Integração de Sistemas de Informação

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1 microsicol micro ICole SIColNet Integração de Sistemas de Informação Sidnei de Souza De Coleções de Culturas a Centros de Recursos Biológicos: implantação e consolidação da rede CRB-Br Petrópolis, Setembro 2013

2 Agenda microsicol status online catalogues SIColNet

3 O que é o microsicol? microsicol é um sistema de gerenciamento de coleções microbiológicas desenvolvido pelocentro de Referência eminformação Ambiental, CRIA desde2005com o apoiodo MinistériodaCiência, Tecnologiae Inovação. Seuobjetivoé darsuportea boas práticasde gerenciamentoe documentaçãode processsos e produtos assegurando a rastreabilidade e facilitando o acesso livre e aberto a dados através da internet (specieslink, SIColNet, catálogos).

4 microsicol coleções de cultura 20 coleções 23 sub-coleções CBAM Coleção de Bactérias da Amazônia Fiocruz Manaus CBAS Coleção de Bactérias do Ambiente e Saúde Fiocruz Rio - CBMA Coleção de Bactérias da Mata Atlântica Fiocruz Rio - CVAS Coleção de Vibrio do Ambiente e Saúde Fiocruz Rio - CBAA Coleção de Bactérias da Amazônia Azul Fiocruz Rio - CBIS Coleção de Bactérias de Impacto na Saúde Fiocruz Rio CBMAI Coleção de Culturas de Microrganismos de Ambiente e Indústria Unicamp - Paulínia CCAMP Coleção de Campylobacter Fiocruz Rio CCFF Coleção de Culturas de Fungos Filamentosos Fiocruz Rio CCGB Coleção de Culturas do Gênero Bacillus e Gêneros correlatos Fiocruz Rio CENT Coleção de Enterobactérias Fiocruz Rio CFAM Coleção de Fungos da Amazônia Fiocruz Manaus CFP Coleção de Fungos Patogênicos Fiocruz Rio CLEP Coleção de Leptospira Fiocruz Rio CLIOC Coleção de Leishmania Fiocruz Rio CLIST Coleção de Listeria Fiocruz Rio CMRVS Coleção de Micro-organismos de Referência em Vigilância Sanitária Fiocruz Rio CMT Coleção Micológica de Trichocomaceae Fiocruz Rio COLPROT Coleção de Protozoários Fiocruz Rio COLTRYP Coleção de Trypanosoma de Mamíferos Silvestres, Domésticos e Vetores Fiocruz Rio CRM Central de Recursos Microbianos da Unesp Unesp Rio Claro CYP Coleção de Yersinia pestis Fiocruz Recife IBSBF Coleção de Culturas de Fitobactérias do Instituto Biológico IB Campinas URM Micoteca URM UFPE Recife

5 microsicol principais características Baseadonasrecomendaçõesdo CABRI*e customizávelparaatendera necessidadese demandas específicas das coleções. Baseado em tecnologia web e compatível com diferentes plataformas. Permitetantocamposde textolivrequantovocabuláriocontrolado. Permite referências internas a documentos, bibliografia e nomes científicos previamente registrados. Multi-língua tanto para navegação quanto conteúdo. Provê um sistema robusto de segurança de acesso à informação registrada em diferentes níveis (usuários, grupos e registros). * Common Access to Biological Resources and Information, CABRI

6 microsicol componentes Documentação do acervo (arquéias, bactérias, fungos filamentosos, leveduras e protozoários) Linhagens(geral, coleta, isolamento, identificação, depósito, cultivo, características, propriedades, estoque) Taxa(configurável) Instituições Pessoas Documentos(imagens, meios, sequências) Referências Bibliográficas Documentação de processos Preservação Distribuição Controle de Qualidade Controle de Estoque(alerta de estoque mín.) Catálogos para acesso externo Integração com SIColNet e specieslink(darwincore2 + extensão microbial)

7

8 microsicol funcionalidades Mapasde Estoque O estoque da coleção é controlado como resultado dos processos de preservação, controle de qualidade e distribuição.

9 microsicol funcionalidades Movimentação de Estoque

10 microsicol funcionalidades Relatóriosde Rastreabilidade Relatórios detalhados de rastreabilidade estão disponíveis para o curador.

11 microsicol funcionalidades Relatórios Tabelas

12 microsicol funcionalidades Relatórios Customizados

13 microsicol funcionalidades Relatórios Gráficos

14 microsicol funcionalidades Contêineres Configuração

15 Agenda microsicol status online catalogues SIColNet

16 web sites coleções Fiocruz ccff.fiocruz.br clioc.fiocruz.br ccgb.fiocruz.br cbma.fiocruz.br cfp.fiocruz.br cfam.fiocruz.br coltryp.fiocruz.br cmt.fiocruz.br

17

18

19 microsicol catálogos integrados aos web sites microsicol CLIOC website Catálogo daclioc disponível

20 agenda microsicol status online catalogues SIColNet

21 SIColNet página inicial

22 SIColNet coleções participantes

23 SIColNet resumo geraldo conteúdo

24 SIColNet resumo geraldo conteúdo

25 SIColNet formuláriode busca

26 SIColNet resultado dabusca: registros e inventários

27 SIColNet detalhesdo do registros e inventários

28 SIColNet mais informação sobreo nome

29 SIColNet mais informação sobreo nome

30 SIColNet resultado da busca em gráficos

31 SIColNet resultado da busca em gráficos

32 SIColNet resultado da busca em mapas

33 SIColNet resultado da busca em mapas

34 SIColNet resumo da busca em mapas

35 SIColNet resumo da busca em números e gráficos

36 SIColNet resumo da busca em números e gráficos

37 the pieces put together CBAM microsicol CFAM CBMAI microsicol Unicamp - SP Fiocruz-AM CENT CCBH CLIST CCAMP CCBS ColTryp CBMA μsicol CMT CFP INCQS CCFF CCGB CLIOC Embrapa Infomicro TAPIRLink specieslink (DarwinCore2) Fiocruz -RJ splinker SIColNet (DarwinCore2 + microbial) global catalogue distribution maps indicators reports datacleaning reports

38 SIColNet search result maps

39 SIColNet outros serviços Informações sobre a coleção Relatórios de data cleaning Análise dos dados, indicadores, sugestões para georreferenciamento

40 Thank you, obrigado! Sidnei de Souza sicol.cria.org.br

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