María Xosé Rodríguez Álvarez Unidade de Epidemioloxía Clínica e Bioestatística (CHUS)

Documentos relacionados
Validade interna e externa em estudos epidemiológicos. Sensibilidade; Especificidade; Valor Preditivo Positivo; Valor Preditivo Negativo

probabilidade e não certeza Concebido como um teste laboratorial, mas também se aplica à informação obtida na história, exame físico ou raio x, etc.

Probabilidades em Biomedicina: Uma Aplicação da Regra de Bayes

Testes Diagnósticos. HEP Cassia Maria Buchalla

Epidemiologia Analítica TESTES DIAGNÓSTICOS

Universidade de São Paulo Faculdade de Saúde Pública Departamento de Epidemiologia. Testes Diagnósticos ANA PAULA SAYURI SATO

Fisiopatologia Laboratorial. Exames Complementares de Diagnóstico e sua Validade

Dimensões da avaliação de Testes de Diagnóstico

DETERMINANTES DE UM VALOR PREDITIVO

Imunologia Aplicada. Sorologia

Princípios de Bioestatística

DIAGNÓSTICO. Processo de decisão clínica que baseia-se, conscientemente ou não, em probabilidade. Uso dos testes diagnósticos

Potencias e radicais

Validação de métodos diagnósticos

UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO CENTRO DE CIÊNCIAS DA SAÚDE INSTITUTO DE ESTUDOS EM SAÚDE COLETIVA DISCIPLINA: MÉTODO EPIDEMIOLÓGICO

Testes de triagem e provas diagnósticas

EXPOSICIÓN DE TEMAS FASES DO TRABALLO. 2. Xustificación necesidade utilidades. 3. Motivación introdutória 3º ESO

Parâmetros Imunológicos. Profª Heide Baida

3.- A ACTIVIDADE ECONÓMICA

NORMATIVA PARA A ORGANIZACIÓN DA DOCENCIA NOS GRAOS PARA O CURSO

Roteiro. Métodos diagnósticos: conceitos gerais. Download da aula e links. Introdução. Fases de um programa sanitário. Parâmetros. PCR ou ELISA?

Rafael Izbicki 1 / 38

Avaliação de testes diagnósticos

Epidemiologia Analítica TESTES DIAGNÓSTICOS 2

UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA CENTRO DE CIÊNCIAS DA SAÚDE DEPARTAMENTO DE SAÚDE PÚBLICA AULA TESTES DIAGNÓSTICOS Eleonora D Orsi Lúcio

Exercício 4 Desempenho Diagnóstico

Orde do 7 de Xaneiro de 2014 pola que se establecen os requisitos formativos para o acceso á formación dos certificados de profesionalidade de nivel

PREGUNTAS E RESPOSTAS SOBRE OS CAMBIOS NO CALENDARIO DE VACINACIÓN

Este proxecto musical nace en 2012 cando varios músicos e profesores de corda de Galiza, interesados na interpretación da música dos séculos XVII e

O CONTRATO DE TRABALLO

Roteiro Testes sorológicos e moleculares no diagnóstico das doenças infecciosas: o que é necessário saber? Download da aula e links.

Que é unha rede de ordendores?

ANEXO III MODELO DE PROGRAMACIÓN DE PROBA LIBRE DE MÓDULOS PROFESIONAIS

Conceitos PARTE III Conceptos PARTE III

NORMATIVA PARA A ORGANIZACIÓN DA DOCENCIA NOS GRAOS PARA O CURSO

Proceso de facturación.

PROGRAMA FORMATIVO MF1445_3 AVALIACIÓN DO PROCESO DE ENSINANZA-APRENDIZAXE NA FORMACIÓN PROFESIONAL PARA O EMPREGO

Programa de formación en comercialización e marketing. Orientación comercial á grande distribución. As claves do punto de venda Entender o lineal

Dna. Mª Luisa Ramos López Dna. Noemí Martín Álvarez CONTIDOS

Classificação de dados em modelos com resposta binária via algoritmo boosting e regressão logística

Área de Ciencia Excelente: Oportunidades no H2020 e programas de apoio na UDC (berce e InTalent)

Convocatoria Valorización de Resultados de Investigación 2012

Avaliação crítica de artigos sobre diagnóstico

PROCEDEMENTO DE CONEXIÓN A SERVIDORES E EQUIPOS DA REDE DE DATOS INTERNA DA UDC

CONSELLERÍA DE CULTURA, EDUCACIÓN E ORDENACIÓN UNIVERSITARIA

Análise Decisional: integridade e validação Por: Lionel Morgado Susana Silva

TÁBOAS DE VALORACIÓN DO RISCO CARDIOVASCULAR

e diferente ter un bo a camiñar.

