Danny Vélez. Estruturação e publicação de informação sobre biodiversidade

Transcrição

1 Danny Vélez Estruturação e publicação de informação sobre biodiversidade

2 Tapir GBIF Portal ISO Ecosistema de ferramentas e padrões Plinian Core ABCD Audubon Core Padrões Darwin Core IPT Metadados Ficha de espécie e-pmg Digir TDWG SiBBr SDD Registros de ocorrências Listas de espécies XML Protocolos GBIF Metadata Profile Bisby Core Dublin Core EML

3 Universo de ferramentas e padrões Fichas de espécies Ocorrências METADATA Listas de espécies

4 Padrões

5 Os padrões permitem Os padrões permitem Dividir a informação em partes (elementos); Controlar a semântica (significado) dos termos; Regras para a sintaxes (estrutura) do conteúdo de cada termo.

6 Comunidade

7 TDWG TDWG was formed to establish international collaboration among biological database projects. TDWG promoted the wider and more effective dissemination of information about the World's heritage of biological organisms for the benefit of the world at large. Biodiversity Information Standards (TDWG) now focuses on the development of standards for the exchange of biological/biodiversity data

8 TDWG Mission Develop, adopt and promote standards and guidelines for the recording and exchange of data about organisms; Act as a forum for discussion through holding meetings and through publications

9 O que é o Darwin Core? O Darwin Core (DwC) é um padrão. Ele inclui um conjunto de termos (em outros contextos estes podem ser chamados de propriedades, elementos, campos, colunas, atributos, ou conceitos) tendentes a facilitar o compartilhamento de informações sobre a diversidade biológica, fornecendo definições de referência, exemplos e comentários.

10 Estrutura do DwC Seção Classe Palavras chave Número de termos Termos que não estão Instituições, coleções, natureza do 19 incluídos em nenhuma classe registro Recordlevel Terms Auxiliary Terms Occurrence Evidencia, ocorrência, observadores, 22 comportamento, mídia associada, referências MaterialSample Identificador, amostra de material 1 Event Protocolo, métodos de amostragem, 15 data, tempo, notas de campo dcterms:location Georreferenciamento 44 GeologicalContext Tempo geológico, chrono-stratrigrafía, 18 bioestratrigrafía, litostratrigrafía Identification Identificação, identificador 8 Taxon Nomes científicos, nomes vernáculos, conceito de táxon 33 ResourceRelationship Relações, objeto do registro, outros 7 recursos MeasurementOrFact Medições, fatos, características, 9 referencias TOTAL 176

11 Estrutura do DwC

12 Estrutura do DwC

13 Estrutura do DwC

14 O que posso estruturar com o DwC? Registros de ocorrências de espécies Listas de espécies

15 Imagens, soms, dados moleculares e outros As extensões do DwC são conjuntos de termos adicionais para descrever informações complementarias de uma ocorrência. No momento existem mais de 20 extensões.

16 Ecological Metadata Language (EML) It is a metadata specification developed by the ecology discipline and for the ecology discipline. Knowledge Network for Biocomplexity

17 GBIF Metadata Profile The GBIF Metadata Profile (GMP) was developed in order to standardise how resources get described at the dataset level in the GBIF Data Portal.

18 Publicando através do SiBBr

19 Benefícios de publicação de dados através do SiBBr Gratuidade - todos os serviços e ferramentas são gratuitos; crédito aos publicadores - o SiBBr dá o devido reconhecimento e visibilidade para os pesquisadores e instituições que contribuem com a publicação dos dados; acompanhamento permanente - o SiBBr está em contato constante com pesquisadores e instituições para facilitar a digitalização, publicação e uso dos dados;

20 Benefícios de publicação de dados através do SiBBr independência dos publicadores - o modelo de publicação inclui ferramentas e mecanismos de fácil acesso e administração que permitem uma maior independência nos processos de publicação dos dados; armazenamento dos dados - o SiBBr facilita o armazenamento dos dados em repositórios perenes; integração e padronização - o SiBBr apoia a padronização de dados e metadados com padrões reconhecidos internacionalmente.

21 Ferramentas y protocolos de publicação

22 Integrated Publishing Toolkit (IPT) The GBIF Integrated Publishing Toolkit (IPT) is a freely available open source web application that makes it easy to share three types of biodiversity-related information: primary taxon occurrence data, taxon checklists, and general metadata about data sources.

23 Integrated Publishing Toolkit (IPT) v1 v2v4 v4 v5

24 Integrated Publishing Toolkit (IPT)

25 Etapas de publicação, padrões, ferramentas e visibilidade de instituições e pesquisadores através do SIBBr

26 Workflow de publicação de ocorrências a través do SiBBr Estruturação dos dados Padrão Padrão Darwin Core Onde? Carga de dados e metadados, publicação e registro dos dados Padrão EML Dar visibilidade e crédito aos publicadores e instituições EXCEL Data paper Banco de dados Integrated Publishing Toolkit Portal SiBBr e GBIF

27 Portal de dados 1. Integrar conjuntos de dados de diferentes publicadores; 2. Procurar ocorrências com filtros; 3. Exibir num explorador SIG as ocorrências georreferenciadas; 4. Selecionar ocorrências por áreas geográficas; 5. Download dos resultados das procuras; 6. Exibir estatísticas dos conjuntos de dados; 7. Fazer procura por publicador; 8. Fazer procura por conjunto de dados; 9. Enviar feedback para os publicadores de dados

28 Obrigado! Danny Vélez Rio de Janeiro, Brasil Nov, 2014