International Conference: the INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and e-infraestructure for Biodiversity

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1 International Conference: the INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and O Progresso da Ciência no país na última década e os avanços na qualificação das coleções botânicas e no compartilhamento de dados O INCT Herbário Virtual da Flora e dos Fungos neste cenário Ariane Luna Peixoto, Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do RJ Leonor Costa Maia, Universidade Federal de Pernambuco

2 Ciência da biodiversidade - área prioritária de investigação científica, tanto nos países desenvolvidos como naqueles em desenvolvimento.

3 Ciência da biodiversidade: atividades e ações com destaque em todo o mundo: - A descoberta, a caracterização e a conservação da biodiversidade; - A bioprospecção da quimiodiversidade; - A compreensão do funcionamento de ecossistemas e serviços ambientais; - O desenvolvimento de mecanismos e sistemas que levem ao compartilhamento de dados e informações; - A disseminação do conhecimento para diferentes setores da sociedade; - A capacitação de recursos humanos com habilidade de prosseguir nos estudos, e também descobrir modelos que acelerem a sustentabilidade ambiental. Aprendizes de jardineiros, 1912 e 2008; Acervo JBRJ

4 Biodiversidade x Conservação A ciência da biodiversidade - nessa última década desenvolveu fortes interfaces com a ciência das mudanças climáticas e com a biologia da conservação. Perda de biodiversidade - problema crítico para a existência humana. Extinção de uma espécie Irreversível Perda de um genoma único Resultado de um processo evolutivo não replicável.

5 Sistemática - uma das áreas básicas na ciência da biodiversidade, - bem desenvolvida no Brasil, - com longa tradição no ensino universitário brasileiro. No. de grupos de pesquisas (Diretório do CNPq) atuando em Sistemática/ Taxonomia: 255, sendo: 148 na área vegetal, 69 na área animal, 38 na de microrganismos. Desses grupos: 173 utilizam ferramentas moleculares em estudos filogenéticos, 28 utilizam técnicas de metagenômica pelo menos 3 utilizam técnicas de DNA Barcoding (Fonte: Joly et al.2011)

6 Grupos de pesquisa em Sistemática - geralmente associados a instituições que possuem grandes coleções biológicas. Coleções - fonte inesgotável de informação. No futuro, deverão propiciar descobertas ainda inalcançáveis com a tecnologia atual. Representam uma herança cultural, testemunho da rica história do país em especial do crescimento das cidades, do desenvolvimento da ciência, e guardam espécimes da fauna, flora e micota já extinta ou pouco amostrada.

7 Brasil - o país mais associado à idéia de megadiversidade por ser o de maior diversidade para diversos grupos de animais, plantas e fungos. Quanto maior a diversidade estimada de um país e quanto menor o seu conhecimento, mais crítica é situação de urgência de esforços em conservação e maior a responsabilidade deste país para com a humanidade. Os números da diversidade da biota brasileira mostram o grau da responsabilidade perante nossa própria nação e perante a humanidade em uma escala de tamanho sem igual em relação aos outros países (Marques & Lamas, 2006).

8 As coleções biológicas brasileiras Estima-se em 26 milhões o número de espécimes depositados em coleções brasileiras, constituindo-se o maior acervo sobre a Região neotropical. Essas coleções estão longe de abrigar toda a documentação da biodiversidade. Faltam especialistas em muitos grupos taxonômicos, o que significa ônus para a pesquisa e um impedimento sério ao desenvolvimento da Sistemática e da Biologia da Conservação. Com a disponibilização on line de dados das coleções, a representação da Biota brasileira vem sendo melhor dimensionada, e vem mostrando que há grandes espaços geográficos onde a representatividade de espécimes em coleções é nula ou muito pequena.

9 Fatores que favoreceram, na última década, o crescimento dos Herbários brasileiros e dos grupos de pesquisa que lidam com Sistemática, : A expansão e a consolidação do sistema de pós-graduação, promovido pela Capes; Programas de pesquisa implementados pelo CNPq, como o PELD, o PPBio, e mais recentemente o Protax, o Sisbiota e o Reflora, sem desconsiderar os grandes avanços provocados pelo programa Linhas de Ação em Botânica. A implementação, em algumas Fap s, de programas que incorporam em seu escopo inventários biológicos ou apoio a coleções científicas. O trabalho coordenado da Sociedade Botânica do Brasil, que de longa data estimula a discussão conjunta sobre coleções de plantas e fungos do Brasil;

