OBJETIVOS. a) Padronizar os testes genéticos para as principais síndromes de câncer hereditário e desenvolver novas metodologias diagnósticas.
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- Aparecida de Sequeira Martins
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3 OBJETIVOS Objetivo principal: Estabelecer uma rede de laboratórios de suporte à Sub-rede de Aconselhamento Genético em Oncogenética, composta por laboratórios de genética e biologia molecular de instituições públicas nacionais, sob a coordenação central da Divisão de Genética do Instituto Nacional de Câncer. Objetivos específicos: a) Padronizar os testes genéticos para as principais síndromes de câncer hereditário e desenvolver novas metodologias diagnósticas. b) Propor um programa de controle de qualidade dos testes genéticos oferecidos. c) Avaliar e otimizar os custos dos testes genéticos padronizados pela rede.
4 RESULTADOS ESPERADOS Resultados esperados -Elaboração e padronização de procedimentos de boas práticas de laboratório entre os centros participantes, estabelecendo normas para obtenção, identificação, armazenamento, transporte e manipulação das amostras biológicas, fazendo o bom uso dos testes genéticos; -IDENTIFICAÇÃO DA AMOSTRA -Utilização de codificação que permita identificar: Centro, Síndrome, Paciente, Origem da Amostra. Uso de código de Barras? -SELEÇÃO DE MÉTODOS: p/ex. DE ISOLAMENTO DE DNA.
5 - Resultados esperados RESULTADOS ESPERADOS -Elaboração e padronização de procedimentos de boas práticas de laboratório entre os centros participantes, estabelecendo normas para obtenção, identificação, armazenamento, transporte e manipulação das amostras biológicas, fazendo o bom uso dos testes genéticos; -ARMAZENAMENTO (material já processado): -Soluções para armazenamento; -Fracionamento da amostra para armazenamento; -TRANSPORTE (material já processado) -DNA: temperatura ambiente via correio? -Fracionamento da amostra prévio ao transporte.
6 RESULTADOS ESPERADOS - Resultados esperados -Avaliação dos custos envolvidos nos procedimentos de laboratório para detecção de mutações nos diferentes centros envolvidos visando a otimização dos mesmos; CUSTOS PARA CADA CONJUNTO DE PROCEDIMENTOS: -Diferenças regionais e custos; -Inclusão do custo de pessoal; -Fontes de financiamento dos centros envolvidos; -Trocas de informações sobre fornecedores; -Otimização dos custos dos métodos
7 RESULTADOS ESPERADOS - Resultados esperados -Otimização e viabilização de tecnologias entre os laboratórios dos centros envolvidos, de acordo com a demanda e disponibilidade dos mesmos; COLABORAÇÃO PARA COMPARTILHAMENTO DE TECNOLOGIAS -Estabelecimento de centros que possam realizar metodologias que necessitam de maior infraestrutura: -Sequenciamento (Next Generation), -Genotipagem, Análise de fragmentos, MLPA; -Treinamento de pessoal para análise.
8 RESULTADOS ESPERADOS - Resultados esperados -Desenvolvimento de novos métodos para detecção de mutações com alta especificidade e sensibilidade e validação em diferentes laboratórios; -Realização de encontros entre os centros envolvidos para difusão e discussão dos métodos, e de cursos abertos a profissionais da área de saúde com a finalidade de divulgar os métodos utilizados, a interpretação dos resultados e as limitações dos mesmos. -Possibilidade de estabelecer centros/laboratórios de referência.
9 PROCESSAMENTO DE DIFERENTES FONTES DE AMOSTRA DNAs obtidos com diferentes graus de integridade de inclusão em parafina PM PM Braggio, 2003
10 UTILIZAÇÃO DE DIFERENTES METODOLOGIAS SSCP Detecção de Variações Seqüenciamento Clonagem PCR MDE / Com e Sem Glicerol MegaBACE / ABI377 pgem-t / pmos Detecção de Grandes Rearranjos Moleculares Southern-blot gdna Endonucleases de Restrição [ 32P]dCTP
11 DIAGNÓSTICO DE DIFERENTES TIPOS DE MUTAÇÃO Câncer de Mama e/ou Ovário 90-95% Hereditário Esporádico 33% 1,8% Mutação BRCA1/2 Diag. negativo Metilação BRCA1/2 Mutação BRCA1/2 Grandes Rearranjos BRCA1/BRCA2 5 UTR? Promotor outros genes
12 Sequenciamento: Next Generation
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