Suínos e Aves Resultados de Pesquisa em Mapeamento de QTL População F2 Mônica Corrêa Ledur Tópicos Introdução Projeto Brasileiro de Genômica de Aves População F2
Introdução Evolução no desempenho de linhagens de frango de corte. Ano Peso frango (g) CA Idade (dias) 1930 1.500 3,50 105 1960 1.600 2,25 56 1970 1.700 2,15 49 1984 1.860 2,00 47 1988 1.940 2,00 47 1998 2.150 1,95 45 2001 2.300 1,85 42 2003 2.350 1,88 43 Fonte: UBA Introdução Características indesejáveis (Burt, 2002): - aumento de doenças metabólicas, - carne de baixa qualidade (PSE, gordura), - redução da fertilidade, - redução da resistência a doenças infecciosas. Informação molecular: - seleção mais efetiva características difíceis de serem medidas e de alto custo de avaliação.
Projeto Brasileiro de Genômica de Aves Suínos e Aves Objetivo: mapear QTLs para várias características. Populações para estudos de mapeamento do genoma avícola. TT CC
42 dias de idade Fêmeas TT e CC Machos TT e CC Experimento com Linhas Puras e F1 Linhagens puras TT e CC e os F1 TC e CT Médias e desvios-padrão dos grupos genéticos Decisão de quais características medir na F2 Decisão na formação de populações F2 recíprocas
3000 Médias de Peso Corporal 2500 2000 g 1500 1000 500 500 0 0 0 1 2 3 4 5 6 7 TC CT CC TT Lc Semanas Resultados Médias estimadas de peso corporal (PC41) e rendimentos de carcaça (RC), peito (RP) e gordura (GOR). Grupo Genético PC41 (g) RC (%) RP (%) GOR (%) CC 513,7±37,8 a 64,2±0,4 a 14,2±0,2 a 0,16±0,10 a TT 2395,4±38,2 b 74,6±0,5 b 20,4±0,2 b 2,41±0,10 b CT 1573,4±38,2 c 70,9±0,5 c 18,3±0,2 c 1,92±0,10 c TC 1193,3±38,2 d 70,0±0,5 c 17,3±0,2 d 1,51±0,10 d Média 1472,6 70,0 17,4 1,65
População F2 Frangos de Corte Populações F2 7 TT x 7 CC 7 TC x 21 TC 2063 animais F2 7 CC x 7 TT 7 CT x 21 CT 1861 animais F2
Características Avaliadas Crescimento: Peso inicial, aos 35, 41 e 42 d. Viabilidade até 35 e 41 d. GP, CR e CA 35 a 41 d. Carcaça: Peso da carcaça, partes e órgãos. Composição da carcaça. Qualidade da carne: gordura na carcaça, colesterol, lipídios totais, triglicerídios. Resultados - F2 P42 TT 2443 CC 521 TC (F1) 1210 CT (F1) 1517 Peso corporal aos 42 dias (P42) e rendimento de peito (RP) de aves F2. F2 MÉDIA MÍNIMO MÁXIMO P42(g) CTCT 1020 350 1625 TCTC 1007 493 1631 RP (%) CTCT 16,23 4,29 33,56 TCTC 16,11 6,10 27,90
Resultados - F2 Médias estimadas para peso aos 42 dias e rendimento de peito (RP) nas populações F2 CT (1693 aves) e TC (2012 aves). SEXO F 2 CT TC P42(g) Macho 1110,6 ± 6,6aA 1114,8 ± 6,1aA Fêmea 967,3 ± 6,9bA 915,1 ± 6,7bB RP (%) Macho 16,24 ± 0,05aA 16,26 ± 0,05aA Fêmea 16,75 ± 0,05bA 16,46 ± 0,05bB Embrapa Suínos e Aves ESALQ/USP Embrapa Gado de Leite Agroceres UNESP Botucatu Embrapa Soja Projeto Brasileiro de Genômica de Aves Purdue University Wageningen University Embrapa Pecuária Sul Roslin Institute UEL US Poultry Genome Project
Resultados de Pesquisa em Mapeamento de QTL GGA 1 (Nones( Nones,, 2004) GGA 2 e 4 (Baron, 2004) GGA 3 e 5 (Ruy, 2004) Delineamento da População P 7 TT x 7 CC (1:1) F 1 7 famílias full-sib TC x TC (1 x 3) 7 x 21 F 2 TCTC 100 filhos/família de mãe = 2063 animais 17 incubações
Características Analisadas Crescimento: Peso inicial, aos 35 e 42 d. GP, CR e CA 35 a 42 d. Viabilidade até 35 e 42 d. Carcaça: Peso da carcaça, partes e órgãos. Composição da carcaça. Qualidade da carne: gordura na carcaça, colesterol, lipídios totais, triglicerídios. Genoma da Galinha - 39 pares de cromossomos (n): total de 78 cromossomos (2n). - 8 macro, 30 micro e os cromossomos sexuais (Cheng, 1997). Ladjali-Mohammedi et al. (1999)