10 Fatores que favoreceram, na última década, o crescimento dos Herbários brasileiros e dos grupos de pesquisa que lidam com Sistemática, : Lideranças acadêmicas - unem grupos de pesquisadores e estudantes e coordenam iniciativas que levam à melhoria de muitas coleções; A indução, por parte do MCT, da elaboração de diagnósticos específicos; a discussão e estabelecimento de Diretrizes Estratégicas para as Coleções Biológicas, posteriormente abrigadas como programas de governo; E, especialmente nos últimos anos, a ampliação do sistema público de universidades brasileiras, com a abertura de novos campi universitários, que levou à contratação de docentes com formação já consolidada em sistemática CGEE e MCT COP 8

11 Os avanços (embora haja muito mais a ser feito) Muitos herbários disponibilizam on line os dados das etiquetas de toda a coleção ou de parte dela; Muitos herbários estão com toda a rotina administrativa informatizada; Vários disponibilizam fotografias de tipos; Há uma busca constante de curadores de coleções por especialistas em diferentes grupos taxonômicos para visitarem as coleções e identificarem espécimes, trabalhando conjuntamente com estudantes locais e ajudando a formá-los; É grande o número de parcerias formadas entre pesquisadores de diferentes instituições no país e também entre pesquisadores do Brasil e de outros países. Na Plataforma Lattes (currículos atualizados entre ), há 398 pesquisadores ou estudantes de ME ou DO que trabalham com sistemática de plantas ou fungos no Brasil e que exercem atividades em uma instituição brasileira.

12 Os avanços A informatização e disponibilização de dados das coleções biológicas brasileiras foi fortemente impulsionada pelo Projeto specieslink, iniciado no âmbito do Programa Biota/FAPESP e ampliado, posteriormente com outras fontes de financiamento, especialmente no âmbito do MCTI. Novas interfaces e novos aplicativos foram desenvolvidos pelo CRIA o que possibilitou a ampliação de consultas a patamares antes não imaginados.

13 Os avanços A produção brasileira de artigos científicos continua crescendo 13ª posição no ranking dos países com maior produção indexada na Web of Science. Também cresceu o número de citações recebidas na base Scopus (usando o Scimago), agregados tanto por país como por revistas científicas. Os avanços na produção científica são resultado, entre outros já citados, do (1) acesso a revistas científicas pelo portal de periódicos da Capes; (2) consolidação e ampliação do sistema Scielo; (3) crescimento do número de revistas nacionais indexadas pelo Web of Science e Scopus, dando maior visibilidade à ciência que é produzida no Brasil. Aumento em qualidade e número da produção científica em Botânica e Micologia: Grande contribuição - compartilhamento de dados dos herbários, facilitando o acesso.

14 Avanços 78 herbários do Brasil com dados de seus acervos integrados em rede; 5 herbários do exterior (Nova Iorque, Field, Paris, Missouri, Smithsonian) disponibilizando os dados repatriados em rede; registros online; > georreferenciados na origem; > georreferenciados por aplicativo; > imagens online Dados textuais e imagens disponíveis como serviços web sendo utilizados pela Lista de Espécies da Flora do Brasil e pelo aplicativo Lacunas (

15 Papel do INCT-Herbário Virtual neste cenário - Expandir a base de conhecimento sobre a diversidade de plantas e fungos; - Melhorar a qualidade dos dados e dos herbários brasileiros; - Incentivar políticas públicas para assegurar a manutenção dos herbários, o treinamento de taxonomistas e o suporte aos estudos da biodiversidade; - Tornar os dados de ocorrência de espécies um instrumento fundamental para a tomada de decisões; - Encorajar o compartilhamento livre e aberto de dados e informações, em formato usável e accessível; - Oferecer dados e informações para tornar a sustentabilidade ambiental tão importante quanto o desenvolvimento econômico e social na formulação de políticas públicas.

16 Recursos humanos Coordenação Comitê Gestor Coordenadores de áreas específicas Taxonomia Pesquisa de produtos Articulação Curadores e pesquisadores Sistema de informações

17 Coordenadora: Leonor Costa Maia Vice Coordenadora: Maria Regina de V. Barbosa Comitê Gestor: Leonor Costa Maia (UFPE) Maria Regina de V. Barbosa (UFPB) Ariane Luna Peixoto (JBRJ) Mariângela Menezes (MN-UFRJ) João Renato Stehmann (UFMG) Ana Odete Santos Vieira (UEL) Coordenadores de áreas: José Rubens Pirani USP (taxonomia de fanerógamas) Kátia Cavalcanti Pôrto UFPE (taxonomia de criptógamas) Ariane Luna Peixoto JBRJ (recursos humanos) Ana Odete Santos Vieira UEL (articulação) Maria Regina Barbosa UFPB (produtos) Dora Ann Lange Canhos CRIA (sistema de informações e produtos online)

