Laboratório Preprocessamento com WEKA Explorer
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- Kevin Amaral
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1 Laboratório Preprocessamento com WEKA Explorer Faça o download do dataset test_credit.csv*, e execute as seguintes tarefas: 1. Use o Weka Viewer para ter uma visão geral do dataset original. 2. Substitua os missing data se houver algum. 3. Verifique se há outliers ou valores extremos no conjunto de dados. 4. Realize normalização de duas características. 5. Realize a discretização em duas características. 6. Realize a substituição em duas características. *disponível em: Nas páginas abaixo, encontram-se tutoriais explicando / ilustrando cada passo:
2 1. Visualização dos dados bruto (raw data) 1. Inicie uma execução do Weka ou execute em linha de comando: java jar weka.jar. 2. Quando a GUI Chooser surgir, selecione o Explorer a partir das quatro opções do lado direito. 3. A tela acima é a principal do Explorer. Existem 6 guias no topo do aplicativo que representam as operações basicas que o Explorer suporta. Agora, estamos no Preprocess. Clique no botão Open file para abrir a janela padrão de diálogo através da qual você pode selecionar um arquivo. Escolha o arquivo weather.nominal.arff. Se você tem um arquivo no formato CSV, modifique de ARFF data files para CSV data files em Files of type. Quando você especificar um arquivo.csv ele é convertido automaticamente para o formato ARFF.
3 4. Para visualizar todo o dataset, clique no botão Edit, e então uma janela de visualização será aberta com o dataset carregado. 5. O primeiro atributo, outlook, é selecionado por default. As características deste atributo são apresentadas. Um histograma no canto inferior direito mostra o quão frequente cada um dos dois valores da classe play ocorre para cada valor do atributo outlook. Você pode visualizar esta análise para outros atributos bastando realizar a seleção na esquerda.
4 6. Se você abrir o outro arquivo Weather, weather.numeric.arff, a visualização dos atributos é diferente. Selecionando-se o segundo atributo, temperature, você visualiza seus valores máximos e mínimos, bem como a média e o desvio padrão. O histograma apresenta a distribuição da classe como uma função deste atributo. 7. Clique na guia Visualize para visualizar gráficos 2D do dataset.
5 1.1 Usando Filtros para Remover Atributos Unsupervised Attribute Filter Remove : Este filtro remove/deleta atributos específicos de um dataset. O mesmo efeito pode ser obtido mais facilmente selecionando-se os atributos relevantes usando as tick boxes e então pressionando-se o botão Remove. 1. Abra um dataset, tal como o weather.nominal dataset. 2. Clique no botão Choose dentro da caixa Filter (acima a esquerda). E então clique em: filters => unsupervised => attribute => Remove. 3. Clique com o botão Direito sobre a caixa Remove, e então escolha Show Properties.
6 4. Existem duas opções para o filtro Remove. Uma opção é attributeindices que especifica a faixa de atributos a ser removida. (No exemplo, os índices 1,2 outlook and temperature - foram escolhidos). A outra opção é invertselection que determina se o filtro seleciona ou deleta os atributos (Foi selecionado False ( default ), que indica para remover ao invés de selecioná-los). E então você clica em OK. 5. Clique no botão Apply próximo da caixa do filtro Remove, e então os dois primeiros atributos são removidos do dataset, e apenas três sobram. Você pode clicar no botao Undo para voltar a operação de filtragem e restaurar o dataset original. Você pode também clicar no botão Save para gravar o dataset processado.
7 2. Manipulando missing data Unsupervised Attribute Filter ReplaceMissingValues : Estes filtro substitui todos os valores faltantes ( missing values ) para atributos nominais e numéricos com a moda para atributos nominais e a média para atributos numéricos com base nos dados de treinamento. 1. Abra o dataset weather.numeric. Clique no botão Edit para visualizar os dados brutos. Você pode verificar que dois dos atributos têm missing values. 2. Clique no botão Choose dentro da caixa Filter. Clique no botão Filter na parte de baixo da janela drop-down.
8 3. Uma janela chamada Filtering Capabilities se abrirá. Esta janela mostra qual tipo de atributos the os filtros suportam. Certifique-se de que apenas os tipos Numeric Attributes, Missing values e Numeric Class estejam selecionados. E então clique em OK. 4. Escolha o filtro ReplaceMissingValues a partir da lista drop-down Para isso clique em: filters => unsupervised => attribute => ReplaceMissingValues. E então clique na caixa Filter para mostrar a janela de propriedade do filtro selecionado.
9 5. Clique no botão Apply dentro da caixa Filter. Então clique no botão Edit para verificar se o dataset foi processado você verá que os missing values foram preenchidos. Se você quiser gravar os dados modificados, basta clicar no botão Save na tela principal. Escolha um nome diferente para salvá-lo de forma que o dataset original seja mantido.
10 3. Usando Filtros para detectar/manipular outliers e extreme values Unsupervised Attribute Filter InterquartileRange : Este filtro adiciona novos atributos que indicam se valores de instâncias podem ser considerados outliers ou extreme Values. 1. Abra o dataset small_telco_labone. Realize o passo de substituição de missing values com o filtro ReplaceMissingValues. Observe que há um total de 22 atributos neste dataset. 2. Então clique no botão Choose dentro da caixa Filter. Clique no botão Filter na parte de baixo da janela drop-down. 3. Uma janela chamada Filtering Capabilities se abrirá. Esta janela mostra qual tipo de atributos the os filtros suportam. Certifique-se de que apenas os tipos Numeric Attributes e Numeric Class estejam selecionados. E então clique em OK.
