Os Protozoários juntamente com as bactérias e fungos, os protozoários auxiliam na decomposição de matéria orgânica.

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1 1. 1- Discuta a afirmativa "Com as técnicas mais tradicionais de pesquisa, no máximo conseguimos visualizar cerca de 10% da diversidade bacteriana existente". De acordo com a afirmativa, as técnicas mais tradicionais de pesquisa da grande diversidade de bactérias surgiram em sua maioria a partir de isolamentos de pesquisas em laboratórios. O que é muito dificultoso apesar das grandes tecnologias, pois as bactérias como um ser microscópico necessita de um meio específico para o seu crescimento e posterior desenvolvimento. Embora 10% da diversidade bacteriana existente seja um número bastante considerado, pois segundo Bohannon, a nossa diversidade microbiológica analisada pelos métodos tradicionais de cultura em laboratórios é menor que 1%. Contudo podemos concluir que apesar desse microorganismo que habitam o solo serem tão pequeno ainda precisamos evoluir para podermos descobrir a sua tão grande colaboração e imensidade. A resposta está essencialmente correta, mas deve ser muito mais aprofundada Porque podemos afirmar que a microbiologia do solo é uma das principais bases da agricultura mundial? Se observamos o termo da palavra microbiologia derivada de três palavras gregas: mikros = pequeno; bios= vida e Logus= estudo. Logo compreendemos que microbiologia significa o estudo de organismos microscópicos, então nos perguntamos, qual a importância desses organismos tão pequenos para o nosso solo? O desenvolvimento da microbiologia como ciência trouxe grandes benefícios, tais como o uso de boas práticas de higiene e controle sanitário bem como o uso de antibióticos, identificação de micróbios, seus mecanismos de ação e patogenias causadas por eles em conjunto com seus tratamentos e o desenvolvimento de técnicas de culturas de microrganismos serem benéficos tanto para a alimentação como para a saúde. Os microrganismos podem servir de fontes de produtos e processos para o benefício da humanidade, entre vários benefícios podemos destacar: - controle biológico - controlando outros microrganismos ou insetos, causadores de pragas e doenças nas plantas, com a finalidade de produzir alimento com alta qualidade. - atividades químicas dos microrganismos no solo: essa atividade é de grande importância para a agricultura mundial, pois através dela podemos produzir alimentos em uma maior escala objetivando atender a necessidade da população mundial. Com isso podemos concluir a importância de uma ciência como a Microbiologia, a qual tem um papel importantíssimo na vida do ser humano, podendo garantir uma produção alimentícia na agricultura mundial. Extremamente superficial. Embora os dois aspectos citados sejam realmente dos mais, ou mesmo os mais importantes, você não disse quase nada. Por exemplo, como estas atividades químicas afetam a agricultura? E as simbioses micorrízica e rizobiana, ou a fixação biológica de N por via associativa? Por outro lado, e as interações patogênicas? E por aí vai Considerando as principais funções ecológicas da biologia do solo, discuta a participação de cada uma das principais classes de organismos em cada função. Pelo que eu entendi é para eu comentar sobre o papel de uma das principais classes de organismo presente no solo: As bactérias têm uma função ecológica de fundamental importância para a manutenção de vida em nosso planeta. Destacam-se, neste caso as bactérias decompositoras ou saprófilas, que, juntamente com certos fungos, atuam na natureza consumindo a matéria orgânica morta e transfomando-a em matéria inorgânica simples, que pode ser reaproveitada por outros seres, especialmente as plantas. Os Protozoários juntamente com as bactérias e fungos, os protozoários auxiliam na decomposição de matéria orgânica. Os fungos são importantes para o equilíbrio ecológico de inúmeros ecossistemas, uma vez que, em sua maioria, atuam como decompositores. Os liquens resultam da associação entre algas unicelulares e fungos. Nssa inetração, as algas constituem os elementos produtores, isto é, sintetizam matéria orgânica e fornecem para os fungos parte do alimento

