CONFORMAÇÕES DO CICLOEXANO: um modelo de estudo no PCMODEL

Documentos relacionados
2.7. Análise Conformacional de Alcanos (Bibliografia Principal: Vollhardt, 3rd) Modos de Representar Moléculas Orgânicas

QUIMICA ORGANICA BÁSICA QMC 160 Prof Hugo Braibante _ UFSM

DIEDROS CONFORMACIONAIS E SUA APLICAÇÃO NO ESTUDO DE ESTABILIDADE DE BIOMOLÉCULAS

COMPOSTOS ORGÂNICOS: ALCANOS E CICLOALCANOS

Prof. Luiz F. Silva Jr - IQ-USP

5. Análise Conformacional

QUIMICA ORGANICA BÁSICA

Química Orgânica I. ESTUDO DOS ALCANOS e CICLOALCANOS. Profa. Alceni Augusta Werle ProfaTânia Márcia Sacramento Melo

Análise Conformacional

Química Orgânica. Conformação: qualquer arranjo tridimensional dos átomos numa molécula que resulte da rotação ao redor de uma ligação simples.

Análise Conformacional. Estereoisomeria em Cicloalcanos. Estereoisomeria cis-trans; E, Z. Prof. Davyson Moreira

UNIVERSIDADE PRESBITERIANA MACKENZIE

PROGRAMA DE ENSINO DE DISCIPLINA

Alcanos Aula 4 Flaviane Francisco Hilário

UNIPAC Universidade Presidente Antônio Carlos Juiz de Fora

Relatório: Proposta de Atividade Didática

Efeitos Conformacionais, Estéricos e Estereoeletrônicos

Reações de Eliminação. Aula 10

Química Orgânica I Profa. Dra. Alceni Augusta Werle Profa. Dra. Tania Márcia do Sacramento Melo ESTUDO DOS ALCANOS. Aula nº5

ESTUDO DOS EFEITOS DE GRUPOS RETIRADORES OU DOADORES DE ELÉTRONS EM CÁLCULOS DE BARREIRAS ROTACIONAIS INTERNAS DE COMPOSTOS AROMÁTICOS.

UNIVERSIDADE ESTADUAL DE FEIRA DE SANTANA

UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO INSTITUTO DE PESQUISAS DE PRODUTOS NATURAIS WALTER MORS

17/11/2010 INTRODUÇÃO ALCANOS E CICLOALCANOS INTRODUÇÃO ALCANOS

Química Orgânica I Profa. Dra. Alceni Augusta Werle Profa. Dra. Tania Márcia Sacramento Melo. REAÇÕES DE ELIMINAÇÃO Aula 13

Alcenos e Alcinos. Aula 5

HIDROCARBONETOS FUNÇÕES ORGÂNICAS

PPGQTA. Prof. MGM D Oca

Alcenos e Alcinos. Aula 14

MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO FUNDAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DO PAMPA PRÓ-REITORIA DE GRADUAÇÃO

QFL-2340 Estrutura e Propriedades de Compostos Orgânicos 2 o Semestre de 2013 Diurno

QUIMICA ORGÂNICA Teórica A

Química A MESTRADO INTEGRADO EM ENGENHARIA DO AMBIENTE. 1º Semestre /2014. Doutor João Paulo Noronha.

ALCANOS E CICLO ALCANOS

Universidade Estadual de Maringá - PROINTE. Lista de Exercícios

4.1 ALCANOS NO USO DIÁRIO

Aula 3 ALCANOS E CICLOALCANOS: NOMENCLATURA E ANÁLISE CONFORMACIONAL. META Apresentar a quimica dos alcanos e a comformação das moléculas saturadas.

