UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL INSTITUTO DE CIÊNCIAS BÁSICAS DA SAÚDE PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MICROBIOLOGIA AGRICOLA E DO AMBIENTE EMENTAS DE DISCIPLINAS DISCIPLINA: Biodegradação de Resíduos CÓDIGO: MAA00073 EMENTA: Estudo de degradação de resíduos agrícolas e industriais pelos microrganismos. Agentes. Síntese microbiana. Aspectos bioquímicos. Técnicas de aproveitamento. Reciclagem. Decomposição de produtos tóxicos e efeito ambiental. Controle de microrganismos patogênicos e produtos poluentes. DISCIPLINA: Bioinformática Aplicada à Microbiologia CÓDIGO: MAA00148 EMENTA: Nesta disciplina serão estudados os algoritmos por trás das ferramentas de bioinformática e o uso das principais ferramentas. Será dada ênfase em dados gerados por plataformas de sequenciamento de nova geração (Next Generation Sequencing) em computadores simples. Além disso, serão descritas as principais ferramentas de análise e suas possíveis aplicações: - Tecnologias de sequenciamento; - Tipos de bibliotecas genômicas e algoritmos de alinhamento de sequências e montagem de genomas; - Predição de genes microbianos e anotação de sequências; - Contextualização sobre ontologia; - Filogenia molecular; - Metagenômica; - Análise de Expressão gênica. DISCIPLINA: Biologia Celular CÓDIGO: MAA00175 NÚMERO DE CRÉDITOS: 2 CARGA HORÁRIA TOTAL: 30H EMENTA: Organização funcional das células animais: Estruturas da membrana plasmática; endocitose e exocitose. Compartimentos intracelulares e organelas. Citoesqueleto e movimento celular. DISCIPLINA: Bioquímica de Microrganismos CÓDIGO: MAA00121 EMENTA: Estudo do comportamento bioquímico dos microrganismos; estudo da estrutura e composição e sua relação com as atividades metabólicas desenvolvidas. Estudo e aplicação dos diversos aspectos de crescimentos resultantes das reações bioquímicas. 1
DISCIPLINA: Componentes Tóxicos de Origem Microbiana CÓDIGO: MAA00137 EMENTA: Fundamentos da toxicologia. Conceitos e classificação das intoxicações. Ensaios toxicológicos. Intoxicações através de microrganismos. Componentes tóxicos em alimentos. Monitorização biológica e ambiental dos agentes tóxicos. Princípios e aplicações da ecotoxicologia. DISCIPLINA: Dípteros Transmissores de Microrganismos CÓDIGO: MAA00136 EMENTA: Estudo dos diferentes ambientes utilizados por dípteros e as formas de transmissão de microrganismos. Identificação dos principais agentes infecciosos transmitidos por dípteros. Susceptibilidade e resistência de dípteros a inseticidas. Métodos de controle de dípteros de interesse em saúde. DISCIPLINA: Ecologia Microbiana CÓDIGO: MAA0072 EMENTA: Desenvolvimento e importância da ecologia microbiana. Avaliações da microbiota: número, biomassa e atividade. Parâmetros e análises estatísticas em ecologia microbiana. Caracterização e efeito de fatores ambientais. O habitat como determinante da população microbiana. Estrutura e desenvolvimento de comunidades e ecossistemas microbianos. Interações envolvendo microrganismos, plantas e animais. Aspectos ecológicos da biodegradação. Os microrganismos e a produção de biomassa e energia. Controle ecológico de populações de pragas e de microrganismos patogênicos. DISCIPLINA: Estágio Docente I CÓDIGO: MAA00124 EMENTA: Familiarizar e treinar o aluno para a prática docente. Aperfeiçoar a capacidade didática. DISCIPLINA: Estatística e Planejamento Experimental CÓDIGO: MAA00139 EMENTA: A estatística aplicada a experimentos. Comparação entre diferentes tratamentos. Introdução ao planejamento experimental. Teste F e Análise de Variância. Planejamento fatorial completo. Planejamento fatorial fracionário e em blocos. Metodologia de superfícies de resposta. Planejamento de misturas. Análise de componentes principais. DISCIPLINA: Fisiologia de Microrganismos CÓDIGO: MAA0036 EMENTA: Estudo do crescimento microbiano, regulação do crescimento. Nutrição. Metabolismo dos carboidratos e produção de energia. Metabolismo e 2