2 produzido; estes com suas hifas envolvem e protegem as algas contra a desidratação, além de lhes fornecer água e sais minerais que retiram do substrato. Novamente essencialmente correto, mas novamente extremamente superficial. Por exemplo, ao falar nas bactérias, eu esperaria um nível de detalhamento muito maior, incluindo alguns exemplos, de outros mecanismos de atuação além da decomposição, tal como fixação de nitrogênio, ou autotrofia em ambiente anaeróbico, e por aí vai. 1, Relacione os conceitos r e k com os organismos do solo, em particular considerando a diferença entre rizosfera e solo "bulk". Você esperaria que um destes grupos dominasse em um dos dois ambientes? Justifique. A seleção r está relacionada com locais com abundância de substrato; enquanto que na seleção k ocorre em habitats com pouco substrato. Considerando a diferença entre rizosfera e solo bulk pode-se concluir que a rizosfera predominaria na seleção r e o solo bulk na seleção k, pelo fato de (r x rizosfera) e ( k x bulk) serem diretamente proporcionais, ou seja em um habitat com muito substrato teremos um número mais elevado de rizosfera, pois ela necessita de um ambiente mais abundante de substrato devido a grande concentração de microorganismos envolvidos a sua volta, enquanto que em um habitat com pouco substrato ser mais propicio a solo bulk, pelo fato do mesmo ser mais compacto e esse tipo de habitat ser mais específico para ele. A ordem está invertida. O r é realmente ligado com a rizosfera, mas a lógica é exatamente a inversa. Ou seja, o r predomina na rizosfera que tem alta população porque tem muito nutriente, e não a rizosfera tem muito nutriente porque tem alta população Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo tenha um bom entendimento do artigo. O artigo fala sobre os grandes avanços e descobertas da evolução dos microorganismos, deixando bem claro que os padrões da evolução microbiana está relacionado com quatro fatores:1-seleção; 2- dispersão; 3-deriva e 4-mutação. Podemos destacar a seleção, a qual NO MEU VER é uma das mais responsáveis evoluções microbianas. Sabemos que o habitat desses microorganismos mudam com o tempo. Um artigo de oito páginas de texto denso, bem escrito e profundo, ser resumido a quatro linhas não é resumir. É o resumo do abstract do resumo da matéria de divulgação sobre o artigo. Você tocou, muito de leve, com medo de encostar a mão nos pontos principais realmente, mas daí a ter feito um resumo suficiente para permitir um bom entendimento do artigo tem uma grande distância. A ideia de um resumo de artigo científico é poder evitar ter de ler novamente o mesmo artigo, enquanto permite que suas informações essenciais possam ser utilizadas de forma confiável quando vamos escrever uma introdução, ou discutir algum resultado. Como esta questão tem peso 2, e esta é a primeira vez, vou ser generoso e dar um 2, mas realmente suas respostas de modo geral foram muito mais superficiais do que seria o esperado em um mestrando. 1. 1) Cite alguns dos principais centros de pesquisa em microbiologia do solo no Brasil, e qual a principal especialidade deles. Resposta: Dentre os principais centros de pesquisa em microbiologia do solo no Brasil podemos destacar: - Instituto agronômico de campinas (IAC) onde foi criado o primeiro laboratório de microbiologia agrícola do Brasil, principais atuações: fixação biológica do nitrogênio, rizobactérias promotoras de crescimento de plantas, micorrizas e atividade e diversidade da microbiota edáfica. - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Agrobiologia- CNPAB): É um dos grandes centros de pesquisa em microbiologia do solo no Brasil. Principais linhas de pesquisa são: Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN) em leguminosas e em não leguminosas, especialmente gramíneas, em Biologia Molecular ( genoma e proteoma ), Recuperação de Áreas Degradadas, Agricultura Orgânica, Ciclagem de Nutrientes, Diversidade de Microorganismos e Fauna do Solo e Biossegurança. - ESALQ departamento de ciências do solo atuando na área de microbiologia com as principais atividades desenvolvidas: Pesquisa em ecologia de fungos micorrízicos, indicadores microbiológicos e bioquímicos

3 de qualidade do solo, estratégias microbiológicas de recuperação de áreas degradadas, rizobiologia, uso de resíduos agro- industriais como fertilizantes, diversidade microbiana em ecossistemas naturais e agrícolas. - Universidade Federal de Lavras (UFLA) ciências do solo atuando na área de microbiologia com as principais atividades desenvolvidas: Os estudos do grupo concentram-se nas simbioses mutualístas entre plantas, bactérias (Fixação Biológica de N2) e fungos (micorrízas) destacando se resultados sobre a capacidade nodulífera (simbiose com rizóbio) de leguminosas florestais tropicais e caracterização, taxonomia e diversidade de rizóbio. - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) ciências do solo atuando na área de microbiologia com as principais atividades desenvolvidas: fixação biológica de nitrogênio. - Universidade Federal de Viçosa (UFV) as principais atividades desenvolvidas em microbiologia do solo: Associações biológicas: Ecologia, fisiologia, genética, regulação de expressão gênica nas interações planta/microrganismo. Temas ligados às associações micorrízicas e à genética de fungos fitopatogênicos são abordados. -Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) principal linha de