Processamento digital de imagens para a detecção e classificação de nódulos em mamografias

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1 Revista Eletrônica da Faculdade Metodista Granbery - ISSN Curso de Sistemas de Informação - N. 9, JUL/DEZ 2010 Processamento digital de imagens para a detecção e classificação de nódulos em mamografias Mônica de Lourdes Souza Batista 1, Aura Conci 1, Leonardo Motta 1, Sérgio Muinhos Barroso Lima 2, Patrícia Lima Quintão 2 1 Universidade Federal Fluminense UFF Rua Passo da Pátria, 156 Bloco E São Domingos CEP: Niterói RJ Brazil 2 Faculdade Metodista Granbery FMG Rua Batista de Oliveira, 1145 Centro CEP: Juiz de Fora MG Brazil mbatista@ic.uff.br, aconci@ic.uff.br, lmotta@ic.uff.br, smblima@gmail.com, pquintao@granbery.edu.br Resumo. O objetivo deste trabalho é classificar o nódulo de uma imagem mamográfica como maligno ou benigno de forma automática, tomando-se como base a intensidade do pixel e a sua morfologia. Na etapa de pré-processamento, o fundo e os ruídos são removidos. A região de interesse é detectada e destacada. Para treinar e testar o método proposto, 20 imagens com diagnóstico confirmado foram utilizadas. Palavras- chave: processamento digital de imagens, câncer, mamografia. Abstract. The aim of this research is to classify a node from a mammography image as malignant or benignant in an automated way based at the pixel intensity and the mode morphology. At the preprocessing step, the background and the noises are removed. The note region is detected and its boundary and interior are highlighted. To train and test the method proposed, 20 images with confirmed diagnosis were used. Key-words: digital image processing, cancer, mammography.

2 1. Introdução Atualmente, no Brasil, o câncer de mama é responsável pela maior taxa de mortalidade entre as mulheres. A sobrevida das pacientes depende fundamentalmente do diagnóstico precoce. O uso de imagem na medicina é considerado um recurso importante na elaboração dos diagnósticos médicos. Para auxiliar estes diagnósticos, técnicas de análise auxiliadas por computador têm sido utilizadas com o objetivo de oferecer melhores parâmetros para a elaboração de um diagnóstico mais acurado, indicando áreas suspeitas, bem como anormalidades mascaradas. Essas técnicas (CAD, de computer-aided diagnosis ) têm sido desenvolvidas por diversos grupos de pesquisas, visando auxiliar na detecção precoce do câncer de mama. Os esquemas CAD têm proporcionado uma ferramenta importante no auxílio ao diagnóstico médico em diversas aplicações radiológicas, sobretudo na mamografia. Pensando na detecção de áreas suspeitas, esse trabalho consiste na aplicação de técnicas de processamento digital de imagens que facilitem a identificação visual e automática de nódulos em mamografias e sua classificação em benignos ou malignos. Para isso, foram realizadas algumas técnicas de pré-processamento para que o fundo e os ruídos fossem removidos e, finalmente, a classificação e reconhecimento do nódulo. Para isso, o trabalho apresenta as seguintes seções: além desta introdução, é apresentado, na seção dois, o pré-processamento da imagem e, na seção três, a classificação e o reconhecimento. Por fim, são destacadas as considerações finais do trabalho e as referências bibliográficas utilizadas. 2. Pré-processamento da imagem A imagem é uma pintura bidimensional formada por pixels que estão em linhas e colunas. Ela é representada em uma matriz de números inteiros, onde cada pixel tem uma cor, brilho, entre outras propriedades (MANFIO, 2009). Na etapa de pré-processamento da imagem, o fundo e os ruídos existentes foram removidos. Este pré-processamento foi composto de duas etapas: restauração e segmentação. Para a realização do pré-processamento utilizou-se o software Adobe Photoshop 7.0.1, e todas as imagens foram transformadas em tons de cinza, ou seja, variando entre o preto com menos intensidade e o branco com maior intensidade. Os histogramas de cada fase do pré- 2

