Amostragem de solo para análise microbiológica

Transcrição

1 Aula Bioinformática aplicada ao estudo de comunidades microbianas Amostragem de solo para análise microbiológica Acacio Aparecido Navarrete

2 Princípio da amostragem Fazer uma observação através da estimativa da média da população sem amostrar toda a população.

3 Coleta/Remessa de amostras de solo Para fins de análise microbiológica : A amostragem de solo deve ser feita de forma criteriosa, de modo a representar da melhor maneira possível a área de estudo e adequar-se à hipótese a ser testada; Para a determinação de parâmetros biológicos as amostras de solo devem ser coletadas com instrumental esterilizado ou desinfectado; As amostras podem ser: deformadas, indeformadas, simples (porção coletada em cada ponto do terreno) e compostas (é a mistura homogênea de várias amostras simples). No caso de amostras compostas, evitar a contaminação da amostra e do operador durante a mistura.

4 Coleta/Remessa de amostras de solo Para fins de análise microbiológica: IdenVficar as amostras cuidadosamente; Após a coleta, as amostras devem ser manvdas sob baixa temperatura, acondicionadas em geladeira, caixas de isopor ou outro ambiente propício. Deve-se levar as amostras para o laboratório preferencialmente dentro de 24 horas ou o mais rápido possível; Os locais de amostragem deverão ser locados, confirmados em campo por meio de GPS e fotografados, retratando as caracterísvcas geográficas locais.

5 PROCEDIMENTOS 1. Localização - Os pontos de amostragem devem ser estabelecidos de acordo com o obje:vo do estudo. - Deve ser realizado o registro adequado em um mapa ou croqui que permita a obtenção de novas amostras nas mesmas áreas.

6 PROCEDIMENTOS 1. Localização? AMOSTRAR AQUI

7 1. Localização Ano de publicação: 2001

8 Agricultura 1. Localização Pastagem Agrofloresta

9 ANÁLISE MICROBIOLÓGICA v Compreensão da distribuição espacial e temporal dos organismos no ambiente do solo. v Agravante: Microbiota do solo NÃO é estática. v Programa de amostragem objetivos definidos Avaliação do ambiente

10 Princípio da amostragem Quanto mais heterogênea a área mais amostras são necessárias para atingir um melhor nível de precisão.

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12 Sensores e Plataformas orbitais LANDSAT SPOT NOAA CBERS ERS RADARSAT TERRA IKONOS

13 Aerofotogrametria

14 1. Localização Amazonas rio Javari * * * * * * * * * Benjamin Constant Corpos hídricos Floresta primária Floresta secundária Cultivos agrícolas tradicionais * * Guanabara II - Ticuna Nova Aliança - Cokama * Pastagem Solo exposto

15 PROCEDIMENTOS 2. Descrição dos sí4os de amostragem - Histórico detalhado como: cobertura vegetal, adubação, calagem, estratégia de manejo, etc., devem ser descritos sempre que possível. 3. Condições de amostragem - As amostras de solo usadas nas análises laboratoriais devem ser preferencialmente ob:das no campo com uma umidade do solo que facilite o peneiramento, conhecido como ponto de friabilidade.

16 PROCEDIMENTOS 4. Profundidade - A profundidade de amostragem para fins de análises microbiológicas deve ser a 0-10 cm, ou ainda de 0-20 cm dependendo do obje:vo do estudo. 5. Época de amostragem - Em caso de culturas ou vegetação que não apresentem período de floração definido, amostrar em período de pleno desenvolvimento vegeta:vo.

17 PROCEDIMENTOS 6. Modo de amostragem Pto. A 0 cm 20 cm

18 PROCEDIMENTOS 6. Outros Utensílios para amostragem

19 TRIGO MILHO SOJA Amostragem para culturas em linha com uso de furadeira. (Nicolodi et al., 2002)

20 Figura 2. Trado calador, Trado holantês e Furadeira adaptada para amostragem de solo. Figura 3. Amostragem com trado holandês (diâmetro 5 cm) na cultura da soja, com auxílio de um molde para delimitar os pontos de amostragem. Um furo na linha de plantio e dois de cada lado das entrelinhas.1

21 Trado calador.

22 7. Armazenamento PROCEDIMENTOS - As amostras devem ser analisadas o mais rapidamente possível, de preferência sem armazenamento. - Caso contrário, armazenadas em geladeira a 4 C (análises microbiológicas dependentes de cultivo) ou em freezer/ultra-freezer a -20 C/-80 C (análises microbiológicas independentes de cultivo). - O congelamento deve ser evitado em alguns casos (p.e. quando se pretende cultivar microrganismos).

23 O passo a passo da coleta de solo Limpeza da superfície do terreno

24 O passo a passo da coleta de solo Aprofundamento do tubo coletor

25 O passo a passo da coleta de solo Identificação e embalagem das amostras

26 O passo a passo da coleta de solo Armazenamento das amostras em campo

27 Aula Bioinformática aplicada ao estudo de comunidades microbianas Obrigado pela atenção!