18 Instituições: sede, associadas e parceiras Missouri MOBOT IBt JBRJ UFPB New York NYBG MN UFPE INPA Berlin BGBM RNP UEFS Reading CoL CRIA Paris MNHN

19 Instituições: Sede e parceiros nacionais UnB UEFS UFRN UFPB IBt

20 Herbário Virtual - Recife, participantes 18-22/set/2012 MAC MOSS PEUFR SP SPF TEPB UFP UFRN URM UB BHCB UFG CEPEC ASE EAC EAN FUEL HST INPA IPA RB JPB R HUEFS HVASF HFSL Início = 26 HUCPE VIES FURB HUEM HUESC HUEG HUESB MBM RON IAC UEC SPSF IRAI MBML HUFU HTSA UFACPZ MIRR HCF BOTU ALCB HRCB SLUI EAFM CGMS UPCB CESJ ICN OUPR HAS FLOR CVRD CRI CNMT MFS MPUC UFRR HERBAM HUCS HUTO HPBR JOI NX HBRA ESA HPL HUCS Hoje = 72 Coloridos = Online

21 Herbários - distribuição geográfica 2 Distribuição dos herbários Rede INCT Herbário Virtual No. inicial = 26 No. atual = 72

22 Principais atividades The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Pesquisa Estudos de diversidade e taxonomia de plantas e fungos Uso de dados sobre a ocorrência de espécies na formulação de políticas públicas Treinamento Taxonomia, curadoria, informática para biodiversidade Transferência de conhecimento Fornecendo dados de forma livre e aberta

23 Resultados diagnóstico Diagnósticos iniciais Famílias de Angiospermas The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Registros* Fabaceae Euphorbiaceae Rubiaceae Asteraceae Malpighiaceae Myrtaceae Melastomataceae Apocynaceae Malvaceae Poaceae *Sem identificação de gêneros/ espécies

24 Resultados visitas de especialistas Visitas Famílias de Angiospermas Monimiaceae Passifloraceae Siparunaceae Erythroxylaceae Cyperaceae Convolvulaceae Gentianaceae Rosaceae Juncaceae Rubiaceae Rapateaceae Annonaceae Phyllanthaceae Turneraceae Sapindales* Boraginaceae Piperaceae Combretaceae Olacaceae * Várias famílias Além de: Briófitas Samambaias Licófitas Fungos

25 Resultados The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Visitas Recife, até dez/ /set/2012 (43 especialistas) Especialistas Visitantes Adriana Lobão - UFF Ana Paula Prata UFSE André Amorim UESC Andréa Flores MIRR Angela Miranda - UFRPE Ariane Peixoto JBRJ Aristônio Teles - UFG Armando Cervi UFPR Benjamin Oellgaard - UA Carolyn Proença UnB Charlotte M. Taylor - MoB Elsie Guimarães JBRJ Fátima Salimena - UFJF Haroldo Lima - JBRJ Inês Cordeiro Ibt Ingrid Koch UFSC Jáder Pereira UESC João Stehmann - UFMG Jomar Jardim UFRN Jorge Fontella UFRJ José Iranildo UEPB José Rubens Pirani USP Keniv Hyde U. Mae Tai Lana Sylvestre UFRJ Leif Ryvarden Univ. Oslo Lúcia Rossi - IBt Luciano Paganucci UEFS Luis Menini Neto- CES-JF Ma. de Fátima Freitas - JBRJ Ma. Iracema Loiola UFC Ma. Mercedes Arbo IBN Marccus Alves UFPE Marcos Sobral UFMG Marli Morim - JBRJ Massimo Bovini JBRJ Milton Groppo - USP Nádia Roque UFBA Olga Yano - IBt Paulo Windisch UFRGS Pedro Luís R. de Moraes - UNESP Rafael Trevisan - UFSC Regina Célia Oliveira - UnB Renato Goldenberg - UFPR Rosângela Simão-Bianchini - IBt Tatiana B. Gibertoni UFPE Vera Lúcia Klein - UFG Vinícius Cotarelli - FUEL

26 Resultados The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Visitas 2009 = = = 25 > 45 herbários atendidos ALCB, ASE, BHCB, CEPEC, CGMF, CGMS, EAC, EAFM, FUEL, HAS, HBR, HST, HSTA, HTSA, HUCS, HUEM, HUFU, HVAST, ICN, HAB, HBR, HRB, HSL, HUEFS, IAC, INPA, IPA, JPB, MAC,MBM, MIRR, MOSS, OUPR, PACA, PEUFR, R, RB, RON, SPF, UB, UEC, UFG, UFP, UFRN, UPCB, URM, VIES Número de espécimens examinados >