3 processamento foram analisados, pois com ele é possível identificar a distribuição dos níveis de cinza da imagem. O histograma é representado por um gráfico que mostra o número de pixels na imagem para cada tom de cinza. A Figura 1 mostra um exemplo de uma mamografia que possui um tumor benigno e a Figura 2 destaca o histograma da mesma (BASTOS, 2010). Figura 1: Mamografia de um tumor benigno Figura 2: Histograma da imagem original De acordo com o histograma da imagem original, representado na Figura 2, percebe-se que não há pixels brancos. A imagem ficaria bem mais nítida se houvesse estes pixels brancos. 2.1 Restauração e realce O realce tem por objetivo destacar detalhes da imagem que são de interesse para análise, ou seja, processar uma imagem de modo que o resultado seja mais apropriado para uma 3

4 aplicação específica do que a imagem original. Já a técnica de restauração é utilizada quando a imagem encontra-se deteriorada (BASTOS, 2010). No caso da mamografia utilizada no trabalho, foram aplicadas as técnicas de Negativo e Contraste Negativo O negativo de uma imagem digital faz com que as cores escuras fiquem claras e as cores claras fiquem escuras (CONCI, AZEVEDO e LETA, 2008). Esta técnica faz com que o histograma da imagem se inverta. Figura 3a: Aplicação de técnica de negativo Figura 3b: Histograma da imagem 4

5 De acordo com a Figura 3, percebe-se que os vasos são melhores vistos na imagem negativa do que na imagem original. Em relação ao nódulo, a imagem negativa não surtiu efeito, sendo possível identificar a presença do mesmo. O histograma da imagem apenas se inverteu, como deveria ser. Neste histograma não há pixels pretos Contraste Contraste é uma medida da diferença de brilho entre as áreas claras e escuras de uma cena. Com esta técnica, os detalhes da imagem são mais realçados. A finalidade do alargamento de contraste consiste no aumento da escala dinâmica dos níveis de cinza da imagem (SILVA, 2010). 5

6 Figura 4: Aplicação da técnica de contraste, com o aumento do mesmo para 41 Com a aplicação desta técnica, aumentando o contraste para 41, tanto o nódulo, quanto o fundo e os vasos ficaram mais realçados. 2.2 Segmentação A segmentação de imagens consiste em dividir uma imagem de entrada em partes constituintes, para uma melhor caracterização das regiões de interesse. As operações de segmentação procuram isolar regiões de pontos da imagem pertencentes a objetos, para posterior extração de atributos (BASTOS, 2010). A representação por região é aquela em que o interesse se concentra em propriedades internas, tais como textura, intensidade de brilho, cor, contraste, dentre outros. Nas imagens mamográficas, a representação por fronteiras tem como objetivo identificar lesões através do seu formato, possibilitando, num primeiro momento, caracterizar uma lesão maligna ou benigna, simplesmente pela sua forma estrutural. Para a realização deste trabalho foram aplicadas as seguintes técnicas de segmentação: limiarização, posterização e equalização Limiarização Esta técnica consiste na identificação confiável dos picos modais em um dado histograma, transformando uma imagem original em uma imagem binária (2 níveis de cinza). 6

7 Essa capacidade é importante para a seleção automática de limiar em situações em que as características da imagem possam variar em uma larga faixa de distribuição de intensidade. Entretanto, a limiarização não apresenta resultados satisfatórios em imagens com iluminação não uniforme ou com baixo contraste entre as diversas regiões (BASTOS, 2010). A Figura 5 apresenta um exemplo da técnica de limiarização na imagem mamográfica. A implementação deste algoritmo é simples: dado o limiar x, todos os pixels que possuem valores abaixo deste limiar vão para a cor preta; caso contrário, vão para a cor branca. 7

