A Progenética Hermes Pardini
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- Izabel Esteves Godoi
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2 A Progenética Hermes Pardini A Progenética é pioneira na implantação de exames moleculares, atuando neste setor desde Possuimos staff médico altamente especializado, com profissionais de referência nas áreas de biologia molecular, oncologia e hematologia. Temos um compromisso com a qualidade e a agilidade no prazo de entrega de resultados, e oferecemos suporte logístico para captação de amostras em todo o Brasil. 2
3 Índice Medicina personalizada e preventiva 5 PreventCode 5 PreventCode Mama 6 PreventCode Nutrigenômica 7 PreventCode Obesidade 12 PreventCode Cardiovascular 13 PreventCode Próstata 14 PreventCode Diabetes Tipo 2 15 PreventCode Pulmão 16 Realização do Teste 17 Referências 18 3
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5 MEDICINA PERSONALIZADA E PREVENTIVA Para a implementação de medidas preventivas, tais como periodicidade de realização de exames de rastreamento e intervenção precoce baseando-se nas mais avanças descobertas científicas relacionadas com o código genético, o Laboratório Progenética oferece os Painéis de Risco Genético para Doenças. Câncer de mama Câncer de próstata Câncer de pulmão Doenças cardiovasculares Nutrigenômica Obesidade Diabetes tipo 2 A análise dessa informação, em conjunto com os fatores ambientais, pode auxiliar nos diagnósticos e permitir uma intervenção precoce, bem como tratamentos personalizados. PAINÉIS DE RISCO GENÉTICO PARA DOENÇAS PREVENTCODE O PreventCode é um teste genético não invasivo, preventivo e rápido, que avalia o risco inerente de desenvolver certas doenças, em algum momento da vida. Ele é baseado em painéis de polimorfismos - SNPs *cuidadosamente selecionados por apresentarem uma forte correlação estatística com a suscetibilidade ou risco do aparecimento de diversas doenças ou condições. Novas tecnologias utilizam o DNA do paciente para detectar os indivíduos em risco elevado para várias doenças como câncer de pulmão, câncer de próstata, doenças cardiovasculares, diabetes, entre outras. Alguns desses testes auxiliam em terapia mais eficaz para os indivíduos, com base em seus perfis genéticos. Outros testes são preditivos e medem a susceptibilidade a doenças hereditárias e doenças onde o ambiente ou o comportamento podem desencadear o aparecimento da doença nas pessoas geneticamente mais vulneráveis. Aplicável na prevenção contra doenças cardiovasculares, diabetes tipo 2, obesidade, câncer de pulmão, câncer de mama, câncer de próstata e análise de funcionamento do metabolismo para aconselhamento personalizado. *SNPs Dentro de cada gene existem muitas mutações ou variações chamadas de polimorfismos de nucleotídeo único ou SNPs ( Single Nucleotide Polimorphisms). SNPs são uma das variações mais comuns nos genoma humano e são responsáveis pelas diferenças entre as pessoas, inclusive aquelas que afetam a saúde de um indivíduo. Um SNP ocorre quando um único nucleotídeo. - A, T, C, ou G - em um gene, difere em uma posição específica na seqüência de DNA entre membros de uma mesma espécie (ou entre pares de cromossomos de um mesmo indivíduo). Somente os SNPs não são os agentes causadores das doenças, mas servem como marcadores biológicos que em conjunto com fatores ambientais podem determinar a suscetibilidade individual a uma doença ou condição específica. 5
