Universidade Católica Portuguesa - Faculdade de Engenharia L I C E N C I A T U R A E M E N G E N H A R I A B I O M É D I C A 2 º A N O - 1 º C I C L O 1 º S E M E S T R E S E T E M B R O 2 0 0 8 / J A N E I R O 2 0 0 9 DISCIPLINA: BIOQUÍMICA Docentes: Drª Filipa do Vale (T,TP+P) Nota biográfica: Filipa do Vale é Doutorada em Engenharia Biomédica pela FEUCP, Mestre em Engenharia da Saúde (2003) pela Faculdade de Engenharia da Universidade Católica Portuguesa e licenciada em Biologia Microbiana e Genética (1996) pela Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa. Assistente da FEUCP (filipavale@fe.ucp.pt). Objectivos da disciplina: A disciplina de Bioquímica tem como objectivo transmitir os conceitos básicos para o estudo dos processos associados aos sistemas vivos. Carga horária: 60 horas Programa da disciplina: 1. Introdução à Bioquímica. 2. Estrutura da célula eucarióta e procariota 3. Estrutura e função de biomoléculas 4. Metabolismo
Bibliografia Lehninger, Principles of Biochemistry, DL Nelson and MM Cox 2007, 4th edition, Worth Publishers, New York Biochemistry, The molecular basis of life T. McKee, J. McKee 2003, 3rd edition, McGraw-Hill, Boston Texbook of Biochemistry with Clinical Correlations T. M. Devlin, John Wiley and Sons ISBN 0-471-15451-2 Bioquímica Manuel Júdice Alpern Lidel, ISBN 972-757-042-9 Bioquímica Geral J. H. Weil, Fundação Caluste Gulbenkian Principles of Biochemistry HR Horton, LA Moran, RS Ochs, JD Rawn, KG Scrimgeour 1996, 2nd edition, Prentice-Hall, Inc., London, ISBN 0-13-439167-5 Biochemistry D. Voet, J.G. Voet, 1995 2nd edition, John Wiley and Sons, Inc., New York, ISBN 0-471-58651-X Biochemistry L. Stryer, 1995 4 th edition, W.H. Freeman and Company, New York, ISBN 0-7167-2009-4 Biochemistry C.K. Mathews, K.E. van Holde,1996 2 nd edition, The Benjamin/Cummings Pub. Co., Inc.,Menlo Park Práticas de Bioquímica para as Ciências da Saúde Cândido Hipólito-Reis, Manuel Nuno M. P. Alçada, Isabel Azevedo Lidel, ISBN 972-757-245-6 Guia do laboratório de Química e Bioquímica José A. Martinho Simões, Miguel A. R. Botas Castanho, Isabel M. S. Lampreia, Fernando J. V. Santos, Carlos A. Nieto de Castro, M. de Fátima Norberto, M. Teresa Pamplona, Lurdes Mira, M. Margarida Meireles Lidel, ISBN: 972-757-146-8 2
Avaliação: II - Avaliação Contínua, Frequências e/ou Exame Final Frequências e/ou exame final 70%. É condição necessária para aprovação na disciplina de classificações positivas em cada uma das duas provas de frequência ou no exame final ou de recurso. Aulas práticas (30 %) A avaliação da parte prática tem um peso de 30% da nota final. Os restantes 70% serão determinados pelo exame das componentes teóricas e teórico-práticas. É necessário aproveitamento na componente prática (i.e., classificação igual ou superior a 10 em 20), para acesso ao exame final. A avaliação da componente prática possui uma parcela de avaliação contínua e depende ainda da nota final dos trabalhos práticos. 3
AULAS TEÓRICO-PRÁTICAS Temas das Sessões: TP1 Apresentação. Segurança no laboratório. Cálculo de soluções. TP2 Propriedades dos aminoácidos. TP3 Técnicas de separação de proteínas. TP4 Espectroscopia de absorção. TP5 Cinética enzimática. TP6 Ácidos nucleicos. 4