pesquisa em microbiologia é na fixação biológica de nitrogênio. -Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) com as principais linhas de pesquisa: fixação biológica de nitrogênio, diversidade microbiana no solo e avaliação da atividade dos microrganismos do solo e seus efeitos nos ciclos biogeoquímicos; transformações microbianas de resíduos orgânicos dispostos no solo. Estudo das interações entre plantas e microrganismos fixadores de nitrogênio. Excelente. A única ressalva é que a além da EMBRAPA Agrobiologia, outros centros da EMBRAPA têm grande importância nesta área de pesquisa, em particular a Soja, e historicamente Cerrados e Arroz e Feijão, embora estes não estejam particularmente ativos atualmente ) Discuta a importância da redundância funcional na capacidade do solo sofrer intervenções mantendo as funções ecológicas mais importantes. Respostas: Redundância funcional é uma característica das comunidades biológicas que descreve o quão sobrepostas são as espécies quanto ao seu desempenho no funcionamento do ecossistema. Essa redundância funcional tem grande importância para o solo principalmente por esse apresentar uma grande diversidade de espécies que desempenham funções importantes para o seu funcionamento e por está sofrendo alterações com o seu uso que podem causar perda de algumas espécies e assim provocar mudanças em atividades ou processos de grande importância. É graças a redundância funcional das espécies que se refere a diversidade funcional de um grupo que o funcionamento do ecossistema é mantido, ou seja, mesmo com a perca de uma espécie não vai causar nenhum dano no funcionamento do ecossistema. Por exemplo, imaginemos duas espécies aparentemente redundantes (A e B) desempenhem uma mesma função e que a espécie A predomine sobre a espécie B em abundância, já que as condições ambientais existentes favorecem a espécie A. Então, quando o ambiente se altera de modo que as novas condições passam a favorecer a espécie B, causando declínio do desempenho da espécie A, a espécie B aumenta em abundância e desempenho de modo que o funcionamento do sistema permanece inalterado. Se a espécie A fosse a única espécie do sistema no momento da mudança ambiental, ocorreria uma perda no funcionamento do ecossistema. Portanto, nesse sentido, a redundância das espécies é um traço importante dos sistemas naturais. Excelente. Vale a pena destacar, no entanto, que a grande diversidade de espécies para uma mesma função é exatamente o significado da redundância funcional ) Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo tenha um bom entendimento do artigo. Resposta: O artigo referem-se à importância de se entender a organização dos padrões biogeográficos e os processos que resultam em tais padrões, enfatizando quatro processos fundamentais a seleção, deriva, dispersão e mutação. A distribuição biogeográfica microbiana se concentra em padrões de distribuição espacial. A evidência de que os micoorganismos apresentam um padrão de distribuição biogeográfico está relacionado a duas categorias a primeira é a existência de espécies endêmicas que por definição uma espécie endêmica é restrita a um determinado local não estando distribuída uniformemente em toda a terra. A segunda evidência é a detecção de padrões de similaridade genética entre a taxa microbiana em diferentes locais. No entanto diante dos estudos ainda não se encontrou evidência para os padrões

4 biogeográficos microbiano em primeiro lugar devido à presença de microorganismos cosmopolita, organismos que estão distribuídos em todas as partes do mundo. Em segundo lugar podemos destacar que os padrões biogeográficos podem existir na ausência de endemismo. Quando estabelecido à existência dos padrões biogeográficos microbianos muitos pesquisadores começaram a desenhar a alguns modelos para avaliar os processos que geram e mantêm estes padrões. Este artigo propôs um foco sobre quatro processos fundamentais que formam a biogeografia microbiana que é regida pela interação evolutiva e ecológica de quatro processos principais a seleção, deriva, dispersão e mutação. Para demonstrar como o processo de seleção deriva, dispersão e seleção atuam na formação dos padrões biogeográficos microbianos é abordado o uma relação de decaimento está abordagem busca correlacionar semelhanças taxonômicas com a distância geográfica. O processo de seleção geralmente diferencia composição microbiana entre locais. A seleção tenderá a produzir uma relação de distância de decaimento, no qual similaridade de composição entre quaisquer duas localizações diminui à medida que a distância geográfica entre eles aumenta. Como a seleção, a deriva fortalece a relação de distância de decaimento é importante ressaltar que a deriva deve interagir com a dispersão para criar um padrão de distância de decaimento. Se a