Introdução ao STATA vs. 9 (Banco de Dados)

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1 Universidade Federal do Rio de Janeiro Faculdade de Medicina Departamento de Medicina Preventiva Núcleo de Estudos de Saúde Coletiva Disciplina: Estatística em Epidemiologia II Introdução ao STATA vs. 9 (Banco de Dados) Tania Guillén de Torres Rejane Sobrino Pinheiro 2009 TGT / RSP 12

2 Sintaxe de um comando STATA Os comandos Stata tem a seguinte estrutura: [by varlist1:] comando [varlist] [=exp] [if exp] [in range] [weight] [, options] onde: os elementos nos colchetes são opcionais by : o comando é repetido para cada valor da variável ou variáveis contidas na varlist1 varlist : lista de variáveis para as quais será executado o comando, se varlist for omitida, o comando será executado para todas as variáveis =exp : opção usada nos comandos generate, replace, egen para definir ou transformar variáveis ( generate imc=peso/(altura*altura) if : restringe a ação do comando a aquelas observações para as quais a expressão é verdadeira (edit if sexo== masculino editor de dados mostrara as observações de indivíduos do sexo masculino ) in : restringe a ação do comando a aquelas observações contidas no intervalo definido no range (ex.: edit in1/10 editor de dados mostrara as primeiras 10 observações) weight : variável contendo os pesos que serão usados para ponderar as observações options : indica as opções específicas a cada comando que serão usadas, devem ser precedidas sempre por uma vírgula. Conhecendo o conteúdo do Banco describe ou desc: permite conhecer o conteúdo de um banco de dados tipo STATA, fornecendo uma série de detalhes como por exemplo: número de observações, número de variáveis, data da última atualização, lista de variáveis com seus respectivos tipos e formatos e os rótulos criados. Abrir o banco leucemia_wbc0.dta File Open Diretório Nome do arquivo > use "C:\data\leucemia_wbc0.dta", clear (Leukemia Remission Study) Para descrever o conteúdo do banco selecione a seqüência a seguir: Data Describe Data Describe variables in memory TGT / RSP 13

3 . desc Contains data from C:\data\Leucemia_Wbc0.dta obs: 42 Leukemia Remission Study vars: 5 17 Mar :32 size: 504 (99.9% of memory free) storage display value variable name type format label variable label weeks byte %8.0g relapse byte %8.0g trtment byte %8.0g sex byte %8.0g wbcc float %9.0g Sorted by: Compactando o banco O comando compress grava o banco de dados em uso no STATA, transformando o tipo das variáveis, sendo possível fazer mudanças sem prejudicar o conteúdo, com a finalidade de poupar espaço no disco. Olhando somente algumas observações Existem diferentes maneiras de visualizar o conteúdo parcial ou total de um arquivo de dados, fazendo uso dos comandos: edit, list e browse. Edit : O ícone ou a seqüência de comandos Data Data editor permitem acessar a planilha de dados do arquivo Stata em uso. Podem ser visualizados os conteúdos de todas as variáveis, sendo possível também, fazer entrada de novos dados, edição dos já existentes, etc. Quando se deseja editar somente algumas variáveis e/ou algumas observações deve-se digitar, na janela de comandos, as opções escolhidas de acordo com a sintaxe a seguir: edit [varlist] [if exp] [in range] [, nolabel] Na opção nolabel não são apresentados os rótulos das observações. Exemplos para digitar na janela de comandos: edit weeks relapse edit weeks relapse if trtment==0 edit weeks relapse if trtment==0 in 15/35 TGT / RSP 14

4 List: É um comando que permite que os valores das variáveis e/ou observações selecionadas na expressão do list sejam apresentados na janela de resultados. Para tal siga a seqüência: Data Describe data List data Na Janela Main do List List values of variables selecione as variáveis que serão listadas na janela de resultados, se deseja selecionar somente algumas observações digite a condição no retângulo do if (por exemplo: sexo==0 ) ou se deseja pode usar a opção [Use a range of observations] na janela by/if/in Exemplos para digitar na janela de comandos: list weeks relapse list weeks relapse if trtment==0 list weeks relapse if trtment==0 in 15/35. list weeks relapse if sex==0 in 15/ weeks relapse Browse: É um comando que também permite visualizar a planilha de dados ou uma parte dela, com a diferença que este comando não permite realizar mudanças nas celulas da planilha. É uma alternativa ao comando list browse weeks relapse if trtment==0 in 15/35, nolabel TGT / RSP 15

5 14. Label: colocando Rótulos Podemos associar descrições (rótulos ou labels) a uma base de dados, a uma variável ou aos códigos de uma variável. No Banco de Dados Para associar uma descrição, de até 31 caracteres, a uma base de dados, selecione a seqüência a seguir na barra de ferramentas do Stata Data Labels Label Datasets Digite a seguir a descriçaõ que deseja associar ao banco de dados na janela: label data attach a label to data label data Leukemia Remission Study Nas Variáveis Para associar uma descrição, de até 31 caracteres, a uma variável, selecione a seqüência a seguir na barra de ferramentas do Stata Data Labels Label variable TGT / RSP 16

6 Digite a seguir a descrição que deseja associar a variável na janela: label data attach a label to a variable Nas Observações label variable relapse "Recidiva do Paciente" label variable relapse "Recidiva do Paciente" label variable weeks "Tempo ate recidiva" label variable trtment "Tipo de tratamento" label variable sex "Sexo do paciente" label variable wbcc "Contagem de Celulas brancas" Para associar código a cada uma das categorias de uma variável (rótulo 8 caracteres). É necessário: Passo 1: criar a variável-rótulo e indicar os códigos da variável original com os respectivos rótulos, selecione a seqüência a seguir, na barra de ferramentas do Stata Data Labels & notes Define value Label TGT / RSP 17