Reações de Eliminação

3.1 ISÔMEROS 3.2 ESTEREOISÔMEROS

Alcanos são compostos de carbono e hidrogênio, com somente ligações simples Fórmula geral: C n H 2n+2

UNIVERSIDADE PRESBITERIANA MACKENZIE

Prof. Luiz F. Silva Jr - IQ-USP

LICENCIATURA EM QUÍMICA QUÍMICA ORGÂNICA I SEGUNDO SEMESTRE 2014 PLANO DE CURSO Professora: Ana Júlia Silveira

CURSO DE FARMÁCIA Reconhecido pela Portaria MEC nº 220 de , DOU de PLANO DE CURSO

Universidade Tecnológica Federal do Paraná Departamento Acadêmico de Química e Biologia. Dr. Tiago P. Camargo

English version at the end of this document

FUNÇÕES ORGÂNICAS NITROGENADAS e HALETOS Os compostos orgânicos nitrogenados são moléculas orgânicas que apresentam em sua constituição o heteroátomo

OBJETIVOS AULA 10 DESENVOLVIMENTO DESCOBERTA. ¾ Otimização de Moléculas Bioativas. ¾ Integração com o processo de HTS

Programa Analítico de Disciplina QUI131 Química Orgânica I

LISTA DE EXERCÍCIOS 2º ANO

QSAR 3D Planejamento de NCEs QSAR 3D. O processo de reconhecimento molecular é um processo tridimensional. Conformação bioativa.

Fármacos que atuam no SNA afetando a neurotransmissão adrenérgica

Fundamentos de QO Aula 1

Origem dos Fármacos Desde os tempos antigos, os povos do mundo tinham uma ampla coleção de produtos naturais para fins medicinais;

DISCIPLINA: Química Fisiológica ASSUNTO: Fundamentos de Química Orgânica: isomeria

2. Ligações Químicas Localizadas

Prof. Luiz F. Silva Jr - IQ-USP

SOLUÇÃO PRATIQUE EM CASA - QUÍMICA

Nomenclatura IUPAC - International Union of Pure and Applied Chemistry. Regras para a atribuição dos nomes dos alcanos

UFABC Bacharelado em Ciência & Tecnologia

Disciplina: SQM0455. Prof. Dr. Andrei Leitão Prof. Dr. Carlos Montanari. Propriedades Físico-químicas

2. Explique o que acontece com o ponto de ebulição dos hidrocarbonetos à medida que aumenta o tamanho de suas moléculas.

Profa. Mônica Tallarico Pupo Química Farmacêutica I

QFL-1322 Reatividade de Compostos Orgânicos 2 o Semestre de 2017

SERVIÇO PÚBLICO FEDERAL MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA INSTITUTO DE QUIMICA

3 N(4) metil tiossemicarbazonas derivadas de 4- nitrobenzaldeído e 4-nitroacetofenona: estudos estruturais

Reação de Substituição em Alcanos

Métodos de Química Computacional

Tópicos em destaque. O que é um orbital atômico? É a provável distribuição espacial dos elétrons ao redor do núcleo.

Ciência que estuda a química da vida (características dos seres vivos)

Química Orgânica Aplicada a Engenharia Geológica

PLANO DE ENSINO. 4- Funções Inorgânicas Ácidos (aplicações, características, classificação e nomenclatura).

Alcenos: estrutura, síntese e reatividade. Fundamentos de Química Orgânica Fábio Herbst Florenzano

Ressonância Magnética Nuclear

EDITAL DE SELEÇÃO DE MESTRADO 2º SEMESTRE 2018

BIOISOSTERISMO: UMA ESTRATÉGIA DE MODIFICAÇÃO MOLECULAR PARA A OTMIZAÇÃO DE UM COMPOSTO-PROTÓTIPO PROTÓTIPO

Disciplina: SQM0485. Prof. Dr. Andrei Leitão

Peptídeos e Proteínas: Estrutura de Proteínas

Prof. Hugo Braibante Química - UFSM

Disciplina de Química Orgânica

Componente Curricular: Química Orgânica Farmacêutica II PLANO DE CURSO

Estudo do átomo de carbono (Hibridização), Estrutura de Lewis, Carga formal. Aula 2

FCAV/UNESP. DISCIPLINA: Química Orgânica. ASSUNTO: Hidrocarbonetos

Química 5 - Aula ISOMERIA ISOMERIA PLANA ISOMERIA ESPACIAL

Introdução à Modelagem Molecular

Ciência que estuda a química da vida

EDITAL DE SELEÇÃO DE MESTRADO 1º SEMESTRE 2019/2ª EDIÇÃO

a mesma fórmula molecular ou seja, é necessário recorrer às fórmulas estruturais para os diferenciar.