dispersão apresentar alguma limitação, a composição microbiana tende a ser mais semelhante entre locais próximos do que entre aqueles mais afastados, assim é de se espera uma maior importância do processo de deriva para o padrão de distância de decaimento para os microrganismos que são sujeitos a uma dispersão relativamente restrita em grande escalas espaciais como, por exemplo, entre continentes. Por último, a mutação modifica a relação de distância decaimento, aumentando a diversidade genética local em todas as localizações. No entanto, quando, onde, por que e quanto cada processo contribui para esses padrões continua sem solução para os microrganismos, como para todos os organismos. Contudo com novos avanços, ferramentas de pesquisas mais poderosas e novos modelos teóricos a compreensão destes processos que moldam a biodiversidade podem ser facilitada. Muito bom ) Discuta algumas funções de eucariontes na ciclagem de nutrientes. Resposta: Quando estudamos os eucariontes estamos nos referindo de quatro reinos que são eles: reino protoctista, plantae, fungi e animália. Para estes organismos no solo podemos destacar como principal atividade que interferem na ciclagem de nutrientes a ação deste como decompositor de material orgânico (protistas, fungos e animália) e o reino plantae como principal responsável pelo aporte de material orgânico no solo. A importância da matéria orgânica e sua decomposição para ciclagem de nutrientes é porque está contribuem para liberação de nutrientes essências para o solo como N, P, S etc. Para o reino plantae podemos destacar a sua importância na ciclagem de nutrientes principalmente por serem os principais responsáveis pelo aporte de material orgânico no solo, pela deposição de material vegetal como galhos, tronco e folhas os quais vão ter a ação de outros organismos do solo para a sua decomposição. Podemos destacar nesta atividade os fungos que obtém energia degradando material orgânico depositado na natureza colonizado por eles, com isso além de obterem nutrientes para seu crescimento também disponibilizam os produtos resultantes da degradação para a ação de outros microorganismos, participando ativamente nos ciclos de nitrogênio e fósforo além de outros nutrientes, podendo estes nutrientes ser novamente utilizados por plantas e eventualmente por animais. Para os fungos também podemos destacar a associação simbiótica entre raízes de plantas e fungos do solo (micorriza), esta associação vai favorecer a planta fornecendo nutriente principalmente fósforo outros nutrientes também participam desta associação, este nutriente pode volta ao solo por meio da decomposição do material vegetal depositado ao solo pela planta. Os organismos do reino animália atuam no processamento da serapilheira através de sua fragmentação o que aumenta a área de superfície exposta ao ataque de microorganismo, alterando as taxas de decomposição da matéria orgânica e de mineralização de nutrientes e atuam na distribuição da matéria orgânica e de nutrientes no solo (transporte vertical e horizontal). Excelente ) Discuta relógios moleculares do ponto de vista de conceito, razão de ser e aplicação. Inclua a discussão sobre adequação de relógios moleculares para diferentes níveis de avaliação da diversidade. Resposta: O relógio molecular é uma técnica em evolução molecular para relacionar o tempo de divergência entre duas espécies com o número de diferenças moleculares medidas entre as sequências de DNA ou proteínas. Nesta técnica mostra que as mutações em genes se acumulavam em ritmo constante,

5 dai o número de mutações entre duas espécies podem ser usados para dizer quando as espécies divergiram, mesmo sem que houvesse evidência fóssil. Uma das criticas em relação a relógios moleculares é que biologicamente é improvável que as taxas de substituição sejam aproximadamente constantes em linhagens tão diferentes. Novas pesquisas dizem que estes relógios moleculares podem não está marcando horas corretamente existem estudos que já mostram taxas de mutações bastante diferentes até para espécies próximas, podendo deixar de se encontra diferenças entre espécies de um mesmo grupo com o uso do relógio molecular. Novamente excelente Cite alguns dos principais centros de pesquisa em microbiologia do solo no Brasil, e qual a principal especialidade deles. - dentro da linha de pesquisa Biologia do solo aplicada à agricultura e ao ambiente desenvolve trabalhos com Fixação Biológica do Nitrogênio, Rizobactérias promotoras de crescimento de plantas, Micorrizas e Atividade e diversidade da microbiota edáfica. a Agrobiologia desenvolve pesquisas nas áreas de Fixação Biológica de Nitrogênio em leguminosas e em não leguminosas, com destaque para gramíneas, Biologia Molecular, Recuperação de Áreas Degradadas, Agricultura Orgânica, Ciclagem de Nutrientes, Diversidade