6 PREVENTCODE MAMA INFORMAÇÃO PERSONALIZADA PARA MEDIDAS ADICIONAIS NO CONTROLE E PROTEÇÃO DA SAÚDE DA MULHER O PreventCode Mama é o teste genético que avalia o risco inerente de desenvolver CÂNCER DE MAMA NÃO-HEREDITÁRIO Analisa o risco relativo (RR) de 41 SNPs nos genes de baixa penetrância na população. O teste avalia se a mulher possui risco moderado, alto risco ou risco muito elevado de desenvolver câncer de mama em algum momento de sua vida, em comparação com a população em geral, independente dos outros genes associados com o câncer de mama hereditário. PAINEL GENÉTICO ASSOCIADO AO CÂNCER DE MAMA Lista dos 41 SNP utilizados no estudo do COGS (Michailidou et al, Nature Genetics, Volume 45: , 2013)¹ GENES SNP GENES SNP PEX14 rs MLLT10-DNAJC1 rs PTPN22-BCL2L15-AP4B1- DCLRE1B-HIPK1 rs DNAJC1 rs Intrônico rs TCF7L2 rs METAP1D-DLX1-DLX2 rs Intrônico rs CDCA7 rs DKFZp761E198-OVOL1- SNX32-CFL1-MUS81 rs DIRC3 rs Intrônico rs ITPR1-EGOT rs Intrônico rs TGFBR2 rs NTN4 rs TET2 rs BRCA2-N4BP2L1-N4BP2L2 rs ADAM29 rs PAX9-SLC25A21 rs RAB3C rs RAD51L1 rs PDE4D rs CCDC88C rs EBF1 rs MIR FTO rs FOXQ1 rs CDYL2 rs RANBP9 rs Intronico rs ARHGEF5-NOBOX rs CHST9 rs Intrônico rs SSBP4-ISYNA1-ELL rs Intrônico rs C19orf61-KCNN4-LYPD5-ZNF283 rs HNF4G rs EMID1-RHBDD3-EWSR1 rs MIR1208 rs MKL1 rs Intrônico rs Recentemente, cientistas que participam do Collaborative Oncological Gene-environment Study COGS, publicaram uma serie de trabalhos (Nature Genetics, Volume 45, 2013) onde comparam através de Estudos de Associação Ampla do Genoma (GWAS) frequências alélicas de SNPs (polimorfismos de único nucleotídeo) em 45,290 casos de câncer de Mama e 41,880 controles de indivíduos com ascendência européia. A partir destes estudos, o Laboratório Progenetica desenvolveu o PreventCode Mama.
7 PREVENTCODE NUTRIGENÔMICA MOTIVAÇÃO E A MANUTENÇÃO DE MUDANÇAS NO ESTILO VIDA A LONGO PRAZO O PreventCode Nutrigenômica analisa 37 polimorfismos em 34 genes distintos envolvidos no metabolismo, transporte de nutrientes, remoção de toxinas e na proteção contra agentes oxidantes. O objetivo da nutrigenética é adicionar um nível de personalização para uma dieta prescrita, ajustando e selecionando a alimentação de acordo com a variabilidade genética de cada indivíduo. A dieta baseada na Nutrigenômica pode ser uma ferramenta adicional para ajudar o indivíduo a atingir um teor de nutrientes ideal. De acordo com o padrão particular de variação genética, um aconselhamento personalizado pode ser gerado com recomendações sobre a dieta e estilo de vida, personalizando objetivos específicos em nutrição e exercício físico. PAINEL GENÉTICO ASSOCIADO À NUTRIGENÔMICA GENES SNP (mutação) Efeito na Saúde e Dieta Recomendação Rs ACE - Angiotensin-converting enzyme Inseção (I) Deletion (D) A inserção no gene reduz a atividade no gene ACE. Esta atividade reduzida ou inibida tem sido associada com aumento e retenção da massa muscular. A deleção no gene ACE aumenta sua atividade enzimática. Este polimorfismo está associado com hipertensão, diminuição da sensibilidade a insulina e alterações nos níveis totais de colesterol e triglicerídeos no plasma. A prática de atividades físicas e implementação de dieta com redução de carboidratos ajudará a reduzir o índice de massa corporal (IMC), hipertensão e melhora na sensibilidade a insulina. APOC3 Apolipoprotein C-III rs O polimorfismo está associado a níveis plasmáticos mais elevados de APOC3, causando elevação nos níveis de colesterol e triglicerideos no plasma. A presença da variante também está associada à dificuldade na perda de peso. Implementação de uma dieta com redução de colesterol, gorduras saturadas e gorduras trans. Uma dieta mais rica em gorduras monoinsaturadas é determinante para as pessoas portadoras do polimorfismo. 7
