Os Avanços e Desafios no Compartilhamento de Dados. Dora Ann Lange Canhos

Transcrição

1 Os Avanços e Desafios no Compartilhamento de Dados Dora Ann Lange Canhos dora@cria.org.br

2 INCT Herbário Virtual da Flora e dos Fungos Demanda do projeto principal atender a demanda da Coordenação e do Comitê Gestor do INCT dar suporte aos herbários na integração dos dados não sensíveis à rede manter e aprimorar o sistema on-line Projeto SisBiota Projeto Reflora

3 Análise dos dados indicadores Serviços Web Requisições externas indicadores data cleaning Relatório data cleaning metadados Herbário Virtual ferramentas imagens mapcria Provedor TAPIR dados mapas network manager imagens Repositório Central Indexador Coleções com provedores TAPIR/DiGIR TAPIR Coleções sem provedores Cache nodes splinker NYBG MNHN Smithsonian JBRJ Mobot

4 Jan/2009

5 10% 10% 80% Não associados < 6 meses 6-12meses > 12 meses 35% 41% 24%

6 Comparação da Lista do Brasil com o Herbário Virtual Nomes em herbários que não estão na Lista do Brasil Nomes na Lista do Brasil que não estão no Herbário Virtual Publicação dos nomes não encontrados para nortear os esforços de digitação ou a realização de novas coletas SisBiota Inconsistências Geográficas Cálculo da precisão da coordenada geográfica Relatório de data cleaning Mais um campo: precisão da coordenada Relatórios de usabilidade de dados para modelagem Índice de usabilidade dos dados para modelagem

7 Modelos de distribuição (nicho ecológico) pontos onde a espécie ocorre variáveis ambientais condições ambientais onde a espécie ocorre mapa de distribuição potencial modelo Temperatura Precipitação Temperatura Precipitação

8 Publicação de Modelos Espécies selecionadas por especialistas Recuperação dos dados do Herbário Virtual (nomes válidos + sinônimos) Passifloraceae registros obtidos da rede specieslink (mais de 30 instituições), sendo (48%) com coordenadas. SisBiota Filtros para dados geográficos Produção dos modelos Validação dos modelos por especialistas Publicação dos modelos Renato De Giovanni <renato@cria.org.br>

9 Procedimento de modelagem Nº de pontos disponíveis Maxent Distância euclideana GARP BS ENFA SVM Mahalanobis 1 algoritmo 2 algoritmos 5 algoritmos Modelo preliminar Modelo exploratório Modelo com uso potencial para tomada de decisão Renato De Giovanni <renato@cria.org.br>

10 Geração dos modelos individuais ENFA GARP BS Maxent SVM Mahalanobis Passiflora luetzelburgii Renato De Giovanni

11 Agregação dos modelos ENFA GARP BS Maxent SVM Mahalanobis Passiflora luetzelburgii Renato De Giovanni

12 Possíveis usos Orientar novas coletas. Fornecer subsídios para novas pesquisas. Melhorar a qualidade dos dados existentes. Priorizar digitação de dados e georreferenciamento. Priorizar espécies em ações de conservação. Valorizar as coleções biológicas. Nota: A qualidade dos dados, tanto dos pontos de ocorrência (identificação da espécie, lat/long), quanto dos dados ambientais, são fundamentais para obter um bom modelo

13 Herbários INCT-HVFF Reflora INCT-HVFF/speciesLink Metadados imagens H.V. Saint-Hilaire(P) webservices

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28 Herbários INCT-HVFF INCT-HVFF/speciesLink Metadados imagens H.V. Saint-Hilaire(P) webservices

29 desenvolvimento CRIA coordenação JBRJ especialistas importação de novas listas controle de usuários interface data cleaning manutenção, correção de bugs correções globais interface estatísticas novas implementações suporte à coordenação logs e controles suporte aos especialistas interface de edição recursos externos backups, backups, backups, backups interface web saída xls planilha saída rtf para impressão mapas de distribuição

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42 Herbário Resultados parciais imagens armazenadas códigos de barra typus registros textuais associados NY P CLF US Subtotal Repatriação SP R UEC BHCB UFG Subtotal Nac TOTAL

43 Obrigada. Dora Ann Lange Canhos