Fundamentos do R. Prof. Cícero Quarto cicerocq.com

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Clara Quintanilha de Paiva
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outras fontes digitais e/ou impressas). Ao final dos slides, traz-se as referências.

2 Prof. Cícero Quarto Os slides são construídos baseados em achados sobre o R (tutoriais da internet e outras fontes digitais e/ou impressas). Ao final dos slides, traz-se as referências. Bons estudos!!! Fonte das imagens. O autor. Google imagens O que sabemos é uma gota, o que não sabemos é um oceano (Sir Isaac Newton) 2

3 Conteúdos de aprendizagem Introdução O programa Como instalar o R Características do R A interface do R Pacotes do R Instalando pacotes no R Carregando pacotes do R Como obter ajuda no R Comandos importantes do R 3

4 Introdução O R é um software livre para computação estatística e construção de gráficos. Permite o uso de pacotes estatísticos para a análise, manipulação e interpretação de dados, com testes paramétricos e não-paramétricos, modelagem linear e não linear, análise de séries temporais, análise de sobrevivência, simulação e estatística espacial, além de apresentar facilidade na elaboração de diversos tipos de gráficos, no qual o usuário tem pleno controle sobre o gráfico criado; O R pode ser obtido gratuitamente em onde é apresentado em versões de acordo com o SO UNIX, Windows ou Macintosh. 4

5 O programa O R é uma linguagem orientada a objetos criada em 1996 por Ross Ihaka e Robert Gentleman que aliada a um ambiente integrado permite a manipulação de dados, realização de cálculos e geração de gráficos; É importante salientar que o R não é um programa estatístico, mas que devido a suas rotinas, permite a manipulação, avaliação e interpretação de procedimentos estatísticos aplicados a dados, permitindo assim a execução de tarefas em estatística; Além dos procedimentos estatísticos, o R permite operações matemáticas simples, e manipulação de vetores e matrizes, assim como confecção de diversos tipos de gráficos. 5

6 +Algumas razões para aprender o R Linguagem de código-fonte aberto Tem uma vasta comunidade de usuários Suporta extensões Extremamente abrangente Linguagem estatística avançada 6

7 Como instalar o R Para instalar o R basta acessar o site em CRAN (Comprehensive R Archive Network) escolher a versão para o seu SO instalado em seu computador, e depois no link base, em seguida escolha o arquivo executável; Para atualizar os pacotes do programa, basta clicar no menu Tools e depois opção Check for Package Updates... 7

8 Características do R O R possui uma GUI (do inglês Graphical User Interface Interface Gráfica do Usuário) com poucas opções de cliques; As análises feitas no R são digitadas diretamente na linha de comandos. Nesta linha de comandos, digita-se os comandos e funções que deseja-se usar; No R o sinal # (quadrado, jogo da velha) é usado para inserir comentários, ou seja, o R não lê o que vem após o #; No R o sinal > (sinal de maior) indica o prompt (conhecido também como R Console) e quer dizer que o R está pronto para receber comandos; Em alguns casos um sinal de + aparecerá no lugar do prompt padrão, isso indica que ficou faltando algo na linha de comandos anterior (isso ocorre quando houver um erro, ou quando a finalização do comando só ocorrerá nas próximas linhas. Se tiver errado pressione Esc para retornar ao prompt normal > e sumir com o sinal de +; Após digitar os comandos tecle Enter para que eles sejam executados; O R é case-sensitive, ou seja, ele diferencia maiúsculas de minúsculas, portanto A é diferente de a. O separador de casas decimais é ponto.. A vírgula é usada para separar argumentos (informações). Não é recomendável o uso de acentos em palavras, pois acentos são usados em programação e podem causar erros. 8

9 A interface do R (ou Workspace (área de trabalho)) Versão do R Barra de menus Informações básicas do programa Clicando neste botão, entra-se no terminal do SO Prompt de comandos 9

10 Pacotes do R Pacotes (em inglês Packages) em R são bibliotecas contendo funções e dados, que são importantes para alguma finalidade específica; Ao instalarmos o R apenas as configurações mínimas para o seu funcionamento básico são instaladas (pacotes que vem na instalação base ). Para realizar tarefas mais complicadas pode ser necessário instalar pacotes adicionais (packages); Um pacote bastante utilizado em ecologia é o vegan (vegetation analysis). 10

11 Instalando pacotes no R Para instalar um pacote vá ao site do R ( e clique em CRAN, escolha o espelho e clique em packages, uma lista com uma grande quantidade de pacotes está disponível; Por exemplo: clique no pacote que deseja e depois clique em windows binary e salve o arquivo. Abra o R e clique em Packages, depois em Install Package(s) from local zip files e selecione o arquivo do pacote que você baixou. Atividade: Baixe e instale o pacote vegan 11

12 Instalando pacotes no R cont... O R também pode conectar-se diretamente à internet. Desta forma é possível instalar e atualizar pacotes sem que seja necessário acessar a página do R. Para instalar o pacote vegan direto do R, digite na linha de comandos do R a linha abaixo: > install.packages( vegan ) # é necessário internet 12

13 Carregando pacotes do R Para usar um pacote do R, por exemplo o pacote vegan, use a função library(nome_do_pacote) ou require(nome_do_pacote) para rodá-lo. Exemplo, digite library(vegan) ou require(vegan) na linha de comandos do R para carregar o pacote vegan 13

14 Como carregar um pacote do R Os pacotes do R podem ser carregados na memória a qualquer instante através da linha de comando digitando library(nome_do_pacote). Para saber quais são os pacotes carregados basta digitar na linha de comandos search( ). A Figura abaixo ilustra esse contexto. comando pacote vegan 14

15 Como obter ajuda no R A ajuda em linha do R é útil quando se deseja saber qual função utilizar ou como uma determinada função. Na tabela abaixo são listados alguns comandos para realizar buscas no R. Ação de ajuda Ajuda sobre um comando x Comando help(comandox) Ajuda no browser instalado help.start( ) Ajuda sobre (p.ex.) o pacote vegan Ajuda para procurar objetos (p.ex.) pelo nome aves Listas as funções e operações contidas no pacote base do R help(package=vegan) apropos( aves ) ls( package:base ) Observação: Uma outra opção para obter ajuda sobre os recursos do R é acessar a página 15

16 Comandos importantes do R Comando Ação q( ) Sai do programa R save.image( ) Salva o trabalho realizado ls( ) Lista todos os objetos da área de trabalho atual rm(x) Remove o objeto x rm(x,y) Remove os objetos x e y library( ) Mostra todos os pacotes instalados require(nlme) Carrega (p.exe.) o pacote nlme citation( ) Cita o R citation( vegan ) Cita o pacote vegan ctrl+l Limpa a tela do R 16

17 Referências LANDEIRO, V. L. Introdução ao uso do programa R. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Programa de Pós-Graduação em Ecologia, SOUZA, E. F. M.; PETERNELLI, L. A. and MELLO, M. P. Software Livre R: aplicação estatística, Internet R(linguagem de programação)/pacotes - URL 17

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