8 GENES SNP (mutação) Efeito na Saúde e Dieta Recomendação CBS Cystathionine-ßsynthase rs Indivíduos com o polimorfismo tem um aumento na atividade da enzima CBS, acarretando a redução dos níveis de homocisteína no plasma. A elevação dos níveis de homocisteína no sangue são indicadores de maiores riscos para o desenvolvimento de doenças cardiovasculares. A suplementação nutricional com ácido fólico e vitamina B12 podem reduzir e normalizar os níveis séricos de homocisteína. CETP Cholesteryl ester transfer protein rs O polimorfismo está associado com a redução dos níveis de CETP, resultando na redução dos níveis de LDL e VLDL, e elevação dos níveis de HDL. Indivíduos portadores do polimorfismo tem melhor perfil lipídico e de colesterol no plasma. Implementação de uma dieta com redução de colesterol, gorduras saturadas e gorduras trans. Uma dieta mais rica em gorduras monoinsaturadas é determinante para as pessoas portadoras do polimorfismo. COLIA1 type I collagen rs O polimorfismo está associado com uma diminuição generalizada da massa óssea (osteopenia), produzindo ossos frágeis, e por um comprometimento de outros tecidos como por exemplo o tecido conjuntivo. Dimuição da ingestão de cafeína, aumento de consumo de laticíneois como yogurte, queijo e leite desnatados. Sugere-se a suplementação de Vitamina D. GSTM1 Glutathione S-transferase Mu1 deleção A deleção no gene GSTM1 está associada com a redução do VO2 max, capacidade máxima do corpo de um indivíduo em transportar e fazer uso de oxigênio durante um exercício físico. A redução do VO2 max causa a redução na oxidação de gordura durante o exercício diminuindo a queima de gordura. Implementação de uma dieta rica em legumes crucíferos (e.g. brócolis, repolhos, nabo, couveflor, agrião, rabanete, etc.) e vegetais allium (e.g.cebola e alho). GSTP1 Glutathione S-transferase P rs1695 O polimorfismo está associado a diminuição da atividade enzimática, reduzindo a proteção contra os radicais livres de oxigênio, toxinas e substâncias carcinogênicas. Implementação de uma dieta rica em legumes crucíferos (e.g. brócolis, repolhos, nabo, couveflor, agrião, rabanete, etc.) e vegetais allium (e.g.cebola e alho). 8
9 GENES SNP (mutação) Efeito na Saúde e Dieta Recomendação GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 Deleção A deleção no gene GSTT1 está associada com a redução do VO2 max, capacidade máxima do corpo de um indivíduo em transportar e fazer uso de oxigênio durante um exercício físico. A redução do VO2 max causa a redução na oxidação de gordura durante o exercício diminuindo a queima de gordura. A deleção deste gene reduz o processo de Fase II de desintoxicação. Implementação de uma dieta rica em legumes crucíferos (e.g. brócolis, repolhos, nabo, couveflor, agrião, rabanete, etc.) e vegetais allium (e.g.cebola e alho). Presença A presença do polimorfismo está associada à redução na proteção contra os radicais livres, toxinas e agentes carcinogênicos.esta variação está associada à fadiga múscular e dor articular. IL6 Inteleukin-6 rs Polimorfismo associado com a elevação na expressão de IL6, resultando no aumento dos processos inflamatórios, recuperação mais lenta e reparação do tecido muscular após o exercício, aumento do dano do tecido mole, com tempo de recuperação insuficiente entre os treinos e aumento da possibilidade de dor nas articulações. 