Universidade de São Paulo Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Diversidade genética em germoplasma de arroz japonês utilizando marcadores moleculares e agromorfológicos Fátima Bosetti Tese apresentada para obtenção do título de Doutor em Ciências. Área de concentração: Genética e Melhoramento de Plantas Piracicaba 2012
Fátima Bosetti Engenheira Agrônoma Diversidade genética em germoplasma de arroz japonês utilizando marcadores moleculares e agromorfológicos Orientador: Prof. Dr. JOSÉ BALDIN PINHEIRO Tese apresentada para obtenção do título de Doutor em Ciências. Área de concentração: Genética e Melhoramento de Plantas Piracicaba 2012
Dados Internacionais de Catalogação na Publicação DIVISÃO DE BIBLIOTECA - ESALQ/USP Bosetti, Fátima Diversidade genética em germoplasma de arroz japonês utilizando marcadores moleculares e agromorfológicos / Fátima Bosetti.- - Piracicaba, 2012. 183 p: il. Tese (Doutorado) - - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, 2012. 1. Arroz 2. Diversidade genética 3. Germinação 4. Germoplasma vegetal 5. Marcador molecular I. Título CDD 633.18 B743d Permitida a cópia total ou parcial deste documento, desde que citada a fonte O autor
3 Aos meus pais, Hermes e Beatris, por tudo o que fizeram pela minha formação, pelo amor incondicional, apoio e incentivo. Ao meu irmão, Ezequiel, pelo ombro amigo de sempre. DEDICO.
4
5 AGRADECIMENTOS À Deus pela benção da vida, por cada dia e cada experiência. Ao Prof. Dr. José Baldin Pinheiro pela acolhida e orientação, e mais do que isso, pela paciência, amizade, abertura e exemplo profissional. À Profª. Drª. Maria Imaculada Zucchi pelas contribuições, incentivo, amizade e disponibilidade em ajudar sempre. À Profª. Drª. Ana Dionísia Novembre e à Helena Pescarin Chamma pela disponibilização da estrutura do Laboratório de Sementes e auxílio nos experimentos de caracterização de tolerância ao frio. Aos professores, colegas e funcionários do departamento de Genética, em especial ao Márcio Araújo Silva, Domingos de Salvio Amaral e Cláudio Roberto Segatelli pela ajuda nos experimentos de campo e sempre que necessário. Ao Dr. Alisson Fernando Chiorato e à Dr. Aluana Gonçalves de Abreu pelo auxílio e discussões de análise de dados. A cada um dos colegas do Laboratório de Diversidade Genética e Melhoramento pela convivência nesses cinco anos, amizade, troca de ideias, ajudas, momentos de descontração, por tudo. À Camila Montebelli pelas constantes ajudas na implantação e avaliação dos experimentos, estendendo o agradecimento para Thiago, Glauber, Carlos, Michelle, Milene, Carlos Eduardo, Talita, Jake, Natália, Keila e Mariza, e a cada um que, mesmo não citado aqui, auxiliou em algum momento. Muito Obrigada! À Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz e ao Departamento de Genética pelo ensino de qualidade. Ao CNPq e à Capes pelos períodos de bolsa de estudos concedida. À FAPESP pelo financiamento deste trabalho (processo n 2007/06615-6). À Embrapa Arroz e Feijão pelo fornecimento de sementes dos genótipos utilizados como padrões nas análises de diversidade molecular. À Pioneer Hi-Bred International Inc. pelo auxílio financeiro e à Dr.ª Sandra Cristina Kothe Milach, ao Dr. Charlie Messina e Dr. Zhanshan Dong pelo incentivo e exemplo de dedicação à pesquisa. Aos meus pais, Hermes e Beatris, por acreditarem e sem medir esforços me apoiarem em cada passo. Ao meu irmão, Ezequiel, pelas conversas e discussões. À todos os familiares e amigos pelas palavras de incentivo e carinho. À todos que colaboraram para a realização desse trabalho. Muito Obrigada!