7 Na janela Define value labels selecione a opção [Define] Na janela Define new label digite o nome do rotulo ou label a ser criado Selecione a opção [OK] Na janela Add value digite o codigo da categoria na opção Value e o rotulo ou label da categoria na opção Text, a seguir a opção [OK] e vai repetindo esta opção para cada uma das categorias da variável. TGT / RSP 18

8 label define sx 0 "Feminino" 1 "Masculino" label define rcdv 0 "Nao" 1 "sim" label define trt 0 "Placebo" 1 "TratNovo" Passo 2: Associar a variável-rótulo criada no passo anterior à variável original, para tal selecione a seqüência a seguir, na barra de ferramentas do Stata Data Labels & notes Assign value to variable Na janela label values attach value label indique, na opção [Variable], o nome da variável que recebera os rotulos que foram criados no passo anterior e na opção [Value label] selecione o nome do rotulo criado e aseguir a opção [OK]. Obs: label values trtment trt label values relapse rcdv label values sex sx 1. Para retirar o rótulo de alguns ou todos os valores de uma variável, pode-se usar a opção label drop ou usar a opção nolabel de alguns comandos Stata. label drop tratamento 2. Com as opções add e modify, é possível adicionar e/ou modificar rótulos para os valores de uma variável label define tratamento 1 "Trata", modify Outras opções do comando Label, digitados na janela de comandos: label dir: lista os nomes das variáveis-rótulos. label list: lista os nomes das variáveis-rótulos e os rótulos dos valores das variáveis Label drop _all: elimina os rotulos de todas as variáveis TGT / RSP 19

9 15. Gerando novas variáveis O comando generate cria uma variável newvar adicional no banco de dados, que irá receber o valor da expressão exp, para as observações selecionadas na condição if e/ou no intervalo in. Sintaxe do comando generate [by varlist:] generate [type] newvar = exp [if exp] [in range] Exemplo:Gerando variáveis continuas Selecione a seqüência a seguir na barra de ferramentas do Stata Data Create or change variables Create new variable Na janela generate Generate a new variable indique, na opção [Generate variable], o nome da variavel que será gerada e na opção [Contents] escreva a expressão que definirá a nova variável, o Stata seleciona o tipo de variável a ser criada, caso não concorde com esta opção, pode fazer a escolha apropriada em [New variable type], a seguir selecione [OK]. generate float logwbcc = log(wbcc) Gerando uma variavel indicadora a partir de uma var continua Para gerar a variável indicadora de logwbcc (logwbcc >= 3) selecione a seqüência a seguir: TGT / RSP 20

10 Data Create or change variables Create new variable Na janela [generate Create a new variable] escreva o nome da nova variável (lgwbccat1) no quadro [New variable name:] e a expressão que definira o conteúdo da nova variável (logwbcc>=3) no quadro [Contents of new variable: (expression)] e a seguir [OK].. generate byte lgwbccat1 = (logwbcc>=3) Quando se deseja gerar uma variável categorica usando mais de um ponto de corte de uma variável contínua, deve-se usar a seqüência de opções a seguir: Data Create or change variables Create new variable (extended) Na janela [egen Extensions to generate] escreva o nome da nova variável (lgwbccat3) no quadro [Generate variable:] da janela [Main] e selecione a opção Cut no quadrado [Egen function:]. No quadro [Form groups:] selecione a opção [Using the following break points:] e escreva no quadro os limites dos lintervalos (0,2.3,3,5.1), selecione a opção Use codes 0,1,2,.. instead of left-hand ends of intervals para atribuir os valores 0, 1, 2 as categorias que serão criadas, para executar o comando de um click em [OK]. TGT / RSP 21

11 . egen byte lgwbccat3 = cut(logwbcc), at(0,2.3,3,5.1) icodes Nesta opção deverão ser criados os rótulos das categorias.. label define wbc 0 Low 1 Medium 2 High Corrigindo valores Replace - muda o conteúdo de variáveis e/ou de observações já definidas de acordo com regras especificadas. Na seqüência de comandos: Data Create or change variables Change contents of variable no quadro Variable da janela [Main], digite o nome da variável que será modificada e no quadro New contents escreva a nova expressão para o conteúdo da variável. A janela if/in permite que o novo conteúdo seja aplicado a algumas observações que podem ser selecionadas no quadro if: (expression) e/ou na opção [Use a range of observations]. TGT / RSP 22

12 Exemplo: replace lgwbccat1 = 2 if logwbcc>3 (17 real changes made) Recode - muda o conteúdo de alguns valores da variável categórica já definida, seguindo a seqüência de comandos: Data Create or change variables Other variable transformation commands Recode categorical variable No quadro [Variable] da janela Main indique o nome da variável categórica cujos valores serão substituídos e no quadro [Required] escreva a expressão que possibilitara a mudança. Exemplo:. recode lgwbccat1 2=1 (lgwbccat1: 17 changes made) TGT / RSP 23

13 Escolha de variáveis e/ou observações Drop elimina as variáveis ou observações selecionadas do banco em uso. keep é um comando similar ao drop, porem neste comando especifica-se as variáveis e/ ou observações que ficaram no banco Para eleiminar variáveis: Data Variables utilities Keep or drop variable Ou para eliminar observações: Data Variables utilities Keep or observations drop wbcc keep sex wbcc logwbcc drop if sex==1 elimina a variável wbcc variáveis que ficam no banco elimina todas as observações para as quais sex==1 drop _all e clear - eliminam todas as observações e variáveis do banco TGT / RSP 24