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1 e< ~ Dias de Sousa o lfogene INSTRUMENTAÇÃO ANALÍTICA E CIENTIFICA, S A. dq \ ÁGUAS oe ~ TRÁS- OS-MONTES e ALTO DOURO ~ ~ P' hlmrp I ' ==.:..'"':":!:=~.: :=

2 Licenciatura em Genética e Biotecnologia Universidade ele Trás-os-Montes e Alto Douro IV JornadllS Nacionais de Genética e Biotecnologia Programa e Livro de Resumos Vila Real - I,2 e 3 de Março de 20 12

3 IV Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia IV Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia Análise molecular de micobacterias patogénicas cm amostras de rim e gànglio de animais selvagens Comunicações em Postcr Identificação e caracterização molecular de material de videira da Região Demarcada dos Vinhos Verdes Identificação molecular de mutantes para a cor do bago cm variedades de videira (l 'itis l'inifera L) Variabilidade genética em populações de Pinus syil'estris L cm Portugal. utilizando marcadores moleculares RAPO c ISSRs Análise da diversidade genética em 34 espécies da família Fagaceae Polimorfismo para o " internaltranscribed spacer.. do ADN ribossomal em avc!ciras portuguesas Projecto MyTtillus - Mirtilo com Inovação.49 Amílise da variabilidade genética de diferentes cultivares de Vaccinium c01ymbosum, com base em frutos e folhas, através de RAPDs Estudo da variabilidade genética cm cultivares de Vaccinium c01ymbosum através de ISSRs Caracterização genética de centeios com diferentes graus de ploidia Avaliação da tolerância ao alumínio através de diferentes colorações histoquímicas53 Organização fisica de SSRs cm centeio e triticalc. 54 Localizaçiio de sequências de microssatciites em cromossomas de 1-/ordewn sp. usando a técnica ND-FISH Amilise de marcadores cpssrs em espécies do género Plantago Efíciência dos marcadores moleculares RAPDs c /SSRs na avaliação da variabilidade genética de espécies do género Plamogo Divers idade morfológica cm acessos de C ucurbita pepo c C. maximo. Estabelec imento in ritro de Camélias dos Jardins de Celorico de 13asto Micropropagação de Came/liajaponica L Estabelecimento in ritro de Jatropha curcas Linn.. Isolamento c análise da diversidade genética de fungos cntomopatogénicos associados a cultura da vinha na Reg ião Demarcada do Douro Potencial antifimgico do extracto aquoso de 711ymus mastichina L., obtido por micropropagação in 1'ttro, sobre Aspetgi/lus fumigatus Avaliação da actividade gcnotóxica I antigcnotóxica de Calendula ojjlcinalis e l-amndula angustifo/ia Effect o!' Ginkgo biloba L!caves extract in HepG2 cclls treated with Paraquat Capacidade amifúngica do extracto aquoso de ll4entlta sp1cma obtido por tmcropropagação in vitro, sobre Aspe1gillus fumigatus Otimizaçào de Protocolo para o Estudo C itogcnético de Quatro Linhas Celulares de Cancro de!3cxiga Complex karyotype in a case of Polycythaemia vcra Análise por cllogcnética convencional c por FISH de lo amostras com suspeita de Mieloma Múltiplo Cytogenetic Evaluauon of Rat Mammary Tumors Chemically-Induccd by 1-Mcthyl- 1-Nitrosourca (MNU) 70 A expressão de c-kit em tumores mclanociticos cutâneos caninos um novo marcador de diagnóstico? Detecção de alterações cromossómicas cm fetos com mal tàrmações ecográtkas utilizando MLPA Aplicação da técnica de clcctroforcsc cm gel de gradtcntc de desnaturação na diferenciação de genogrupos c genótipos de norovirus cm amostras biológicas c ambientais.. 73 Importância dos saca-rabos (f-le1pesres ic/meumon) como reservatórto de Mycobacrerium lli'iwii subsp paratuberc ulosis Dctcção por técnicas tradicionais c moleculares Detcção molecular de Mycobacterium avi um subsp. paratuberculosis cm duas lontras (Lutra lwra, Linnaeus, 1758) Estudo da variabilidade genética do gene Matrilin- 1 cm Equus asinus Selecção de primers para análise molecular, através de RAPDs c ISSRs, de animais das Iam i lias Cen idae e Suidae Dctcction of loci undcr selcction in Apis me/lifera iberiensis as compared with two frequentist methods Padrões de variação genética cm loci sob selecção na abelha lberica comparação da selecção balanccadora e direccional Utilizaç<lo de RAI'[)s para a deteção de marcadores ligados ao sexo em peixe-zebra Detecção de marcadores ISSRs ligados ao sexo cm peixe-zebra (Danio rerw)... R l Deteção de hibridação de DNA usando um biosscnsor ótico Ferramentas para análise de sequências de dados em biologia molecular...83 Agradecimentos

