Roteiro da Disciplina

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1 Roteiro da Disciplina 1. Docente: Antônio Carlos Roque da Silva Filho Homepage: (link Ensino, link Introdução à Neurociência Computacional) 4. Horário: 2 a feira, 14:00 17:00 e 5 a feira, 14:00 16:00 5. Início: 23/09/2013; Término: 02/12/ Local: Sala 220 (Bloco B2 superior) 7. Tópicos: Elementos básicos de neurociência; Disparos neurais e o código neural; Neurônios e modelos baseados em condutâncias; i. Formalismo de Hodgkin-Huxley; ii. Modelagem compartimental. Modelos de sinapses; Modelos simplificados de neurônios; Modelos de redes de neurônios; Modelos baseados em taxas de disparos. 8. Metodologia: Aulas expositivas em sala de aula. Exercícios e problemas para casa.

2 9. Critério de Avaliação: Listas de exercícios semanais (E) e projetos computacionais (C) para casa. A nota final (NF) será dada pela seguinte fórmula: 2 E + 3 C NF =, 5 onde E é a média aritmética das notas das listas de exercícios e C é a média aritmética das notas dos projetos computacionais. 10. Conceito final: O conceito final será atribuído em função da nota final segundo a regra: A: 10 NF 8,5; B: 8,5 < NF 6,5; C: 6,5 < NF 5,0; R: NF < 5,0 11. As respostas das listas de exercícios e dos projetos computacionais poderão ser entregues feitas à mão ou com auxílio de editores de texto (Word, LaTeX, etc). Elas poderão ser entregues em versões físicas (manuscritos originais ou cópias impressas) ou eletrônicas (cópias escaneadas dos manuscritos originais ou arquivos gerados pelos editores de texto, em formato pdf) através de s enviados ao professor ou CDs gravados. As versões físicas ou os CDs gravados deverão ser entregues diretamente ao professor em sala de aula ou deixadas no seu escaninho no DFM (fica no fim do corredor

3 onde está a secretaria). Os arquivos enviados por devem ser identificados por nomes com o seguinte formato: lista#_nome_do_aluno.ext. 12. Sobre provas substitutivas e trabalhos extras: Espera-se que todos os alunos compareçam às aulas e entreguem as listas e projetos nas datas marcadas. Por favor, não peça ao professor permissão para entregar uma lista ou projeto depois do prazo ou para fazer uma prova substitutiva ou trabalho adicional para repor ou melhorar uma nota, exceto em caso de urgência médica (comprovado por atestado). Caso uma prova substitutiva seja necessária, ela será feita oralmente na sala do professor. 13. Bibliografia: Sterrat, D., Graham, B., Gillies, A. & Willshaw, D., Principles of Computational Modelling in Neuroscience, Cambridge University Press, Cambridge, UK, Gerstner, W. & Kistler, W., Spiking Neuron Models, Cambridge University Press, Cambridge, UK, Disponível em formato html em: Koch, C., Biophysics of Computation: Information Processing in Single Neurons, Oxford University Press, Oxford, Alguns capítulos do livro encontram-se a disposição no site:

4 Dayan, P. & Abbott, L.F., Theoretical Neuroscience: Computational and Mathematical Modeling of Neural Systems, MIT Press, Cambridge, MA, Alguns capítulos do livro e exercícios resolvidos encontram-se disponíveis no site: Notas de aula do professor e artigos científicos a serem divulgados em sala de aula (disponíveis pela internet ou em revistas existentes na Biblioteca). 14. Livros-texto de Neurociência: úteis como material de apoio. Bear, M. F., Connors, B.W. & Paradiso, M. A., Neurociências: desvendando o sistema nervoso, 3 a edição. ARTMED, Porto Alegre-RS, 2007 Purves, D., Hall, W.C. & McNamara, J.O., Neurociências, 4 a edição. ARTMED, Porto Alegre-RS, Material de apoio na Web: Há muito material didático de bom nível disponível na internet (mas também há muito lixo, tomem cuidado). Em geral, verifiquem a procedência do material (a instituição que está por trás, a afiliação de quem o preparou, etc) antes de acessar. Alguns sites interessantes são: Encyclopedia of Computational Neuroscience onal_neuroscience

5 Brains, Minds and Media Special Issue on Realistic Neural Modeling The GENESIS website Free Internet Edition of The Book of GENESIS The NEURON website Computational Neuroscience on the Web. NEST