11 4. Escolha o filtro InterquartileRange a partir da lista drop-down list de filtros não supervisionado para atributos. Para isso clique em: filters => unsupervised => attribute => InterquartileRange. 5. Clique (com o botão Esquerdo ) dentro da caixa Filter, e então a janela de propriedades é apresentada. Clique no botão More para mostrar mais informações sobre este filtro.
12 Os fatores são usados para definir os extreme values e outliers de acordo com a definição de Q1, Q3 e IQR (veja ilustração abaixo).
13 6. Clique no botão Apply dentro da caixa Filter. Você encontrará dois atributos extras/novos que foram gerados. Estes dois atributos marcam uma instância como um outlier ou um extreme value se qualquer um dos seus valores de seus atributos são tidos como outlier ou extreme value.
14 7. Se nós mudamos a opção detectionperattribute do filtro InterquartileRange, de False to True, um par indicador outlier-extreme para cada atributo é gerado.
15 8. Você pode clicar em cada atributo gerado para verificar se existem valores outlier ou extreme value para atributos originais. Você pode remover aqueles atributos indicadores que não tenham nenhum outlier ou extreme value com o botão Remove.
16 3.1. Removendo in3stâncias com outliers e extreme values Unsupervised Instance Filter RemoveWithValues : Este filtro remove instâncias de acordo com valores de um atributo. 1. Após encontrarmos instâncias com valores outlier ou extreme value, nós podemos podemos removê-las completamente do dataset. Escolha o filtro RemoveWithValues na lista drop-down de filtros não-supervisionados de instâncias. Para isso clique em: filters => unsupervised => instance => InterquartileRange. Como o atributo outlier está indexado com 23 e o último valor é yes, modifique as opções atributeindex para 23 e o nominalindices para last
17 2. Então clique no botão Apply depois de confirmar as mudanças. 70 instâncias serão removidas do dataset e o atributo Outlier ficará não terá instâncias com valor yes. 3. Você poderá também remover instâncias de por atributo de acordo com pares outlier-atributo mesma forma.
18 4. Usando filtros para executar a normalização Unsupervised Attribute Filter Normalize : Este filtro normaliza todos os valores numéricos valores no dataset fornecido para o intervalo padrão de [0,0, 1,0]. 1. Abra o dataset processed_weather.numeric.arff (os valores ausentes foram substituídos já). 2. Escolha filtro Normalize na lista drop-down de filtros de atributos não supervisionados. Para isso clique em: filters => unsupervised => attribute => Normalize. E, em seguida, clique com o botão Esquerdo para abrir sua janela de propriedades. Queremos fazer normalização em todos os atributos numéricos. Clique em OK e Apply.
19 3. Você pode escolher um intervalo diferente definindo fatores de scale e translation. A scale é a diferença entre min. e max. valores. Quando a scale é 2 e a translation ainda é 0, o intervalo é [0,0, 2,0].
20 4. A translation é a distância entre o min. e 0,0. Quando a scale é 2 e a translation é -1, o intervalo é [-1,0, 1,0].
21 5. Você deve salvar o dataset se estiver satisfeito com os resultados.
22 5. Discretização com Filtros Unsupervised Attribute Filter Discretize : Este filtro converte atributos numérico em atributos nominais usando discretização equal-width (largura - default) or equal-depth (frequência) 1. Abra o dataset weather.numeric. Primeiro, substitua os missing values com o filtro. 2. Escolha o filtro Discretize a partir da lista drop-down de filtros de atributos não supervisionados. Para isso clique em: filters => unsupervised => attribute => Discretize. E então clique (com o botão Esquerdo ) para abrir a janela de propriedades. Vamos realizar uma discretização equal-width (largura) no atributo 2 temperature com 3 bins.
23 3. Clique no botão Apply. E então selecione o atributo temperature para verificar os resultados.
24 4. Para realizar a discretização equal-depth (frequência) no atributo 3 - humidity, escolhemos o filtro PKIDiscretize a partir da lista drop-down de filtros de atributos não supervisionados. Para isso clique em: filters => unsupervised => attribute => PKIDiscretize. Este filtro usa a raiz quadrada do número de valores como o número de bins.
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26 6. Usando Filtros para Substituir valores Unsupervised Attribute Filter NumericCleaner : Este filtro substitui os valores dos atributos numéricos que são muito pequenos ou muito grande ou muito próximos a um valor particular por valores default. 1. Ao invés de remover instâncias com outlier e extreme value, nós poderíamos substituir os valores dos atributos para valores default. Vamos usar o atributo income como um exemplo. Clique no atributo income, e então suas estatísticas são mostradas na parte direita da janela: o mínimo é 9, o máximo é 1668 e a média é Realize uma filtragem RemoveWithValues invertida com o atributo income_outlier.
27 3. Verifique o status do atributo income nas 30 instâncias remanescentes. O min. Agora é 248, e o max. é 398.
28 4. Clique no botão Undo e repita o passo e repita os passo 2 com o atributo income_extremevalue. Verifique o atributo income nas 15 instâncias remanescentes. O min. Ficou em 418, e o max. é Clique no botão Undo. 6. Então estamos prontos para realizar o filtro não supervisionado no atributo NumericCleaner em todas as instâncias. Escolha o filtro NumericCleaner na lista drop-down, e então clique com o botão Esquerdo na caixa do filtro para mostrar a janela de propriedades.
29 7. Clique no botão Apply para realizar a filtragem, então selecionar o atributo income para visualizar as estatísticas do atributo modificado. Se você gostou do resultado, salve o dataset.
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