Uma resposta para o paciente e família

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1 Uma resposta para o paciente e família

2 O sequenciamento do exoma: uma abordagem global do diagnóstico genético Existem mais de doenças mendelianas com alta heterogeneidade genética e/ou fenotípica. Isso dificulta a priorização dos genes a serem estudados, sendo necessária a análise simultânea de todas as mutações associadas às doenças ou deficiências de um indivíduo. Fluxograma do Diagnóstico das Doenças Genéticas Avaliação clínica Histórico familiar, antecedentes pessoais, sinais, sintomas e exames complementares. Suspeita de doença genética caracterizada por: Nos éxons de um indivíduo estão localizadas as variações no DNA responsáveis por 85% das doenças genéticas 1,2. As informações genéticas do nosso Aneuploidias, duplicações ou deleções de uma região genômica Mutações associadas a um fenótipo inespecífico e/ou de alta heterogeneidade genética Número limitado de mutações frequentes em um gene organismo estão contidas em genes, que constituem nosso genoma. Os éxons são as regiões dos genes que Cariótipo MLPA acgh Sanger A identificação dos genes causais permite: Direcionar os exames diagnósticos e as medidas terapêuticas. Estabelecer um prognóstico. Proporcionar o aconselhamento genético ao paciente e seus familiares. contêm as informações necessárias para produzir as proteínas, elementos fundamentais para que os organismos vivos se desenvolvam normalmente. O exoma é o conjunto de todos os éxons do genoma. NIMGenetics oferece três possibilidades de análise dos resultados do sequenciamento. Dirigido Clínico Trio

3 ..a partir do sequenciamento de genes, uma análise que se adapta ao diagnóstico genético do seu paciente. O sequenciamento do exoma permite a análise simultânea de dezenas a milhares de genes, de maneira rápida e econômica. A genética médica está evoluindo dos painéis de genes para o sequenciamento do exoma devido ao seu potencial diagnóstico. O sucesso desta tecnologia está na sua flexibilidade e na sua capacidade de adaptação às necessidades do paciente. A partir do sequenciamento do exoma, podemos selecionar os genes que serão analisados (modelos personalizados) e estudar diferentes fenótipos simultânea ou sequencialmente (reanálise) 3-5.

4 Algoritmo de análise Sequenciamento e análise bioinformática Identificação e anotação de variantes Seleção de variantes Priorização e Categorização Interpretação Clínica Validação por Sanger das variantes patogênicas Análise orientada clinicamente Banco de Dados próprio >1.000 exomas Comparação das variantes identificadas com os bancos de dados, permitindo selecionar as informações genéticas relevantes. Prognóstico de patogenicidade com algoritmos bioinformáticos. Revisão dos bancos de dados de mutações e publicações científicas. Categorização das variantes, de acordo com os critérios do ACMG*. Integração das informações clínicas. Determinação da associação entre o fenótipo e o genótipo. Definição do padrão de herança da variante. * American College of Medical Genetics Recomendações clínicas em relação ao manejo do paciente, exames complementares e estudos de segregação familial. Resultados interpretados no contexto clínico, com informações relevantes obtidas nos bancos de dados e literatura científica. Reclassificação das variantes em função de novas evidências. Interpretação de variantes de acordo com as recomendações do ACMG. Validação de variantes patogênicas e provavelmente patogênicas pelo método de Sanger. Inclui informações relativas à qualidade do sequenciamento e às coberturas dos genes estudados. NIMGenetics indica e realiza os estudos de segregação necessários para definir a etiologia da variante e facilitar o aconselhamento genético. NIMGenetics possui uma equipe multidisciplinar com experiência comprovada relatório clínico de fácil interpretação assessoria genética ao especialista consulta e aconselhamento genético Relatório