2. Associado com Diabetes tipo 2 Implementação de dieta com alimentos ricos em Omega-3 (importante papel em alergias e processos inflamatórios, pois são necessários para a formação das prostaglandinas inflamatórias, tromboxanos e leucotrienos) e anti-oxidantes como Vitamina A, Vitamina C e Vitamina E. LPL Lipoprotein lipase rs328 Polimorfismo associado com a elevação do nível de LPL. Este é considerado uma variação protetora, com redução de triglicerídeos, LDL e HDL. A proteína sintetizada pelo LPL está localizada nas paredes dos vasos sanguíneos e no coração, nos depósitos de gordura e nos músculos. Essa enzima destrói os triglicerídeos. Dessa maneira, níveis baixos de LPL estão associados ao aumento de doenças cardiovasculares. Portanto, níveis altos de LPL são benéficos e substâncias que estimulam a ação da LPL, ajudando a evitar as doenças arteriais coronarianas. Implementação de uma dieta com redução colesterol, gorduras saturadas e gorduras trans. Uma dieta mais rica em gorduras monoinsaturadas é determinante para as pessoas portadoras do polimorfismo. MTRR Methionine synthase reductase rs Polimorfismo associado com a elevação dos níveis de níveis de Homocisteína. A elevação dos níveis de homocisteína no sangue são indicadores de maiores riscos para o desenvolvimento de doenças cardiovasculares. A suplementação nutricional com ácido fólico e vitamina B12 podem reduzir e normalizar os níveis séricos de homocisteína. 9
10 GENES SNP (mutação) Efeito na Saúde e Dieta Recomendação MTHFR Methylenetetrahyd rofolate reductase rs rs Níveis elevados de homocisteína no plasma têm sido associados com maior risco de doença cardiovascular. Embora ainda não estejam totalmente compreendidos os mecanismos envolvidos da hiper-homocisteinemia na indução de coronariopatias, existem evidências em relação ao dano oxidativo endotelial, proliferação de músculo liso endotelial e oxidação de lipoproteínas de baixa densidade. Dentre alguns fatores que podem levar à hiper-homocisteinemia são: Deficiência de metionina sintetase por depleção de metilcobalamina (B12);Diminuição na atividade da MTHFR (metilenotetrahidrofolato redutase) por concentrações baixas de folatos, tetrahidrofolato ou etilismo. A elevação dos níveis de homocisteína no sangue são indicadores de maiores riscos para o desenvolvimento de doenças cardiovasculares. A suplementação nutricional com ácido fólico e vitamina B12 podem reduzir e normalizar os níveis séricos de homocisteína. MTR methyltetrahydrofo late-homocysteine methyltransferase rs Polimorfismo associado com a elevação dos níveis da enzima MTR diminuindo a homocisteína no plasma. Protetor para níveis altos de homocisteínas NOS3 nitric oxide synthase 3 rs Portadores deste polimorfismo no gene NOS3 possuem concentrações plasmáticas de TAG (triacilglicerol) mais responsivas a ação de n-3 PUFA (ácido graxo poliinsaturado). Esta observação sugere que indivíduos portadores deste polimorfismo podem se beneficiar mais do consumo de ácidos graxos poliinsaturados para a redução da concentração plasmática de TAG (triacilglicerol). Dieta com alimentos ricos em Omega-3 (importante papel em alergias e processos inflamatórios, pois são necessários para a formação das prostaglandinas inflamatórias, tromboxanos e leucotrienos) e antioxidantes com a Vitamina A, Vitamina C e Vitamina E. PPARGC1A peroxisome proliferator - activated receptor gamma coactivator 1-alpha rs Este polimorfismo está associado com a hipertensão, regulação da homeostase do colesterol e ao desenvolvimento da obesidade. Implementação de atividade física e dieta melhora o perfil. LIPC hepatic lipase rs rs Polimorfismos no promotor do gene LIPC estão associados com a baixa taxa de transporte de glicose estimulado pela insulina. Também associado com baixas taxas de HDL e altas de taxa de LDL. Implementação de atividade física e dieta baixa em carboidratos ajudarão a reduzir o índice de massa corporal e hipertensão. Aumento na sensibilidade a insulina. PON1 paraoxonase 1 rs662 O polimorfismo está associado a baixa atividade do gene PON1 resultando em altas taxas de oxidação do LDL. Oxidação do LDL parece ser o mediador da artereoesclerose e doenças coronarianas. Implementação de dieta rica em polifenois, componentes naturais de uma ampla variedade de alimentos: e.g. cebola, maçã, chá, vinho tinto, uvas vermelhas, suco de uva, morango e certas nozes. rs Polimorfismo associado ao alto risco de diabetes tipo 2. 10
