AVANÇOS NA DIAGNOSE DE FITONEMATOIDES DO GÊNERO MELOIDOGYNE EM ARROZ IRRIGADO
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- Márcia Figueiredo
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1 AVANÇOS NA DIAGNOSE DE FITONEMATOIDES DO GÊNERO MELOIDOGYNE EM ARROZ IRRIGADO Regina M.D.G. Carneiro e Vanessa S. Mattos Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, CP Brasília DF O arroz é um dos cereais mais produzidos no mundo e o Brasil destaca-se no mercado orizícola como nono maior produtor e oitavo exportador mundial. O Brasil cultiva uma área de aproximadamente 2,1 milhões de hectares de arroz (Oryza sativa L.), com produção de 12,1 milhões de toneladas (CONAB, 2017). O Rio Grande do Sul (RS) é o maior produtor nacional, responsável por 65% da produção de arroz, seguido pelo estado de Santa Catarina que detém 7,3% da produção nacional (CONAB, 2017). A produção de arroz pode ser limitada por vários agentes fitopatogênicos, dentre eles, os nematoides das galhas (Meloidogyne Göldi, 1887). Dentre as mais importantes espécies de Meloidogyne relatadas no arroz está M. graminicola Golden & Birchfield, 1965, detectada no Brasil desde o ano de 1990 (Sperandio & Monteiro, 1991). A perda de produção pode chegar a 70% em solos infestados com M. graminicola (Bridge et al., 2005). Outras espécies como M. hainanensis Liao & Feng, 1995, M. lini Yang, Hu & Xu, 1988, M. incognita (Kofoid & White, 1919) Chitwood, 1949, M. javanica (Treub, 1885) Chitwood, 1949, M. arenaria (Neal, 1889) Chitwood, 1949, M. oryzae Maas, Sanders & Dede, 1978, M. salasi López, 1984, M. sasseri Handoo Handoo, Huettel and Golden,1995 e M. triticoryzae Gaur, Saha and Khan,1993 foram relatadas também parasitando raízes de arroz no mundo (Brigde et al., 2005). Em levantamento recente realizado por Negretti et al. (2017), foi relatada a presença das espécies M. graminicola e M. javanica, além de três outros nematoides com fenótipos de esterase atípicos, em regiões orizícolas do RS e SC, provocando danos às plantações. No Paraná, um complexo de espécies também foi detectado, predominando Meloidogyne sp.3, M. graminicola, Meloidogyne sp.2 e uma população sem perfil de enzima, Meloidogyne sp.0 (Soares, 2017). Mais recentemente, algumas populações de Meloidogyne sp.0 foram enviadas para o laboratório de Nematologia do Cenargen, provenientes de outras regiões de Santa Catarina e todas apresentaram perfis sem bandas de esterase (Mattos et al., 2017b). A identificação dessas espécies de Meloidogyne por meio de características morfológicas, bioquímicas e moleculares seria a primeira etapa para a implementação futura de técnicas de manejo, como o uso da resistência genética e da rotação de culturas, que são imprescindíveis para a manutenção ou aumento da produção orizícola nacional. A identificação precisa das espécies de Meloidogyne é difícil e, às vezes é baseada em caracteres subjetivos. Além disso, a diagnose é dificultada pelo elevado número de espécies descritas, muitas vezes com descrições duvidosas (como é o caso das espécies do arroz), presença de espécies crípticas e pela existência de alta variabilidade intraespecífica (M. graminicola). Além do mais, existe o problema do conceito de espécie para organismos predominantemente partenogenéticos, que são considerados hídribos entre espécies anfimíticas e partenogenética meióticas (Triantaphyllou, 1985; Castagnone-Sereno et al., 1993; Roberts, 1995; Hunt & Handoo, 2009). Isso pode ser visto no arroz em M. graminicola (n =18), M. salasi (2n=36) e M. oryzae (3n=52-54). Os métodos mais utilizados na diagnose de Meloidogyne spp. são a configuração da região perineal de fêmeas, a morfologia da região anterior e do estilete de machos, fêmeas e juvenis de segundo estádio (J2), características citogenéticas e sobretudo identificação bioquímica e molecular (Eisenback & Hunt, 2009). Embora a caracterização por meio do polimorfismo das esterases seja uma técnica prática para a identificação de várias espécies do gênero, não existem padrões para todas elas (Carneiro & Cofcewicz, 2008). O desenvolvimento de técnicas moleculares abriu novas perspectivas quanto à identificação de espécies e estudos da variabilidade intraespecífica dos nematoides de i
