Carregadores de energia. ATP, GTP, etc. Cofatores e coenzimas. Coenzima A, FAD, NAD. Mensageiros químicos. AMP cíclico, GMP cíclico

Transcrição

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2 Nucleotídeos: funções essenciais Unidades monoméricas dos ácidos nucléicos Carregadores de energia ATP, GTP, etc Cofatores e coenzimas Coenzima A, FAD, NAD Mensageiros químicos AMP cíclico, GMP cíclico

3 Nucleotídeos como monômeros dos ácidos nucléicos DNA e RNA: : estrutura X função

4 Nucleosídeos deos: : carregadores de energia química Nucleosídeos trifosfato: energia química precursores ativados para síntese de RNA e DNA

5 Nucleosídeos deos: : composição Nucleosídeos do DNA uracila (CH3 x H) H x OH (d) adenosina (d) guanosina (d) timidina (d) citidina Purinas Pirimidinas

6 (d)ntps: termodinâmica favorável vel à síntese Etc... Pu - O P O Pu quebra da ligação energia +PPi =Δ G negativo + quebra do PPi = Δ G mais negativo

7 Síntese do polímero mero: ligações fosfodiéster ster

8 Síntese do polímero Vista lateral DNA: DNA polimerase

9 Síntese do polímero mero: ligações fosfodiéster ster

10 Na década d de Watson & Crick História: Miescher (1868): DNA material genético (nucleína) Avery, MacLeod e McCarty: transformação (1944) Hershey e Chase: infecção de E.coli (1952) As regras de Chargaff: relação A-T/G-C Franklin: Difração de Raio X

11 DNA: princípio pio da transformação História: Avery, MacLeod e McCarty (1944): o princípio da transformação (Griffith, 1928) Tratamento com DNAse ou proteinase

12 DNA: informação genética/hereditariedade História: Avery, MacLeod e McCarty: transformação Hershey e Chase: : infecção de E.coli

13 Na década d de Watson & Crick História: Miescher (1868): DNA material genético (nucleína) Avery, MacLeod e McCarty: transformação (1944) Hershey e Chase: infecção de E.coli (1952) As regras de Chargaff: relação A-T/G-C Franklin: Difração de Raio X

14 Watson & Crick: a construção do modelo

15 Watson & Crick: características estruturais do DNA estrutura planar das bases Interações hidrofóbicas difração de Raio X: densidade e padrão em camadas Regra de Chargaff A=T e G=C intuição: pontes de H

16 Plasticidade da dupla hélice

17 Watson & Crick: características estruturais importantes

18 Watson & Crick: características estruturais importantes

19 Características do DNA = interações múltiplas e específicas

20 DNA no trabalho : Interação DNA-Proteina Kalodimos et al, EMBO 2002 Vassylyev et al, Nature 2007

21 DNA no trabalho : Interação DNA-Proteina

22 Watson & Crick: a estabilidade da dupla fita estrutura planar das bases interações hidrofóbicas ressonância absorção de luz UV (260nm)

23 Watson & Crick: a estabilidade da dupla fita Pareamento de bases A/T & G/C Ligações de H

24 Estabilidade da estrutura 2 ária e 3 ária Temperatura = desnaturação propriedades: viscosidade absorção de luz

25 Replicação: processo semiconservativo Watson e Crick: modelo Meselsohn e Stahl: experimento Fitas Fitasparentais

26 Características do polímero Esqueleto hidrofílico Caráter ácido Neutralização 5 3 poliaminas proteínas ions Polaridade: 5 3 a t Estrutura planar das bases 3 g c 5

27 Estabilidade da estrutura 2 ária e 3 ária Estrutura x desordem íons, proteínas, ligações de H, Van der Walls repulsão eletrostática Temperatura = desnaturação do DNA (Tm) absorção de luz viscosidade

28 Tm é característica de cada DNA Como função de: Razão GC x AT ph força iônica tamanho da molécula Processo reversível análise C o T hibridação

29 Processo reversível: hibridação

30 Hibridação como ferramenta

31 Pescando genes DNA ou RNA Marcador Gel Membrana de nitrocelulos e Hibridação com uma sonda radioativa DNA transferido Eletroferese Migração Papel-toalha Base Remoção da sonda não associada Sonda hibridada a uma seqüência complementar Gel Solução salina Membrana de nitrocelulose Exposição a um filme de raio-x Auto-radiografia

32 A hibridação em sistemas comparativos complexos

33 Estrutura do RNA: um mundo de diferenças & extrema plasticidade

34 Estrutura do RNA Pareamento não W/C & bases não usuais

35 Estrutura do RNA: extrema plasticidade Fita simples dupla fita regional, seqüência dependente empilhamento Liberdade de rotação Pareamento não W/C Estrutura secundária variável funções múltiplas

36 Estrutura do RNA: extrema plasticidade

37 RNA: extrema plasticidade... funcional RNA: funções múltiplas rrna, mrna, trna, RNAs de funções especiais ribozimas, estruturais, regulatórios (RNAs de interferência, pequenos RNAs)