4 IV Jornadas Nacionais de Genética c Biotecnologia IV Jornadas Nacionais de Genética c Biotccnologra Análise molecular de micobactérias patogénicas em amostras de rim e gânglio de animais selvagens N. Sou.m 1 '.A. Mendes 1 S. Almres 3 C Miranda 3 L. Figueira ~.A. C. Coellw-'. A. C. Matoi. M. Mato/ 1 Studcnts of Gcnetics a.nd D1otcdmology Uruvcrsity of Trfls-os-Mmucs and Alto-Douro ~Sc h ool of Agriculturc. Polytechnic Institui c of (;,ste!o Branco ~CECAV - Ccntcr for An1mal Sctcncc and Vctt,"Tma.ry, Univcrsity oftrãs-os-1\lontcs nnd Alto-Douro, Dcpartmenl of Vetcrinarv Scicnccs ~mb - Institutc for Bioteclmology and Biocnginccring, Centre of Genomic nnd lliotechnology. Univcrsity of Trá">-os Momcs and Alto-Dmno. Dcparrmcm ofgencltcs and Biotechnology md1n. desous:1@gmail. com COMUNICAÇÕES EM POSTER Kcywords: Mycobacteri Javali, Veado, Rim, G;lnglio, PCR As micobactérias provocam infecções crónicas denominadas micobacterioscs, que podem infectar directa ou indirectamente todos os tecidos c órgãos de humanos c de um vasto leque de animais, quer domésticos quer selvagens. Entre os seus hospedeiros selvagens podemos encontrar o javali (Sus scrofa) c o veado (Cervus elaplrus), que funcionam como resef' atórios, promovendo a disseminação desta patolo gia Neste estudo foi extraído DNA a partir de tecidos de rim c gânglios linfáticos provenientes de javali e veado com o objectivo de detectar mrcobactérias. Para detectar Mycobacterium realizou-se o ensaio l 6S rdna (Wilton c Cousins, l 992, adaptado por Moravkova et a/. 2008) com " primers" específicos para o género. No que diz respeito a Mycobacterium m iw11 subsp. paratuherculosis utili7.aram-se "pr imcrs" especílieos para a IS 900 (adaptada de Moss e/ ai. 19'>2), sequência de inserção específica para esta subespécie. No total foram utilizadas 47 amostrus, sendo 33 de gânglios linfáticos c 14 de rim. Das amostras de gânglio, 20 pertenciam a veado e as restantes a javali, observandose incidência de micobactérias numa grande percentagem de amostras. Relativamente às amostras de rim, 9 pro vinham de veado c 5 de javali, verificando-se que a maioria das amostras de veado se revelaram positivas para Mycobacrerilllll m irm1 subsp. paratubercu/osis, enquanto que todas as amostras de javali eram negat ivas para esta sub-espécie. Todas as amostras pos itivas para a sub-espécie revelaram-se positivas para o género Mycobacrerium. A técnica de PC R é uma ferramenta muito útrl para a detecção d e micobactérias, podendo ser util i7.ada futuramente como técnica padrão para o diagnóstico de micobacterioses, cm detrimento de outros métodos morosos, como é o caso da cultura bacteriológica

5 IV Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia IV Jornadas Nacionais de Genética e Biotecnologia P35 P36 Detection of toei under selection in Apis mel/ifera iberiensi.5 as comparcd with two frequentist methods Padrões de variação genética em toei sob selecção na abelha Ibérica: comparação da selecção balanceadora e direccional J. C. Chávcz-Galarza I, D. Henriques I, J. S. Johnsto1,Z, J C. Azevedo I, I. Muiioz 3, P. de la Rúa 3, J. C. Patton". F. Costa 5, M. A Pinto' 1 Mountain Rcscarch Centre (cimo), Pol)'1he<Cruc lnstitutc of Oragança campus de Sama Apolmua apanado 1172, Bragança 3201-&SS.portugal ~ Dcparuncnt ofentomology, Tcx;.IS A & M Umversily College Sta.tion, Texas 77&.\ USA J Área de llwlngm Animal Departamento de Zoolot;ia y Antropologia Fis1ca, Umvcrs1dad de Mure ia Campus de Espmardo. Murcia 30010, Esp.1il..1 ~Dcpartment of Forcstry and Nawral Rcsour<:cs, Purduc Uni vcrsity 7 15 \V Statc St We:sl Lafuycltc. lndlana USA 'Centre of Mnlt.