biossíntese de lipídeos, esteróis e compostos aromáticos. Metabolismo do nitrogênio. Biossíntese dos aminoácidos. Metabolismo das purinas e pirimidinas. DISCIPLINA: Genética de Fungos CÓDIGO: MAA00126 EMENTA: Noções básicas de Micologia. Estudo de mutação e recombinação genética em fungos. Alterações na ploidia e estrutura dos cromossomos. Herança extracromossômica. Principais mecanismos de controle genético do metabolismo, do crescimento vegetativo e de reprodução sexuada de fungos. DISCIPLINA: Genética de Procariotos CÓDIGO: MAA0068 EMENTA: A disciplina aborda a organização da célula procariótica, código genético, expressão gênica dos microrganismos procariotos, reparo e recombinação de DNA, transposons, plasmídeos, transferência gênica. DISCIPLINA: Interações Microrganismo - Hospedeiro CÓDIGO: MAA00133 EMENTA: Interações microrganismos - hospedeiros (bactérias, fungos, vírus X animais). Mecanismos de adesão, invasão e fuga de mecanismos de defesa. Microbiota, comunicação bacteriana e formação de biofilme. Aplicações benéficas do conhecimento das interações. DISCIPLINA: Interações Mutualísticas entre Plantas e Microrganismos CÓDIGO: MAA00132 EMENTA: A diversidade microbiana associada aos vegetais: uma visão geral. Definição e tipos de associações mutualisticas entre plantas e microrganismos. Isolamento, purificação, identificação e taxonomia dos principais microrganismos que vivem em associação com plantas. Sinalização celular: comunicação bioquímica entre plantas e microrganismos simbiontes. Microrganismos epifíticos: microbiologia da rizosfera e rizoplano. Associações planta-microrganismos relacionadas com a nutrição nitrogenada da planta: organismos endofíticos, simbioses com Frankia, cianobactérias e rizóbios. Fatores limitantes, mecanismo da fixação, inoculação, aspectos genéticos da simbiose e benefícios. Princípios e tecnologias para produção de inoculantes e para inoculação em plantas. Associações planta-microrganismos relacionadas com a nutrição de fósforo da planta: micorrízicas: estrutura, tipos e benefícios; microrganismos solubilizadores de fosfatos minerais. Interações com microrganismos promotores de crescimento vegetal: produção de fitohormônios; supressão de patógenos de raiz. Papel dos microrganismos em associação com plantas na fitorremediação e rizorremediação. DISCIPLINA: Laboratório de Genética Molecular de Procariotos CÓDIGO: MAA00112 3
EMENTA: Princípios teóricos e práticos da tecnologia de DNA recombinante. Biologia de plasmídeos. Regulação da expressão gênica em procariotos. DISCIPLINA: Marcadores Moleculares no Estudo de Microrganismos CÓDIGO: MAA00120 EMENTA: Princípios teóricos e práticos dos marcadores moleculares mais utilizados no estudo da variabilidade genética (isoenzimas, RFLP, VNTR, PCR, DGGE e DGTE), bem como suas aplicações práticas no estudo da variabilidade genética de populações de microrganismos. DISCIPLINA: Metodologia Científica CÓDIGO: MAA00171 EMENTA: Ciência e ética em Ciência. Métodos científicos. Tipos de trabalhos científicos. Projeto de pesquisa científica. Leitura científica crítica. Fraudes científicas. DISCIPLINA: Métodos Imunodiagnósticos Aplicados a Microrganismos CÓDIGO: MAA00117 EMENTA: Revisão dos conceitos básicos de imunologia. Métodos imunológicos para a detecção de microrganismos. Fundamentos e aplicações dos imunotestes nas áreas agrícola e ambiental. Técnicas de imunização de animais para a obtenção de anticorpos. DISCIPLINA: Microbiologia de Alimentos CÓDIGO: MAA00001 EMENTA: A disciplina estuda os principais microrganismos encontrados em alimentos e os princípios e métodos para estudo da relação microrganismos-matéria prima alimentos. DISCIPLINA: Microbiologia Geral CÓDIGO: MAA00043 EMENTA: Classificação dos microrganismos. Estrutura de bactérias, vírus e fungos. Crescimento de bactérias e fungos. Replicação de vírus. Controle do crescimento microbiano. Antimicrobianos. Segurança no laboratório. Métodos em microbiologia prática. Diversidade bacteriana. DISCIPLINA: Microbiologia Industrial CÓDIGO: MAA00114 EMENTA: Estudo dos microrganismos produtores de matérias primas e insumos, por via fermentativa e biossintética, com aplicação industrial. A disciplina estuda as classes mais representativas e importantes de bactérias, leveduras, fungos filamentosos, actinomicetos e algas, com vistas a sua utilização como agentes microbianos em processos fermentativos e biossintéticos, transformações microbianas e aproveitamento de substratos, produtos e resíduos industriais. 4