27 Cursos The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Cursos Coleção, estocagem e preservação de plantas Técnicas para trabalho em herbários Organização de coleções botânicas Taxonomia e ecologia de Cyanobacteria Taxonomia, morfologia, evolução e desenvolvimento de plantas aquáticas Usando o Brahms Criptógamos como preparar registros para herbários Identificação morfológica de Glomeromycota Coleções de herbário: organização e uso para conhecimento e conservação Latim instrumental para botânicos

28 Cursos The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Biogeografia Taxonomia de Glomeromycota Taxonomia de plantas da Caatinga Política e gerenciamento de coleções de herbário Introdução ao uso de ferramentas para banco de dados Informatização de coleções usando o BRHAMS e o specieslink Técnicas de identificação para Fungos poliporóides tropicais Identificação de Cyperaceae, Juncaceae e Rapateaceae Filogenia para entendimento da biodiversidade Métodos em taxonomia e florística Nomenclatura Botânica Coleções biológicas em Botânica Sistemática de Leguminosas

29 Cursos Paola Bonfante (Univ. Turin) Rafaela Forzza (JBRJ) Carl Larsson (Univ. Oslo) Kevin Hyde (Univ. Mae Fah Luang) e José Luiz Bezerra (UESC) Benjamin Oellgaard Univ. Aarhus

30 Cursos The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Total : 39 No. de alunos 679 Instituições > 35 UEFS,2009 UFPE, 2009 UEBA, 2011 UFRJ, 2012 JBRJ, 2012

31 Visitas de técnicos Instalação de programas/treinamento em banco de dados Novas ferramentas de busca

32 Novas ferramentas e serviços The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Georeferenciamento automático Interface administrativa para cada herbário ver e utilizar suas imagens no próprio website Dados textuais associados a imagens

33 Indicador de crescimento dos registros online Indicador de crescimento dos registros on line

34 Registros online Download Download/Reg online JBRJ_RB HUEFS FURB NYBG_BR JBRJ_RB HUEFS INPA-Herbario NYBG_BR JPB MBM INPA-Herbario HFSL-Fungos MOBOT_BR CEPEC ALCB HUEFS MOBOT_BR HVASF UB MBM VIES ESA ALCB CVRD CEPEC BHCB CEPEC BHCB ESA HUESC UEC JPB MOSS SP UEC HUESB URM UB FLOR ALCB FURB INPA-Fungos UPCB URM ASE ICN MBML-Herbario MBML-Herbario IPA EAC INPA-Herbario FUEL SP RON JPB FLOR PEUFR EAC IAC HTSA Top 20 nas 3 colunas Top 20 em 2 colunas TOP 20

35 Metas do INCT Herbário Virtual Continuar promovendo cursos e oficinas de capacitação voltados a taxonomistas, a técnicos em herbários e a técnicos em informática para a biodiversidade Continuar estimulando visitas de especialistas de diferentes grupos taxonômicos a herbários, qualificando as coleções com identificações acuradas. Estimular, com as visitas aos herbários, a formação de novos taxonomistas em diferentes localidades do país.

36 Metas do INCT Herbário Virtual Formar recursos humanos em Sistemática de Plantas e Fungos; Colaborar com a formação de recursos humanos em informática para a biodiversidade; Estabelecer o uso de vocabulário controlado; Incentivar a atualização da nomenclatura e a manutenção do histórico das mudanças nomenclaturais realizadas; Definir conjuntamente campos específicos a determinados tipos de vegetação, a determinados grupos taxonômicos, sem perder a unidade; Ampliar o número de registros on-line, qualificados por taxonomistas e georeferenciados

37 Metas do INCT Herbário Virtual Desafios: país megadiverso, de dimensões continentais, com diferentes tipos de vegetação = muito mais trabalho Desejamos desenvolver e aprimorar continuamente um sistema distribuído de dados dos acervos de herbários, acessível na Internet de forma livre e aberta, com ferramentas de busca cada vez mais refinadas. Em longo prazo, desejamos integrar todos os herbários do Brasil, disponibilizando todos os dados não sensíveis sobre as plantas e os fungos colecionados no país.

38 INCT -Herbário Virtual projetos complementares REFLORA -Repatriamento de dados e imagens de coleções do Brasil depositadas no exterior; -Sala de exposição: Herbário Virtual; -Resgate e disponibilização on line da coleção bibliográfica de Chaves Batista. SISBIOTA coletas e ampliação das coleções

39 ACERVO DE A.C.BATISTA

40 ACERVO DE A.C.BATISTA

41 SALA DE VISITAÇÃO PÚBLICA

42 SALA DE VISITAÇÃO PÚBLICA

43 Obrigada! The INCT Virtual Herbarium of Plants and Fungi and Agradecimentos Curadores Pesquisadores Técnicos Estudantes Instituições Financiadores