PLANO DE FOMENTO CORRESPONSABILIDADE

Roteiro. PCC142 / BCC444 - Mineração de Dados Avaliação de Classicadores. Estimativa da Acurácia. Introdução. Estimativa da Acurácia

Matemática Financeira

Introdução à Bioestatística Turma Nutrição

INSTRUCIÓNS E DOCUMENTACIÓN PARA A SOLICITUDE DE ADMISIÓN MATRÍCULA PARA O CURSO

Listaxe dos compoñentes do grupo-clase. Horario das clases. Profesorado e módulos. Calendario escolar. Actividades complementarias e extraescolares.

Bioestatística Aula 3

OS INDICADORES DEMOGRÁFICOS

Fisiopatologia Laboratorial

programas .py python nome.py

Política e Obxectivos de Calidade

Os Números Reais. 1. Introdución. 2. Números racionais. Número irracionais

BIOESTATÍSTICA AULA 3. Anderson Castro Soares de Oliveira Jose Nilton da Cruz. Departamento de Estatística/ICET/UFMT

Dirección Xeral de Educación, Formación Profesional e Innovación Educativa CIFP DO SISTEMA EDUCATIVO DE GALICIA. Versión Modificación Data

clases sen fume CUESTIONARIO ESCOLARES

REGULAMENTO XERAL CATEGORIAS DE PARTICIPACION

BENQUERENCIA TERRA - MAR

Aula 9. Prof. Adilson Gonzaga

Bioestatística F Testes Diagnósticos

Achega as persoas á natureza, é unha forma sinxela e natural de reciclar os restos orgánicos, e ten múltiples beneficios ambientais:

Princípios de Bioestatística Testes Diagnósticos

PAU XUÑO 2013 MATEMÁTICAS II

Treinamento de um Classificador Neural Binário: Estimativa da Distribuição de Padrões

A MÚSICA NA ESCOLA INFANTIL

CE055 - Bioestatística A - Prova 1 - Gabarito

Non se vai predeterminar ningún libro de texto. O material didáctico deixarase por avaliacións, en carpetas, nos computadores da biblioteca.

PROBLEMAS DE SELECTIVIDAD ( )

OS VERBOS IRREGULARES IRREGULARIDADES COMÚNS.

UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO AVALIAÇÃO DE TESTES DE DIAGNÓSTICO

Medidas de Acurácia Diagnóstica na Pesquisa Cardiovascular

Exemplo. Dirección Xeral da Función Pública PERMISOS E LICENZAS. Permiso por parto. Permiso por parto no suposto de discapacidade do fillo.

PROCEDEMENTO FACTURA ELECTRÓNICA - UNIVERSIDADE DE VIGO 2015

MANUAL DE USUARIO DE etrades

ANEXO III MODELO DE PROGRAMACIÓN DE PROBA LIBRE DE MÓDULOS PROFESIONAIS

Control de programación en Matlab

Potencias e raíces de números enteiros

III CIRCUITO CONCELLO DE VIGO DE ATLETISMO EN PISTA - SERIES MUNICIPAIS

MESTRADO EM INFORMÁTICA MÉDICA UNIDADE CURRICULAR DE SISTEMAS DE ESTUDO COMPARATIVO O DE 2009

XII TRAVESÍA A NADO CONCELLO DE ARTEIXO XI Memorial Marina Álvarez

Rede CeMIT Cursos Gratuítos de Alfabetización Dixital MAIO Aula CeMIT de Cuntis

clases sen fume información para os escolares curso É un concurso para mozos e mozas da túa idade (12-14 anos).