11 GENES SNP (mutação) Efeito na Saúde e Dieta Recomendação SOD2 Superoxide dismutase 2 rs10370 Ala 16 Va1 Polimorfismo associado com a redução da proteção antioxidante do SOD2. Implementação de dieta com alimentos ricos em Omega-3, Vitamina A, Vitamina C e Vitamina E. SOD3 Superoxide dismutase 3 rs Polimorfismo associado com a redução da proteção antioxidante do SOD3. Implementação de dieta com alimentos ricos em Omega-3, Vitamina A, Vitamina C e Vitamina E. TNFalfa tumor necrosis factor-alf rs TNF alfa é um potente peptídio inflamatório. Este polimorfismo está associado e elevados níveis de TNFalfa que podem resultar em processos inflamatórios, recuperação mais lenta do tecido muscular e reparação após o exercício. Implementação de dieta com alimentos ricos em Omega-3, Vitamina A, Vitamina C e Vitamina E. rs Polimorfismo Fok1 VDR vitamin D receptor rs Polimorfismo Bms1 rs Polimorfismo Apa1 Indivíduos portadores do polimorfismo parecem ter maior perda óssea. Aumento de consumo de laticíneos (e.g.yogurte, queijo, leite e desnatados). Sugere-se a suplementação de Vitamina D e Cálcio. rs Polimorfismo Taq1 Dimuição da ingestão de cafeína, alem do aumento de consumo de vitamina D e Calcio. 11
12 PREVENTCODE OBESIDADE INTERAÇÕES ENTRE O CÓDIGO GENÉTICO COM FATORES AMBIENTAIS E COMPORTAMENTAIS O PreventCode Obesidade baseia-se em um painel de 9 SNPs cuidadosamente selecionados por apresentarem uma forte correlação estatística com a suscetibilidade ou risco do desenvolvimento da obesidade e elevação do índice de massa corporal (IMC). A influência genética mais observada na obesidade é de caráter poligênico, conferindo a certos indivíduos uma suscetibilidade a diferentes manifestações da doença. A comunidade científica tem deduzido que o recente aumento na prevalência da obesidade está correlacionado com a exposição de indivíduos geneticamente suscetíveis a mudanças seculares em fatores ambientais e comportamentais, incluindo o aumento da disponibilidade e redução de custo dos alimentos de alto valor calórico combinados com a redução da atividade física durante o trabalho e lazer². O teste genético PreventCode Obesidade faz parte de uma estratégia para a implementação de medidas preventivas tais como periodicidade de realização de exames de rastreamento e intervenção precoce baseando-se nas mais avançadas descobertas científicas relacionadas ao código genético. A obesidade é um fator determinante no risco de desenvolvimento de várias doenças crônicas, como a diabetes tipo 2, hipertensão, doenças cardiovasculares, apneia do sono, problemas psicossociais, doenças ortopédicas e diversos tipos de câncer. PAINEL DE GENES PREVENTCODE OBESIDADE GENES NEGR1 TMEM18 GNPDA2 MTCH2 BDNF FAIM2 SH2B1 FTO MC4R SNP rs rs rs rs rs rs rs rs rs
