Importar dados de arquivos de texto para um banco de dados no BioNumerics versão 6.5 no idioma Inglês

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1 Importar dados de arquivos de texto para um banco de dados no BioNumerics versão 6.5 no idioma Inglês 1. Preparacão do documento de texto. a. O arquivo deve ser do tipo texto com extensão.txt. Não servem outras extensões tais como.doc,.docx, etc. O documento deve conter uma tabela bem definida com linhas correspondentes às entradas (identificação única das amostras) e colunas correspondentes aos campos de informações ou aos parâmetros dos respectivos ensaios. Os cruzamentos de linhas e colunas devem conter as informações dos campos ou as variáveis numéricas ou binárias (caracteres) relativos aos experimentos. As delimitações entre as colunas podem ser indicadas com tab, : ou ;. b. Salva o arquivo num local que pode ser facilmente encontrado. 2. Preparação do banco de dados no BioNumerics. Caso queira importar somente dados de campos de informação não é necessária executar qualquer tarefa antes de iniciar a importação para dentro do BioNumerics. Quando deverão ser importados também dados de caracteres (variáveis), é necessário antes de iniciar a importação, criar no BioNumerics o(s) experimento(s) correspondente(s). Neste exemplo vamos importar campos de informação e dados numéricos referentes à resistência das amostras a varias drogas. Caso querem usar os dados deste exemplo, use o arquivo Texto.txt disponível na pasta Dicas de BioNumerics. a. Cria no BioNumerics um experimento com nome Resistência e indicando que se trata de valores binários. b. Inicia a importação com o comando File>Import para mostrar o menu de importação. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 1

2 3. Importação de campos de informação. a. Em Entry information data seleciona Import fields (text file) e clique em Import para mostrar a próxima tela. b. Clique em Browse para apontar o arquivo que quer importar, neste exemplo Texto.txt. Mantem o Field separator em [TAB] e clique em Next. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 2

3 c. Cria um novo modelo de importação clicando em Create New... para aparecer a próxima tela. Preenche os campos Name e Description com informação sobre a importação a ser executada. Por exemplo: Importação de dados em Name e Importação de dados de campos de informação em Description. Marque a primeira linha (que contem os identificadores únicos das amostras) e clique em Edit destination e na próxima tela escolhe Key e clique em OK. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 3

4 d. Marque agora as próximas linhas correspondentes aos campos de informação, neste caso Cidade, Idade, Etnia e Sexo. Em seguido clique em Edit destination. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 4

5 Seleciona Entry info field e clique em OK. e. A próxima tela mostra a sugestão do BioNumerics com referência aos nomes dos campos de informação. São os mesmos nomes existentes no arquivo txt. Caso não quiser fazer nenhuma alteração é só clicar em OK. Se quiser alterar um nome, clique com o botão esquerdo do mouse no nome na coluna Destination e edite o nome que quer usar. Depois de ter feitas as alterações, clique em OK. Aceite a mensagem de aviso, clique em OK, novamente em OK, clique em Next e novamente em Next. O BioNumerics criará os campos de informação e importará os respectivos dados. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 5

6 4. Importação de caracteres (dados numéricos ou binários relacionados à experimentos). a. Inicia novamente a importação com o comando File>Import para mostrar o menu de importação. Clique em Character type data e seleciona Import fields and characters (text file) e clique em Import. Clique em Browse para apontar o arquivo que quer importar, neste exemplo Texto.txt. Mantem o Field separator em [TAB] e clique em Next. Cria um novo modelo de importação clicando em Create New... b. Preenche os campos Name e Description com informação sobre a importação a ser executada. Por exemplo: Importação do experimento Resistência em Name e Importação de valores binários do experimento Resistência a drogas em Description. Marque a primeira linha (que contem os identificadores únicos das amostras) e clique em Edit destination e na próxima tela escolhe Key e clique em OK. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 6

7 c. Marque agora as próximas linhas correspondentes aos valores binários de resitência às drogas, R (Rifampicina), I (Isoniazida), P (Pirazinamida), Sm (Estreptomicina), e Eb (Etambutol). Em seguido clique em Edit destination. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 7

8 d. Clique em Character e escolhe o experimento Resistência. e. A próxima tela mostra a sugestão do BioNumerics com referência aos nomes dos caracteres do experimento. São os mesmos nomes existentes no arquivo txt. Caso não quer fazer nenhuma alteração é só clicar em OK. Se quiser alterar um nome, clique com o botão esquerdo do mouse no nome na coluna Destination e edite o nome que quer atribuir. Depois de ter feitas as alterações, clique em OK. Aceite a mensagem de aviso, clique em OK, novamente em OK, clique em Next e novamente em Next. O BioNumerics criará os caracteres do experimento e importará os respectivos dados na coluna do experimento Resistência. Importar dados de arquivo de texto no BioNumerics vs.6.5 no idioma Inglês Page 8