QUÍMICA ORGÂNICA ISOMERIA ÓPTICA

Estruturas de polímeros

Disciplina de Química Orgânica

Ciência que estuda a química da vida (características dos seres vivos)

II. Alcanos Hidrocarbonetos Alifáticos Saturados

Metabolismo e Endocrinologia 2.º Ano LEBM, 29 de Março de Estereoisómeros

Fármacos e Quiralidade: uma abordagem sobre formas puras e racêmicas. Ana Paula Sena Costa Farmácia

Ciência que estuda a química da vida

7.1 REAÇÃO DE ELIMINAÇÃO

Hidrocarbonetos. Alcanos contém somente C e H em ligações simples na sua estrutura. O alcano mais simples e mais abundante é o metano (CH 4 ).

Ciência que estuda a química da vida

Transcrição:

CONFORMAÇÕES DO CICLOEXANO: um modelo de estudo no PCMODEL Anderson Hollerbach Klier 1 RESUMO: O estudo molecular conformacional ainda é visto como um dos entraves para o entendimento de estabilidade molecular principalmente pelos estudantes de graduação que cursam disciplinas na área química. O software PcModel pode ser uma ferramenta bastante útil, quando aplicado na previsão e estimativa do cálculo de energia envolvendo as conformações mais e menos estáveis do cicloexano substituído, podendo ser aplicado em aulas práticas de química. PALAVRAS-CHAVE: conformação, estabilidade, interação 1,3-diaxial INTRODUÇÃO A análise conformacional ou o estudo da estabilidade de moléculas, normalmente é visto como conteúdo complicado e de difícil compreensão principalmente pelo público discente, em virtude de requerer uma visão ampla e espacial que envolve o conhecimento pregresso referente a geometria espacial (MAR- TINS, 2009). Com o intuito de desmitificar e facilitar o entendimento do assunto, a disciplina de Química Farmacêutica do curso de Farmácia do Centro Universitário Newton Paiva, inclui em seu programa simulações no software PcModel. Estas simulações permitem que os alunos comprovem que certos valores teóricos de energia para alguns tipos de interações químicas podem ser estimados e visualizados com uma certa facilidade dentro das matrizes de cálculo no ambiente virtual. Como molécula modelo para as simulações, o cicloexano, um hidrocarboneto da classe dos cicloalcanos, se mostra bastante adequado por possuir estrutura tridimensional como forma mais estável, além de três padrões de substituição, com duas configurações para cada padrão de substituição e duas conformações para cada configuração (SOLOMONS, 1996). Estruturalmente o cicloexano possui fórmula molecular C 6 H 12, com conformação mais estável do tipo cadeira, que segundo o padrão de substituição dos átomos de hidrogênio por substituintes mais volumosos, pode apresentar interações conhecidas como interações 1,3-diaxiais. Estas são interações oriundas principalmente de repulsões eletrônicas, que podem estabilizar uma determinada conformação, quando seu valor é baixo, ou desestabilizar outra conformação quando seu valor for mais elevado, (figura 1). Como parâmetro de estabilidade as interações 1,3-diaxiais sempre existem entre substituintes em posição axial ligados em carbonos do cicloexano que reservam entre si, um padrão de posicionamento do tipo-1,3. Se considerarmos dois substituintes aleatórios A e B substituindo hidrogênios no cicloexano, estes podem estar ligados nas posições 1 e 2, 1 e 3 ou 1 e 4. Cada um destes padrões de substituição pode assumir duas configurações, cis ou trans, e cada uma destas configurações podem assumir duas conformações distintas, que serão mais ou menos estáveis de acordo com o número de interações 1,3-diaxiais presentes, conforme representado na figura 2. Dentre as possibilidades, as conformações com dois substituintes (A e B) em equatorial serão mais estáveis que conformações com um dos substituintes (A ou B) em axial, e estas mais estáveis que conformações com os dois substituintes (A e B) em axial. PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785 l 233