13 PREVENTCODE CARDIOVASCULAR IDENTIFICAÇÃO DE RISCO MODERADO, ALTO OU MUITO ELEVADO PARA DESENVOLVIMENTO DE DOENÇAS CARDIOVASCULARES O PreventCode Cardiovascular é um teste genético que se baseia em um painel de 22 SNPs em 17 regiões cromossômicas distintas, cuidadosamente selecionados por apresentarem uma forte correlação estatística com a suscetibilidade ou risco de desenvolvimento de doenças cardiovasculares 3,4,5 em algum momento da vida em comparação com outros indivíduos. A maioria das doenças cardiovasculares possui um caráter poligênico, contendo tanto contribuições de fatores hereditários, como também de fatores ambientais e comportamentais. Estima-se que os fatores hereditários sejam responsáveis por aproximadamente 30%-60% da variação interindividual no risco para o desenvolvimento de doença arterial coronariana 3. Possibilita a implementação de medidas preventivas tais como periodicidade de realização de exames de rastreamento e intervenção precoce, baseando-se nas mais avançadas descobertas científicas relacionadas com o código genético. Permite a tomada de decisões para reduzir o risco de doença, como prática de exercícios, dieta equilibrada, controle de visitas ao cardiologista, entre outras medidas adicionais para controlar e proteger a saúde do paciente. PAINEL GENÉTICO PARA DOENÇAS CARDIOVASCULARES GENE SNP ID GENE SNP ID F5 rs6025 CDKN2B-AS1 rs SORT1 rs INTRONIC rs MIA3 rs INTRONIC rs WDR12 rs CDKN2A, CDKN2B rs MRA5 rs DAB2IP rs LOC rs CXCL12 rs INTRONIC rs F2 rs PHACTR1 rs CHRNA3 rs LPA rs ZFHX3 rs SEC11B rs SMARCA4 rs INTRONIC rs MRPS6GE rs
14 PREVENTCODE PRÓSTATA ANÁLISE DE SUSCETIBILIDADE OU RISCO DO APARECIMENTO DO CÂNCER DE PRÓSTATA O PreventCode Próstata é um teste genético que se baseia em um painel de 5 SNPs cuidadosamente selecionados por apresentarem uma forte correlação estatística com a suscetibilidade ou risco do aparecimento do câncer de próstata. O teste genético PreventCode Próstata faz parte de uma estratégia para a implementação de medidas preventivas tais como periodicidade de realização de exames de rastreamento e intervenção precoce baseando-se nas mais avançadas descobertas científicas relacionadas com o código genético. De acordo com dados do Instituto Nacional de Câncer (INCA), no Brasil o câncer de próstata é o segundo tipo de câncer mais frequente entre os homens. Para o ano de 2012, foram estimados novos casos de câncer de próstata. PAINEL RISCO GENÉTICO AO CANCER DE PRÓSTATA GENE HNF1B Intergênico Intergênico LOC Intergênico SNP ID rs rs rs rs rs
15 PREVENTCODE DIABETES TIPO 2 INFORMAÇÃO PERSONALIZADA PARA TOMAR MEDIDAS ADICIONAIS PARA CONTROLAR E PROTEGER A SAÚDE O PreventCode Diabetes tipo 2 é um teste genético rápido desenvolvido pelo Laboratório Progenética que se baseia em um painel de 4 SNPs cuidadosamente selecionados por apresentarem uma forte correlação estatística com a suscetibilidade ou risco do aparecimento da diabetes tipo 2. O teste genético PreventCode Diabetes Tipo 2 faz parte de uma estratégia para a implementação de medidas preventivas tais como periodicidade de realização de exames de rastreamento e intervenção precoce, baseando-se nas mais avançadas descobertas científicas relacionadas com o código genético. A partir dessa informação, o paciente poderá tomar medidas para reduzir o risco de doença, como praticar exercícios, ter uma dieta equilibrada, fazer visitas frequentes ao seu medico entre outras. A identificação de variantes de DNA que influenciam a predisposição a doença podem fornecer pistas para os processos envolvidos na patogênese, oferecendo oportunidades para a utilização da medicina personalizada através da estratificação do individuo de acordo com o risco e na classificação mais precisa do subtipo da doença 6,7. PAINEL DE GENES E SNPS ESTUDADOS NO PREVENTCODE DIABETES GENE CDKAL1 SNP ID rs p21.3 rs PPARG TCF7L2 rs rs