6
7 SUMÁRIO RESUMO... 11 ABSTRACT... 13 LISTA DE FIGURAS... 15 LISTA DE TABELAS... 19 1 INTRODUÇÃO... 23 Referências... 26 2 DIVERSIDADE FENOTÍPICA EM GERMOPLASMA DE ARROZ JAPONÊS... 31 Resumo... 31 Abstract... 31 2.1 Introdução... 32 2.2 Material e Métodos... 35 2.2.1 Instalação e condução dos experimentos... 35 2.2.2 Caracterização e avaliação dos acessos... 36 2.2.2.1 Descritores utilizados no ano agrícola 2007/2008... 36 2.2.2.2 Descritores utilizados no ano agrícola 2008/2009... 38 2.2.3 Análise de dados... 39 2.2.3.1 Estatísticas descritivas, análise univariada e estimativa de parâmetros... 39 2.2.3.2 Análises multivariadas... 40 2.3 Resultados... 43 2.3.1 Características avaliadas no ano agrícola 2007/2008... 43 2.3.2 Características avaliadas no ano agrícola 2008/2009... 58 2.3.3 Análises considerando os dois anos de avaliação... 60 2.4 Discussão... 63 Referências... 70 3 DIVERSIDADE GENÉTICA MOLECULAR EM GERMOPLASMA DE ARROZ JAPONÊS UTILIZANDO MARCADORES MOLECULARES ANÔNIMOS E EXPRESSOS (SSRs E EST-SSRs)... 75 Resumo... 75 Abstract... 75 3.1 Introdução... 76 3.2 Material e Métodos... 78
8 3.2.1 Material vegetal... 78 3.2.2 Extração de DNA e Genotipagem com marcadores SSR... 79 3.2.3 Análise de dados... 81 3.3 Resultados... 82 3.3.1 Diversidade detectada pelos marcadores SSRs... 82 3.3.2 Análises de agrupamento e estrutura populacional... 88 3.4 Discussão... 99 Referências... 105 4 VARIABILIDADE PARA TOLERÂNCIA AO FRIO NA GERMINAÇÃO EM GERMOPLASMA DE ARROZ DE ORIGEM JAPONESA... 111 Resumo... 111 Abstract... 111 4.1 Introdução... 112 4.2 Material e Métodos... 115 4.2.1 Material Vegetal... 115 4.2.2 Avaliação da tolerância ao frio... 115 4.2.3 Análise de dados... 119 4.3 Resultados... 121 4.3.1 Experimento I: Germinação a 13ºC e 28ºC... 121 4.3.2 Experimento II: Germinação em grandiente de temperaturas... 130 4.3.3 Experimento III: Tolerância ao frio na fase de germinação-emergência e desenvolvimento inicial... 138 4.4 Discussão... 140 Referências... 146 5 OBTENÇÃO DE UMA COLEÇÃO NUCLEAR DE ACESSOS JAPONESES DE ARROZ... 151 5.1 Introdução... 152 5.2 Material e Métodos... 155 5.2.1 Dados fenotípicos e moleculares usados na obtenção da coleção nuclear... 155 5.2.2 Obtenção e representatividade da coleção nuclear... 155 5.3 Resultados... 158 5.3.1 Coleção nuclear... 158 5.3.2 Comparação de propriedades fenotípicas... 159 5.3.3 Comparação de propriedades moleculares... 165
Gracias por visitar este Libro Electrónico Puedes leer la versión completa de este libro electrónico en diferentes formatos: HTML(Gratis / Disponible a todos los usuarios) PDF / TXT(Disponible a miembros V.I.P. Los miembros con una membresía básica pueden acceder hasta 5 libros electrónicos en formato PDF/TXT durante el mes.) Epub y Mobipocket (Exclusivos para miembros V.I.P.) Para descargar este libro completo, tan solo seleccione el formato deseado, abajo: