Liderando o diagnóstico genético Pré-natal

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1 Pré-natal Liderando o diagnóstico genético Pré-natal Voltado ao diagnóstico de 124 síndromes envolvidas na deficiência intelectual e alterações congênitas

2 O que é um array-cgh? O array-cgh (Hibridação Genômica Comparada) é a técnica genômica mais nova e eficiente para o diagnóstico clínico de doenças genéticas. O array-cgh permite analisar todo o genoma de um indivíduo em busca de alterações devidas ao ganho ou perda de material genético. Como funciona um array-cgh O DNA da amostra é comparado com o DNA controle (sem alterações). Ambas as amostras são marcadas por fluorescência com cores diferentes e são hibridadas na plataforma KaryoNIM Pré-natal. A seguir, faz-se o escaneamento e os dados adquiridos são analisados. DNA Controle (sem alterações) Marcação fluorescente Hibridar e escanear em KaryoNIM Pré-natal Além disso, essa detecção é rápida e confiável, obtendose a análise completa do genoma em um prazo inferior a 14 dias úteis após a recepção da amostra. DNA Paciente Recomendado por especialistas O uso do array-cgh no diagnóstico pré-natal é reconhecido por revistas médicas de prestígio. Seu uso é aceito e recomendado por especialistas em genética clínica e ginecologia em guias internacionais.

3 Mais potente que as provas convencionais O array-cgh demostrou ser uma ferramenta eficaz para o diagnóstico pré-natal na detecção de anomalias cromossômicas. A análise através do array-cgh identifica alterações microscópicas que não são visíveis em um cariótipo convencional. Recentemente, um estudo sobre casos de diagnóstico pré-natal com cariótipo normal, detectou alterações cromossômicas em 97 casos. Isso significa que 2,5% dos casos com cariótipo normal apresentavam alterações visíveis somente por array-cgh. Em quase metade desses casos (45 casos), foram detectadas alterações ecográficas nas gestações. Além disso, todos os cariótipos que apresentaram alterações foram confimados por array-cgh. Indicação de diagnóstico pré-natal invasivo Casos com cariótipo normal Casos de array-cgh com alterações não visíveis com cariótipo Idade materna avançada Risco alto para teste triplo Alterações ecográficas % Os dados atuais demostram que a aplicação dos arrays-cgh no diagnóstico pré-natal são uma ferramenta de grande utilidade para diversas indicações clínicas. Os array-cgh devem ser desenhados e orientados para as regiões cromossômicas responsáveis por patologias frequentes no diagnóstico pré-natal. Com isso, aumentam a detecção de rearranjos genômicos fetais e apresentam custo-beneficio. Especialistas consideram que o array- CGH deve substituir o cariótipo em gestações que apresentam alterações ecográficas e no qual indique um diagnóstico invasivo. Outras Resumo Tabela modificada de Wapner et al, Recomendações do Colégio Americano de Obstetrícia e Ginecologia (ACOG) sobre o uso de microarrays em diagnóstico pré-natal. Committee Opinion nº 581. Obster Gynecol 2013:122: Chromosomal Microarray versus Karyotyping for Prenatal Diagnosis. Wapner R.J. et al, New England Journal of Medicine 2012, 367, 23,

