CONCURSO DE SELEÇÃO DE DOUTORADO EDITAL Nº 01/2018: SELEÇÃO DE CANDIDATOS AO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOQUÍMICA: DOUTORADO PROVA ESCRITA

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1 Universidade Federal do Ceará Centro de Ciências Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular Programa de Pós-Graduação em Bioquímica Campus do Pici Prof. Prisco Bezerra - Bloco 907 Telefone: +55 (85) FAX: +55(85) pg@bioquimica.ufc.br CONCURSO DE SELEÇÃO DE DOUTORADO EDITAL Nº 01/2018: SELEÇÃO DE CANDIDATOS AO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOQUÍMICA: DOUTORADO PROVA ESCRITA Data: 10/07/2017 Horário: 8:30 12:30 CPF do Candidato (a):.. - Número de inscrição: Leia atentamente as instruções antes de iniciar a prova 1. A prova terá duração de 4 h, improrrogáveis. Portanto, procure gerenciar adequadamente o seu tempo. 2. As perguntas apresentadas a seguir foram elaboradas com base no artigo em anexo MicroRNAs from the parasitic plant Cuscuta campestris target host messenger RNAs e em conhecimentos já estabelecidos sobre Bioquímica, Biologia Molecular e Fisiologia Vegetal. 3. A prova é composta por 04 questões (sendo uma em língua inglesa), que devem ser respondidas no espaço destinado para cada resposta. Para efeito de correção, não serão consideradas as respostas escritas a lápis ou fora desses espaços. 4. Todas as respostas devem ser escritas sem rasuras, utilizando canetas de tinta azul ou preta. Estarão disponíveis para os candidatos folhas de papel para rascunho. 5. Todo o material recebido deverá ser entregue junto com a prova. 6. A pergunta formulada em língua inglesa deverá ser respondida em inglês. A resposta será avaliada em função de seu conteúdo e da redação apresentada pelo candidato. 1

2 UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ CENTRO DE CIÊNCIAS DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOQUÍMICA CONCURSO DE SELEÇÃO DE DOUTORADO PROVA ESCRITA - GABARITO Questão 1. Leia atentamente o artigo MicroRNAs from the parasitic plant Cuscuta campestris target host messenger RNAs doi: /nature Baseado na sua leitura e entendimento sobre este artigo, faça uma descrição do artigo, da qual devem constar seus fundamentos teóricos, objetivos, resultados e conclusões. (4,0 pontos) Este artigo trata de investigar se micrornas produzidos pela planta parasita Cuscuta spp são capazes de modular a expressão de genes específicos em Arabidopsis thaliana, de tal maneira a ocasionar a facilitação do parasitismo. A modulação da expressão gênica na relação hospedeiro-parasita, particularmente na interação planta fungo, através de micro-rna produzidos pelo parasita e que levam ao silenciamento de genes do hospedeiro já é bem conhecida. Este trabalho é o primeiro a investigar a transferência de micrornas em casos de interação planta-planta. Os resultados obtidos mostram que determinados micrornas produzidos nos haustório de Cuscuta têm como alvo mrnas específicos do hospedeiro, cujo silenciamento provocado pelos micrornas tem um efeito positivo no estabelecimento da relação de parasitismo. O artigo mostra ainda que o silenciamento do gene SEOR1 é crucial para o estabelecimento do parasitismo, uma vez que este gene codifica uma proteina do floema que reduz a perda de fotossintatos quando o floema sofre alguma injúria. Outro aspecto importante do artigo foi mostrar que microrna produzidos por Cuscuta são capazes de silenciar genes de hospedeiros outros que não apenas A. thaliana, tal como Nicotiana benthamiana. Desta maneira ficou demonstrado que micrornas de Cuscuta são capazes de sequestrar a maquinaria de silenciamento da planta hospedeira em seu próprio benefício. 2

3 Questão 2- Faça uma distinção entre genômica, transcritômica, proteômica e metabolômica. (2,0 pontos). Genômica: é um ramo da bioquímica que estuda o genoma completo de um organismo. Essa ciência pode se dedicar a determinar a seqüência completa do DNA de organismos ou apenas o mapeamento de uma escala genética menor. A comparação de diferentes genomas (genômica comparativa), é atualmente uma ferramenta amplamente usada no estudo evolutivo do genoma de diferentes espécies. Transcriptômica ou Genômica Funcional: refere-se ao estudo das moléculas de RNA formadas a partir do processo de transcrição, ou seja expressão gênica. Então os RNAs formados, também referidos como produtos da expressão de genes, podem variar em quantidade e qualidade em diferentes órgãos, tecidos, idade de desenvolvimento e estado fisiológico de um organismo. O conjunto de RNAs de uma célula (transcriptoma) determinará as proteínas (Proteoma) a serem formadas pela célula. Proteômica é a ciência da área de biotecnologia que estuda o conjunto de proteínas e suas isoformas contidas em uma amostra biológica seja esta um organismo, seja tecido, seja organela celular ou célula, que são determinadas pelo genoma da mesma. Metabolômica: é o ramo da ciência que visa identificar e quantificar o conjunto de metabólitos - o metaboloma - produzidos e/ou modificados por um organismo.o metaboloma representa o conjunto de todos os metabólitos em uma célula, fluido biológico, tecido ou organismo, sendo estas substâncias consideradas os produtos finais dos processos celulares. 3

4 Questão 3. A via biossintética dos triacilgliceróis nas células vegetais, envolve a participação de plastídeos e do retículo endoplasmático. Descreva sucintamente o papel de cada uma destas organelas nesta via biossintética. Os plastídeos são os locais onde residem as enzimas da via biossintética dos ácidos graxos. Após sua síntese os ácidos graxos são transportados para fora dos plastídeos através da ação de transportadores específicos e subsequentemente são transferidos para o retículo endoplasmático onde residem as enzimas necessárias para a esterificação dos ácidos graxos com o glicerol, levando à formação dos triacilgliceróis. 4

5 Questão 4 As sessile organisms, plants are subjected constantly to different biotic and abiotic stress conditions. Explain how plants defend themselves from the attack of insects and of extreme abiotic conditions such as drought and high temperatures. (2,0 pontos) In order to cope with biotic and abiotic stress, plants rely on constitutive and inducible defenses. Among the constitutive defenses against biotic stresses, the accumulation of proteins, peptides or secondary compounds which can deter the attack of particular predators is widely used. Among the constitutive defenses against abiotic stresses, two of the most common examples are the accumulation of certain chemicals, such as glycine-betaine, which can confer certain degree of osmoprotection, and the accumulation of carotene in leaves as a protection against the excess of light. One of the most common inducible defenses in plants against the attack of insects is the induction of the synthesis of proteinase inhibitors, which following its ingestion by insects, can severely inhibit the growth of insect populations. When plants are subjected to drought, flooding or heat they are able to induce the synthesis of proteins or secondary metabolites which will help the plant to adapt to the specific stress. The inducible defenses in plants against abiotic or biotic stresses are mediated the phytohormones which are able to active signal transduction pathways which will ultimately result in the expression of the relevant defence gene. 5