ANEXO I PROCEDEMENTO CÓDIGO DO PROCEDEMENTO DOCUMENTO TIPO NOME DA VÍA NUM BLOQ ANDAR PORTA TIPO NOME DA VÍA NUM BLOQ ANDAR PORTA

PRAZAS LIMITADAS. GRUPO MÁXIMO DE 15 PERSOAS

Universidade Federal de Ouro Preto. Probabilidade e avaliação de testes diagnósticos

XEOMETRÍA MÉTRICA DO ESPAZO

Patrício Costa. Escola de Ciências da Saúde Universidade do Minho

INFORMACIÓN PARA PAIS E EDUCADORES

PANORAMA E CLAVES NO GRAN CONSUMO

Boas Maneiras em Aprendizado de Máquinas

As persoas que presentan estes trastornos manifestan, en maior ou menor medida, as seguintes características:

PIALE Integración en lingua portuguesa

Transcrição:

María Xosé Rodríguez Álvarez maria.jose.rodriguez.alvarez2@sergas.es Unidade de Epidemioloxía Clínica e Bioestatística (CHUS)

Pódome fiar do resultado dunha proba diagnóstica? Medidas da exactitude dunha proba diagnóstica: Sensibilidade, Especificidade e curva ROC

Índice 1. Probas diagnósticas en medicina 2. Avaliación da exactitude de probas diagnósticas 3. Medidas da exactitude diagnóstica Sensibilidade e Especificidade Curva de Características Operacionais do Receptor (Receiver Operating Characteristic ROC curve). 4. Conclusión/Resumen 5. Software 6. Bibliografía 3

1. Probas diagnósticas en medicina 4

1. Probas diagnósticas en medicina Unha proba diagnóstica é calquera tipo de procedemento médico realizado co fin de axudar no diagnóstico ou detección dunha enfermidade.?? 5

1. Probas diagnósticas en medicina Segundo o resultado da proba diagnóstica, estas se clasifican en: Binarias: só dous resultados (positivo e negativo). Continuas: valor numérico. Para as probas binarias, o resultado da proba proporciona a regra de clasificación. No caso das probas con resposta continua, a regra de clasificación, porén, émáis complicada. 6

2. Avaliación da exactitude dunha proba diagnóstica 7

2. Avaliación da exactitude dunha proba diagnóstica A clasificación dun individuo non está, polo xeral, exenta de erro. É necesario cuantificar os erros que se cometen na clasificación, co fin de avaliar a validez ou invalidez dunha proba diagnóstica na práctica. Debemos medir a exactitude dunha proba diagnóstica ou a súa capacidade para discriminar entre estados alternativos de saúde (enfermo/san) 8

3. Medidas da exactitude diagnóstica 9

3. Medidas da exactitude diagnóstica Probas Binarias: Sensibilidade e Especificidade Resultado da proba Verdadeiro estado Enfermo San Positivo Verdadeiro Positivo (VP) Falso Positivo (FP) Negativo Falso Negativo (FN) Verdadeiro Negativo (VN) Total VP + FN FP + VN Sensibilidade = Fracción Verdadeiros Positivos = (FVP) Especificidade = Fracción Verdadeiros Negativos = (FVN) VP VP + FN VN VN + FP 10

3. Medidas da exactitude diagnóstica Sensibilidade e Especificidade: Exemplo Tacto rectal Biopsia prostática Enfermo San Total Positivo 634 269 903 Negativo 487 1251 1738 Total 1121 1520 2641 VP VP + FN 634 634 + 487 634 1121 Sensibilidade = = = = 0. 5656 VN VN + FP 1251 1251+ 269 1251 1520 Especificidade = = = = 0. 8230 11

3. Medidas da exactitude diagnóstica A sensibilidade éa habilidade da proba para detectar a enfermidade cando está presente. A especificidade éa habilidade da proba para excluír a enfermidade cando está ausente. Indican a validez da proba Non dependen da prevalencia da enfermidade. Existen outras medidas da exactitude: Valores predictivos positivos e negativos (fiabilidade) Razón de probabilidades positivas e negativas 12

3. Medidas da exactitude diagnóstica Probas continuas: Curva de Características Operacionais do Receptor (curva ROC) No caso de probas diagnósticas con resultado continuo: Cómo podemos clasificar a un individuo como san ou enfermo? 13

3. Medidas da exactitude diagnóstica Probas continuas: Curva ROC Cada elección dun valor de corte dá lugar a unha proba binaria. Poderemos calcular a súa exactitude en termos da Sensibilidade e a Especificidade (ou 1 Especificidade). 14

3. Medidas da exactitude diagnóstica Exemplo: Cancro de páncreas Marcador CA 19 9 Pancreatite (san) 51 individuos VALOR DE CORTE: ENFERMOS SANS 15 3.4, 3.65, 3.7, 4, 4, 4.6, 4.9, 5, 5.1, 5.3, 5.3, 5.7, 6.5, 6.5, 6.5, 6.6, 6.9, 6.9, 7.6, 7.8, 7.8, 8.2, 8.2, 8.8, 8.9, 10, 10.2, 10.4, 11.1, 11.5, 14.4, 15.2, 15.4, 15.5, 16.2, 17.3, 18, 21.6, 21.8, 22.1, 25.6, 28, 31.2, 32.5, 32.6, 32.9, 44.2, 55.6, 59.2, 87.5, 107.9 Cancro de páncreas (enfermo) 90 individuos 2.4, 3.6, 3.9, 4.1, 5.6, 5.8, 6.6, 6.9, 7.8, 8.45, 10.4, 12.8, 12.8, 14.7, 15.6, 15.7, 15.7, 18, 21.8, 23.7, 27.3, 28.6, 39.3, 43.5, 45.6, 45.8, 50, 55.7, 58.7, 60.2, 70.9, 79.4, 83.3, 85.4, 90.1, 100.5, 109.7, 113.1, 162, 222, 225, 227, 235, 239, 247.6, 251, 255, 336, 361, 361, 369, 454, 464, 479, 508, 521.5, 542, 555, 592, 682, 719, 770, 900, 1021, 1079, 1090, 1490, 1520, 1600, 1630, 1715, 1810, 2106.6, 2500, 2540, 3100, 3160, 3190, 3275, 3560, 4070, 6160, 8230, 9590, 9810, 9820, 10290, 11630, 12320, 24000 15

3. Medidas da exactitude diagnóstica CA 19 9 Estado real Corte: 15 Cancro Pancreatite Positivo 76 20 Negativo 14 31 Total 90 51 Sensibilidade = 76 = 90 0.8444 Especificidade = 31 = 0.6078 1 Especificidade = 51 0.3922 16

3. Medidas da exactitude diagnóstica Probas continuas: Curva ROC Por qué escoller un valor de corte a priori? Por qué non avaliar a exactitude diagnóstica para tódolos posibles valores de corte, e logo decidir cal éo mellor? 17

3. Medidas da exactitude diagnóstica CA 19 9 Estado real Corte: 8 Cancro Pancreatite Positivo 81 30 Negativo 9 21 Total 90 51 Sensibilidade = 0.90 1 Especificidade = 0. 5882 18

3. Medidas da exactitude diagnóstica CA 19 9 Estado real Corte: 15 Cancro Pancreatite Positivo 76 20 Negativo 14 31 Total 90 51 Sensibilidade = 0.8444 1 Especificidade = 0. 3922 19

3. Medidas da exactitude diagnóstica CA 19 9 Estado real Corte: 60 Cancro Pancreatite Positivo 61 2 Negativo 29 49 Total 90 51 Sensibilidade = 0.6778 1 Especificidade = 0.0392 20

3. Medidas da exactitude diagnóstica Probas continuas: Curva ROC {( 1-Especificidade( c), Sensibilidade( c) ), c (, ) } 21

3. Medidas da exactitude diagnóstica Curva ROC: proba diagnóstica non perfecta informativa 22

3. Medidas da exactitude diagnóstica Cómo avaliamos a exactitude diagnóstica? 23

3. Medidas da exactitude diagnóstica Éhabitual resumir a información que proporciona a curva ROC en índices numéricos. O máis común éo Area Baixo a Curva (AUC) ROC. O AUC toma valores entre 0.5 (proba non informativa) e 1 (proba perfecta). 24

25 4. Conclusión/Resumen

4. Conclusión/Resumen Importancia de avaliar a exactitude dunha proba diagnóstica: válida? En función do resultado da proba diagnóstica: Binaria: Sensibilidade e Especificidade Continua: Curva ROC e área baixo a curva (AUC) 26

27 5. Software

5. Software SPSS Permite o cálculo da curva ROC e o AUC. No software de libre distribución R (www.rproject.org) existen varios paquetes que permiten o cálculo da Sensibilidade, Especificidade, VPP e VPN, LR+ e LR (DiagnosisMed), así como da curva ROC e o AUC (ROCR e proc). No software epidemiolóxico de libre distribución Epidat (www.sergas.es). 28

29 6. Referencias bibliográficas

5. Referencias bibliográficas www.fisterra.com Formación Metodología de la investigación Pepe, MS. The Statistical Evaluation of Medical Tests for Classification and Prediction, 2003. Oxford University Press. Burgueño MJ, García Bastos JL, González Buitrago JM. Las curvas ROC en la evaluación de las pruebas diagnósticas. Med Clin (Barc) 1995; 104: 661 670. 30