8 Figura 5: A 1ª figura corresponde à imagem original. A 2ª figura corresponde à imagem binária (limiar 128) Observa-se na Figura 6 que, com o limiar igual a 128, é possível verificar a existência do nódulo na imagem, mas uma parte bem pequena do nódulo foi perdida. Figura 6: Parte pequena do nódulo que foi perdida com o limiar igual a 128 Já com o limiar igual a 110, a parte que foi perdida com o limiar igual a 128 permanece, ou seja, o nódulo fica bem perceptível, mas aparecem também outras regiões. A Figura 7 mostra esta situação. 8

9 Figura 7: Nódulo bem perceptível, mas algumas regiões também são mostradas Após análise de vários limiares, o que mais permitiu a visualização da existência do nódulo, sem também mostrar regiões que não são de interesse, foi o limiar Posterização Quando ocorrem variações abruptas em tons, ao invés de transições suaves, tem-se o efeito de posterização (BASTOS, 2010). Com a aplicação da posterização, houve uma segmentação da imagem em três regiões, sendo que a região com o tom mais claro corresponde à região de interesse. A melhor posterização encontrada foi a posterização com quatro níveis, conforme visto na Figura 8. 9

10 Figura 8: Aplicação da técnica de Posterização Equalização A técnica de equalização tem por objetivo modificar o histograma da imagem original para que a imagem transformada tenha um histograma uniforme, onde todos os níveis de 10

11 cinza aparecem com a mesma freqüência (BASTOS, 2010). A equalização reduz o contraste em áreas muito claras ou muito escuras em uma imagem, para que os tons de cinza tenham a mesma frequência. Esta técnica também foi utilizada, mas, de acordo com a Figura 9, percebe-se que ela não foi boa para o caso em questão, pois introduziu muitos ruídos e realçou muitas regiões. Figura 9: Aplicação da técnica de Equalização Utilizando-se imagens já segmentadas, torna-se possível obter dados relevantes ou atributos das regiões ou objetos destacados. De acordo com a segmentação realizada, percebese que existe na imagem um nódulo de formato arredondado. 11

12 3. Classificação e reconhecimento Uma vez que os descritores da imagem e dos objetos segmentados encontram-se disponíveis, passa-se para a etapa seguinte, que consiste em distinguir objetos na imagem, agrupando esses parâmetros de acordo com sua semelhança para cada região de pixels encontrada. Essa é a função dos processos de classificação e reconhecimento. De acordo com a imagem segmentada, pode-se dizer que a mesma possui um nódulo que se classifica em um nódulo benigno, pois o nódulo possui o formato arredondado. De acordo com a medicina, quando um nódulo tem a forma arredondada, ele se classifica em nódulo benigno. Quando o nódulo possui o formato especular (cheio de pontas), ele é um nódulo maligno. Estes dois nódulos são ilustrados na Figura 10. Do lado esquerdo, o nódulo benigno, e do lado direito, o maligno. Figura 10: Nódulo benigno (formato arredondado) e o nódulo maligno (formato especular) Para verificar a existência de um nódulo e classificá-lo foi desenvolvido um sistema implementado em C e a biblioteca SDL (Simple DirectMedia Layer) foi utilizada para a manipulação da imagem. 12

13 3.1 Implementação Para verificar a existência de um nódulo e classificá-lo, foi desenvolvido um sistema implementado em C, e a biblioteca SDL (Simple Directmedia Layer) foi utilizada para a manipulação da imagem. As imagens utilizadas nesta pesquisa foram retiradas do banco de dados de mamografias (MAMMOGRAPHIC DATABASE, 2009), na qual as mesmas foram diagnosticadas e classificadas por médicos. Para eliminar o fundo da imagem foram calculados os primeiros quatro momentos da intensidade de uma janela ajustável. No primeiro momento, o algoritmo calcula o valor médio. No segundo, o desvio padrão. No terceiro, a raiz cúbica e, finalmente, no quarto, a raiz quarta (GONZALEZ e WOODS, 1993). O software verifica a maior média encontrada no primeiro momento e altera todos os pixels que estão abaixo da média para zero. Estes pixels representam o fundo e não a área de interesse. A Figura 11 mostra este passo. Figura 11: Fundo e ruídos eliminados. Após a segmentação, a detecção de candidatos para as regiões de interesse (ROIs) é feita com base no histograma da imagem. O valor limite é definido pelo usuário, e os pixels com intensidade maior que o limite definido são alterados para branco, conforme visto na Figura 12. Esses pixels são candidatos para ROIs. Figura 12: ROI 13

