Biologia Genômica. 2º Semestre, Recombinação Homóloga e Sítio-Específica. Prof. Marcos Túlio
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- Fábio Pereira
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1 Biologia Genômica 2º Semestre, 2017 Recombinação Homóloga e Sítio-Específica Prof. Marcos Túlio mtoliveria@fcav.unesp.br Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas de S.J.R.P. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
2 Aula Passada - Reparo de DNA
3 Recombinação
4 Recombinação para Reparo Double-Strand DNA Breaks
5 NHEJ
6
7 Recombinação Homóloga
8 Recombinação Homóloga
9
10 Recombinação Homóloga
11 Recombinação Homóloga - Reparo
12 Sistema RecBCD de E. coli
13 Sistema RecBCD de E. coli
14 Invasão de ssdna - RecA de E. coli
15 Invasão de ssdna - RecA de E. coli Yu et al., PNAS 98:
16 Invasão de ssdna - RecA de E. coli
17 Invasão de ssdna - RecA de E. coli
18 Migração de ssdna - RuvAB de E. coli
19 Migração de ssdna - RuvAB de E. coli
20 Resolução - RuvC de E. coli
21 Recombinação Meiótica
22 Recombinação Meiótica
23 Troca de Sexo? Só levedura mesmo...
24 Troca de Sexo? Só levedura mesmo...
25 Recombinação Homóloga - Resumo RecG Rad54, Rad5, BLM, WRN, RECQ1, RECQ5, FANCM, etc.
26 Embaralhando o Genoma...
27 Recombinação Sítio-Específica
28 Recombinação Sítio- Específica
29 Serina e Tirosina Recombinases
30 Integrase do Bacteriófago Lambda
31 Hin Recombinase de Salmonella
32 XerCD Recombinase de E. coli
33 XerCD Recombinase de E. coli
34 XerCD Recombinase de E. coli
35 Transposição
36 Transposição
37 Cut and Paste
38 Retrotransposons/ Retrovirus
39 Retrotransposons/Retrovirus
40 Recombinação/ Reparo e Evolução de Genomas
41 Mecanismos de duplicação gênica Brown, Genomes, 2nd ed.
42 Mecanismos de duplicação gênica Brown, Genomes, 2nd ed.
43 8.8 Morphological Complexity Evolves by Adding New Gene Functions FIGURE 17: Common eukaryotic proteins are concerned with essential cellular functions FIGURE 18: Increasing complexity in eukaryotes is accompanied by accumulation of new proteins for transmembrane and extracellular functions
44 Famílias de Genes/Proteínas
45 8.10 Globin Clusters Arise by Duplication and Divergence FIGURE 20: Each of the alpha-like and beta-like globin gene families is organized into a single cluster that includes functional genes and pseudogenes (psi)
46 8.10 Globin Clusters Arise by Duplication and Divergence FIGURE 21: Different hemoglobin genes are expressed during embryonic, fetal, and adult periods of human development
47 8.10 Globin Clusters Arise by Duplication and Divergence
48 8.10 Globin Clusters Arise by Duplication and Divergence FIGURE 22: Seven mouse genes include two early embryonic genes, one late embryonic gene, two adult genes, and two pseudogenes
49 8.11 Pseudogenes Are Nonfunctional Gene Copies Some pseudogenes may gain functions different from those of their parent genes, such as regulation of gene expression, and take on different names. FIGURE 23: Many changes have occurred in a betaglobin gene since it became a pseudogene
50 FIGURE 24: Most human RP pseudogenes are of recent origin; many are shared with the chimpanzee but absent from rodents Adapted from S. Balasubramanian, et al., Genome Biol. 20 (2009): R2.
51 Brown, Genomes, 2nd ed. Genes Homeobox
52 Exon/Domain Shuffling Brown, Genomes, 2nd ed.
53 Brown, Genomes, 2nd ed. Exon Shuffling
54 Exon/Domain Shuffling Brown, Genomes, 2nd ed.
55 Duplicação de genomas inteiros Brown, Genomes, 2nd ed.
56 Genoma de Plantas = Bagunça!
57 Genoma de Plantas = Bagunça! FIGURE 13: DNA content of the haploid genome increases with morphological complexity of lower eukaryotes, but varies among higher eukaryotes
58 Hipótese 2R de duplicação do genoma de vertebrados
59 Da mitocôndria para o núcleo: NUMTs Bhazkani-Covo et al., Molecular Poltergeists: Mitochondrial DNA Copies (numts) in Sequenced Nuclear Genomes. PLoS Genetics, e:
60 Do cloroplasto para o núcleo, eu até entendo, mas do cloroplasto de uma alga para o núcleo de um animal Rumpho et al., J Exp Biol, 214:
61 Evolução de Blocos de Genes: Inversões Cromossômicas
62 Evolução de Blocos de Genes: Inversões Cromossômicas
63 Evolução de Blocos de Genes: Inversões Cromossômicas Ananina et al., GMB, 27:61-69.
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