I Jornada de Prospectiva e Gestão do Conhecimento Biodiversidade: a experiência do CRIA com as atividades de gestão da informação Dora Ann Lange Canhos dora@cria.org.br
O desafio social... Renato Dagnino (2001)
O Papel da Comunidade Científica A democratização política e econômica depende de uma ciência voltada para as necessidades sociais. A resolução dos problemas ambientais e o planejamento de um futuro sustentável exigem: Competência Articulação: diferentes segmentos, diferentes níveis (local, nacional, regional, internacional) Informação científica de qualidade
CRIA - Organização da Sociedade Civil de Interesse Público (OSCIP) Missão: a socialização do conhecimento científico Informática para biodiversidade: pesquisa desenvolvimento serviços Comunidade Científica CRIA Público Alvo
Novas tecnologias de informação e comunicação: permitem prever o desencadeamento de uma cultura cooperativa e colaborativa antes inimaginável. Acesso à informação: 1 software (www) O desafio: a articulação da comunidade Promover uma mudança cultural: compartilhar dados/ informações a definição de padrões mínimos (integração de dados de fontes diversas) o desenvolvimento e uso de ferramentas de integração de dados e de interoperabilidade de sistemas a produção de sínteses e diagnósticos inteligíveis aos mais diversos segmentos da sociedade organizada
Política do CRIA Uso de software de domínio público Linux (sistema operacional) Apache Web Server Linguagens de programação: Java e Perl PostgreSQL Database Management System Padrões abertos para interoperabilidade XML (Extensible Markup Language) XSL (Extensible Stylesheet Language) XML Schema SOAP (Simple Object Access Protocol) HTTP (Hypertext Transfer Protocol) Distributed Generic Information Retrieval (DiGIR)
Desenvolvido com ferramentas open source Vantagens de ferramentas open source : Rápida absorção de novas tecnologias Compatibilidade com os padrões mais utilizados Alto grau de estabilidade (bug free) Custo reduzido (software) Rede de colaboradores (equipe expandida ) Demanda uma equipe capacitada
Sistema de Informação Integrado e Interoperável Se considerado Algo complexo impossível traduzido em campos mínimos comuns, vocabulário controlado, formatos comuns Torna-se Tecnicamente viável: interoperabilidade, integração de dados conceito fundamental Provedor deverá ter total controle dos dados
Tipos de Sistemas de Informação Centralizados Distribuídos Mistos (parte centralizada parte distribuída)
Sistema Centralizado de Informação Usuário Sistema Central Provedores de dados
Problemas: atualização Perigo: Rompimento entre o provedor e o sistema centralizado Usuário Provedores de dados Sistema Centralizado
Problema: distância usuário - provedor Possível falta de interação entre o usuário e o provedor de dados Usuário Provedores de dados Sistema Central
Vantagens Provedor: Baixa demanda em informática Usuário Sistema Central Provedores de dados
Sistema Distribuído Atualização em tempo real Consultas são distribuídas Autoria (custodianship) Internet 2 Gateway de Dados Aplicativos: Catálogo Virtual Modelagem... Col 1 Col 2 Col 3 Requer boa infra-estrutura computacional dos provedores Requer boa conectividade Exige uma capacidade de integração de sistemas heterogêneos
Sistema Misto Aplicativos: Gateway de Dados Catálogo Virtual Modelagem... Internet 2 Col 1 Cache Node Banco de Dados Internet Col 2 Col 3 Col 4 Col 5
Projetos CRIA Biota (Fapesp) SinBiota Revista Biota Neotropica Website do Programa Biota/Fapesp O Instituto Virtual da Biodiversidade SICol (MCT/CNPq) Website Catálogo Virtual SpeciesLink (Fapesp) Lifemapper (NSF) Desktop Garp Hydro (Fapesp) Bioline Publications (U. Toronto, Bioline/UK)
SinBiota: Sistema Centralizado Provedor: pesquisador Padronização da entrada de dados ficha de coleta Uso de GPS Alimentação ou alteração de dados: via Internet, pelo provedor (protegido por senhas)
http://sinbiota.cria.org.br
Banco de Dados
Informação sobre a coleta
Sistema de Informação de Coleções de Interesse Biotecnológico Apoio MCT/CNPq http://sicol.cria.org.br
Centros de Recursos Biológicos (CRB) Centros especializados que adquirem, validam, estudam e distribuem: organismos "cultiváveis (microorganismos, tecidos de plantas e animais, células humanas) partes replicáveis destes (genomas, plasmídeos, virus e bancos de cdna) organismos viáveis mas ainda não cultivados Centros de informação Workshop "Science & Technology Infrastructure: Support for Biological Resource Centres", OECD http://www.oecd.org
Evolução: Catálogo (CC) Centro de Dados (CRB)
Objetivos do SICol Servir de elemento integrador às diversas e diferenciadas coleções (CRBs). Atender à demanda por informação das coleções e dos usuários de insumos biológicos na área da biotecnologia Atender à demanda por informação dos formuladores de políticas públicas.
Modelo: CABRI Common Access to Biological Resources and Information iniciativa da Comunidade Européia integra as principais coleções ex-situ da Europa desenvolveu um sistema federado de bancos de dados acessível via World Wide Web Padrões: dados mínimos, dados recomendados e dados completos para cada grupo taxonômico. permite a inclusão de dados históricos permite a inserção de dados mais completos http://www.cabri.org/
SICol (visão geral) Bactérias Usuário Fungos Células Interface Web Etc... Centros de Recursos Biológicos Base de dados do SICol Slide: Mauro Munhoz (mauro@cria.org.br)
http://sicol.cria.org.br/cv
Gateway de Dados Aplicativos: Catálogo Virtual Modelagem Outros Internet 2 Species Analyst Col 1 Cache Node SinBiota SICol Internet Col 2 Col 3 P1 Pn CRB
Utilização dos Pontos de Ocorrência das Espécies Ocorrências de espécies são associadas a pontos específicos no espaço, permitindo a caracterização de necessidades ecológicas Ocorrências de espécies são associadas a pontos específicos no tempo, permitindo a avaliação de mudanças temporais Slide: Marinez Ferreira de Siqueira (marinez@cria.org.br)
Integração entre os dados Pontos de ocorrência vegetação temperatura precipitação relevo Variáveis ambientais (coberturas geográficas) Distribuição prevista Slide: Townsend Peterson e Marinez Ferreira de Siqueira (marinez@cria.org.br)
Modelagem de Distribuição Geográfica Geografia Ecologia Algoritmo Temperatura Pontos de Ocorrência Modelo do Nicho Ecológico Precipitação Previsão da Distribuição Slide: Townsend Peterson e Marinez Ferreira de Siqueira (marinez@cria.org.br)
Exemplo de Análise de Distribuição Geográfica Dados dos Projetos: Viabilidade de Conservação dos Fragmentos de Cerrado do Estado de São Paulo Programa Biota/FAPESP: levantamento de espécies arbóreas Projeto de Cooperação Técnica: Conservação e Manejo da Biodiversidade do Bioma Cerrado - EMBRAPA Cerrados - UnB - Ibama/DFID Reino Unido Autores da Análise: Marinez Ferreira de Siqueira, CRIA (tese de doutorado) Prof. A. Townsend Peterson do Natural Museum and Biodiversity ResearchCenter, da Universidade de Kansas
Modelagem: distribuição esperada para duas espécies de Anadenanthera Slide: Marinez Ferreira de Siqueira (marinez@cria.org.br)
Analisando Mudanças de Cenário: Clima Geografia Ecologia Algoritmo Pontos de Ocorrência Temperatura Modelo do Nicho Ecológico Precipitação Previsão da Distribuição Projeção considerando alterações climáticas Projeção com Mudança Climática Slide: Townsend Peterson
Análises de Alteração Climática Modelo de Circulação Geral (HadCM2) usando dois cenários: HHGSDX50-0.5%/ano CO 2 HHGGAX50-1%/ano CO 2 Afeta: Temperatura Média Precipitação Média
Exemplos de predição de distribuição atual (1961-1990) e futura (2055) para espécie arbórea de cerrado: Acosmium subelegans (Siqueira et.al. submetido) Área habitável em 2055 baseado no cenário conservador Área habitável em 2055 baseado no cenário liberal Slide: Marinez F. Siqueira (marinez@cria.org.br)
Padrão previsto de riqueza de espécies (162) arbóreas de cerrado para a área core de cerrado no Brasil baseado em cenário climático atual (1961-1990) (Siqueira et.al. submetido) Região prevista que abrigaria a maior riqueza de espécies
Previsão baseada em cenários futuros Área prevista que abrigaria maior riqueza de espécies para um cenário de mudança climática conservador Área prevista de maior riqueza para cenário liberal
Possíveis Projeções Geografia Ecologia Algoritmo Temperatura Pontos de Ocorrência Modelo do Nicho Ecológico Precipitação Previsão da Distribuição Nativa Projeção sobre Projeção outra região sobre clima alterado Projeção sobre Clima Modificado Previsão de Invasão
Lantana camara L. Hábito Habitat - Preferências Climas quentes Relativamente abertas e úmidas Grande tolerância(baars & Neser, 1999) Complexo poliplóide de espécies (Stirton,1977) Nativa dos Neotrópicos Planta Ornamental Slide: rafael@cria.org.br
Distribuição Nativa Lantana camara L. Slide: rafael@cria.org.br
Distribuição Exótica - África Lantana camara L. Slide: rafael@cria.org.br
Distribuição Exótica - Australásia Lantana camara L. Slide: rafael@cria.org.br
Crotalaria pallida (nativa África, invasora Brasil)
Crotalaria pallida (FABACEAE) Região Nativa Slide: rafael@cria.org.br
Crotalaria pallida (FABACEAE) Área de Invasão Slide: rafael@cria.org.br
Modelagem Preditiva: Algumas Aplicações Biologia Melhora a compreensão sobre a distribuição de espécies raras, ameaçadas, espécies bioindicadoras etc; Norteia programas de re-introdução de espécies; Orienta o desenvolvimento de novos inventários estabelecendo lacunas de conhecimento; Validação de dados Conservação: informação de apoio à decisão Estuda os efeitos da mudança climática sobre a biodiversidade; Auxilia no desenvolvimento de planos de conservação da biodiversidade. Economia Espécies invasoras Agricultura e pestes agrícolas Saúde Pública Doenças infecciosas
Desenvolvendo Ferramentas e Protocolos Parcerias CRIA: Modelagem: Universidade de Kansas (NSF) desktop Garp Lifemapper Interoperabilidade de Sistemas: California Academy of Science, Universidade de Kansas, grupos de pesquisa da Australia e da Europa Distributed Generic Information Retrieval (DiGIR) Servidor de Localidades: Universidade de Kansas e Museu de Zoologia de Vertebrados de Berkeley BioGeoMancer Servidor de Nomes
Centro de Referência em Informação Ambiental Obrigada. Dora Ann Lange Canhos dora@cria.org.br www.cria.org.br