14 Depois do nódulo destacado, o software reconhece a existência de um nodo e determina o contorno do mesmo, como ilustrado na Figura 13. Figura 13: Detecção automática do nódulo Com o nódulo detectado, a classificação é iniciada. A fim de realizar este passo, o perímetro e a área da região de interesse foram calculados, contando-se o número de pixels do contorno e do nódulo detectado. O perímetro do nódulo foi calculado da seguinte maneira: foi verificada a cor de cada pixel. Caso o pixel fosse branco, era verificada a cor dos pixels vizinhos. Se a cor destes pixels vizinhos não fosse branca, incrementava-se a variável de controle. Por fim, se esta variável fosse maior do que zero e menor do que quatro, significava que o pixel analisado era um contorno e a variável que armazenava o valor do perímetro era incrementada de um. A área do nódulo é calculada contando-se a quantidade de pixels brancos existentes na imagem. A classificação do nódulo é feita calculando a razão entre o perímetro e a área do nódulo. Para encontrar o melhor limiar, dez imagens que tiveram o diagnóstico conhecido foram testadas durante a fase de treinamento. Depois disso, outras dez imagens da mesma base de dados foram testadas. A Tabela 1 mostra o percentual de sucesso usando estas imagens. Tabela 1: Porcentagem de sucessos e erros. 14

15 4. Considerações finais Este trabalho apresentou um método para pré-processar imagens de mamografia, eliminando o fundo e ruídos, detectando os nódulos e, por fim, classificando-as em malignos ou benignos. A classificação foi feita com base na razão entre o perímetro e a área do nódulo. Para verificar a precisão da metodologia, dez imagens foram utilizadas durante o processo de treinamento e outras dez imagens para o teste final. De acordo com a Tabela 1, não foi encontrado nenhum falso negativo, 80% de precisão para detectar nódulos benignos e 100% de precisão para os casos malignos. Como trabalhos futuros, sugere-se a aplicação de outras técnicas de processamento digital de imagens e algoritmos de inteligência artificial para encontrar padrões para auxiliar na tomada de decisões. 5. Referências Bibliográficas BASTOS, V. P., Técnicas de Segmentação de Imagens para Recuperação de Informações Visuais. Disponível em < Acessado em junho de CONCI, A., AZEVEDO, E., LETA, F.G. Computação Gráfica: volume 2 (Processamento e Análise de Imagens Digitais), Campus/Elsevier LLOBET, R., SOLVES, J.A., CORTES, J.C.P., PERALES, F.R. Mammographic_Density_Classification_based_on_Local_Histograms. MANFIO, F. Computação Gráfica. Disponível em < Acessado em junho de MASCARO, A. Segmentação de imagens de mamografias digitais Trabalho de conclusão de curso, Universidade de Pernambuco. SILVA, J. D. S. Realce de Imagens. Disponível em < Acessado em junho de SONKA, M., HLAVAC, V., BOYLE, R. Image Processing, Analysis and Machine Vision, 3th Edition, Thomson, GONZALEZ, R.C., WOODS, R.E., EDDINS, S.L. Digital Image Processing Using MATLAB, Publishing House of Electronics Industry, GONZALEZ, R. C., WOODS, R. E. Digital Image Processing, Addison Wesley Pub, VIANNA, A., CONCI, A., TORREÃO, J., AS, MARCELLE. Mammographic Database. Disponível em < Acessado em: julho de