Um protótipo de ambiente de desenvolvimento Web para a linguagem R
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- William Almada Pinheiro
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1 Um protótipo de ambiente de desenvolvimento Web para a linguagem R Katiano Favretto 1, Willingthon Pavan 1, José Maurício Cunha Fernandes 2, Cristiano Roberto Cervi 3, Jaqson Dalbosco 1, Clyde William Fraisse 3 1 Universidade de Passo Fundo (UPF), BR 285, Bairro São José, Caixa Postal 611, CEP Passo Fundo/RS Brasil 2 Embrapa Trigo - BR 285, km 294, CEP: , Passo Fundo/RS Brasil 3 University of Florida 271 Frazier Rogers Hall PO Box Gainesville, FL USA katiano@comilonibus.com.br, pavan@upf.br, mauricio@cnpt.embrapa.br, cervi@upf.br, jaqson@upf.br, cfraisse@ufl.edu Resumo. Este artigo apresenta um ambiente interativo para a linguagem R, desenvolvido em e disponibilizado via web, sendo capaz de interpretar os comandos R e disponibilizar as saídas textuais, em forma de planilhas e resultados gráficos, além de permitir o armazenamento de scripts e a criação de uma biblioteca de comandos própria. O protótipo demonstra a viabilidade de integração entre o R e tecnologias web, tornando-se uma ferramenta de fácil acesso para auxilio na área da educação e para usuários iniciantes ou ocasionais. Abstract. This article presents an interactive environment for the language R, developed in and available through the web. It is able to interpret the commands R providing the outputs in text, spreadsheets and graphics. In addition, it provides the storage of scripts and the creation of a library commands. The prototype demonstrates the feasibility of integration between the R and Web technologies, becoming a tool for easy access for beginners, occasional users or to assist in education classes. 1. Introdução O R é uma linguagem e ambiente para computação estatística e geração de gráficos, que disponibiliza uma grande variedade de métodos estatísticos, como modelagem linear e não linear, testes estatísticos, séries temporais, classificação, métodos multivariados, geoestatística, além de técnicas gráficas. Um dos seus pontos fortes é a facilidade com que gráficos de alta qualidade podem ser produzidos (R Project, 2007). A criação de uma interface gráfica suficientemente elaborada que permita uma interação amigável com o usuário e disponível na Web poderia tornar o aprendizado desta linguagem menos exaustivo, visto que proporcionaria uma grande facilidade de acesso por qualquer pessoa, de qualquer lugar, com acesso à internet, bem como dispensaria qualquer instalação no computador pessoal. Além disso, todo o processamento ficaria a cargo de um servidor, liberando a máquina do usuário de
2 qualquer processamento. Este trabalho tem como objetivo criar um ambiente web, acessível a qualquer usuário, possibilitando a este a utilização da linguagem R de forma fácil e ilimitada, para geração de cálculos estatísticos, gráficos e quaisquer outras funcionalidades disponibilizadas pelo R. Permitindo ainda ao usuário a geração e armazenamento de scripts, bem como a criação de uma biblioteca de comandos, que poderá ser compartilhada com outros usuários. Este documento apresenta inicialmente uma breve descrição, acompanhada da motivação, sobre as tecnologias utilizadas no desenvolvimento do protótipo. Na seqüência é descrito o protótipo, apresentando-se a estrutura, funcionalidades, formas de trabalho e utilização do mesmo. Ao final são realizadas algumas discussões e conclusões sobre os benefícios, viabilidade de implementação e limitações da aplicação. 