Genotipagem GGA 1 (625 cm): Marcadores: 80 32 GS 12 + 14 = 26 em 649 F2 GGA 2 (464 cm): Marcadores: 34 22 GS 7 + 6 = 11 em 614 F2 GGA 4 (282 cm): Marcadores: 13 11 GS 6 + 2 = 8 em 614 F2
4 4 3,5 3.5 3 LEI 146 ADL 150 LEI 71 LEI 160 LEI 79 Log log (1/P) 2,5 2.5 2 1,5 1.5 1 0,5 0.5 MCW 168 LEI 209 MCW 106 MCW 11 GCT06 ADL 19 ADL 234 MCW 297 LEI 174 MCW 58 LEI 101 MCW 218 LEI 108 LEI 88 MCW 200 LEI 91 LEI 139 LEI 106 LEI 169 MCW 283 LEI 107 MCW 145 ADL 101 ADL 238 ABR328 LEI 134 P=0,10 MCW 107 0 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600 Distância em cm Distância em cm Genotipagem Seletiva no Cromossomo 1 (625 cm) Genótipo + Mapa de Ligação + Fenótipo Análise Estatística
Resultados F 40 35 30 25 20 15 BW42 P42 Heart Coração Drums Coxas and e sobrecoxas Thighs Breast Peito Adj_FC35-41 Adj_CA35-41 Carcass Carcaça 10 5 0 01 50 51 100 101 150 151 200 201 250 251 300 301 350 351 Distância cm Distance (cm) QTLs mapeados no Cromossomo 1 - Nones (2004) QTLs GGA 1 Inéditos: peso da moela, fígado, pulmão, coração e comprimento do intestino. Confirmados: P42, CR, peso da carcaça, GA. Importantes: peso do coração e pulmão ajustados para P42. CA e GA ajustadas para P42.
Resultados F 14.0 12.0 10.0 BW42 P42 Heart Coração Breast Peito Abdominal GA Fat FI CR_35-41 8.0 6.0 4.0 2.0 0.0 Distância (cm) 0 50 100 150 200 250 300 Distance (cm) QTLs mapeados no Cromossomo 2 - Baron (2004) Resultados 11 10 9 F BW42 P42 Breast Peito 8 7 6 5 4 3 2 1 0 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 Distance (cm) QTLs mapeados no Cromossomo 4 - Baron (2004)
QTLs GGA 2 e 4 GGA 2: P35, P41 e P42, peso do peito. GGA 4: PN, peso do peito, peso da moela e % GA. PES ASA COXA 10 9 5% no genoma 8 7 6 Ligação sugestiva 5 4 3 2 1 0 0 50 100 150 200 250 300 Dis tância em c M QTLs mapeados no cromossomo 3 (Ruy, 2004)
6,37% da Vp GORD PGORD 14 12 Valores de F 10 8 6 4 1% no genoma 2 0 0 50 100 150 200 250 300 Distância em cm QTLs mapeados no cromossomo 3 (Ruy, 2004) COR CR 9 8 7 Valores de F 6 5 4 3 2 Ligação sugestiva 1 0 0 50 100 150 200 250 Dis tânc ia e m c M Distância em cm QTLs mapeados no cromossomo 5 (Ruy, 2004)
Equipe Pesquisadores e Professores Mônica Corrêa Ledur Luiz L. Coutinho Alexandre Nepomuceno Amauri Wenseslau Ana Sílvia Moura Carlos Costa Déborah Cléa Ruy Dirceu Luiz Zanotto Eraldo L. Zanella Fátima Jaenisch Gilberto Silber Schmidt Giovani Bertani Helena Javiel Alves Irineu Umberto Packer Jane Eyre Gabriel Kátia Nones Lúcia Elvira Alvares Magda Vieira Benavides Mário Luiz Martinez Massami Shimokomaki Roberto Aguilar Silva Tércio Michelan Filho Doutorandos (as) Érica Elias Baron - (ESALQ) - Bolsa FAPESP Jorge Lara - (UEL) - Bolsa CNPq Clarissa Sanches da Silva - (ESALQ) - Bolsa CAPES Erika Jorge (ESALQ) Bolsa CNPq Luís Fernando Pinto (ESALQ) Bolsa CNPq Millor F. Rosário - (ESALQ) - Bolsa FAPESP Mestrandos (as) Carla Souza - (ESALQ) - Bolsa FAPESP Kerli Ninov - (ESALQ) - Bolsa FAPESP Clarissa Boschiero (UNESP) - Bolsa FAPESP Raquel Campos - (ESALQ) - Bolsa FAPESP Marcel Ambo - (ESALQ) - Bolsa FAPESP Erik Almeida - (ESALQ) - Bolsa CNPq Técnicos Claudete Hara Klein Edison Bomm Joel Boff Levino José Bassi Márcio Gilberto Saatkamp Paulo Baldi Stela Cíntia Perboni