2 galhas (NG). A técnica RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), baseada na PCR, é utilizada atualmente para os estudos genéticos e para a diferenciação de várias espécies de Meloidogyne, a partir de perfis gerados com o auxílio de primers aleatórios (Castagnone-Sereno et al., 1994; Blok et al., 1997; Semblat et al., 1998; Randig et al., 2002; Carneiro et al., 2004, 2008; Fargette et al., 2005; Muniz et al., 2008; Santos et al., 2012). A conversão de marcadores RAPD em marcadores espécie específicos (SCAR) tem sido realizada para espécies de Meloidogyne, e cerca de nove das 20 espécies detectadas no Brasil já podem ser identificada através dessa ferramenta (Carneiro et al., 2016). Para as espécies de NG do arroz, dois marcadores espécie-específicos foram desenvolvidos para a identificação de M. graminicola (Bellafiore et al., 2015; Htay et al., 2016), porém a especificidade desses marcadores não foi confirmada (Negretti et al., 2017). Recentemente, Mattos et al desenvolveram três marcadores do tipo SCAR para M. graminicola, M. oryzae e M. salasi. Foi relatado pela primeira vez no Brasil a presença da espécie M. oryzae, no estado de Santa Catarina, parasitando o arroz irrigado. Estudos morfológicos mostraram características típicas da espécie como a morfologia do estilete de machos e fêmeas e o formato e comprimento da cauda do juvenil de segundo estádio e o perfil de esterase espécie-específico (O1, Rm: 1,2), caracterizado para a espécie. Também foram conduzidos estudos citogenéticos e moleculares que ajudaram a esclarecer a posição filogenética dessa espécie de reprodução partenogenética mitótica, diferindo completamente de M. graminicola, por exemplo, uma espécie com reprodução partenogenética meiótica facultativa (Mattos et al., 2017). Foram apresentados dados sobre a variabilidade genética das populações de Meloidogyne encontradas em arroz, através dos marcadores neutros AFLP e RAPD. Meloidogyne graminicola apresentou uma alta percentagem de polimorfismo (75,2%) e M. oryzae apresentou uma menor variabilidade (12,9%), resultados esperados, considerando os modos de reprodução diferentes para as duas espécies. Nas análises filogenéticas, todas as espécies analisadas agruparam-se com 100% de bootstrap e M. salasi, uma importante espécie do arroz na Costa Rica e Venezuela, mostrou-se geneticamente distante das demais espécies. Fragmentos de RAPD-PCR específicos foram utilizados para a construção de primers SCAR espécie-específicos para as principais espécies do arroz detectadas nas Américas: M. graminicola, M. oryzae e M. salasi. A amplificação dos primers desenvolvidos produziram fragmentos específicos de 230 pb, 130 pb e 190 pb para M. graminicola, M. oryzae e M. salasi, respectivamente (Mattos et al. 2018). Devido à alta variabilidade observada em M. graminicola (PCR- RAPD) marcadores mais conservados como os mitocondriais poderiam ser desenvolvidos para o complexo de espécies de Meloidogyne, ocorrentes no Brasil e no mundo. Nos próximos anos, uma ênfase especial será dada à identificação ou descrição das espécies atípicas: Meloidogyne sp.0, Meloidogyne sp2 e Meloidogyne sp.3. Referencias BELLAFIORE, S., JOUGLA, C., CHAPUIS, E., BESNARD, G., SUONG, M., VU, P.N., DE WHALE, D., GANTET, P. & THI, X.N Intraspecific variability of the facultative meiotic parthenogenetic root-knot nematode (Meloidogyne graminicola) from rice fields in Vietnam. Comptes Rendus Biologies 338: BLOK, V.C., PHILLIPS, M.S., MCNICOL, J.W. & FARGETTE, M Genetic variation in tropical Meloidogyne spp. as shown by RAPDs. Fundamental and Applied Nematology 20: BRIDGE, J., PLOWRIGHT, R.A. & PENG, D Nematode parasites of rice. In: Luc, M., Sikora, R.A., & Bridge, J. (eds). Plant Parasitic Nematodes in Subtropical and Tropical Agriculture. CAB International, Wallingford, UK. p ii
3 CARNEIRO, R.M.D.G., TIGANO, M.S., RANDIG, O., ALMEIDA, M.R.A. & SARAH, J.L Identification and genetic diversity of Meloidogyne spp. (Tylenchida: Meloidogynidae) on coffee from Brazil, Central America and Hawaii. Nematology 6: CARNEIRO, R.M., DOS SANTOS, M.F., ALMEIDA, M.R.A., MOTA, F.C., GOMES, A.C.M. & TIGANO, M.S Diversity of Meloidogyne arenaria using morphological, cytological and molecular approaches. Nematology 10(6): CARNEIRO, R.M.D.G. & COFCEWICZ, E.T Taxonomy of coffee-parasitic root-knot nematodes, Meloidogyne spp. In: Souza, R.M. (ed). Plant parasitic nematodes of coffee. Springer, Holland. p CARNEIRO, R.M.D.G., MONTEIRO, J.M.S., SILVA, U.C. & GOMES, G Gênero Meloidogyne: diagnose através de eletroforese de isoenzimas e marcadores SCAR. In: Oliveira, C.M., Dos Santos, M.A., & Castro, L.H.S. Diagnose de Fitonematoides. Millennium, Campinas, Brasil. p CASTAGNONE-SERENO, P., BONGIOVANNI, M., & DALMASSO, A Stable virulence against the tomato resistance Mi gene in the parthenogenetic root-knot nematode Meloidogyne incognita. Phytopathology, 83(8): CASTAGNONE-SERENO, P., VANLERBERGHE-MASUTTI, F. & LEROY, F Genetic polymorphism between and within Meloidogyne species detected with RAPD markers. Genome 37: CONAB - Companhia Nacional de Abastecimento file:///c:/users/vanessa/downloads/boletimzgraoszdezembroz2017.pdf. Consultado em 20/03/2018 EISENBACK, J.D. & HUNT, D.J General morphology. In: Perry, R.N., Moens, N., & Starr, J.L. (eds). Root-knot Nematodes. CABI, Cambridge, USA. p FARGETTE, M., LOLLIER, V., PHILLIPS, M., BLOK, V., & FRUTOS, R AFLP analysis of the genetic diversity of Meloidogyne chitwoodi and M. fallax, major agricultural pests. Comptes Rendus Biologies, 328(5): HTAY, C., PENG, H., HUANG, W., KONG, L., HE, W., HOLGADO, R. & PENG, D The development and molecular characterization of a rapid detection method for rice rootknot nematode (Meloidogyne graminicola). European Journal of Plant Pathology146(2): HUNT, D.J. & HANDOO, Z.A Taxonomy, identification and principal species. In: Perry, R.N., Moens, N., & Starr, J.L. (eds). Root-knot Nematodes. CABI, Cambridge, USA. p MATTOS, V.S., CARES, J.E., GOMES, C.B., GOMES, A.C.M.M., MONTEIRO, JMS, GOMEZ,G.M., CASTAGNONE-SERENO, P. & CARNEIRO, R. M. D. G Integrative Taxonomy of Meloidogyne oryzae (Nematoda: Meloidogyninae) parasitizing rice crop in Southern Brazil. European Journal of Plant Pathology ( MATTOS V.S., MULET K, CARES J.E., GOMES, C.B., FERNANDEZ, D., GROSSI DE SÁ, M.F. CARNEIRO, RM.D.G. & CASTAGNONE-SERENO, P Development of Diagnostic SCAR Markers for Meloidogyne graminicola, M. oryzae and M. salasi Associated to Irrigated Rice Fields in Americas. Plant Disease (no prelo). MATTOS, V. D. S., SOARE, R., GOMES, A., ARIEIRA, C., GOMES, C., & CARNEIRO, R. 2017b. Caracterização de um Complexo de Espécies do Nematoide das Galhas Parasitando Arroz Irrigado na Região Sul do Brasil. Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia-Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E). MUNIZ, M.F.S., CAMPOS, V.P., CASTAGNONE-SERENO, P., CASTRO, J.M.C., ALMEIDA, M.R.A. & CARNEIRO, R.M.D.G Diversity of Meloidogyne exigua (Tylenchida: Meloidogynidae) populations from coffee and rubber tree. Nematology 10(6): NEGRETTI, R. R., GOMES, C. B., MATTOS, V. S., SOMAVILLA, L., MANICA-BERTO, R., AGOSTINETTO, D., CASTAGNONE-SERENO, P., & CARNEIRO, R.M.D.G iii
4 Characterization of a Meloidogyne species complex parasitizing rice in southern Brazil. Nematology, 19(4), RANDIG, O., BONGIOVANNI, M., CARNEIRO, R.M.D.G. & CASTAGNONE-SERENO, P Genetic diversity of root-knot nematodes from Brazil and development of SCAR markers specific for the coffee-damaging species. Genome 45: ROBERTS, P.A Conceptual and practical aspects of variability in root-knot nematodes related to host plant resistance. Annual Review of Phytopathology 33:199. SANTOS, M.F.A., FURLANETTO, C., CARNEIRO, M.D.G., ALMEIDA, M.R.A., MOTA, F.C., GOMES, A.C.M.M., SILVEIRA, N.O.R., SILVA, J.G.P., CASTAGNONE-SERENO, P., TIGANO, M.S. & CARNEIRO, R.M.D.G Biometrical, biological, biochemical and molecular characteristics of Meloidogyne incognita isolates and related species. European Journal of Plant Pathology 134: SEMBLAT, J.P., WAJNBERG, E., DALMASSO, A., ABAD, P. & CASTAGNONE SERENO, P High-resolution DNA fingerprinting of parthenogenetic root-knot nematodes using AFLP analysis. Molecular Ecology 7: SOARES, M.R.C., Caracterização isoenzimática de Meloidogyne spp. em arroz irrigado no Noroeste do Paraná e tratamento de semente no controle do nematoide. Dissertação de Mestrado, Curso de Agronomia. Universidade Estadual de Maringa, PR. 64 pp. SPERANDIO, C.A. & MONTEIRO, A.R Ocorrência de Meloidogyne graminicola em arroz irrigado no Rio Grande do Sul. Nematologia Brasileira 15:24. TRIANTAPHYLLOU, A.C Cytogenetics, cititaxonomy and phylogeny of root-knot nematodes. In: Carter, C.C., & Sasser, J.N. (eds.). An advanced treatise on Meloidogyne, vol. 1, Biology and control. North Carolina State University Graphics, Raleigh, USA. p iv
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