16 PREVENTCODE PULMÃO FATORES GENÉTICOS CONTRIBUEM PARA O RISCO DE DESENVOLVER CÂNCER DE PULMÃO O PreventCode Pulmão é um teste genético rápido desenvolvido pelo Laboratório Progenética que se baseia em um painel de 7 SNPs cuidadosamente selecionados por apresentarem uma forte correlação estatística com a suscetibilidade ou risco do aparecimento do câncer de pulmão. PreventCode Ca Pulmão avalia o risco inerente de desenvolver câncer de pulmão em fumantes e ex-fumantes. O teste identificará risco moderado, alto risco ou risco muito elevado de desenvolver câncer de pulmão em algum momento de sua vida, em comparação com outros indivíduos. Estudos epidemiológicos têm mostrado que fatores genéticos também contribuem para o risco de desenvolver câncer de pulmão PAINEL GENÉTICO ASSOCIADO À PREDISPOSIÇÃO AO CÂNCER DE PULMÃO GENE CLPTM1L CLPTM1L TERT GPC5 CHRNA3 CHRNA5 AGPHD1 SNP ID rs rs rs rs rs rs rs Recentemente, cientistas descobriram uma associação entre o diagnóstico de câncer de pulmão e duas variantes específicas no genoma. Uma variante está localizada no cromossomo 15 no cluster do gene receptor de acetilcolina nicotínica. Em fumantes, esta mesma variação também aumenta o risco de Dependência da Nicotina e Doença Arterial Periférica. A segunda variante está localizado no cromossomo 5 do gene da telomerase. Um possível papel da susceptibilidade genética ao câncer de pulmão foi sugerido baseando-se na aglomeração e segregação familiar de casos da doença. Todos os indivíduos possuem uma combinação única de marcadores polimórficos que participa e modifica a susceptibilidade genética para diversas condições incluindo respostas do organismo a exposição a drogas, químicos e carcinógenos. 16
17 REALIZAÇÃO DO TESTE 1. COLETA E ENVIO DO TESTE Utilizar kit próprio fornecido pelo Progenética para o exame PreventCode. Para a realização do exame são obrigatórios: 1. Apresentação de pedido médico (exceto Nutrigenômica) 2. Preenchimento do Termo de Ciência PreventCode 3. Preenchimento do formulário Identificação do paciente PreventCode Seguir as instruções de coleta do kit. Não realizar higiene bucal três horas antes da coleta. É recomendado jejum de três horas. 2. METODOLOGIA: PCR SEGUIDO DE SEQUENCIAMENTO BIDIRECIONAL DIRETO A amostra coletada do swab bucal é processada no laboratório para a extração do DNA genômico. Este DNA é analisado qualitativamente e quantitativamente por técnicos qualificados permitindo que somente amostras de alta qualidade avancem para estágios posteriores do exame. Regiões previamente determinadas (dependendo do tipo de painel selecionado) serão amplificadas pela técnica de PCR e submetidas para análise sequencimento do DNA parade identificação simultânea de SNPsdiversos polimorfismos com alta sensibilidade e reprodutibilidade. 3. RELATÓRIO DO PAINEL DE RISCO GENÉTICO Formato do resultado que apresenta informações relativas ao perfil genético individual associado a cada polimorfismo com os níveis de risco elevado, moderado ou baixo quando comparado com o risco geral da população para a condição investigada. São representadas por símbolos estabelecidos. Os dados são analisados por um software especificamente desenvolvido para este tipo de aplicação e os resultados apresentados ao paciente na forma de um detalhado relatório. Estes relatórios contem informações referentes aos SNPs identificados, o valor do fator de risco associado com cada SNP e valor de risco total que leva em consideração a presença simultânea de todos os polimorfismos, além de todas as referencias literárias pertinentes. 