2. Materiais e Métodos 2.1. Tecnologias utilizadas O protótipo foi desenvolvido em HTML com auxilio de tecnologias bastante difundidas, como CSS utilizado para definição de padrões de aparência das páginas; JavaScript como forma de reduzir a quantidade de requisições ao servidor, por rodar na máquina do cliente; e AJAX para reduzir o trafego de informações, visto que somente são trafegadas informações de áreas especificas da página. O foi responsável pela geração de conteúdo dinâmico, pois possibilita interagir com bancos de dados e aplicações existentes no servidor. O MySQL foi a escolha para persistência das informações do sistema e dados dos usuários. O ImageMagick, assim como o R, foram instalados no servidor de aplicação para processar as informações do usuário. As imagens geradas pelo R são disponibilizadas no formato PS (PostScript), que não é reconhecido pelos navegadores de internet, e por isso a utilização da ImageMagick que converte estes arquivos para o formato PNG (Portable Network Graphics) que pode ser exibido no navegador. Utilizou-se de um editor de código fonte chamado EditArea, inserido na aplicação do protótipo, como área para digitação dos scripts R. O EditArea foi desenvolvido e é mantido por Christophe Dolivet (Dolivet, 2007). 3. Resultados Como resultado obteve-se uma aplicação WEB que possibilita a geração e o armazenamento de scripts, bem como a execução de códigos da linguagem R e a visualização de resultados de sua execução, em forma de gráficos e/ou textos. O sistema está disponível a qualquer usuário, sem exigir que este tenha instalado em seu computador, qualquer software relacionado ao R, bastando apenas um acesso a internet. Para utilizar o ambiente não é necessário qualquer cadastro, mas caso seja de interesse, o usuário pode cadastrar-se e passar a usufruir de alguns benefícios, que somente estão disponíveis para usuários cadastrados, as quais são descritas no decorrer deste capítulo.
3 3.1. Funcionamento do sistema O processo é iniciado pelo usuário com a digitação de um script e o envio deste ao servidor. O processo de envio se dá através de uma requisição AJAX, interpretada por uma página, que recebe o conteúdo e o insere em um arquivo denominado arqinput. O arquivo arqinput é submetido ao R, através do comando exec do. Que gera um novo arquivo denominado arqoutput, com o resultado em formato texto, e opcionalmente o arquivo Rplots.ps, que por padrão é criado pelo R quando a execução do script resultar em imagens ou gráficos. Este arquivo de imagem é submetido, via, ao ImageMagick, juntamente com alguns parâmetros, tais como, rotação, nome e formado para conversão do arquivo, gerando assim arquivos no formato PNG prontos para exibição. Após a execução do processo descrito, o arquivo texto (arqoutput) e as imagens (PNG) são lidos e convertidos em um formado HTML, para que possam ser retornadas ao processo cliente, onde, através do AJAX, os mesmos são exibidos, conforme demonstra a Figura 1. Quando exibidos os arquivos gerados no servidor são eliminados para que não permaneçam ocupando espaço em disco. O sistema possui ainda um módulo gráfico, que ao invés de possuir uma área para digitação do script, apresenta um formulário com campos pré-definidos. Quando preenchidos estes campos são convertidos, através de uma página em um script texto e enviados ao servidor, seguindo então o mesmo fluxo de processamento. Navegador Cliente Editor de scripts R Resultados AJAX AJAX Servidor Script R HTML arqinput arqoutpu t grafico-0 grafico-1 grafico-n IM Linguage m R R R Rplots.ps Image Magick Figura 1 Fluxograma de processamento de scripts
4 3.2. Estrutura do protótipo O protótipo foi estruturado em forma de uma tabela HTML, conforme mostra a Figura 2, dividido em quatro áreas principais, chamadas respectivamente de Módulos, Comandos, Principal e Resultados. O conteúdo exibido em cada uma destas áreas é carregado, atualizado e alterado através de requisições AJAX ao servidor. Módulos Comandos Principal Resultados Figura 2 Estrutura da aplicação Na área módulos são exibidos os quatro ícones principais (modo texto, modo gráfico, biblioteca de comandos e repositório de scripts) responsáveis pela navegabilidade pelo sistema. A direita está disposta a área de login, que é utilizada pelo usuário para efetuar o seu login no sistema. Na seqüência está posicionada a área comandos, onde são disponibilizados os comandos responsáveis pela inserção de scripts previamente criados, e pela exibição dos formulários disponíveis no modo gráfico. A área principal é utilizada