-çular and Envtronmcnral Hiology (CUMA), Umvcrslty of Mmho C.unpus d.: Gualtar, Braga J'ortug..1l (ienomc scans with many gcnclic markcrs providc thc opportunity to invcstigatc local adaptation in natural populations and identify candidate genes undcr selcction. Thc rcccnt advent of high-throughput Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping tcchnologics have opened ncw perspective ofrcsearch and thcsc markers are commonly obscrvcd in functional genes making thcm ideal markers to study adaptivc molecular variation. This approach has become commonly employed in ccological and population gcnctics studies to detect outlier loci that are putatively under selection. Hcrein, wc show a preliminary exploration ofa gcnomc scan to dctcct signatures ofsclcction on thc Iherian honcy bec genome The objective of this study was to determine loci undcr selection of A m. iberiensis by using SNPs. O ver 711 individuais werc sampled in the lbcrian Peninsula across thrcc Jatitudinal transccts and thcn genotyped for 1536 SNPs using thc Goldcn Gatc Assay of lllumina. Loci under selection wcrc identificd by two frcquentist methods: Fdist, implcmcntcd in LOS!TAN, and BAYESCAN. Thcrc wcrc identified 22 loci undcr sclection by BAYESCAN and 12 Joci by LOS!TAN, bcing lo Joci detected by both mcthods. Thc SNPs undcr selectron wcre Jocated in linkagc group I, 4, 6, 7, 8, 9, 10, II, 12, 13 and 15 from honey bce genomc and may be relatcd to genes with divcrsc functions as hormonal, nervous, devclopmcnt, ccll signaling and some unknown. D. Henrique/, J.C. Cháw:-Ga/ar:a 1 JS Jolmstot/. J C A:evedo 1 /. Muiio: 3 P. de la Rría 3 J. C. Pallo11', F. Costa 5 M. A. l'iltlo 1 1 Mountain Rcscmch Ccnlcr (CIMO). Polythccnu.: Jnslilulc of Campus de S.1nta Apolonin i\pmta.du 1172,!Jrag:mça Portugal ~Deparlmcnt of Entomology. Texas A & J\ 1 Univcrsity College Station. Texas 77843<!475. USA JÁrc.1 de Biologia Animal [)cpa.rtamt- nto d~ Zoologin y Antropologia Fisie1. Univcrsid.'ltl de Murei:'! Campus de Espin:!.rdo. Murc±a 30010, Esp,:1fu ~Ocpartmcnt of Forcstry and Natur.J.I Rt...-sources. l'urduc ünivcrsity 7!5 W Statc St. \Vcst Laf.:1yc1te. fndiana ~ USA ~Cent re of Molcculnr and Envircnmcntat 13iology (CBMA). Univcrsity of 1\. tinh<l Campus de! Guah:u. Draga , Portugal Kcywords: Abelha Ibérica, selecção balanceada, selecção direccional, Península Ibérica A Península Ibérica tem sido reconhecida como um "hotspot" de diversidade c endemismo para diversas espécies quer animais quer vegetais. Em parte esta grande diversidade encontrada na Península Ibérica deve-se ao flicto de este local ter sido util izado como refugio por diferentes espécies durante as glaciaçôes A abelha é um dos muitos casos onde este processo aconteceu. Na verdade, a Península Ibérica é umas das regiões da Europa onde esta espécie apresenta uma maior diversidade c complexidade genética. A abelha ibérica que está distribuída pela Península Ibérica é o fruto de uma hibridação natural entre a linhagem Africana c a linhagem da Europa ocidental. O estudo de zonas hibridas tem sido muito importante para compreender os processos evolutivos que levaram à complexidade genética tão característica dos refúgios O objectivo deste trabalho é fazer uma abordagem inicial para perceber como é que os diferentes tipos de selecção (balanceadora e direccional) influenciam a diversidade genética das abelhas na Península Ibérica e tentar perceber qual o papel da selecção na divergência adaptativa das populações. Para tal foram calculadas algumas cstatisticas sumárias e também toram utilizados diversos sothvares que implementam algoritmos Bayesianos de forma a verificar que estrutura é captada ao utilizar-se as regiões do genoma sob diferentes tipos de selecção (balanceadora ou direccional). No total foram detectados 22 loci sob selecção usando o Bayescan, 9 dos quais apresentavam aparentam estar sob de uma selecção balanceada c 13 sob selecção direccional. Neste trabalho é representado o padrão obtido utilizado sollware "STRUCTURE"