6 Só será permitido o uso de dicionário INGLÊS/INGLÊS.

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1 Confira se os dados contidos na parte inferior desta capa estão corretos e, em seguida, assine no espaço reservado para isso. Se, em qualquer outro local deste Caderno, você assinar, rubricar, escrever mensagem, etc., será excluído do Exame. Este Caderno contém 5 questões discursivas referentes à Prova da Língua Estrangeira escolhida pelo candidato. Não destaque nenhuma folha. Se o Caderno estiver incompleto ou contiver imperfeição gráfica que impeça a leitura, solicite imediatamente ao Fiscal que o substitua. Será avaliado apenas o que estiver escrito no espaço reservado para cada resposta, razão por que os rascunhos não serão considerados. Escreva de modo legível, pois dúvida gerada por grafia, sinal ou rasura implic ará redução de pontos. 6 Só será permitido o uso de dicionário INGLÊS/INGLÊS. 7 Use exclusivamente caneta esferográfica, confeccionada em material transparente, de tinta preta ou azul. Em nenhuma hipótese se avaliará resposta escrita com grafite. 8 Utilize para rascunhos, o verso de cada página deste Caderno. 9 Você dispõe de, no máximo, três horas, para responder as 5 questões que constituem a Prova. 10 Antes de retirar-se definitivamente da sala, devolva ao Fiscal este Caderno. Assinatura do Candidato: UFRN Exame de Proficiência 2014_3 Inglês

2 As questões de 01 a 05, cujas respostas deverão ser redigidas EM PORTUGUÊS, referem -se ao texto abaixo. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics Zong Wang, Mark Gerstein and Michael Snyder Abstract RNA-Seq is a recently developed approach to transcriptome profiling that uses deep -sequencing technologies. Studies using this method have already altered our view of the extent and complexity of eukaryotic transcriptomes. RNA-Seq also provides a far more precise measurement of levels of transcripts and their isoforms than other methods. This article describes the RNA -Seq approach, the challenges associated with its application, and the advances made so far in characterizing several eukaryote transcriptomes. The transcriptome is the complete set of transcripts in a cell, and their quantity, for a specific developmental stage or physiological condition. Understanding the transcriptome is essential for interpreting the functional elements of the genome and revealing the molecular constituents of cells and tissues, and also for understanding development and disease. The key aims of transcriptomics are: to catalogue all species of transcript, including mrnas, non -coding RNAs and small RNAs; to determine the transcriptional structure of genes, in terms of their start sites, 5 and 3 ends, splicing patterns and other post-transcriptional modifications; and to quantify the changing expression levels of each transcript during development and u nder different conditions. Various technologies have been developed to deduce and quantify the transcriptome, including hybridization-or sequence-based approaches. Hybridization-based approaches typically involve incubating fluorescently labelled cdna with custom-made microarrays or commercial high-density oligo microarrays. Specialized microarrays have also been designed; for example, arrays with probes spanning exon junctions can be used to detect and quantify distinct spliced isoforms. Genomic tiling microarrays that represent the genome at high density have been constructed and allow the mapping of transcribed regions to a very high resolution, from several base pairs to ~100 bp. Hybridization-based approaches are high throughput and relatively inexpensi ve, except for high-resolution tiling arrays that interrogate large genomes. However, these methods have several limitations, which include: reliance upon existing knowledge about genome sequence; high background levels owing to cross-hybridization; and a limited dynamic range of detection owing to both background and saturation of signals. Moreover, comparing expression levels across different experiments is often difficult and can require complicated normalization methods. Fonte: The Journal of Biological Chemistry Vol. 287, No. 2, pp , January 6, 2012 UFRN Exame de Proficiência 2014_3 Inglês Ciências Biológicas 1

3 Questão 1 Cite as razões pelas quais a abordagem do RNA-Seq é considerada uma ferramenta revolucionária para a transcriptômica. Questão 2 Em que consiste o transcriptoma e qual a importância da sua compreensão? UFRN Exame de Proficiência 2014_3 Inglês Ciências Biológicas 2

4 Questão 3 Quais os principais objetivos da transcriptômica? Questão 4 Enumere as vantagens e desvantagens das abordagens baseadas na hibridização. UFRN Exame de Proficiência 2014_3 Inglês Ciências Biológicas 3

5 Questão 5 Traduza o fragmento textual abaixo no espaço reservado para isso. Seu texto deverá apresentar clareza e estar bem articulado tanto em termos estruturais quanto de sentido. Hybridization-based approaches typically involve incubating fluorescently labelled cdna with custom-made microarrays or commercial high-density oligo microarrays. Specialized microarrays have also been designed; for example, arrays with probes spanning exon junctions can be used to detect and quantify distinc t spliced isoforms. Genomic tiling microarrays that represent the genome at high density have been constructed and allow the mapping of transcribed regions to a very high resolution. ESPAÇO DESTINADO AO TEXTO DEFINITIVO UFRN Exame de Proficiência 2014_3 Inglês Ciências Biológicas 4

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