As conformações características dos padrões de substituição estrutural do cicloexano, possuem importância específica principalmente em moléculas bioativas (BARREIRO, 2008). Estas moléculas quando possuem receptores biológicos são chamadas Fármacos específicos, e para tanto irão apresentar interações químicas fármaco-receptor, que para fármacos que possuam cicloexano ou análogos em sua estrutura, dependerão da conformação do cicloexano ou de seus análogos (BARREIRO, 2008). Como exemplos de fármacos que apresentam tal peculiaridade, podem ser citados; meperidina (1), fentanil (2), ciclofosfamida (3), gatifloxacino (4) e vardenafil (5), representados estruturalmente na figura 3 (BARREI- RO, 2008; FOYE, 1995; LEDNICER, 1998; LEDNICER, 2008). 234 PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785

Objetivos Em função das peculiaridades estruturais já decritas, bem como as implicações destas em possíveis atividades biológicas, o presente trabalho objetivou simular a energia de diferentes substituintes no cicloexano, a fim de prever valores para possíveis interações 1,3-diaxiais existentes em conformações de uma configuração específica do mesmo. Material e Métodos Como ferramenta virtual facilitadora do entendimento de estrutura conformacional, utilizamos o software PcModel 7.2 Serena software, nos laboratórios de informática do Campus Silva Lobo do Centro Universitário Newton Paiva. Foram feitas simulações das energias totais do cicloexano não substituído e do cicloexano mono e dissubstituido, a fim de compararmos os valores das possíveis interações 1,3-diaxiais existente em possíveis substituintes nas posições axiais. As comparações foram feitas entre os valores obtidos nas simulações computacionais e os valores reais descritos na literatura (SOLOMONS, 1996; CLAYDEN, 2001). Resultados e discussão Como protótipo minimizamos a energia do cicloexano não substituído a fim de obtermos a energia total da molécula, conforme figura 4. O valor de energia total do cicloexano não substituído foi de 6,551 Kcal/mol. Em termos estruturais, este valor corresponde a todas as seis ligações C-C, doze ligações C-H e seis interações repulsivas hidrogênio-hidrogênio, três acima do plano e três abaixo do plano. Estas são consideradas de muito baixa energia, pois são os menores substituintes possíveis para qualquer cadeia carbônica. Quando consideramos o cicloexano monossubstituído, como metilcicloexano, podemos otimizar sua energia conformacional, (figura 5). PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785 l 235

Aqui percebemos uma energia de 8,670 Kcal/mol para o metilcicloexano em sua conformação menos estável, ou seja, o substituinte metil em posição axial com duas interações repulsivas 1,3-diaxiais com os hidrogênios vizinhos também em axial. Já quando procedemos o cálculo para o mesmo metilcicloexano em sua conformação mais estável, ou seja, o substituinte metil em equatorial, onde inexistem interações do tipo 1,3-diaxiais, podemos um valor de energia de 6,890 Kcal/mol, como é mostrado na figura 6. Considerando que em relação ao cicloexano não substituído o metilcicloexano já conta com uma ligação C-C e duas ligações C-H a mais em sua energia total, e considerando como desprezível os valores de energia das repulsões entre hidrogênios axiais, podemos estimar os valores das interações 1,3-diaxiais entre grupos metil e hidrogênios na conformação de maior energia do metilcicloexano. Para tanto basta subtrairmos da energia da conformação menos estável (8,670 Kcal/mol) a energia da conformação mais estável (6,890 Kcal/mol), o que resulta numa diferença de energia de 1,78 Kcal/mol, que dividido pelo número de interações metil-hidrogênio, duas, nos fornece um valor de 0,89 Kcal/mol de energia para a interação 1,3-diaxial metil-hi- 236 PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785