de Microorganismos e Fauna do Solo e Biossegurança. pesquisa com fungos micorrizicos. Embora isto corresponda diretamente ao conteúdo do livro, eu esperava uma maior abrangência, considerando pelo menos um levantamento rápido do atual panorama. Por exemplo, o IAC nem microbiologista do solo tem mais, e isto já faz um bom tempo 1, Discuta algumas funções de eucariontes na ciclagem de nutrientes. Os eucariontes têm papel fundamental na ciclagem dos nutrientes, onde as plantas constituem a principal fonte de matéria orgânica no solo, servindo de fonte de energia para grande parte dos organismos presentes no solo, além disso as plantas estabelecem relações simbióticas com fungos micorrízicos e fixadores de nitrogênio. Os fungos do solo têm como função a decomposição da matéria orgânica, tornando os nutrientes disponíveis. Os eucariontes do Reino Animalia presentes no solo são responsáveis pelo processamento da matéria orgânica facilitando a ação dos microoganismos na decomposição, além da produção de húmus. Resposta excessivamente sumária. Para complicar, até onde me consta os fixadores são bactérias ou Archaea, então o que diabos estão fazendo na resposta a esta pergunta? Tocou bem de passagem nos principais aspectos que influenciam, ou seja a produção de matéria orgânica pelas plantas e o papel de animais e fungos na decomposição Discuta a afirmativa "Com as técnicas mais tradicionais de pesquisa, no máximo conseguimos visualizar cerca de 10% da diversidade bacteriana existente". A diversidade bacteriana existente é pouco conhecida, pois a maior parte destes organismos não podem ser isolados e cultivados em laboratórios, além disso muitas bactérias podem ser considerados fenotipicamente semelhantes, o que dificulta a classificação dessas pelos métodos tradicionais de pesquisa. Parece que está arrancando um dente.. A resposta dificilmente poderia ser mais sumária. Tocou, novamente muito de passagem, no ponto principal, que é a alta proporção de microrganismos não-cultiváveis, mas isto seria uma resposta superficial na graduação, quanto mais no mestrado Relacione os conceitos r e k com os organismos do solo, em particular considerando a diferença entre rizosfera e solo "bulk". Você esperaria que um destes grupos dominasse em um dos dois ambientes? Justifique. Os conceitos de seleção r e k para os organismos do solo estão relacionados a concentração de substrato. Os organismos selecionados em r, ou seja, ambientes com abundância de substrato apresentam crescimento

6 rápido, são menos eficientes na utilização de substratos complexos e utilizam substratos mais simples e que estão facilmente disponíveis. Por outro lado, a seleção em k ocorre em ambientes com pouco substrato, por isso os organismos presentes nestas condições apresentam taxa de crescimento moderada, são mais eficientes na utilização de substratos mais complexos e diversos. Considerando que rizosfera seja um ambiente mais rico em substrato em relação ao solo de um modo geral, espera-se que os organismos selecionados em r predominem na rizosfera, enquanto que os organismos selecionados em k predominem no solo. Ótima resposta Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo tenha um bom entendimento do artigo. O artigo Beyond biogeographic patterns: processes shaping the microbial landscape, de um modo geral fala sobre os padrões biogeográficos microbianos, através de estudos sobre os mecanismos que interferem nesses padrões. Propõe quatro processos que atuam separadamente ou de conjuntamente, criando e mantendo a diversidade dos microorganismos: seleção, deriva, dispersão e mutação, no entanto pouco se sabe o quanto cada processo contribui para os padrões biogeográficos microbianos. Estudos sobre a biogeografia, dos organismos vem sido conduzidas, principalmente com os microorganismos, utilizando-se de técnicas como a biologia molecular, que permite o estudo da diversidade de maneira mais eficaz. O estudo da biogeografia baseia-se na interação do tempo e do espaço. No caso dos microorganismos os padrões microbianos são altamente variáveis dentro do tempo, além disso, o estudo temporal é dificultado pela dificuldade de se encontrar registros fósseis, por isso o estudo leva mais em consideração a questão espacial. Em relação ao espaço os microorganismos podem ser considerados endêmicos de determinadas regiões, ou há também os que são cosmopolitas, que são encontrados em quase todos os ambientes. Quanto maior a distância geográfica entre duas populações maior será a diferença entre elas, pois cada ambiente exerce uma seleção sobre os organismos existentes nele. A dispersão e a deriva também são dificultadas com a distância e as mutações aumentam a variabilidade dentro da população, quando estas conseguem se fixar. Quanto maior a resolução taxonômica do estudo maior é a