em toda a aplicação como a área de trabalho do usuário, exibindo a área de digitação de scripts, os formulário, assim como as listas e telas do sistema. E no final da aplicação está localizada a área resultados, que é responsável pela apresentação dos resultados (textos, gráficos ou imagens) dos scripts submetidos ao R Cadastro de Usuários O ambiente de desenvolvimento está disponível para acesso por qualquer usuário, e este não precisa se cadastrar para utilizá-lo, porém, o usuário que possuir cadastro, ao logarse terá alguns benefícios como, adicionar novos comandos à biblioteca de comandos, salvar scripts para reutilizá-los quando necessário, entre outros. Para que usuário possa realizar o cadastro há um link chamado Cadastrar abaixo dos campos login e senha Modo texto Quando acessado, o modo texto dispõe de uma lista de comandos, uma área para digitação de scripts R e uma área onde os resultados dos scripts submetidos são
5 exibidos. Para usuários não logados, a área de comandos lista todos os comandos públicos disponíveis na biblioteca de comandos do sistema, já no caso de usuários logados a lista exibida é a sua própria biblioteca de comandos. Opcionalmente, este poderá configurar o sistema para também exibir os comandos públicos. Para que o conteúdo de um comando seja inserido no script, basta clicar sobre comando e o conteúdo deste será inserido ao final do script já existente, ou caso haja algum texto selecionado, este será substituído pelo conteúdo do comando. A área de digitação, para a qual foi utilizado o componente EditArea, é uma área de livre digitação, onde o usuário pode compor seus scripts, digitando-os ou inserindo códigos da biblioteca de comandos. O EditArea possui um barra de ferramentas que possibilita a execução de algumas funções que facilitam a composição dos scrips. Os resultados do processamento do R e do ImageMagick são exibidos abaixo do script, na área de resultados. O resultado de um script pode ser visto na Figura 3, que exibe o script e a imagem retornados. Figura 3 - Resultado de um script submetido 3.5. Modo gráfico O modo visual ou gráfico, que pode ser visto na Figura 4, é uma área onde funções, previamente definidas, podem ser disponibilizadas aos usuários, sem a necessidade de qualquer conhecimento, por parte destes, da linguagem R. Neste modo, a área de digitação de scripts é substituída por formulários, com campos que precisam ser preenchidos pelo usuário, e ao serem enviados, os valores são inseridos em um script R, e submetidos ao servidor. O resultado (gráfico ou texto) é exibido na área de resultados da aplicação, da mesma forma como no modo texto. Figura 4 - Tela do modo gráfico
6 Na área de comandos estão listados os formulários disponíveis ao usuário. Ao contrário do modo texto, onde os comandos podem ser criados, alterados e excluídos pelo usuário, no modo gráfico os formulários precisam ser criados pelo administrador do sistema. Ao usuário resta apenas utilizá-los, sem a possibilidade de inclusão, alteração ou exclusão dos mesmos Biblioteca de comandos Esta é uma área acessível somente para usuários cadastrados, e é necessário estar logado para executar qualquer ação neste modo. A biblioteca de comandos é utilizada para cadastro e manutenção dos comandos que serão exibidos na área comandos do modo texto. Como pode ser visto na Figura 5, ao acessar essa biblioteca, uma lista de comandos já cadastrados pelo usuário é exibida. Figura 5 - Tela da biblioteca de comandos Para o cadastro e edição de comandos, o usuário dispõe de um formulário, exibido na Figura 6. Figura 6 Cadastro e edição de comandos 3.7. Repositório de scripts Assim como a biblioteca de comandos, o repositório de scripts também está disponível apenas para usuários cadastrados no sistema, e para acessá-lo o usuário precisa estar logado. O repositório de scripts é uma área destinada ao armazenamento de scripts produzidos pelo usuário, possibilitando o resgate destes quando necessário. A tela do repositório de scripts, com uma listagem de scripts salvos, pode ser vista na Figura 7.