4 Pré-natal KaryoNIM Pré-natal é uma plataforma baseada em array-cgh que detecta simultaneamente a presença ou ausência de ganhos ou perdas de regiões genômicas e cromossômicas (como deleções, duplicações ou trissomias), responsáveis por até 124 síndromes genéticas, com uma resolução 10 vezes maior que o cariótipo convencional. KaryoNIM utiliza tecnologia array-cgh e inclui sondas ao longo de todo o genoma humano. Com objetivo voltado ao diagnóstico genético, permite a detecção de alterações de pelo menos 1 Mb em todo o genoma, o que implica aumentar 10 vezes a resolução do cariótipo convencional. KaryoNIM está indicado para a detecção de alterações genéticas relacionadas às síndromes genéticas. Nas regiões críticas das referidas síndromes, a resolução é 50 vezes maior que um cariótipo convencional, podendose detectar, em alguns casos, regiões alteradas menores que 200 Kb. Com esse objetivo evitamos informação desnecessária em amostras específicas, como as de pré-natal e focamos a análise em regiões associadas às doenças conhecidas. Por que usar KaryoNIM para o diagnóstico pré-natal? 1. Porque seu protocolo é baseado em DNA e não em culturas celulares KaryoNIM não precisa de culturas celulares para obter células em metáfase. É necessário somente uma pequena quantidade de DNA da amostra (200 a 500 nanogramas), obtido aproximadamente, a partir de 4-5 ml de líquido amniótico. A qualidade do material genético é crucial, por isso deve-se redobrar a atenção na manipulação da amostra, especialmente na etapa de extração do DNA. 2. Porque os resultados são confiáveis e rápidos O prazo do recebimento da amostra até a emissão do resultado pode ser inferior a 14 dias úteis. A análise é realizada pela nossa equipe de geneticistas e bioinformatas, especialistas na utilização das ferramentas de software avançado necessários para a elaboração dos resultados. A detecção de alterações é muito objetiva e baseia-se em parâmetros estatísticos que se ajustam a padrões e critérios qualitativos e quantitativos.

5 Elaboração de relatórios com orientação clínica O resultado é redigido para utilização clínica e inclui uma resposta clara com relação à presença ou ausência da alteração genômica analisada, para cada uma das síndromes incluídas especificamente no array. Adicionalmente, qualquer outra alteração cromossômica que implique ganho ou perda genômica maior que 1 Mb (como trissomias completas) estarão presentes no resultado. A relevância clínica dos achados será sempre explicada com uma linguagem direta, facilitando a transmissão da informação do médico ao paciente. Para enfatizar a interpretação clínica confiável, este resultado não inclui síndromes de penetrância incompleta ou com dúvidas sobre seu padrão de herança. Esse resultado levará em conta as limitações desta técnica com a qual não poderão ser detectadas alterações que forem causadas por dissomia uniparental, mutações gênicas, rearranjos cromossômicos equilibrados (por exemplo, translocações equilibradas), poliploidias completas, ou a presença de alterações em mosaico que afetem menos que 30% das células. Nos casos de diagnóstico pré-natal, o KaryoNIM é uma tecnologia que complementa ou substitui o cariótipo convencional e substitui o FISH pré-natal ou o MLPA, ao ser capaz de detectar simultaneamente até 124 síndromes genéticas graves que implicam em microdeleção/ duplicação. Coleta de Amostras As amostras deverão ser coletadas e enviadas a NIMGenetics Condições das Amostras Sangue de cordão umbilical: 1 ml em tubo de heparina ou EDTA (tampa verde e roxo). Líquido amniótico: 5 ml de amostra em tubo ou seringa. Biopsia de vilosidade coriônica: Fragmento de 2 milímetros cúbicos de vilosidade coriônica suspensa em meio estéril de coleta (tipo PBS). Recomendase, neste caso, um tubo tipo Falcon com 5 a 15 ml de meio.