chance de se detectar efeitos da distância, ou seja a variação e diversidade, portanto a utilização de estudos com todo o genoma e técnicas multilocus são mais eficientes em relação a estudos que utilizam um único gene, técnicas de fingerprinting (impressão digital) com o gene 16S, ou técnicas morfológicas. O estudo da biogeografia dos microorganismos é mais promissor em relação aos outros organismos, pela rapidez em que diversas gerações podem ser obtidas em um curto espaço de tempo, e com o uso de técnicas modernas de pesquisa e da tecnologia, principalmente da biologia molecular. Razoável, embora muito sumário 3,5 1. Discuta a afirmativa "A avaliação da biodiversidade do solo é simples". O solo é um sistema complexo, um dos ecossistemas com maior diversidade do planeta, habitado por comunidades de organismos micro e macroscópicos, e podem ser citadas como atividades desses organismos a decomposição de matéria orgânica, ciclagem de nutrientes, fluxo de energia, produção de húmus, produção de compostos complexos que auxiliam a agregação do solo, decomposição de xenobióticos, entre outras. A diversidade biológica pode ser definida como a variabilidade entre organismos vivos. De acordo com seu tamanho, a biota (conjunto de seres vivos do ecossistema) do solo pode ser classificada em microrganismos, micro, meso e macrofauna. A avaliação do solo pode ser considerada um indicador de qualidade ambiental, uma vez que o solo não é só o meio de produção vegetal, mas também atua em outros processos importantes. Alterações na estrutura ou nas funções da comunidade microbiana podem causar mudanças no ecossistema, podendo ser percebidas com maior facilidade e sensibilidade, já que a comunidade está envolvida nos ciclos biogeoquímicos, e decomposição, por exemplo. Em relação ao número de espécies e suas características morfológicas, fisiológicas, bioquímicas e genéticas, tem-se pouco conhecimento, seja dos microrganismos que não podem ser cultivados, sejam aqueles os quais os hábitats ainda não foram estudados, ou ainda os que não foram identificados. Dessa forma, a biodiversidade é fundamental no fluxo

7 de energia, servindo de modelo para avaliação da qualidade de um ecossistema; além disso, as comunidades dos organismos realizam atividades fundamentais para a manutenção e sobrevivência de vegetais e animais. Rodou, rodou, e não discutiu a afirmativa. Pelo texto, parece discordar da afirmativa, o que é o correto, mas estou precisando ler nas entre-entrelinhas a função deste tipo de situação é avaliar o seu entendimento do assunto, e antes de mais nada ajudar vocês a entender melhor o que se fala, e a aprofundar o conhecimento de modo geral. A parte de avaliação vem em segundo plano, e muito longe por sinal Discuta a afirmativa "Com as técnicas mais tradicionais de pesquisa, no máximo conseguimos visualizar cerca de 10% da diversidade bacteriana existente". Segundo Morais (2008), o estudo da microbiota utilizando meios de cultura apresenta limitações, já que somente de 1 a 5% dos microrganismos do solo pode ser cultivado em laboratório. Além disso, de maneira geral, as técnicas de pesquisa da diversidade bacteriana envolvem etapas de coleta, isolamento, identificação e descrição. Contudo, as bactérias dependem de um hospedeiro e/ou substratos específicos para sua sobrevivência e multiplicação, o que limita, ou até mesmo impossibilita o isolamento através de métodos de cultivo tradicionais. No cultivo de células de bactérias em laboratório, a partir de colônias isoladas podem ser realizados testes bioquímicos e fenotípicos, auxiliando na identificação de espécies, porém não informam as relações evolutivas entre os organismos, importantes para o sistema de classificação. Dessa forma, as limitações dos métodos tradicionais fazem com que outras técnicas sejam utilizadas para o estudo da diversidade microbiana, como a biologia molecular utilizando o gene RNA ribossômico 16S, que possui características que possibilitam sua utilização em estudos ecológicos, como a presença em todos os procariotos, e tamanho considerado satisfatório para estudos filogenéticos. Excelente 2 3. Discuta papeis dos organismos autotróficos em alguns ambientes do solo. Os organismos autotróficos são de fundamental importância aos solos, já que sintetizam matéria orgânica, ou seja, produzem o seu próprio alimento. Durante esse processo de fabricação utilizam uma fonte de energia externa e fazem esse alimento mais rico a partir de substâncias minerais provenientes do meio exterior. Podem sintetizar matéria orgânica a partir de substâncias minerais e fixam energia da luz sob a forma de energia química. Pertencem a este nível as plantas verdes, algas azuis - cianofíceas ou cianófitas -, e algumas bactérias capazes de realizar a fotossíntese, devido à clorofila presente. Organismos