5 dirigido ExoNIM Dirigido: trabalhamos com você onde for necessário O que é? Exoma: sequenciamento simultâneo dos genes do paciente. Neurologia Dirigido: aos genes selecionados por sua associação com o fenótipo do paciente. Pediatria Indicações Dermatologia Síndromes com uma apresentação clínica característica e elevada heterogeneidade genética. Vantagens Cardiologia Imunologia Reanálise da sequência em caso de: 1) surgimento de novos sintomas, 2) redefinição do fenótipo e 3) inclusão de novos genes envolvidos na patologia em estudo. Em patologias com sobreposição do fenótipo, podem ser combinados diferentes exomas dirigidos disponíveis. Otorrinolaringologia Gastroenterologia Hematologia Exomas personalizados e adaptados a cada paciente. Ampliação para ExoNIM Clínico e ExoNIM Trio sem necessidade de sequenciar novamente a amostra do paciente. A serviço do diagnóstico genético O exoma é uma ferramenta dinâmica Endocrinologia Nefrologia Uma abordagem multidisciplinar Os modelos de ExoNIM Dirigido são atualizados periodicamente, com base na literatura recente. NIMGenetics oferece assessoria para a escolha do desenho de ExoNIM Dirigido mais adequado para o seu paciente.

6 dirigido Neurologia dirigido Gastroenterologia, endocrinologia e nefrologia Colestase intra-hepática Déficit combinado de Hormônios Hipofisários e Hipotireoidismo Diabetes neonatal Diabetes congênita ou crônica de início precoce Erros inatos do metabolismo com hiperamonemia Febre recorrente Hipercolesterolemia familial Neuroacantocitose, Doença de Wilson e Doença por depósito de ferro Pancreatite Crônica Pseudo-hipoaldosteronismo Síndrome de Alport Síndrome de Bartter e patologias associadas a transtornos hidroeletrolíticos Síndrome Tricho-Hepato-Entérica Ortopedia, cardiologia, dermatologia e imunologia Alterações genéticas da aorta (Aneurismas e Dissecções) Síndrome de Coffin-Lowry Doenças do tecido conjuntivo Cútis laxa Displasias Ectodérmicas Displasias Ósseas Hipermobilidade Articular Ictiose congênita Osteogênese imperfeita Osteopetrose Síndrome de Hiperimunoglobulinemia E Telangiectasia Hemorrágica Hereditária VP110 VP74 VP86 VP85 VP76 VP80 VP94 VP78 VP47 VP100 VP109 VP81 VP18 VP75 VP65 VP103 VP99 VP68 VP37 VP33 VP24 VP66 VP107 VP52 VP46 Hematologia Amiloidose Eritroblastopenia congênita de Blackfan-Diamond Neutropenia congênita sindrômica e não sindrômica Síndrome hemolítica urêmica Otorrinolaringologia Discinesia Ciliar Primária Hipoacusias Familiais Síndrome do aqueduto vestibular alargado Surdez autossômica recessiva Síndromes poliformativas com ou sem deficiência intelectual Artrogripose Cardiopatias congênitas Craniossinostose Disostose facial Doença de Hirschsprung Esclerose Tuberosa Fissura palatina e lábio leporino Microcefalia Primária Hereditária e Síndrome de Meier-Gorlin Rasopatias Síndrome de Bardet-Biedl Síndrome de Coffin-Siris Síndrome de Cornelia de Lange Síndrome de Donnai-Barrow Síndrome Kabuki Síndrome de Robinow Síndrome de Rubinstein-Taybi Supercrescimento e macrocefalia VP64 VP43 VP42 VP14 VP25 VP9 VP84 VP19 VP56 VP102 VP6 VP69 VP51 VP8 VP93 VP41 VP12 VP95 VP59 VP5 VP40 VP23 VP67 VP60 VP96 Polineuropatías hereditarias Polineuropatias hereditárias Charcot-Marie Tooth e neuropatias hereditárias sensitivo-motoras relacionadas Neuropatia Distal Hereditária Alterações de marcha Ataxia espinocerebelar Ataxias Coreoatetose Distonias Hemiplegia alternante da infância Enxaqueca hemiplégica familiar Paraplegia Espástica Hereditária Doença de Parkinson Leucodistrofias Angioma Cavernoso Familial Atrofia Muscular Espinal Doenças peroxissomais e lisossomais Doença de Fahr Doenças por transtorno do metabolismo do glicogênio Leucodistrofias Lipofuscinose Cerebral Síndrome de Aicardi-Gutieres Síndrome de Joubert Morfogênese Cerebral VP32 VP3 VP11 VP2 VP36 VP73 VP57 VP97 VP101 VP26 VP58 VP35 VP82 VP63 VP62 VP105 VP27 VP72 VP1 VP22 VP17 Miopatias e Doenças neuromusculares Canalopatias Neuromusculares Distrofia Muscular de Cinturas (LGMD) Distrofias musculares Distrofinopatias Distroglicanopatias Esclerose lateral amiotrófica e síndromes incluídas no Diagnóstico diferencial Miastenia congênita Miopatia congênita centronuclear Miopatias Transtornos Hereditários do Colágeno VI Demências Alzheimer de início precoce Demência Frontotemporal Transtornos do neurodesenvolvimento Autismo Deficiência Intelectual Deficiência Intelectual Ligada ao cromossomo X Síndrome de Angelman e síndromes incluídas no diagnóstico diferencial Doenças Mitocondriais Alterações mitocondriais secundárias a mutações do DNA nuclear VP21 VP39 VP61 VP55 VP71 VP48 VP70 VP31 VP50 VP20 VP28 VP91 VP83 VP7 VP79 VP98 VP10