6 Síndromes incluídas em KaryoNIM Prenatal 60k OMIM SÍNDROME Síndrome de monossomia 1p Síndrome de microdeleção 1p32-p Síndrome de microdeleção 1q41-q Síndrome de microdeleção 1q43-q Síndrome de Feingold Síndrome de hipotonia-cistinúria Holoprosencefalia Síndrome de microdeleção 2p16.1-p Síndrome de microdeleção 2p11-p Displasia mesomélica, tipo Savariayan Síndrome de Joubert Nefronoftise Malformação mãos e pés fendidos Síndrome de microdeleção 2q Síndrome de microdeleção 2q32-q Holoprosencefalia Síndrome de braquidactilia-retardo mental Blefarofimose, ptose e epicanto invertido Síndrome de Dandy-Walker Microftalmia sindrômica Malformação mãos e pés fendidos Síndrome de microdeleção 3q Síndrome de duplicação 3q Síndrome de Wolf-Hirschhorn Síndrome de microdeleção 4q Síndrome de Axenfeld Rieger Síndrome de cri-du-chat (inclui região distal) Síndrome de Cornelia de Lange Síndrome de duplicação 5p Heterotopia periventricular associada a deleção 5q Síndrome de microdeleção 5q14.3 OMIM SÍNDROME Síndrome de Sotos Síndrome de microdeleçao 6pter-p Displasia cleidocraneana Síndrome de microdeleção 6q11-q Síndrome similar à síndrome de Prader-Willi no cromossomo Síndrome de microdeleção 6q24-q Síndrome de Saethre-Chotzen Síndrome de Cefalopolissindactilia de Creig Síndrome de Williams-Beuren Síndrome de duplicação de Williams-Beuren Síndrome de Williams-Beuren associado a espasmos infantis Malformação mãos e pés fendidos Holoprosencefalia Hérnia diafragmática Síndrome CHARGE Síndrome de Langer Giedion Síndrome Trico-rino-falangeana I Síndrome do cromossomo 8 recombinante Deleção 9p24.3 associada à disgenesia gonadal 46,XY, parcial ou completa Síndrome de microdeleção 9p Holoprosencefelia Síndrome de unha-rótula Síndrome de Kleefstra Hipoparatiroidismo, surdez neurossensorial e doença renal Síndrome de DiGeorge 2 (inclui região do gene Nebulette) Síndrome de microdeleção 10q Malformação mãos e pés fendidos Síndrome de microdeleção 10q Síndrome de Beckwith-Wiedemann Síndrome de microdeleção em homozigose 11p15-p Síndrome de microdeleção 11p Síndrome WAGR Síndrome de Potocki-Shaffer

7 OMIM SÍNDROME Síndrome de Jacobsen Síndrome de Pallister-Killian Síndrome de Pitt-Hopkins Síndrome de Noonan Síndrome de Patau Holoprosencefalia Microfalmia sindrômica Síndrome de Prader-Willi Síndrome de Angelman Síndrome de duplicação 15q11-q Síndrome de microdeleção 15q Hérnia diafragmática congênita Síndrome de microdeleção 15q26-qter Síndrome de microdeleção 16p Síndrome de alfa talassemia e deficiência intelectual ligada ao cromossomo Doença renal policística infantil grave com esclerose tuberosa Síndrome de Rubinstein-Taybi Síndrome de microdeleção 16p12.2-p Síndrome de lisencefalia de Miller-Dieker Síndrome de duplicação 17p Doença de Carchot-Marie-Tooth, desmielinizante, tipo 1A Neuropatia hereditária com sensibilidade a estímulos de pressão Síndrome de Smith-Magenis Síndrome de Potocki-Lupski Síndrome de microdeleção 17q Síndrome de microdeleção 17q Síndrome de duplicação 17q Síndrome de microdeleção 17q23.1-q Displasia Campomélica Síndrome de deleção 18p Síndrome de Edwards Holoprosencefalia 4 OMIM SÍNDROME Síndrome de deleção 18q Atresia aural congênita Inversão pericêntrica do cromossomo Síndrome de microdeleção 19q Síndrome de Alagille Síndrome de Down Holoprosencefalia Síndrome do olho de gato (Cat-Eye) Síndrome de Digeorge Velocardiofacial Opitz-GBBB Síndrome de microdeleção 22q11.2 distal Síndrome de microdeleção 22q13.3 Síndrome de Turner Síndrome do triplo X Síndrome de Klinefelter Síndrome de deleção de genes contíguos da ictiose complicada ligada ao X Síndrome de microdeleção Xp Distrofia muscular de Duchenne (deleção do gene DMD) Síndrome de microdeleção Xp Síndrome de duplicação Xp11.23-p Deficiência intelectual sindrômica ligado ao X tipo Turner Deficiência intelectual ligada ao X com pan-hipopituitarismo Síndrome de microdeleção Xq Síndrome de duplicação MECP Síndrome de duplicação Xq Reversão sexual 46,XY 1 Síndrome do XYY

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