A experiência do Herbário SP na produção e divulgação de imagens do acervo



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Material biológico compreende todo material vivo ou morto de importância técnico-científica que faz parte do acervo das coleções.

Transcrição:

A experiência do Herbário SP na produção e divulgação de imagens do acervo Maria Candida Henrique Mamede Curadora de Fanerógamas Instituto de Botânica São Paulo, Brasil

Instituto de Botânica Fundação: 9 Novembro 1938 Herbário (Instituto de Botânica) Orquidário (Jardim Botânico) Frederico Carlos Hoehne Museu Botânico Barbosa Rodrigues

Herbário SP Escola Politécnica Plantas medicinais: A. Usteri

Herbário SP Comissão Geográfica e Geológica de São Paulo, 1888-1903 A. Loefgren & G. Edwall 4.226 coleções 171 tipos

Herbário SP Horto Oswaldo Cruz Principal coleção de F.C. Hoehne (1927-1938)

Herbário SP Museu Paulista H. Luederwaldt

Organização Herbário SP > 490.000 coleções Staff: 33 pesquisadores, 100 estudantes (graduação e pós-graduação) Biblioteca Revistas Livros Hoehnea, Boletim do Instituto de Botânica Flora Fanerogâmica do Estado de São Paulo Flora Fanerogâmica da Ilha do Cardoso

Organização Fanerógamas: M. Candida H. Mamede Pteridófitas: Jefferson Prado Briófitas: Denilson Fernandes Peralta Algas: Célia L. Sant Anna Fungos & Líquens: Michel N. Benatti Palinoteca: Cynthia F.P. Luz Xiloteca: Agnes E. Luchi

Curadoria Visitantes/ano: 100-150 Intercâmbio: todos os herbários cadastrados no Index Herbariorum

Bancos de dados Brahms & Access specieslink 94.265 Fanerógamas 28.669 Algas 20.830 Briófitas INCT Herbário Virtual 5.117 imagens Fanerógamas

http://splink.cria.org.br

Coleção Tipo 2.413 tipos 1.782 imagens http://splink.cria.org.br Família Tipos Orchidaceae 493 Leguminosae 220 Malpighiaceae 144 Myrtaceae 130 Melastomataceae 114 Begoniaceae 99 Bromeliaceae 90 Asteraceae 84 Rubiaceae 63 Euphorbiaceae 61 Lauraceae 57 Poaceae 52 Apocynaceae 48

Global Plant Initiative - 2009 Coleção tipo Scanner Epson

3 minutos 4 minutos

GPI - Material volumoso

INCT Herbário Virtual - 2011 Canon EOS 550D KISSX4 Canon Macro Ring Lite MR-14EX

Código de barras do espécime Escala de cores Gretag Macbeth Mini ColorChecker Escala com logotipo institucional

Configuração da máquina Modo: Manual Abertura do diafragma: F4.5 ISO: 100 Foco automático: multifoco Imagem RAW (bruta) Anti-choque Disparo: 5 segundos

Processamento da imagem Transformar RAW em TIF Selecionar área (Trim image) Salvar o arquivo nomeando com o código de barras Inserir o código de barras no banco de dados Enviar para o CRIA Imagens (ftp) Banco de dados (splink)

Processamento da imagem Imagem original Imagem processada 2 minutos

Material volumoso

Scanner Canon

Estratégia 1 Digitalizar coleções científicas importantes (tipos e históricas) Tipos: 2.500-2.600 imagens Comissão Geográfica e Geológica de São Paulo: 4.100 imagens

Estratégia 2 Digitalizar toda a coleção Annonaceae: digitalização simultanea à informatização Início: 9/4/2012 Fim: 15/9/2012 Total de imagens: 1.222

Estratégia 3 Digitalizar exsicatas representativas de cada táxon Espécime com flor Espécime com fruto Identificação confiável (especialista) Distribuição geográfica Material identificado apenas ao nível de gênero? MYRTACEAE: 525 imagens

Família Registros Imagens Taxa total Taxa imagens Extra BR Extra Neotrópicos Leguminosae 17333 433 3159 194 908 873 2092 Myrtaceae 10754 708 1401 142 482 439 820 Malpighiaceae 10042 208 522 53 35 0 469 Melastomataceae 9349 278 1003 162 177 12 829 Rubiaceae 9546 236 1003 58 265 92 853 Euphorbiaceae 6915 154 846 41 205 123 682 Orchidaceae 6941 238 1789 183 162 98 1508 Apocynaceae 3978 205 621 112 116 89 420 Lauraceae 2553 97 344 45 67 35 264 Begoniaceae 1423 131 164 54 4 0 110 Phyllanthaceae 744 42 103 8 18 13 82 24/08/2012 8129 Fanerógamas: 400.000 coleções 92.633 registros 2 imagens = 16.258 3 imagens = 24.387

Leguminosae

Myrtaceae

Orchidaceae

Rubiaceae

Perspectivas futuras Coleções importantes Tipos Coleções históricas (Gardner, Regnell, Sellow, Blanchet, Saint-Hilaire) Coleções representativas dos taxa Espécimes com flor e fruto Distribuição geográfica

Perspectivas futuras Mecanismos de controle de qualidade Qualidade da imagem Consistência da informação

Colaboradoras Fátima Souza Buturi Elaine Alves da Silva Renata de Almeida Scabbia

Apoio

Obrigada! mcmamede@gmail.com