AULAS PRÁTICAS Temas das Sessões: P1 Estudo do efeito da desnaturação na proteina albumina. P2 Extracção de proteínas e doseamento semi-quantitativo. P3 Extracção e visualização de DNA humano. P4 Pesquisa de endonucleases de restrição em isolados bacterianos. Estudo do efeito da temperatura na actividade enzimática. P5 Extracção de lípidos e quantificação de colesterol Normas Os alunos não poderão frequentar as aulas práticas sem bata. A aula começa à hora indicada no horário. A máxima pontualidade é imprescindível para o bom funcionamento e para a execução atempada de cada trabalho prático. Os trabalhos práticos realizar-se-ão em grupos de 2 a 3 alunos. Para um melhor funcionamento das aulas práticas, cada aluno deve ler previamente o protocolo experimental e realizar sempre a "Preparação da aula prática" com esquematização do protoloco. Uma cópia do esquema deverá ser entregue ao Professor no início da aula. Cada esquema contribuirá em 5% para a nota prática. Cada grupo deverá elaborar 3 relatórios dos trabalhos práticos. O relatório deve ser entregue ao docente durante um período de duas semanas após a respectiva aula prática (ver elaboração do relatorio). O relatório contribui em 60% para a nota prática. No final de cada aula prática cada aluno deve ainda entregar o questionário preenchido (15% da nota prática). As aulas práticas (P) e as aulas teórico-práticas (TP) funcionam normalmente em regime de alternância, como se indica no quadro que se segue. 5
CALENDÁRIO DAS AULAS PRÁTICAS (P) e TEÓRICO-PRÁTICAS (TP) 25/09 02/10 9/10 16/10 23/10 13/11 Apresentação. Introdução às técnicas de Bioquímica (TP1) Propriedades ácido-base dos aminoácidos. (TP2) Técnicas de separação de proteínas (TP3) Espectrometria de absorção (TP4) Cinética Enzimática (TP5) Estudo do efeito da desnaturação na proteína albumina (P1) 20/11 27/11 04/12 13/12 03/01 Extracção de proteínas e doseamento semi-quantitativo (P2) Extracção e visualização de DNA humano (P3) Pesquisa de endonucleases de restrição em isolados bacterianos (P4) Extracção de lípidos e quantificação de colesterol (P5) Ácidos Nucleicos (TP6) NOTA: A ordem dos trabalhos práticos poderá sofrer alterações. 6
Instruções para a elaboração do Relatório O relatório deve ser conciso (~5 páginas), e deve incluir os seguintes tópicos: 1. Título 2. Introdução Teórica (máx. 1 página). Deverá abordar apenas os temas relacionados com o trabalho experimental. As referências à literatura utilizada devem ser mencionadas no texto, referindo-se à lista numerada da bibliografia. Por exemplo, a enzima catalase tem um cofactor hémico [2]. O mesmo se aplica a quaisquer figuras utilizadas. 3. Materiais e Métodos (máx. 1 página). Deverão remeter para o protocolo experimental, e apenas detalhar as alterações introduzidas. 4. Resultados e Discussão. Os resultados deverão ser apresentados em tabelas e gráficos numerados. Este tópico compreende também a discussão da técnica usada, sua eficiência, comentários críticos em relação ao trabalho efectuado. Esta secção deve incluir o especificado em cada trabalho. 5. Conclusões Seja breve e sucinto e refira apenas as conclusões relacionadas com o trabalho experimental realizado. 6. Bibliografia Deve ser numerada e as citações no texto devem referir-se a essa numeração. Exemplo de formato para citação de livro: Horton, Moran, Ochs, Rawn e Scrimgeour (1996) Principles of Biochemistry, 2 nd Edition, Prentice Hall, London. Exemplo de formato para citação de artigo científico: Sánchez, R., Sali, A. (1998) Large-scale protein structure modeling of the Saccharomyces cerevisiae genome, Proc. Natl. Acad. Sciences USA 95, 13597-13602 Nota: Dos 6 trabalhos práticos a realizar os alunos deverão entregar três relatórios completos. Para todos devem ser entregues as resoluções às questões colocadas no início e no final de cada protocolo. 7