDOS PARA FORMAR O DNA?
DO GENE À PROTEÍNA O processo de formação das proteínas no ser humano pode ser difícil de compreender e inclui palavras e conceitos que possivelmente nos são desconhecidos. Assim, vamos tentar explicar
Leia maisCriado e Desenvolvido por: RONNIELLE CABRAL ROLIM Todos os direitos são reservados 2015. www.tioronni.com
Criado e Desenvolvido por: RONNIELLE CABRAL ROLIM Todos os direitos são reservados 2015. www.tioronni.com ÁCIDOS NUCLEICOS ÁCIDOS NUCLÉICOS: são substâncias formadoras de genes, constituídas por um grande
Leia maisResposta: Interbits SuperPro Web
1. (Fuvest 2012) Uma mutação, responsável por uma doença sanguínea, foi identificada numa família. Abaixo estão representadas sequências de bases nitrogenadas, normal e mutante; nelas estão destacados
Leia maisAvaliação Curso de Formação Pós-Graduada da Biologia Molecular à Biologia Sintética 15 de Julho de 2011 Nome
1 Avaliação Curso de Formação Pós-Graduada da Biologia Molecular à Biologia Sintética 15 de Julho de 2011 Nome 1 - As enzimas de restrição ou endonucleases recebem uma designação que provem (1 valor) a)
Leia maisBANCO DE QUESTÕES - BIOLOGIA - 1ª SÉRIE - ENSINO MÉDIO ==============================================================================================
PROFESSOR: Leonardo Mariscal BANCO DE QUESTÕES - BIOLOGIA - 1ª SÉRIE - ENSINO MÉDIO ============================================================================================== Ácidos Nucleicos 01- Os
Leia maisApresentação do programa e bibliografia; Regras de funcionamento e de avaliação; Organização interna de um computador
Ano Lectivo: Docente: Disciplina: Turma: SIG4 2003/2004 Semestre: 2 António Nabais Análise e Avaliação de Sistemas de Computação Data de Impressão: 09/06/04 Data Inicio Nº Pres. Sumários Observações 3-Mar-04
Leia maisPLANEJAMENTO ANUAL / TRIMESTRAL 2014 Conteúdos Habilidades Avaliação
COLÉGIO LA SALLE BRASÍLIA SGAS Q. 906 Conj. E C.P. 320 Fone: (061) 3443-7878 CEP: 70390-060 - BRASÍLIA - DISTRITO FEDERAL Disciplina: Biologia Trimestre: 1º Professor(a): Camilla Silva (B1) e Elisangela
Leia maisGABARITO BIOLOGIA REVISÃO 01 3 ANO A/B ENSINO MÉDIO
GABARITO BIOLOGIA REVISÃO 01 3 ANO A/B ENSINO MÉDIO Resolução: 01. B 02. E 03. No alantóide da ave há uma rede de capilares sangüíneos onde ocorre a respiração. O principal excreta nitrogenado da ave é
Leia maisVersão 0.3 Capítulo 5. Bancos de dados. Estrutura e modelos de dados
Versão 0.3 Capítulo 5 Bancos de dados Estrutura e modelos de dados Banco de dados, em uma definição geral, é uma coleção dados inter-relacionados que representa algum aspecto do mundo real ou um subconjunto
Leia maisBIOLOGIA MOLECULAR APLICADA AO ESTUDO DE DOENÇAS
! Universidade Federal de Pernambuco Centro de Ciências da Saúde Departamento de Patologia Laboratório de Imunopatologia Keizo Asami Prof. Dr. Lucas Brandão BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA AO ESTUDO DE DOENÇAS
Leia maisLinguagens Formais e Autômatos
Linguagens Formais e Autômatos SLIDE 1 Professor Júlio Cesar da Silva juliocesar@eloquium.com.br site: http://eloquium.com.br/ twitter: @profjuliocsilva facebook: https://www.facebook.com/paginaeloquium
Leia maisCom auxílio da bioinformática, grupo da USP gera catálogo de genes de espécies de Eimeria
Com auxílio da bioinformática, grupo da USP gera catálogo de genes de espécies de Eimeria Os pesquisadores Arthur Gruber e Alda Madeira, professores do Instituto de Ciências Biomédicas da USP e seu grupo
Leia maisFicha de Exercícios A Célula (VERSÃO CORRIGIDA) Ano lectivo: 10º ano Turma: Data:
Ficha de Exercícios A Célula (VERSÃO CORRIGIDA) Ano lectivo: 10º ano Turma: Data: 1- A célula é uma importante estrutura do mundo vivo. Todos os seres vivos começam por existir sob a forma de célula. Alguns
Leia maisCriado e Desenvolvido por: Todos os direitos são reservados 2015. www.tioronni.com
Criado e Desenvolvido por: Todos os direitos são reservados 2015. www.tioronni.com O NÚCLEO E A SÍNTESE PROTEÍCA O núcleo celular, descoberto em 1833 pelo pesquisador escocês Robert Brown, é uma estrutura
Leia maisIdentificar os reagentes, produtos e processos básicos da fotossíntese e da respiração celular.