DISCIPLINA: Microbiomas CÓDIGO: MAA00174 NÚMERO DE CRÉDITOS: 2 CARGA HORÁRIA TOTAL: 30h EMENTA: Microbioma; Biodiversidade e biogeografia microbiana; Bacterioma, micoma, viroma, etc.; Microbiomas ambientais; Microbiomas de plantas; Microbiomas de animais; Microbiomas humanos; Disbiose; Fatores bióticos e abióticos que afetam os microbiomas; Mecanismos de diversificação e evolução dos microbiomas; Métodos de avaliação dos microbiomas; Ferramentas de análise de microbiomas. DISCIPLINA: Pesquisa Orientada Microbiologia Agrícola e do Ambiente CÓDIGO: MAA00059 NÚMERO DE CRÉDITOS: 0 CARGA HORÁRIA TOTAL: 0 EMENTA: Trabalho de Conclusão de Curso. DISCIPLINA: Planejamento Racional de Antimicrobianos CÓDIGO: MAA00173 NÚMERO DE CRÉDITOS: 2 CARGA HORÁRIA TOTAL: 30h EMENTA: Estudos das bases racionais para o planejamento de substâncias antimicrobianas, abrangendo o planejamento e escolha do composto hit, as estratégias de otimização hit-to-lead e o estudo de propriedades físicoquímicas ideais para atingir os sítios de ligação. DISCIPLINA: Processos Bioquímicos de Microrganismos Industriais CÓDIGO: MAA00129 EMENTA: Estudo do metabolismo secundário, sua regulação e a produção de metabólitos originados de microrganismos, com relevante aplicação industrial. Estudo de produtos complexos, biossínteses de metabólitos secundários. Fatores e parâmetros que influenciam a produção e regulação dos principais grupos de metabólitos secundários. Estudo de recuperação dos metabólitos produzidos. DISCIPLINA: Processos Fermentativos CÓDIGO: MAA00035 EMENTA: Desenvolvimento da tecnologia de bioprocessos. Processos de cultivo de microrganismos. Metabolismo, cinética, modelos matemáticos. Equipamentos, projeto, operações e controles. Substratos industriais. Preparo de meios. Esterilização industrial. Escalonamento de equipamento e processos. Isolamento de microrganismos com interesse industrial. Uso de microrganismos engenheirados em tecnologia de bioprocesso. Recuperação de produtos. Aplicações. DISCIPLINA: Processos Microbiológicos de Biocatálise CÓDIGO: MAA00130 EMENTA: Estudo dos microrganismos realizadores de transformações catalíticas de compostos e moléculas importantes em biossínteses de matérias-primas e produtos com aplicação industrial. Estudo das rotas metabólicas primárias e secundárias das classes de microrganismos mais representativos. Estudos de 5
produção em biorreatores nas escalas de bancada e piloto, buscando otimizar os parâmetros de precursores metabólicos, nutrientes, ph, aeração, agitação e temperatura. Estudos de separação, concentração e purificação dos metabólitos mais representativos. Análise físico-química dos compostos obtidos. DISCIPLINA: Protozoologia Ambiental CÓDIGO: MAA00134 EMENTA: Sistemática, morfologia, biologia, epidemiologia, técnicas de diagnóstico, biossegurança e controle de protozoários de interesse encontrados no ambiente natural (água, solos e efluentes). Avaliação de riscos ambientais na transmissão de protozoonoses. DISCIPLINA: Purificação de Produtos de Origem Microbiana CÓDIGO: MAA00122 EMENTA: Estudo dos fundamentos dos métodos de separação de partículas em mostos dos biorreatores; estudo das propriedades e características das células microbianas em relação à separação; propriedades e características dos produtos de origem biossintética; escolha de equipamentos de separação, concentração e purificação. DISCIPLINA: Redação Científica CÓDIGO: MAA00172 NÚMERO DE CRÉDITOS: 3 CARGA HORÁRIA TOTAL: 45h EMENTA: Divulgação científica. Tipos de trabalhos científicos escritos. Linguagem científica. Redação de projeto, dissertação / tese e artigo. Elaboração de artigo científico. Escolha de revista para submissão de artigo. Instruções para autores. Carta de submissão. Função do editor-chefe, editor-assistente e revisor (reviewer). Processo de avaliação por revisores. Resposta aos revisores. Correção da prova (proof). DISCIPLINA: Seminário I CÓDIGO: MAA0060 EMENTA: Apresentação e defesa dos projetos de pesquisa, resultados parciais de pesquisa. Apresentação e discussão de artigos científicos. DISCIPLINA: Seminário II CÓDIGO: MAA00131 EMENTA: Apresentação e defesa dos projetos de pesquisa, resultados parciais de pesquisa. Apresentação e discussão de artigos científicos. DISCIPLINA: Seminário III CÓDIGO: MAA00149 EMENTA: Apresentação e defesa dos projetos de pesquisa, resultados parciais de pesquisa. Apresentação e discussão de artigos científicos. 6