7 clinico trio O que é? O que é? Exoma: sequenciamento simultâneo dos genes do paciente. Exoma: sequenciamento simultâneo dos genes do paciente. Clínico: análise dirigida de mais de genes OMIM 7. Indicações Síndromes difíceis de diagnosticar clinicamente e caracterizadas por: Alta heterogeneidade genética Alta variabilidade fenotípica ou fenótipos complexos Trio: Através das informações genéticas dos progenitores, são selecionadas as variantes responsáveis pelo fenótipo do paciente, contemplando tanto a apresentação clínica como o padrão de herança. Indicações Síndromes com alta heterogeneidade genética e/ou fenotípica. Diagnóstico diferencial de síndromes que compartilham manifestações clínicas ou de doenças raras. Vantagens Análise de todos os genes associados a doenças mendelianas. Possibilidade de ampliação para ExoNIM Trio. Minimiza a identificação de achados incidentais ou a identificação de variantes nos genes sem um fenótipo clínico associado. Abrindo portas para o diagnóstico Primeira escolha em casos de TEA e Transtorno do Neuro Desenvolvimento após array-cgh negativo. Ampliação do ExoNIM Dirigido/Clínico negativo. Vantagens Permite identificar novos genes não incluídos inicialmente no diagnóstico diferencial. Máxima rentabilidade diagnóstica, superior a 40%. Permite definir o padrão de herança das variantes. Uma análise de amplo espectro Acelera o processo diagnóstico e evita exames desnecessários.

8 PEDIDO DE ExoNIM Documentação necessária: 1. Envio da solicitação médica. 2. Consentimento informado. 3. Relatório clínico do paciente. CONDIÇÕES E ENVIO DA AMOSTRA Sangue periférico: 2 tubos de 5mL de EDTA. Para outras amostras, consulte a Diretoria Técnica. Bibliografia: 1. Choi M et al. (2009). Proc Natl Acad Sci U S A 106(45): Pussegoda KA (2010). Clin Genet 78(1): Lee H et al. (2014). JAMA 312(18): Van Nimwegen KJ et al. (2015). Eur J Paediatr Neurol 19(2): Monroe GR et al. (2016). Genet Med [Epub ahead of print]. 6. Richards S et al. (2015). Genet Med 17(5): Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) Por que NIMGenetics A qualidade do ExoNIM está certificada (Thermo Certified Service Provider). Os relatórios da NIMGenetcs foram qualificados como excelentes por líderes de opinião em Neurologia, Genética Clínica e outras especialidades. Empresa liderada por uma equipe multidisciplinar altamente qualificada, que serve de apoio para o especialista, oferecendo-lhe assessoria pré e pós-teste. Membros credenciados pela Asociación Española de Genética Humana (AEGH) e participação ativa na European Molecular Quality Network (EMQN). Soluções integrais. NIMGenetcs conta com uma ampla oferta de testes de genética molecular para cobrir as necessidades de cada paciente.

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