autotróficos mais evoluídos produzem grande parte da biomassa, fonte de energia para os níveis tróficos seguintes, e criam um ambiente no solo favorável aos microrganismos, pois adicionam matéria orgânica, retendo maior umidade do solo e adicionando uma fonte de carbono que possa ser utilizada pelos heterotróficos. Os organismos autótrofos fotossintetizantes produzem praticamente todo o alimento consumido pelos heterótrofos, além de liberar oxigênio no ambiente, gás utilizado na respiração pelos animais, plantas e microrganismos. Existem ainda alguns seres autótrofos que fazem quimiossíntese quimioautotróficos -, como por exemplo, algumas bactérias terrestres e aquáticas, e utilizam a energia química proveniente da oxidação de compostos inorgânicos para a síntese de matéria orgânica. Os quimioautotróficos estão envolvidos no ciclo do nitrogênio (bactérias nitrificantes e amonizantes), participando de processos como a nitrificação (o nitrato é a forma que melhor as plantas podem aproveitar a partir do substrato em que se encontram), que por ser o processo central no ciclo do nitrogênio, pode ser um bom indicador da atividade biológica e da fertilidade do solo; e desnitrificação (o nitrogênio volta à atmosfera sob a forma de gás quase inerte, realizado por bactérias como Pseudomonas); metabolização do enxofre (bactérias púrpuras proteobactérias capazes de realizar fotossíntese); metanogênese (arqueobactérias microrganismos importantes no ciclo do carbono). No ciclo do carbono, a entrada do carbono no compartimento biológico dos ecossistemas, através de reservatórios gasosos, ocorre por meio da fotossíntese, realizado pelos organismos autotróficos clorofilados. Os organismos autótrofos também modificam a superfície das rochas (estabelecimento inicial), como os liquens (associação simbiótica entre fungos e algas verdes ou fungos e cianobactérias), possibilitando um ambiente propício para a chegada de outros seres vivos (heterotróficos) e participando na reciclagem de matéria e fluxo de energia. Muito bom, mas tome um pouco de cuidado com o padrão repetitivo das primeiras linhas Relacione microbiologia e fertilidade do solo.

8 O solo acumula grande parte do carbono do planeta, está envolvido nos ciclos biogeoquímicos, e se destaca de outras formações geológicas pela diversidade de microrganismos. Esses microrganismos agem direta ou indiretamente em processos como a mineralização da matéria orgânica, ou de simbiose como na fixação biológica de nitrogênio. Através da fixação de nitrogênio ocorre o fornecimento de alimento à planta e diminui a poluição de rios, lagos e lençóis freáticos por nitrato. Além disso, pode-se citar as micorrizas, importantes na microbiologia do solo, uma vez que através delas ocorre a absorção de fósforo (nutrição mineral), e assim as plantas tornam-se mais tolerantes aos diversos tipos de estresse. A microbiologia também atua na ciclagem de nutrientes, como em florestas tropicais, em que o solo dessas regiões é pobre em nutrientes minerais, e grande parte dos nutrientes absorvidos pelas plantas são provenientes da decomposição de matéria orgânica depositada no solo pelas próprias plantas. A decomposição é eficiente devido à abundância de microrganismos, como bactérias e fungos. Caso não houvesse essa atividade de microrganismos, os nutrientes permaneceriam em matéria orgânica morta, e consequentemente as plantas morreriam por falta de reserva no solo. A maior parte dos nutrientes está presente nas árvores, e quando há a retirada da mata nativa, a maior parte dos elementos nutritivos também é retirado. Além disso, o solo sem cobertura vegetal e exposto às chuvas ácidas é logo lixiviado, perdendo sua fertilidade. Assim, é importante o solo apresentar, ou mesmo equilibrar, propriedades como boa organização estrutural, alta fertilidade, abundância e diversidade de microrganismos. Excelente. Só o detalhe de que a reciclagem de nutrientes não é só importante na floresta, mas também nos sistemas agrícolas 2 5. Discuta o artigo desta semana de forma detalhada o suficiente para que o leitor de seu resumo tenha um bom entendimento do artigo. Normalmente são relatadas pesquisas de biogeografia com plantas e animais. Contudo, o artigo aborda os estudos recentes focado na biogeografia de microrganismos, incluindo bactérias, arqueobactérias, vírus, fungos e outros microrganismos eucariotas. A Biogeografia é o estudo da distribuição dos organismos no espaço e no tempo, e seu objetivo é compreender os mecanismos que geram e mantêm a diversidade, incluindo a sua riqueza e composição. Há inúmeros enquadramentos teóricos, diferentes terminologias e abordagens utilizados por pesquisadores que dificultam interpretar e comparar padrões biogeográficos microbianos. Além disso, estudos de biogeografia microbiana normalmente usam métodos de genética