Aula 07-08-2017 Bioinformática aplicada ao estudo de comunidades microbianas Amostragem de solo para análise microbiológica Acacio Aparecido Navarrete
Princípio da amostragem Fazer uma observação através da estimativa da média da população sem amostrar toda a população.
Coleta/Remessa de amostras de solo Para fins de análise microbiológica : A amostragem de solo deve ser feita de forma criteriosa, de modo a representar da melhor maneira possível a área de estudo e adequar-se à hipótese a ser testada; Para a determinação de parâmetros biológicos as amostras de solo devem ser coletadas com instrumental esterilizado ou desinfectado; As amostras podem ser: deformadas, indeformadas, simples (porção coletada em cada ponto do terreno) e compostas (é a mistura homogênea de várias amostras simples). No caso de amostras compostas, evitar a contaminação da amostra e do operador durante a mistura.
Coleta/Remessa de amostras de solo Para fins de análise microbiológica: IdenVficar as amostras cuidadosamente; Após a coleta, as amostras devem ser manvdas sob baixa temperatura, acondicionadas em geladeira, caixas de isopor ou outro ambiente propício. Deve-se levar as amostras para o laboratório preferencialmente dentro de 24 horas ou o mais rápido possível; Os locais de amostragem deverão ser locados, confirmados em campo por meio de GPS e fotografados, retratando as caracterísvcas geográficas locais.
PROCEDIMENTOS 1. Localização - Os pontos de amostragem devem ser estabelecidos de acordo com o obje:vo do estudo. - Deve ser realizado o registro adequado em um mapa ou croqui que permita a obtenção de novas amostras nas mesmas áreas.
PROCEDIMENTOS 1. Localização? AMOSTRAR AQUI
1. Localização Ano de publicação: 2001
Agricultura 1. Localização Pastagem Agrofloresta
ANÁLISE MICROBIOLÓGICA v Compreensão da distribuição espacial e temporal dos organismos no ambiente do solo. v Agravante: Microbiota do solo NÃO é estática. v Programa de amostragem objetivos definidos Avaliação do ambiente
Princípio da amostragem Quanto mais heterogênea a área mais amostras são necessárias para atingir um melhor nível de precisão.
Sensores e Plataformas orbitais LANDSAT SPOT NOAA CBERS ERS RADARSAT TERRA IKONOS
Aerofotogrametria
1. Localização Amazonas rio Javari * * * * * * * * * Benjamin Constant Corpos hídricos Floresta primária Floresta secundária Cultivos agrícolas tradicionais * * Guanabara II - Ticuna Nova Aliança - Cokama * Pastagem Solo exposto
PROCEDIMENTOS 2. Descrição dos sí4os de amostragem - Histórico detalhado como: cobertura vegetal, adubação, calagem, estratégia de manejo, etc., devem ser descritos sempre que possível. 3. Condições de amostragem - As amostras de solo usadas nas análises laboratoriais devem ser preferencialmente ob:das no campo com uma umidade do solo que facilite o peneiramento, conhecido como ponto de friabilidade.
PROCEDIMENTOS 4. Profundidade - A profundidade de amostragem para fins de análises microbiológicas deve ser a 0-10 cm, ou ainda de 0-20 cm dependendo do obje:vo do estudo. 5. Época de amostragem - Em caso de culturas ou vegetação que não apresentem período de floração definido, amostrar em período de pleno desenvolvimento vegeta:vo.
PROCEDIMENTOS 6. Modo de amostragem Pto. A 0 cm 20 cm
PROCEDIMENTOS 6. Outros Utensílios para amostragem
TRIGO MILHO SOJA Amostragem para culturas em linha com uso de furadeira. (Nicolodi et al., 2002)
Figura 2. Trado calador, Trado holantês e Furadeira adaptada para amostragem de solo. Figura 3. Amostragem com trado holandês (diâmetro 5 cm) na cultura da soja, com auxílio de um molde para delimitar os pontos de amostragem. Um furo na linha de plantio e dois de cada lado das entrelinhas.1
Trado calador.
7. Armazenamento PROCEDIMENTOS - As amostras devem ser analisadas o mais rapidamente possível, de preferência sem armazenamento. - Caso contrário, armazenadas em geladeira a 4 C (análises microbiológicas dependentes de cultivo) ou em freezer/ultra-freezer a -20 C/-80 C (análises microbiológicas independentes de cultivo). - O congelamento deve ser evitado em alguns casos (p.e. quando se pretende cultivar microrganismos).
O passo a passo da coleta de solo... 1. Limpeza da superfície do terreno
O passo a passo da coleta de solo... 2. Aprofundamento do tubo coletor
O passo a passo da coleta de solo... 3. Identificação e embalagem das amostras
O passo a passo da coleta de solo... 4. Armazenamento das amostras em campo
Aula 07-08-2017 Bioinformática aplicada ao estudo de comunidades microbianas Obrigado pela atenção! acacionavarrete@gmail.com