DISCIPLINA: Seminário IV CÓDIGO: MAA00150 EMENTA: Apresentação e defesa dos projetos de pesquisa, resultados parciais de pesquisa. Apresentação e discussão de artigos científicos. DISCIPLINA: TÓPICOS AVANÇADOS (PORTAL DE PERIODICOS CAPES) CÓDIGO: MAA00146 EMENTA: Treinamento PROJETO PRÓ-MULTIPLICAR CAPES abrangendo portal de periódicos e bases bibliográficas. DISCIPLINA: TÓPICOS AVANÇADOS II CÓDIGO: MAA00147 EMENTA: Treinamento PRÓ-MULTIPLICAR CAPES abrangendo o portal e bases bibliográficas. DISCIPLINA: TÓPICOS ESPECIAIS EM MICROBIOLOGIA E DO AMBIENTE CÓDIGO: MAA00119 EMENTA: Apresentação e discussão de matérias importantes e específicas, relacionadas à Microbiologia Agrícola e do Ambiente, não abrangidas pelas disciplinas regulares do Curso. Os conteúdos programáticos, teóricos e práticos serão propostos pelos respectivos ministrantes. Após a devida análise e aprovação pela Comissão do Curso, a disciplina terá sua divulgação autorizada para inscrições dos interessados no semestre anterior à sua ministração. DISCIPLINA: Virologia CÓDIGO: MAA00135 EMENTA: Histórico da virologia, propriedades e multiplicação dos vírus, interações entre vírus e células, bem como aplicações práticas da interação entre meio ambiente, vírus e hospedeiros. DISCIPLINA: ATIVIDADES COMPLEMENTARES I CÓDIGO: MAA00151 DISCIPLINA: ATIVIDADES COMPLEMENTARES II CÓDIGO: MAA00152 7
DISCIPLINA: ATIVIDADES COMPLEMENTARES III CÓDIGO: MAA00153 DISCIPLINA: ATIVIDADES COMPLEMENTARES IV CÓDIGO: MAA00154 DISCIPLINA: ATIVIDADES COMPLEMENTARES V CÓDIGO: MAA00155 DISCIPLINA: ATIVIDADES COMPLEMENTARES VI CÓDIGO: MAA00156 TÓPICOS ESPECIAIS: ORGANIZAÇÃO DO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA APLICADA I CÓDIGO: MAA00157 NÚMERO DE CRÉDITOS: 2 CARGA HORÁRIA TOTAL: 30h EMENTA: Participação na Comissão Organizadora do Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada. TÓPICOS ESPECIAIS: ORGANIZAÇÃO DO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA APLICADA II CÓDIGO: MAA00158 NÚMERO DE CRÉDITOS: 2 CARGA HORÁRIA TOTAL: 30h EMENTA: Participação na Comissão Organizadora do Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada. TÓPICOS ESPECIAIS: APRESENTAÇÃO DE TRABALHO NO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA APLICADA CÓDIGO: MAA00159 EMENTA: Apresentação de trabalho no Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada. TÓPICOS ESPECIAIS: APRESENTAÇÃO DE TRABALHO NO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA APLICADA CÓDIGO: MAA00160 8
EMENTA: Apresentação de trabalho no Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada. TÓPICOS ESPECIAIS: APRESENTAÇÃO DE TRABALHO NO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA APLICADA CÓDIGO: MAA00161 EMENTA: Apresentação de trabalho no Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada. TÓPICOS ESPECIAIS: APRESENTAÇÃO DE TRABALHO NO SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA APLICADA CÓDIGO: MAA00162 EMENTA: Apresentação de trabalho no Simpósio Brasileiro de Microbiologia Aplicada. SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS I CÓDIGO: MAA00163 SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS II CÓDIGO: MAA00164 SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS III CÓDIGO: MAA00165 SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS IV CÓDIGO: MAA00166 SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS V CÓDIGO: MAA00167 SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS VI CÓDIGO: MAA00168 SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS VII CÓDIGO: MAA00169 9
SEMINÁRIOS: SEMINÁRIOS DIVERSOS VIII CÓDIGO: MAA00170 10