1 D1 (B) Identificar os reagentes, produtos e processos básicos da fotossíntese e da respiração celular. D2 (b) Explicar a inter-relação entre fotossíntese e respiração celular nas células dos organismos
Leia maisCURSO DE GENÔMICA, PROTEÔMICA, LIPIDÔMICA E METABOLÔMICA
CURSO DE GENÔMICA, PROTEÔMICA, LIPIDÔMICA E METABOLÔMICA ORGANIZAÇÃO o Docentes responsáveis - modulo Genômica: Dra. Analy Salles de Azevedo Melo e Dra. Ana Carolina Padovan; o Docentes responsáveis -
Leia maisTRIAGEM METABÓLICA POR PKS E NRPS EM ACTINOBACTÉRIAS ENDOFÍTICAS DE Citrus reticulata
Quim. Nova, Vol. XY, No. 00, S1-S5, 200_ TRIAGEM METABÓLICA POR PKS E NRPS EM ACTINOBACTÉRIAS ENDOFÍTICAS DE Citrus reticulata Pedro L. R. da Cruz a, Leila R. Giarola b, Suellen da Silva Moraes a, Déborah
Leia maisANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs
ANÁLISE GENÔMICA, MAPEAMENTO E ANÁLISE DE QTLs João Meidanis Scylla Bioinformática e UNICAMP III Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas Gramado, RS Maio 2005 MINI-CURSO - AGENDA 1. Primeiro Dia
Leia maisPreparação de pedidos de patente e modelo de utilidade. Instituto Nacional da Propriedade Industrial Departamento de Patentes e Modelos de Utilidade
Preparação de pedidos de patente e modelo de utilidade Instituto Nacional da Propriedade Industrial Departamento de Patentes e Modelos de Utilidade 1 Sumário 1. Documentos a apresentar 2. Enquadramento
Leia maisAbordagens moleculares no estudo da diversidade microbiana
A vida sem microrganismos não seria possível! Abordagens moleculares no estudo da diversidade microbiana Teresa Lino Neto tlneto@bio.uminho.pt Departamento de Biologia Universidade do Minho 1 Importantes
Leia maisBusca em banco de dados
Busca em banco de dados Busca em banco de dados A quantidade imensa de dados existentes nos bancos públicos torna critica a existência de ferramentas eficientes que permitam a recuperação de dados desejados
Leia maisNovas Tecnologias de Sequenciamento
Novas Tecnologias de Sequenciamento Tecnologias de sequenciamento Sanger (Capilaridade) Uma das inovações tecnológicas de maior influência na pesquisa biológica, desde que foi lançada em 1977 Abordagem
Leia mais> ESTUDO DO RNA. (C) O ácido nucléico I é DNA e o II, RNA. (D) O ácido nucléico I é RNA e o II, DNA. (E) I é exclusivo dos seres procariontes.
Biologia > Citologia > Sintese Protéica > Alunos Prof. Zell (biologia) (C) O ácido nucléico I é DNA e o II, RNA. (D) O ácido nucléico I é RNA e o II, DNA. (E) I é exclusivo dos seres procariontes. > ESTUDO
Leia maisBiologia Avançada Jatropha curcas L.
1 Pesquisadores: Hugo Bruno C. Molinari Betania F. Quirino Biologia Avançada Jatropha curcas L. Maior banco de informações moleculares em todo o mundo Gerar ferramentas para subsidiar programa de Melhoramento
Leia maisSíntese Artificial de Peptídeos
Síntese Artificial de Peptídeos Rebeca Bayeh Seminário apresentado para a disciplina Princípios Físicos Aplicados à Fisiologia (PGF530) Prof. Dr. Adriano Mesquita Alencar Segundo semestre de 2013 Motivação
Leia maisUniversidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO
Universidade Federal de Pelotas Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel Programa de Pós-Graduação em Agronomia CENTRO DE GENOMICA E FITOMELHORAMENTO Introdução à Bioinformática Professores: Luciano Maia Antonio
Leia maisEXAME DE BIOLOGIA Prova de Acesso - Maiores 23 Anos (21 de Abril de 2009)
INSTITUTO POLITÉCNICO DE BEJA EXAME DE BIOLOGIA Prova de Acesso - Maiores 23 Anos (21 de Abril de 2009) Nome do Candidato Classificação Leia as seguintes informações com atenção. 1. O exame é constituído
Leia mais