O futuro do melhoramento genético de suínos. Marcos Lopes Egbert Knol

Transcrição

1 O futuro do melhoramento genético de suínos Marcos Lopes Egbert Knol ABRAVES

2 De onde viemos? Onde estamos? Para onde vamos?

3 Ganho genético De onde viemos? Métodos tradicionais de seleção 250% 200% Esp. toucinho Tam. Leitegada Ganho de peso Conv. alimentar 150% 100% 50% 0% Ano Knol & Merks (2010)

4 Pedigree De onde viemos? Métodos tradicionais de seleção: BLUP Fenótipos + = Valor genético estimado Matriz A

5 Onde estamos? Seleção genômica

6 Seleção genômica Coleta de amostras

7 Armazenamento e envio para extração de DNA

8 Genotipagem (60K SNP chip)

9 Marcadores moleculares (SNP) Sneijder Neymar

10 Estudos de associação A G = 0,5Kg AG AG AA AG GG Kg Kg 2 Kg Gene BRCA1 87% câncer de mama

11 Explorar a variação dentro de leitegada ao nascimento Coeficiente de parentesco real *Assumindo ausência de consanguinidade Pedigree: 0.50

12 Coeficiente de parentesco real A G Gisele Bündchen Irmã gêmea (não idêntica) Pedigree (A) = 0.50 Real (G) =??? Lopes et al. (2013)

13 Pedigree Onde estamos? Seleção genômica ssgblup Fenótipos + = Valor genético estimado Genótipos Matriz A Matriz G Matriz H: single-step GBLUP

14 Estimação do valor genético Pedigree: Genômico:

15 Prediction accuracy Acurácia de predição 35% 30% 25% +31% +44% +37% 20% 15% 10% 5% 0% Production Reproduction TSI Maior acurácia, maior ganho genético!!

16 Para onde vamos? Buscar maximizar cada vez mais o uso de todas as ferramentas disponíveis para aumentar a eficiência produtiva

17 O futuro é: High-tech

18 Genotipagem com maior número de marcadores SNP chips 400 => 60K 10K => 60K 60K Illumina 660K Affymetrix Sequenciamento do genoma

19 Gene - QTL 60K Ligado ao gene: o efeito do marcador vai depender do LD (desequilíbrio de ligação) - Captura parte do efeito do gene sequenciamento Mutação causal Poucos genes de grande efeito até hoje (Ex, IGF2, Halotano) - Captura todo o efeito do gene

20 Fenotipagem para seleção de precisão Tomografia computadorizada

21 Fenotipagem para seleção de precisão Tomografia computadorizada Avaliação in vivo de: Características de carcaça Qualidade de carne Osteocondrose Órgãos internos etc

22 Fenotipagem para seleção de precisão Tomografia computadorizada PhD em diagnósticos por imagens

23 Fenotipagem para seleção de precisão Comedouros automáticos Consumo individual Eficiência alimentar - Futuro próximo: diferentes dietas de acordo com as necessidades de cada animal?

24 Fenotipagem para seleção de precisão Novas técnicas de fenotipagem: redefinir os fenótipos Onde estamos? ganho de peso diário (carne + gordura + ossos) Para onde vamos? Ganho diário de carne de alta qualidade

25 Fenotipagem para seleção de precisão Novas técnicas de fenotipagem: novas possibiliddaes, mas algumas características tradicionais continuarão sendo de grande importância a eficiência produtiva Onde estamos? nr. de leitões desmamados/porca/ano, eficiência alimentar Para onde vamos? nr. de leitões desmamados/porca/ano, eficiência alimentar

26 Seleção para resistência à doenças -Diminuir mortalidade -Diminuir o uso de antibióticos - etc.

27 Seleção para resistência à doenças Plos One

28 Melhoramento para efeitos sociais Duijvesteijn et al (2014) Baixo valor genético social Menos bem-estar animal Menor crescimento Alto valor genético social Mais bem-estar animal Maior crescimento Gestação em baias coletivas

29 Características reprodutivas de machos QualiSperm Biophos Switzerland No successful implementation Diniz et al. (2014)

30 Edicão gênica (futuro mais distante ) DNA é inserido, substituído, removido de um genoma usando tesouras moleculares (nucleases artificias) Não é transgênico!

31 Edicão gênica Terapia genética: substituir os alelos ruims por alelos bons Medicina humana: OK Produção animal:??? Muitas promessas, mas as dúvidas são ainda maiores Ex: Roslin (UK), diversos grupos chineses

32 Considerações finais

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34 Ganho genético De onde viemos? Métodos tradicionais de seleção 250% 200% 150% 100% 50% Esp. toucinho Tam. Leitegada Ganho de peso Conv. alimentar 0% Ano

35 Onde estamos? Seleção genômica? + 40% 30% = 20% G 10% ano 0% acurácia =

36 Para onde vamos? = Eficiência produtiva Características tradicionais: Nr. Leitões desmamados/porca/ano Eficiência alimentar