MÓDULO 3 BIOLOGIA MOLECULAR
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- Natan Garrau Sabala
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1 MÓDULO 3 BIOLOGIA MOLECULAR Aula 1 - Estrutura e Propriedades dos Ácidos Nucleicos
2 Evidências de que o DNA constitui o material genético Experimento de Frederick Griffith (1928) Pneumococcus pneumoniae Não virulenta (R) Virulenta (S) Cápsula de polissacarídio
3
4 Conclusão: Algum fator da bactéria virulenta passava para a bactéria não virulenta
5 Da bactéria virulenta separaram: - a proteína - o polissacarídio - o DNA Misturaram cada componente com a bactéria não virulenta Injetaram os camundongos Conclusão: O DNA continha a informação da virulência
6 Análise da composição de bases do DNA
7 Ácidos Nucleicos (DNA e RNA) Moléculas compostas de nucleotídeos Nucleotídeos são os blocos estruturais dos ácidos nucleicos
8 Estrutura de um nucleotídeo 2 Base Nitrogenada 3 Fosfato Pentose 1 X X H desoxiribose Ác. desoxiribonucleicos (DNAs) OH ribose Ác. ribonucleicos (RNAs)
9 2 Bases nitrogenadas que compõem os ácidos nucléicos Purinas Adenina Guanina Pirimidinas DNA RNA Citosina Timina Uracila
10
11 OH OH OH OH Os quatro nucleosídios do DNA: desoxiadenosina (da), desoxiguanosina (dg), desoxicitidina (dc), (desoxi)timidina (dt, ou T). Os quatro nucleosídios do RNA: adenosina (A), guanosina (G),citosina (C), uridina (U).
12 Nucleotídios Um nucleotídio é um nucleosídio que contém um ou mais grupos fosfato covalentemente ligados ao Carbono 5 ou 3 do açúcar (ligação éster)
13 Desoxiribonucleotídeos (Fosfato na posição 5 )
14 Ribonucleotídeos
15 Ligação entre os Nucleotídios Um nucleotídio se liga ao outro nucleotídio por ligação fosfodiéster entre o C3 de um nucleotídio e o C5 do nucleotídio seguinte OH
16 Orientação de uma cadeia de DNA ou RNA extremidade 5 OH 3 extremidade 3
17 Ácidos nucleicos são polímeros lineares de nucleotídeos unidos por ligações fosfodiéster DNA RNA Extremidade 5 Oligonucleotídeos: até 50 unidades Polinucleotídeos: > 50 unidades H Extremidade 3
18 A dupla hélice do DNA
19 Evidências
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22 James Watson e Francis Crick (1953) O modelo da dupla hélice
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24 Pontes de hidrogênio entre bases C-G e A-T em fitas de DNA complementares A forma 2 pontes de hidrogênio com T na fita oposta e G forma 3 pontes de hidrogênio com C na fita oposta
25 Características da Dupla Hélice de DNA 1- Duas fitas (cadeias) de DNA formam uma hélice, que se enrola em volta de um eixo, com uma espiral para a direita 2- As duas fitas de DNA correm em sentidos opostos (antiparalelas) 3- Os esqueletos de açúcar e fosfato das duas fitas de DNA enrolam-se ao redor do eixo da hélice 4- As bases nitrogenadas dos nucleotídios estão voltadas para o interior da hélice, empilhadas uma sobre a outra 5- Os grupos fosfato carregados ficam voltados para fora Nota: não confundir com alfa-hélice de proteínas...
26 Forças que estabilizam a dupla hélice 1. Pontes de Hidrogênio entre as bases nitrogenadas; 2. Forças de Van der Waals entre os anéis aromáticos das bases nitrogenadas empilhadas no interior da hélice 3. Interações hidrofílicas dos grupos fosfato carregados negativamente com o meio externo.
27 Em função da especificidade do pareamento das bases, as duas fitas do DNA são chamadas complementares
28 A Dupla Hélice do DNA é a estrutura secundária nativa (ou normal) A conversão da dupla hélice do DNA em fitas simples é chamada desnaturação A conversão de fitas simples de volta para a estrutura de dupla hélice é chamada renaturação A renaturação só ocorre porque há complementaridade entre as fitas do DNA
29 DESNATURAÇÃO Separação das duas fitas de DNA e formação de estruturas desordenadas. AGENTES DESNATURANTES Extremos de ph (< 4; >11); Temperatura ( o C); Agentes que quebram pontes de H (uréia; guanidina; formamida)
30 DNA parcialmente desnaturado
31 RNA também é um polímero de nucleotídeos Tipos de RNA numa célula: - RNA mensageiro (mrna) - RNA transportador ou de transferência (trna) - RNA ribossômico (rrna) - Pequenos RNAs (snrna)
32 RNA é um polímero de fita simples Apresenta estrutura secundária por dobramento da cadeia. Pontes de hidrogênio intra-cadeia Em sua estabilidade participam as mesmas forças que atuam no DNA.
33 Estrutura do RNA com exceção de certos tipos de vírus, o RNA é uma molécula encontrada na forma de fita simples moléculas de RNA também apresentam estrutura secundária formam pontes de hidrogênio entre as bases (ligação intra-cadeia) rrna 3 trna 5 5 3
34 Propriedades do DNA e RNA O RNA é hidrolisado por álcali (bases) O DNA não é hidrolisado por álcali
35 Nucleases são enzimas que rompem a ligação fosfodiéster e digerem ácidos nucleicos Desoxiribonucleases atuam no DNA Ribonucleases atuam no RNA
36 A estrutura do DNA e a complementaridade entre as fitas permitiram que Watson e Crick propusessem: - O mecanismo de replicação do DNA - A origem das Mutações - A forma como a informação genética seria armazenada - A forma como a informação genética do DNA é traduzida (e expressa) em proteína
37 Em 1965 Crick define o DOGMA CENTRAL DA BIOLOGIA MOLECULAR Replicação DNA Transcrição RNA Tradução PROTEÍNA O dogma Central da Biologia Molecular define os três processos fundamentais envolvidos na preservação e transmissão da informação genética contida no genoma (DNA) do organismo.
38 Processos Replicação DNA Transcrição RNA Tradução PROTEÍNA Replicação processo pelo qual uma molécula de DNA dá origem a duas moléculas idênticas Transcrição Processo pelo qual o DNA é copiado numa molécula de RNA (mrna, rrna e trna). Tradução Processo pelo qual a mensagem genética (transcrita no mrna) é decodificada em aminoácidos que são utilizados para a síntese da proteína.
39 Organização do Genoma
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42 Cromossomo de Bactéria
43 Cromossomo de Eucariotos DNA de uma célula humana = 2 metros
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45 Histonas proteínas básicas, ricas em Lisina e Arginina
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Figura 1. Exemplo da estrutura de um nucleotídeo
2 - ÁCIDOS NUCLÉICOS Na natureza há dois tipos de ácidos nucléicos: DNA ou ácido desoxirribonucléico e RNA ou ácido ribonucléico. Analogamente a um sistema de comunicação, essas informações são mantidas
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