drogênio. Tal valor obviamente é bastante próximo do valor real descrito na literatura, que é de 0,90 Kcal/mol, pois os softwares de simulação computacional são abastecidos com valores de referência da literatura, entretanto, o que se chama atenção aqui é a utilização prática destes softwares para comprovação de dados literários em experimentos que desmitifiquem o conteúdo químico, especialmente no campo da estereoquímica que tem se mostrado bastante árido para a grande maioria dos alunos de graduação. A tabela 1, mostra alguns substituintes comuns e suas simulações de energia para interações 1,3-diaxiais com o hidrogênio, obtidas no PcModel de modo análogo ao relatado para o metilcicloexano. A partir destes resultados, extrapolamos o cálculo para derivados do cicloexano dissubstituídos, a fim de caracterizarmos outras interações 1,3-diaxiais entre outros substituintes diferentes do hidrogênio. Para tanto, iniciamos com interação entre dois grupos metila em configuração cis, em suas conformações mais estáveis equatorial-equatorial e menos estável, axial-axial, como representado abaixo. Após as simulações de energia no PcModel foram obtidos 12,545 Kcal/mol para o conformero diaxial e 7,208 Kcal/mol para o conformero diequatorial. Considerando que na conformação de maior energia e menor estabilidade, diaxial, existem duas interações 1,3-diaxiais metil-hidrogênio e uma interação 1,3-diaxial metil-metil, temos a seguinte representação: A fim de calcularmos o valor da interação A-B, metilametila, subtraímos da energia da conformação diaxial, 12,545 Kcal/mol, o valor da energia da conformação diequatorial 7,208 Kcal/mol, obtendo uma diferença de 5,337 Kcal/mol. Como esta diferença inclui a interação desejada A-B e duas interações metila-hidrogênio, A-C e B-C, subtraímos desta diferença 1,78 Kcal/mol (0,89 Kcal/mol por interação previamente determinado), o que resulta num valor de 3,557 Kcal/ mol para a interação A-B, metila-metila. As simulações de energia para a conformação mais estável diequatorial e menos estável diaxial para o 1,3-dimetilcicloexano, são apresentadas nas figuras 7 e 8. PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785 l 237

Conclusão Após as simulações com o software PcModel foi possível observar que as mesmas são bastante próximas dos valores reais em termos de energia, permitindo uma previsão bastante útil para valores energéticos de interações 1,3-diaxiais em substituintes no cicloexano. Interações estas que podem ser simuladas tanto para interações com o átomo de hidrogênio quanto interações com grupamentos mais volumosos. Além das simulações de energia, como ferramenta virtual o software facilita o entendimento das diferenças estruturais pertinentes a definição de configuração e conformação, o que o torna útil especialmente no ensino dos conteúdos químicos envolvendo estereoquímica. Referências BARREIRO, E.J.; FRAGA, C.A.M. Química Medicinal: As bases Moleculares da Ação dos Fármacos. Porto Alegre: Artmed, 2008. 536p. CLAYDEN, J. GREEVES, N., WARREN, S., WOTHERS, P. Organic Chemistry. Oxford: Oxford University Press, 2001. 1512p. FOYE, W.O.; LEMKE, T.L.; WILLIAMS, D.A. Principles of Medicinal Chemistry. Baltimore: Lippincott Williams & Wilkins, 1995. 995p. LEDNICER, D. Strategies for Organic Drug Synthesis and Design. New 238 PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785

York: John Wiley & Sons, 1998. 502p. LEDNICER, D. The Organic Chemistry of Drug Synthesis. New Jersey: John Wiley & Sons, 2008, Vol. 07. 272p. MARTINS, A.S., LEMOS, R.C., REZENDE, J.V., KLIER, A.H., OLIVEIRA, C.T.B., ANDRADE, R.J. Uma Nova Ferramenta virtual útil para o ensino de Geometria molecular e Momento Dipolar. Revista de Iniciação Científica Newton Paiva, 116-129, 2008-2009. SOLOMONS, T.W.G. Organic Chemistry. New York: John Wiley & Sons, 1996.1218p. NOTAS DE RODAPÉ 1 Docente dos cursos de Farmácia e Ciências Biológicas do Centro Universitário Newton Paiva PÓS EM REVISTA DO CENTRO UNIVERSITÁRIO NEWTON PAIVA 1/2012 - EDIÇÃO 5 - ISSN 2176 7785 l 239