7 Figura 7 - Tela do repositório de scripts 4. Discussão Segundo Grosjean (2007), vários projetos estão sendo desenvolvidos, visando proporcionar uma maior facilidade de utilização da linguagem R, visto que usuário iniciantes tem maior dificuldade de aprendizado quando utilizam interfaces de linha de comando. A maioria desses projetos visa o desenvolvimento de ferramentas que precisam ser instaladas no computador do usuário, dificultando o acesso por pessoas que utilizam o R em locais e computadores diferentes. Os projetos para disponibilizar o R na web não são muitos, e os existentes oferecem apenas ferramentas estáticas, ou seja, não possibilitam ao usuário customização e criação de funções, disponibilizando apenas funções pré-estabelecidas ou uma área para digitação livre. O ambiente desenvolvido visa auxiliar as pessoas no aprendizado do R, proporcionando a estes toda a flexibilidade de uma interface de linha de comando, com recursos adicionais, como a possibilidade de criação de uma biblioteca de comandos própria, que pode ser disponibiliza a outros usuários, e um repositório para armazenamento dos scripts. Desta forma os scripts estarão disponíveis para consulta, edição e utilização em qualquer computador em que o ambiente seja acessado, eliminando a necessidade de mecanismos portáteis de armazenamento, para usuários que utilizam a linguagem R em locais e computadores diferentes. O ambiente está disponível em forma de código fonte aberto, possibilitando que outros colaboradores possam dar continuidade ao projeto, aprimorando as funcionalidades já existentes, ou criando novas, e expandir o mesmo de forma que se torne uma ferramenta reconhecida pela comunidade de desenvolvedores R. Este ambiente está em fase de protótipo, e por esse motivo as funcionalidades são limitadas e bastante restritas, o que pode ser um limitador para usuários experientes e que necessitem de todas as funcionalidades disponíveis na linguagem R. Uma das limitações é quanto aos formulários do modo gráfico que somente podem ser criados pelo administrador do sistema, sendo assim, fica como sugestão para trabalhos futuros à alteração deste modo, para que a criação e manutenção destes formulários possa ser feita pelo usuário. A integração entre aplicações e sistemas web mostrou-se como uma alternativa viável, visto que possibilita uma maior facilidade de utilização no aprendizado, por estar disponível em qualquer lugar com acesso a internet e não necessitar instalação de qualquer aplicativo no computador do usuário.
8 O R apresenta-se como uma ferramenta promissora, podendo adaptar-se a diversas áreas de interesse, como na educação, no desenvolvimento de soluções comerciais, etc. Por esses, e por outros motivos, o R vem sendo utilizado cada vez mais por diferentes usuários em diversas áreas do conhecimento (Silva Junior, 2005). 5. Conclusão Os resultados apresentados neste trabalho demonstram a viabilidade de integração entre o R e tecnologias web (HTML, CSS,, JavaScript, AJAX, MySQL), tornando possível a utilização do mesmo sem a necessidade de instalação de qualquer aplicação no computador do usuário. O ambiente desenvolvido apresenta-se como uma alternativa eficiente para utilização do R em ambientes educacionais e para usuários ocasionais, visto a possibilidade de centralização das informações e a facilidade com que as mesmas podem ser acessadas. Para utilização em ambientes profissionais, o protótipo precisa ser aprimorado, acrescentando-se a este algumas funcionalidades que permitam a total utilização dos recursos da linguagem R. 6. Trabalhos Futuros O protótipo aqui apresentado atingiu os objetivos gerais esperados, porém alguns pontos merecem atenção para que a ferramenta seja aperfeiçoada e tenha continuidade. Como trabalhos futuros, pode-se mencionar uma das limitações referente aos formulários do modo gráfico, visto que somente podem ser criados ou alterados pelo administrador do sistema, sendo assim, fica como sugestão a melhoria deste modo, para que mesmas possam ser feitas pelo usuário do sistema. Novas funcionalidades, como conexão com diferentes bancos de dados e upload de arquivos, podem ser acrescentadas ao sistema, possibilitando que dados sejam importados e armazenados pelo usuário. Referencias Dolivet, Christophe. (2007) Cdolivet.net, Setembro. Grosjean, Philippe. (2007) R GUI projects, Março. R Project. (2007) The R Project for Statistical Computing, Março. Silva Junior, Vilson Vierida da. (2005) Perspectivas para uso da linguagem R. Publicado em 19 de agosto de 2005.
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