molecular, permitindo a diversidade de ser examinado ao longo de uma escala contínua de resolução taxonômica. Também é importante identificar os mecanismos que moldam esses padrões. Quatro processos moldam os padrões biogeográficos microbianos, sem separar as escalas ecológicas e evolutivas, são eles: seleção, deriva, dispersão, e mutação. No artigo é considerando como a interação desses quatro processos modificam um padrão biogeográfico, além da relação de endemismo. O endemismo é a mais clara demonstração de biogeografia microbiana. Estudos descobriram evidências de que diferentes locais abrigam microrganismos que diferem na composição genotípica. Além disso, os padrões biogeográficos podem existir na ausência de endemismo. A capacidade de detectar um padrão biogeográfico pode depender de uma resolução taxonômica. Em relação à avaliação dos processos que geram e mantem os padrões biogeográficos, alguns pesquisadores utilizada uma abordagem que divide os efeitos relativos dos atuais fatores ambientais contra os efeitos históricos sobre padrões biogeográficos microbianos. Já outros pesquisadores, se envolvem no campo de ecologia geral, utilizando a teoria de metacomunicação e a teoria neutra de biodiversidade para interpretar padrões biogeográficos microbianos. Os mecanismos que contribuem para a composição genética e diversidade dentro das espécies são considerados processos microevolutivos. Já as espécies são um grupo de indivíduos que potencialmente cruzam e geneticamente recombinam. Quatro processos evolutivos podem contribuir para a diversidade dentro das espécies: mutação, seleção, fluxo gênico e deriva genética. Os mecanismos de formação da decomposição e diversidade entre as espécies, e das espécies com o meio que os cerca e em comunidades, são referidos como processos ecológicos. Os processos podem ainda ser divididos em quatro classes: especiação, seleção, dispersão e deriva ecológica. As pesquisas referentes aos padrões biogeográficos microbianos tem focado nos processos ecológicos, uma vez que consideram a distribuição e diversidade entre os táxons. Para demonstrar como os processos de seleção, deriva, dispersão e mutação formam padrões biogeográficas deve-se considerar a relação de endemismo. O processo de seleção geralmente diferencia a composição microbiana entre locais, e os fatores seletivos são geralmente organizados espacialmente. A seleção e a

9 deriva tenderá a produzir uma relação de endemismo, por exemplo, é provável que dois locais perto do oceano sejam mais semelhantes entre si na composição microbiana do que um local mais para o interior. O endemismo tende a ser mais alto em regiões maiores e mais isoladas. As pesquisas também indicam que tanto a seleção contemporânea (influência do atual ambiente na distribuição atual da diversidade microbiana), quanto os processos históricos (em que a história - engloba a recente e o passado geológico - deixou um legado na atual composição microbiana, por meio de seleção ou deriva) modificam os padrões biogeográficos. Entre os estudos analisados, a seleção contemporânea teve um efeito maior sobre a composição microbiana do que os processos históricos, parecendo ser a seleção mais importante para a biogeografia de organismos pequenos e grandes. A importância relativa da seleção contemporânea pode depender de características fisiológicas de um táxon. O tipo de habitat pode afetar também a importância dos processos históricos. Além disso, processos históricos podem ser mais evidentes em grandes escalas geográficas, devido à diminuição das taxas de migração. A capacidade de detectar processos históricos pode depender de resolução taxonômica, como por exemplo, no estudo com Pseudomonas spp. que mostrou evidência mais forte para endemicidade no solo com um método de genotipagem de alta resolução do que o método de fingerprinting ( impressão digital ). Assim, a seleção parece ser influenciada por processos históricos. Uma das dificuldades para inferir os processos de condução a partir de padrões biogeográficos é que os processos ocorrem ao longo de um contínuo de espaço e de tempo, enquanto que os padrões discretamente amostrados representam uma integração destes processos ao longo do tempo. Novos modelos matemáticos, prováveis adaptações da genética de populações e teoria ecológica, poderiam esclarecer os processos biogeográficos. A biogeografia microbiana possibilita testar hipóteses que não são possíveis em organismos maiores. Assim, mesmo a biogeografia microbiana tendo feito progresso nos últimos anos, é necessário mais pesquisas que esclareçam como os processos contribuem para os padrões biogeográficos. Excelente. Sugiro apenas que depois de escrever tente ler para ver se ficou claro, porque em vários pontos está fazendo um zig-zag que pode dificultar a compreensão pelo leitor 4