4. INTERPRETAÇÃO DOS RESULTADOS Os resultados são válidos somente para a avaliação de risco genético nos polimorfismos selecionados, não excluindo a presença de outros fatores relevantes a condição investigada. Os resultados não significam que o paciente tenha no presente ou irá desenvolver no futuro as patologias investigadas. O exame apenas avalia apenas o risco relativo (RR) baseado no genótipo do paciente para determinados polimorfismos. Os resultados não descartam ou excluem a presença das patologias investigadas. A exclusão ou diagnóstico deve ser feita por profissionais médicos qualificados com a utilização de testes de diagnóstico apropriados e monitoramento clínico. Em sua maioria, os estudos utilizados como referência no relatório de resultados, usaram como população referência, a população HapMap-CEU (branca de ancestralidade europeia). Logo, os resultados e as frequências alélicas se aplicam a esta população. 17
18 REFERÊNCIAS 1. Michailidou K, et al. Large-scale genotyping identifies 41 new loci associated with breastcancer risk. Nat Genet Apr;45(4): Scuteri A, Sanna S, Chen WM, Uda M, Albai G, Strait J, Najjar S, Nagaraja R, Orrú M, Usala G, Dei M, Lai S, Maschio A, Busonero F, Mulas A, Ehret GB, Fink AA, Weder AB, Cooper RS, Galan P, Chakravarti A, Schlessinger D, Cao A, Lakatta E, Abecasis GR. Genome-wide association scan shows genetic variants in the FTO gene are associated with obesity-related traits. PLoS Genet Jul;3(7):e Wallace C, Newhouse SJ, Braund P, Zhang F, Tobin M, Falchi M, Ahmadi K, Dobson RJ, Marçano AC, Hajat C, Burton P, Deloukas P, Brown M, Connell JM, Dominiczak A, Lathrop GM, Webster J, Farrall M, Spector T, Samani NJ, Caulfield MJ, Munroe PB. Genome-wide association study identifies genes for biomarkers of cardiovascular disease: serum urate and dyslipidemia. Am J Hum Genet Jan;82(1): Wang AZ, Li L, Zhang B, Shen GQ, Wang QK. Association of SNP rs on chromosome 1q41 and rs on 1p13.3 with myocardial infarction in an American caucasian population. Ann Hum Genet Jul;75(4): Hiura Y, Fukushima Y, Yuno M, Sawamura H, Kokubo Y, Okamura T, Tomoike H, Goto Y, Nonogi H, Takahashi R, Iwai N. Validation of the association of genetic variants on chromosome 9p21 and 1q41 with myocardial infarction in a Japanese population. Circ J Aug;72(8): Travers ME, McCarthy MI. Type 2 diabetes and obesity: genomics and the clinic. Hum Genet Jul;130(1): doi: /s Epub 2011 Jun 7. Review. 7. Vimaleswaran KS, Loos RJ. Progress in the genetics of common obesity and type 2 diabetes. Expert Rev Mol Med Feb 26;12:e7. doi: /S Review. 8. Raben, A. et al. Phase II trial of combined surgical resection, high dose rate intraoperative radiation therapy, and external beam radiotherapy for malignant pleural mesothelioma. International Journal of Radiation Oncology Biology Physics, v. 39, n. 2, p , Seregni, E. et al. Tumor-Marker Evaluation in Patients with Lung-Cancer. Scandinavian Journal of Clinical & Laboratory Investigation, v. 55, p , Kiyohara C, Otsu A, Shirakawa T, Fukuda S, Hopkin JM. Genetic polymorphisms and lung cancer susceptibility: a review. Lung Cancer Sep;37(3): Review. 11. Falvella FS, Alberio T, Noci S, Santambrogio L, Nosotti M, Incarbone M, Pastorino U, Fasano M, Dragani TA. Multiple isoforms and differential allelicexpression of CHRNA5 in lung tissue and lung adenocarcinoma. Carcinogenesis James MA, Wen W, Wang Y, Byers LA, Heymach JV, Coombes KR, Girard L, Minna J, You M. Functional characterization of CLPTM1L as a lung cancer risk candidate gene in the 5p15.33 locus. PLoS One. 2012;7(6):e doi: /journal.pone Epub 2012 Jun 4. PubMed PMID:
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20 20 Responsável Técnico: Dr. Carlos Gil Moreira Ferreira - CRM
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